Детские вопросы

[Jauhien]

У меня на страничке ФТДНА рядом со снипами написано (persumed positive) в то же время я заметил, что  есть также такая категория как tested positive. Однако у меня ни под одним снипом этой надписи нет.На этом форуме уже спрашивали проводилось ли снип тестирование, так я уже сомневаюсь, что оно проводилось. Ведь если бы проводилось, то должно было быть "установлено" а не "предполагаться" наличие тех или иных снипов. Также интересно, как они определили мою гаплогруппу( у меня "predicted haplogroup"), по маркерам что ли?
Если кто в курсе, просветите пожалуйста.

[nmash]

www.decodeme.com
Подскажите - кто ближе - (250 кб)
Your genetic sharing with Ezekiel Kalicharan
Sharing 56.3% (low: 43.7%, medium: 53.1%, high: 3.2%)
1 мб - Sharing 13.8% (low: 86.2%, medium: 13.8%, high: 0.1%)

или

Your genetic sharing with bonal
Sharing 62.2% (low: 37.8%, medium: 57.7%, high: 4.4%)
1 мб - Sharing 19.1% (low: 80.9%, medium: 18.7%, high: 0.4%)
СПАСИБО!!!!!!!!!!!!!

[татиа]

nmash Поскольку 0.4 больше чем 0.1 (сравниваем high, 1 mb),
то второй ближе чем первый

[nmash]

nmash Поскольку 0.4 больше чем 0.1 (сравниваем high, 1 mb),
то второй ближе чем первый

Я правильно поняла - сравнивать надо именно в разрешении 1 мб??
И там выискивать у кого HIGH выше??

[Овод]

У меня на страничке ФТДНА рядом со снипами написано (persumed positive) в то же время я заметил, что  есть также такая категория как tested positive. Однако у меня ни под одним снипом этой надписи нет.На этом форуме уже спрашивали проводилось ли снип тестирование, так я уже сомневаюсь, что оно проводилось. Ведь если бы проводилось, то должно было быть "установлено" а не "предполагаться" наличие тех или иных снипов. Также интересно, как они определили мою гаплогруппу( у меня "predicted haplogroup"), по маркерам что ли?
Если кто в курсе, просветите пожалуйста.

Если - presumed, значит на снип не типировали, а гаплогруппу предсказали по СТР-маркерам, по предиктору. Надёжность предсказания зависит от гаплотипа и может быть от 50 до 95 %. Снип - проктически -100%, но надо найти денежку.
 
Не дадите мне ссылку на Ваш гаплотип, чтобы устроить Вас на дереве Молгена?

[татиа]

Я правильно поняла - сравнивать надо именно в разрешении 1 мб??
И там выискивать у кого HIGH выше??

Сравнивать можно любые параметры в любом разрешении, просто аналогичные (в смысле не сравнивать low с high).
1 Mb я выбрала просто потому, что он первым выскакивает после того, как вы нажимаете на compare. Быстренько сообразили, что показатель низкий по high и не стали углубляться, перешли к следующему сравниваеммому. Я обращаю внимание на персон с показателем не ниже 0.2 в high 1mb. Только с такими влезаю в разные разрешения и прочие премудрости. 

[nmash]

Я обращаю внимание на персон с показателем не ниже 0.2 в high 1mb. Только с такими влезаю в разные разрешения и прочие премудрости. 

Вот, что я нашла для Ларки (это моя приемная дочь, сирота-подкидыш, пытаюсь найти ей хоть какую-то родню...)

Your genetic sharing with bonal
Sharing 19.1% (low: 80.9%, medium: 18.7%, high: 0.4%)
(250 кб - Sharing 62.2% (low: 37.8%, medium: 57.7%, high: 4.4%))
Mito group: T Origin: Rize, Turkey

Your genetic sharing with R1a1a
Sharing 18.9% (low: 81.1%, medium: 18.7%, high: 0.2%)
(250 кб - Sharing 61.7% (low: 38.3%, medium: 57.9%, high: 3.9%)
Ethnicity: European ancestry  Mito group: H

Your genetic sharing with rogers
Sharing 18.8% (low: 81.2%, medium: 18.7%, high: 0.1%)
(250 кб - Sharing 61.3% (low: 38.7%, medium: 57.3%, high: 4.0%)
Ethnicity: European ancestry Mito group: U* Origin: Croatia
-
Меня только "грузит", что:

bonal
1 МБ - high: 0.4%, 250 кб - high: 4.4%

но
R1a1a
1 МБ - high: 0.2%, 250 кб - high: 3.9%

rogers
1 МБ - high: 0.1, 250 кб - high: 4.0%

Не пойму тут логики...

