АвторТема: Family Finder от FTDNA  (Прочитано 484413 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн I2a1a

  • ...
  • Сообщений: 10364
  • Страна: ee
  • Рейтинг +761/-8
Re: Family Finder от FTDNA
« Ответ #1545 : 27 Январь 2016, 11:26:53 »
Какой приблизительно степени родства соответствует результат в 89.51 cM, 15 сегментов, три самых крупных: 24.04, 23.98 и 10.55?
FTDNA определяет как 2nd Cousin - 4th Cousin, но хотелось бы посмотреть и "живые" примеры.

Эти cегменты на одной хромосоме или на разных? Если такие сегменты на трех разных хромосомах, тогда - в силу менделевского закона независимого наследования - предикт скорее всего точный (т.к. вероятность родства  вычисляется независимо для каждого из сегментов). Если на одной - родство может быть более удаленным, т.к. сегменты физически сцеплены.

Оффлайн I2a1a

  • ...
  • Сообщений: 10364
  • Страна: ee
  • Рейтинг +761/-8
Re: Family Finder от FTDNA
« Ответ #1546 : 27 Январь 2016, 16:13:31 »
Какой приблизительно степени родства соответствует результат в 89.51 cM, 15 сегментов, три самых крупных: 24.04, 23.98 и 10.55?
FTDNA определяет как 2nd Cousin - 4th Cousin, но хотелось бы посмотреть и "живые" примеры.

Эти cегменты на одной хромосоме или на разных? Если такие сегменты на трех разных хромосомах, тогда - в силу менделевского закона независимого наследования - предикт скорее всего точный. Если на одной - родство может быть более удаленным, т.к. сегменты физически сцеплены.

24.04 и 10.55 на одной, 23.98 на другой. Ну и мелочи всякой почти на каждой второй набросано.

В приципе, наличие двух больших сегментов на разных хросомах  -это надежный индикатор.
На мелочь (большое количество мелких совпадающих сегментов-блоков) можно не обращать внимание. В большинстве случае они свидетельствуют не о родстве в генеалогически обозримом интервале, а о размере эффективной популяции (т.е степени генетического однообразия генетического пула популяции). Часто они вносят помехи в определение реальной степени родства - классический пример евреи-ашкеназы с небольшим размером начальной эффективной популяции.

Оффлайн I2a1a

  • ...
  • Сообщений: 10364
  • Страна: ee
  • Рейтинг +761/-8
Re: Family Finder от FTDNA
« Ответ #1547 : 27 Январь 2016, 16:23:57 »
У меня самого немного (всего два) примера, когда благодаря IBD-анализу (т.е изучению общих по происхождению) сегментов хромосом я нашел ранее неизвестных мне людей, с которыми удалось выйти на линию общих предков.

Первый пример - канадка, бабушка которой происходит из рода Качановских, а прабабушка Агафия Васильевна из рода Вереничей. Благодаря метрическим книгам я узнал, что наше реальное родство 5 поколений до общего предка (с учетом простейшей линии родства). На Gedmatch медианное значение степени вероятного родства -  4.4.

Ниже приводятся технические детали 3 совпадающих сегментов (как видите, все три сегмента проходят пороговые требования к  минимальному размеру (7 cM) и числу снипов (700) в  сегменте), и - что наиболее важно - все три находятся на разных хромосомах. Поскольку наследование каждого сегмента, то вероятности случайного (негенеалогического) совпадения этих сегментов перемножаются.

ChrStart LocationEnd LocationCentimorgans (cM)SNPs
432,232,22442,421,62513.21,115
78,295,40513,845,9899.8885
1136,784,44545,084,8788.0881

Largest segment = 13.2 cM
Total of segments > 7 cM = 30.9 cM
Estimated number of generations to MRCA = 4.4

 

Оффлайн Ya-nina

  • Сообщений: 204
  • Страна: by
  • Рейтинг +85/-4
  • Y-ДНК: R-YP1410 (отец),
  • мтДНК: HV2 (отец); V7а (я)
Re: Family Finder от FTDNA
« Ответ #1548 : 27 Январь 2016, 17:42:56 »
На тему еврейских совпаденцев (ашкенази).
Есть, например, у меня такой совпаденец (папа - еврей, мама -- ирландка). На ФТДНА 3-5 кузен, 8 сегментов, сумма 42.69 сМ. Совсем мелкие сегменты опускаю.

Chr.     Start Location                End Location               (cM)       SNPs
11   27451835      30151147      2.41      500
11   40345455      43471106      3.89      800
12   54388428      57269740      2.29      700
13   43809556      74903294      25.38      7600

на Гедматче
Сравнение 1:1
Largest segment = 23.9 cM
 Total of segments > 7 cM = 23.9 cM (в таблице – 41сМ)
 Estimated number of generations to MRCA = 4.6 (в общей таблице – 4,2)

В обозримом прошлом никаких пересечений пока не просматривается. Хотелось бы все-таки узнать поточнее -- учитывая специфику этноса -- насколько эта генетическая дистанция может соответствовать стандартной ситуации?

