АвторТема: Результаты Family Finder от FTDNA  (Прочитано 282879 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Alesh

  • Сообщений: 933
  • Рейтинг +80/-1
Re: Результаты Family Finder от FTDNA
« Ответ #75 : 10 Май 2010, 19:03:37 »
так подробнее скажите , куда, как и кому кидать и что  ;D

Просьба ко всем получившим результаты Family Finder'a прислать их для добавления в упсометр.
Kак загрузить результаты:
зайти на familytreedna.com со своим логином и открыть http://www.familytreedna.com/my-ftdna/family-finder-download.aspx?t=a
Сохранить файл и послать на napobo3@gmail.com
Спасибо.

Рекомендую, информативная и удобная программа.

Оффлайн napobo3

  • Сообщений: 1336
  • Страна: il
  • Рейтинг +337/-2
  • קַח-נָא אֶת-בִּנְךָ אֶת-יְחִידְךָ אֲשֶׁר-אָהַבְתָּ, אֶת-יִצְחָק
  • Y-ДНК: J-FGC5231
  • мтДНК: N1b2
Re: Результаты Family Finder от FTDNA
« Ответ #76 : 10 Май 2010, 19:07:34 »
так подробнее скажите , куда, как и кому кидать и что  ;D
На страничке http://hirs.snpology.com есть копирайт строка © HIRopractors, 2009,2010
Нажимаете на нее, прикладываете файлы, посылаете.

Оффлайн arbuz

  • Сообщений: 139
  • Рейтинг +6/-0
  • Y-ДНК: N1c1d
  • мтДНК: J1c2c2a
Re: Результаты Family Finder от FTDNA
« Ответ #77 : 11 Май 2010, 00:38:41 »
Сохранил, как рекомендовали в предыдущем посте
На адресс указанный в последнем  ;D

Оффлайн dyuser

  • Сообщений: 80
  • Рейтинг +7/-0
  • Y-ДНК: G2a3b1* (P303)
  • мтДНК: H1b (FGS)
Re: Результаты Family Finder от FTDNA
« Ответ #78 : 11 Май 2010, 17:00:43 »
Пришли и мои результаты ФФ теста - батч 351. Уже отправил результаты, согласно инструкции выше. Заранее признателен Вам за помещение в БД, прошедших ФФтест.

Честно признаться - мало знаком с азами интерпретации полученных результатов. Сказать точнее - они меня немного с толку сбивают.
В Y-DNA 67 - совпаденцев уже на 25 маркерах не было, зато на mt-DNA (FGS) - аж 5 матчей! Но вот в результатах ФФ-теста - этих самых людей нет (есть новые 2 фамилии 5-th cousine и все).

Благодарю за объяснение данного факта!


Оффлайн I2a1a

  • ...
  • Сообщений: 10999
  • Страна: ee
  • Рейтинг +755/-8
Re: Результаты Family Finder от FTDNA
« Ответ #79 : 11 Май 2010, 18:41:55 »
Энн Тернер поделилась объяснением методологии поисков кузенов в RF

Цитировать
The Ancestry Labs/ Advanced does not distinguish between complete and half-identical sections. Might that explain what you're seeing? Also, how different is "markedly"? The display in Ancestry Labs rounds (or truncates) the base position to the nearest million bases.

The input for the Family Inheritance diagram, which color-codes complete and half-identical sections, uses the base position of nearest SNP. There's a Firefox utility called Firebug, which can capture the base positions fed to the painting function. If you search this Forum for Firebug, I think you'll find instructions on how to use it. It's a bit cryptic, but you can examine the text output to find the numbers.

Энн упоминала о некоем плагине Файервокса, который отлавливает информацию  передаваемую сервером в диаграмму Family Inhertance о базовых позициях ближайщих SNPs, и сохраняет их в текстовом файле.

Оффлайн I2a1a

  • ...
  • Сообщений: 10999
  • Страна: ee
  • Рейтинг +755/-8
Re: Результаты Family Finder от FTDNA
« Ответ #80 : 11 Май 2010, 20:03:17 »
Энн Тернер поделилась объяснением методологии поисков кузенов в RF

Цитировать
The Ancestry Labs/ Advanced does not distinguish between complete and half-identical sections. Might that explain what you're seeing? Also, how different is "markedly"? The display in Ancestry Labs rounds (or truncates) the base position to the nearest million bases.

The input for the Family Inheritance diagram, which color-codes complete and half-identical sections, uses the base position of nearest SNP. There's a Firefox utility called Firebug, which can capture the base positions fed to the painting function. If you search this Forum for Firebug, I think you'll find instructions on how to use it. It's a bit cryptic, but you can examine the text output to find the numbers.

Энн упоминала о некоем плагине Файервокса, который отлавливает информацию  передаваемую сервером в диаграмму Family Inhertance о базовых позициях ближайщих SNPs, и сохраняет их в текстовом файле.

То же можно сделать и в FF.

Оффлайн arbuz

  • Сообщений: 139
  • Рейтинг +6/-0
  • Y-ДНК: N1c1d
  • мтДНК: J1c2c2a
Re: Результаты Family Finder от FTDNA
« Ответ #81 : 12 Май 2010, 15:43:35 »
У меня по FF имеется 2 кузена

двоим отправил письма, от одного получил ответ, но скорее всего у нас с ним пересенения по тем линиях, которые и у меня и у него плохо изведаны  :(

Он прислал мне ссылку на свое дерево и старые фотки. Среди них мне бросилась в глаза одна фотография - похоже ли Вам эти 2 женщины ?