Кто из них ближе к Ларке??

[Jauhien]

Если - presumed, значит на снип не типировали, а гаплогруппу предсказали по СТР-маркерам, по предиктору. Надёжность предсказания зависит от гаплотипа и может быть от 50 до 95 %. Снип - проктически -100%, но надо найти денежку.
 
Не дадите мне ссылку на Ваш гаплотип, чтобы устроить Вас на дереве Молгена?

Спасибо, вот ссылка http://forum.molgen.org/index.php/topic,410.msg34203.html#msg34203

[татиа]

Меня только "грузит", что:
bonal
1 МБ - high: 0.4%, 250 кб - high: 4.4%
но
R1a1a
1 МБ - high: 0.2%, 250 кб - high: 3.9%
rogers
1 МБ - high: 0.1, 250 кб - high: 4.0%

Не пойму тут логики... Кто из них ближе к Ларке??

Логика такая: ближе всех bonal, потом R1a1, самый дальний rogers.
Потому что: в 1 mb 0.4 , больше чем 0.2, и меньше всего 0.1
То есть тот человек у кого показатель в high выше - тот и ближе к Ларе.

В 250 high цифры правильно записаны?

Я бы со свойственным мне иногда волюнтаризмом обращала бы внимание только на bonal и ему написала бы письмо с вопросом об оттенках его этнического портрета и из какого он региона (если я не путаю, он, кажется, - турок), а о двух других перцах просто временно или навсегда забыла бы. Гораздо интереснее те кто выше 0.2.
Но... старшие товарищи-господа всегда приглашаются поправить дам  .

[nmash]

Логика такая: ближе всех bonal, потом R1a1, самый дальний rogers.

В 250 high цифры правильно записаны?

bonal
Sharing 62.2% (low: 37.8%, medium: 57.7%, high: 4.4%)

R1a1a
Sharing 61.7% (low: 38.3%, medium: 57.9%, high: 3.9%)

rogers
Sharing 61.3% (low: 38.7%, medium: 57.3%, high: 4.0%)

Вставила здесь методом "копи-паст".

[татиа]

По показателю Sharing последовательность приближения к Ларе сохраняется: ближе всех bonal, потом R1a1, последний rogers. Почему в 250 high у R1a1 меньще на одну десятую... черт его знает. Но гораздо интереснее для Лары, откуда bonal.

Dawidski где-то писал, что если в 500 у сравниваемого с вами больше 44%, а в 250 больше 64% (sharing), почти наверняка этот человек из одного с вами региона.

[nmash]

Гораздо интереснее те кто выше 0.2.

А у Вас (или других товарищей с форума) много совпаденцев с high в 1 МБ выше 0,2%??

И какая-та интересная связь с такими совпаденцами нашлась?

Жаль, что их нет в 23-энд-ми и, естественно, нет и в RF....

[I2a1a]

Bonal -это мужчина или женщина?
High sharing в терминологии Decode - это когда у сравниваемых совпадают оба варианта аллеля. Medium sharing - то же самое, что sharing в 23andme.

250Кб сответствует масштабам сравнения на общепопуляционном уровне. 

[татиа]

Bonal - мужчина из Турции:

Mito group: T
Y group: G subgroup 1
Origin: Rize, Turkey

[nmash]

Но гораздо интереснее для Лары, откуда bonal.

Dawidski где-то писал, что если в 500 у сравниваемого с вами больше 44%, а в 250 больше 64% (sharing), почти наверняка этот человек из одного с вами региона.

в 500

bonal
Sharing 41.2% (low: 58.8%, medium: 39.6%, high: 1.6%)
Mito group: T.  Origin: Rize, Turkey
(У Ларки - U4b)

R1a1a
Sharing 41.6% (low: 58.4%, medium: 40.4%, high: 1.2%)
Ethnicity: European ancestry  Mito group: H

rogers
Sharing 40.8% (low: 59.2%, medium: 39.6%, high: 1.1%)
Ethnicity: European ancestry Mito group: U* Origin: Croatia


Думаю, что и R1a1a интересен для Лары, да?
Проблема в том, что все эти господа сообщают, откуда они сами родом и, в лучшем случае, откуда их предки по папе...

Да и разброс регионов впечатляет, не правда ли?