Оффлайн I2a1a

  • ...
  • Сообщений: 10364
  • Страна: ee
  • Рейтинг +761/-8
Re: Family Finder от FTDNA
« Ответ #1549 : 27 Январь 2016, 18:33:18 »
На тему еврейских совпаденцев (ашкенази).
Есть, например, у меня такой совпаденец (папа - еврей, мама -- ирландка). На ФТДНА 3-5 кузен, 8 сегментов, сумма 42.69 сМ. Совсем мелкие сегменты опускаю.

Chr.     Start Location                End Location               (cM)       SNPs
11   27451835      30151147      2.41      500
11   40345455      43471106      3.89      800
12   54388428      57269740      2.29      700
13   43809556      74903294      25.38      7600

на Гедматче
Сравнение 1:1
Largest segment = 23.9 cM
 Total of segments > 7 cM = 23.9 cM (в таблице – 41сМ)
 Estimated number of generations to MRCA = 4.6 (в общей таблице – 4,2)

В обозримом прошлом никаких пересечений пока не просматривается. Хотелось бы все-таки узнать поточнее -- учитывая специфику этноса -- насколько эта генетическая дистанция может соответствовать стандартной ситуации?

Точно неизвестно. Но реально значимый сегмент в совпадении у вас один - на 13 хромосоме. Проблема в том, что мы ничего не знаем о характере наследования этого участка - может быть это недавний кусок генома общего предка, cохранившийся после множества кроссинговеров. А может - консервативный фрагмент генома, находящийся под давлением естественного отбора (например, в этом сегменте находятся полезные гены иммунитета от некоторых заболеваний).

Вы спрсите меня: "А кто знает?" Да наверное, никто. До тех пор пока не будет изучена этногеномика условных популяций ваших условных предков.

Оффлайн dars

  • Сообщений: 607
  • Страна: ru
  • Рейтинг +107/-0
  • Y-ДНК: N-Y9022
  • мтДНК: U7
Re: Family Finder от FTDNA
« Ответ #1550 : 27 Январь 2016, 20:32:20 »
Точно неизвестно. Но реально значимый сегмент в совпадении у вас один - на 13 хромосоме. Проблема в том, что мы ничего не знаем о характере наследования этого участка - может быть это недавний кусок генома общего предка, cохранившийся после множества кроссинговеров. А может - консервативный фрагмент генома, находящийся под давлением естественного отбора (например, в этом сегменте находятся полезные гены иммунитета от некоторых заболеваний).

Вы спрсите меня: "А кто знает?" Да наверное, никто. До тех пор пока не будет изучена этногеномика условных популяций ваших условных предков.

а можно подробнее вот этот момент? как вы это видите?

Оффлайн I2a1a

  • ...
  • Сообщений: 10364
  • Страна: ee
  • Рейтинг +761/-8
Re: Family Finder от FTDNA
« Ответ #1551 : 27 Январь 2016, 22:35:38 »
Точно неизвестно. Но реально значимый сегмент в совпадении у вас один - на 13 хромосоме. Проблема в том, что мы ничего не знаем о характере наследования этого участка - может быть это недавний кусок генома общего предка, cохранившийся после множества кроссинговеров. А может - консервативный фрагмент генома, находящийся под давлением естественного отбора (например, в этом сегменте находятся полезные гены иммунитета от некоторых заболеваний).

Вы спрсите меня: "А кто знает?" Да наверное, никто. До тех пор пока не будет изучена этногеномика условных популяций ваших условных предков.

а можно подробнее вот этот момент? как вы это видите?

Так и вижу - подробное изучения аутосомного генофонда популяций

Оффлайн Ya-nina

  • Сообщений: 204
  • Страна: by
  • Рейтинг +85/-4
  • Y-ДНК: R-YP1410 (отец),
  • мтДНК: HV2 (отец); V7а (я)
Re: Family Finder от FTDNA
« Ответ #1552 : 27 Январь 2016, 23:29:10 »

Точно неизвестно. Но реально значимый сегмент в совпадении у вас один - на 13 хромосоме. Проблема в том, что мы ничего не знаем о характере наследования этого участка - может быть это недавний кусок генома общего предка, cохранившийся после множества кроссинговеров. А может - консервативный фрагмент генома, находящийся под давлением естественного отбора (например, в этом сегменте находятся полезные гены иммунитета от некоторых заболеваний).

Вы спрсите меня: "А кто знает?" Да наверное, никто. До тех пор пока не будет изучена этногеномика условных популяций ваших условных предков.

Этот сегмент на 13 хромосоме  я унаследовала от отца, правда, в каждом подобном случае у меня сегмент чуть-чуть, но увеличивается (?). И всех евреев, которые есть у меня в совпаденцах (а это из 34 стр. на ФТДНА -- пожалуй, половина) можно сгруппировать на расположению большого сегмента -- их 3 группы, на 3, 8 и 13 хромосоме. И на 13-й они все локализуются на одном участке в основном. Но в этнокалькуляторах  ашкеназов у меня нет.

Оффлайн vnik

  • Сообщений: 242
  • Страна: de
  • Рейтинг +23/-0
  • мтДНК: H16
Re: Family Finder от FTDNA
« Ответ #1553 : 28 Январь 2016, 21:51:03 »
Кстати если кому интересно, вот результаты сравнения результатов по 5-6 юродным родстенникам:
В FTDNA - всего 42.70 cM, Longest Block: 16.00 cM.
В FTDNA - всего 47.50 cM, Longest Block: 14.41 cM.

Можете подсказать, когда были рождены общие предки по указанным выше примерам?

Оффлайн smolinsky

  • Сообщений: 132
  • Страна: ru
  • Рейтинг +22/-0
  • u r not me
  • Y-ДНК: N-Y4706
  • мтДНК: H24A
Re: Family Finder от FTDNA
« Ответ #1554 : 01 Февраль 2016, 20:02:14 »
Можете подсказать, когда были рождены общие предки по указанным выше примерам?
1) Климентий Федоров (1773-1848) и Агафья Фокеева (1774-1843);
2) Козихин Евдоким Герасимов (1764-1833) и Татьяна Васильева (1760-1818).
А реальное число поколений какое? Не пять же по пятьдесят лет?

Оффлайн smolinsky

  • Сообщений: 132
  • Страна: ru
  • Рейтинг +22/-0
  • u r not me
  • Y-ДНК: N-Y4706
  • мтДНК: H24A
Re: Family Finder от FTDNA
« Ответ #1555 : 01 Февраль 2016, 21:46:54 »
А реальное число поколений какое? Не пять же по пятьдесят лет?
Не понял вопроса. По 1 примеру ДНК взят у шестиюродных братьев 1949 и 1961 г.р.
По 2 примеру у пятиюродного дяди 1930 г.р. и его пятиюродного племянника 1949 г.р.
Gedmatch предсказал 4,9 и 4,3 поколения до общего предка в первом и втором случае соответственно. А в реальности какое количество поколений до общего предка в обоих случаях?
Я сморю по метрическим книгам и часто поколение  даже меньше двадцати лет, а племянники старше дядей.

Оффлайн smolinsky

  • Сообщений: 132
  • Страна: ru
  • Рейтинг +22/-0
  • u r not me
  • Y-ДНК: N-Y4706
  • мтДНК: H24A
Re: Family Finder от FTDNA
« Ответ #1556 : 01 Февраль 2016, 21:52:00 »
И еще, у меня есть два совпаденца, с дистанцией в 5 поколений (судя по gedmatch) и у каждого из них протестирован родитель. Почему в обоих случаях дистанция до общего предка на несколько десятых у меня меньше с детьми, но не с родителями?

Оффлайн FELIX

  • Сообщений: 4079
  • Страна: rw
  • Рейтинг +1584/-8
  • Y-ДНК: R-YP569
  • мтДНК: U5a1a1b
Re: Family Finder от FTDNA
« Ответ #1557 : 01 Февраль 2016, 23:10:29 »
Если родственники шестиюродные и пятиюродные, то сколько будет поколений до общего предка?  ;D
180 лет на 5-6 поколений - это нормально. У меня 13 поколений за 400 лет - примерно такой же интервал на поколение.

И еще, у меня есть два совпаденца, с дистанцией в 5 поколений (судя по gedmatch) и у каждого из них протестирован родитель. Почему в обоих случаях дистанция до общего предка на несколько десятых у меня меньше с детьми, но не с родителями?

Как вариант: сегменты не только делятся, но ещё и суммируются: родителей то двое. У меня лично есть такое пересечение - из 4 значимых сегментов один оказался по линии второго родителя, но родство было определено верно (по средней величине интервала).

Оффлайн smolinsky

  • Сообщений: 132
  • Страна: ru
  • Рейтинг +22/-0
  • u r not me
  • Y-ДНК: N-Y4706
  • мтДНК: H24A
Re: Family Finder от FTDNA
« Ответ #1558 : 02 Февраль 2016, 00:01:25 »
Как вариант: сегменты не только делятся, но ещё и суммируются: родителей то двое. У меня лично есть такое пересечение - из 4 значимых сегментов один оказался по линии второго родителя, но родство было определено верно (по средней величине интервала).
Сравните эти три кита: A878766 A822579 F449990
Сегодня младшая из них письмо прислала, ищет украинские корни.

Оффлайн smolinsky

  • Сообщений: 132
  • Страна: ru
  • Рейтинг +22/-0
  • u r not me
  • Y-ДНК: N-Y4706
  • мтДНК: H24A
Re: Family Finder от FTDNA
« Ответ #1559 : 02 Февраль 2016, 00:07:52 »
Если родственники шестиюродные и пятиюродные, то сколько будет поколений до общего предка?  ;D
Я еще не во все въезжаю, поэтому и задаю глупые вопросы. Степень родства в вышеприведенном примере определилась с помощью фэмэли файндера или с помощью уже имеющегося древа? Совпали ли результаты до общего предка, предсказанные гедматчем, с реальным числом поколений и результатами, полученными в FF? Это поможет интерпретировать мои собственные результаты.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.