Оффлайн Mich GlitchАвтор темы

  • Genus regis
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 33827
  • Страна: ca
  • Рейтинг +2739/-44
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Re: Результаты Family Finder от FTDNA
« Ответ #82 : 12 Май 2010, 15:53:04 »
На мой взгляд, определенно есть сходство.
Точно родичи!
:)

Оффлайн arbuz

  • Сообщений: 139
  • Рейтинг +6/-0
  • Y-ДНК: N1c1d
  • мтДНК: J1c2c2a
Re: Результаты Family Finder от FTDNA
« Ответ #83 : 12 Май 2010, 16:09:16 »
забыл сказать , кто на фото
Cathrine Wallace 1816 - 1860 Отец John Wallace и мать Elizabeth Fuller
Сенченко Антонина Емельяновна 1884 - 1975  отец Пивень Емельян и мать пока нет информации

Оффлайн Mich GlitchАвтор темы

  • Genus regis
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 33827
  • Страна: ca
  • Рейтинг +2739/-44
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Re: Результаты Family Finder от FTDNA
« Ответ #84 : 12 Май 2010, 16:27:31 »
Да, уж догадались, что речь идет о родственнице и родиче.
 ::)

Оффлайн татиа

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 5070
  • Страна: 00
  • Рейтинг +651/-0
  • Y-ДНК: R-L1029+
  • мтДНК: J1c2c
Re: Результаты Family Finder от FTDNA
« Ответ #85 : 12 Май 2010, 18:33:35 »
Вот 11 из 13 FF-кузенов моего родича.
Их всех (и с ним) объединяет один фрагмент на 15 хр.

Оффлайн I2a1a

  • ...
  • Сообщений: 10999
  • Страна: ee
  • Рейтинг +755/-8
Re: Результаты Family Finder от FTDNA
« Ответ #86 : 12 Май 2010, 19:22:35 »
Вот 11 из 13 FF-кузенов моего родича.
Их всех (и с ним) объединяет один фрагмент на 15 хр.

А где именно на хромосоме? Дело в том, что 15 хромосома это одна из семи аутосомных хромосом (остальные -1,2,9,13,14,2) в которых детектировано присутствие обильного количества сегментных дупликаций в регионах рядом с теломером и центрометром хромосомы. Эти дупликации очень древнего происхождения, но алгоритм может ошибочно принимать эти дублированные сегменты, как свидетельство недавнего родства.

Вот работа, в которой объясняются нюансы
Цитировать
Here we present a finished sequence of human chromosome 15, together with a high-quality gene catalogue. As chromosome 15 is one of seven human chromosomes with a high rate of segmental duplication1, we have carried out a detailed analysis of the duplication structure of the chromosome. Segmental duplications in chromosome 15 are largely clustered in two regions, on proximal and distal 15q; the proximal region is notable because recombination among the segmental duplications can result in deletions causing Prader-Willi and Angelman syndromes2, 3. Sequence analysis shows that the proximal and distal regions of 15q share extensive ancient similarity4. Using a simple approach, we have been able to reconstruct many of the events by which the current duplication structure arose. We find that most of the intrachromosomal duplications seem to share a common ancestry. Finally, we demonstrate that some remaining gaps in the genome sequence are probably due to structural polymorphisms between haplotypes; this may explain a significant fraction of the gaps remaining in the human genome.

Оффлайн I2a1a

  • ...
  • Сообщений: 10999
  • Страна: ee
  • Рейтинг +755/-8
Re: Результаты Family Finder от FTDNA
« Ответ #87 : 12 Май 2010, 19:45:22 »
http://www.nature.com/nature/journal/v425/n6960/full/nature02055.html
Цитировать
Other notable regions of high sequence variation are located at 26.7–27.0 Mb, 57.4–57.5 Mb and 58.2–58.5 Mb on the short arm of the chromosome. Interestingly, all three regions contain segmental duplications, supporting the hypothesis that paralogous sequence variants may have been falsely identified as SNPs in dbSNP18, thereby increasing the apparent density of 'SNPs'.[/

Прямое доказательство того, что паралогии в сиквенсе и наличие дупликаций может ошибочно детектироваться как одиночной нуклеотидный полиморфизм, тем самым ошибочни увеличивается плотность снипов на сегменте. А последний фактор -плотность или вернее количество снипов на совпадающем сегменте является одним из 2 важных критериев для предиктов в RF и FF.
« Последнее редактирование: 12 Май 2010, 20:05:57 от Vadim Verenich »

Оффлайн Anode

  • Группа N
  • *
  • Сообщений: 1500
  • Страна: ca
  • Рейтинг +145/-0
  • PS1 -> TT1 -> EE1 -> PS2
  • Y-ДНК: N1c1
  • мтДНК: H10a1, U5b1
Re: Результаты Family Finder от FTDNA
« Ответ #88 : 12 Май 2010, 20:23:50 »
Мы целыми вечерами ломаем голову с кузенами - откуда общие упсы.
Вадим, ничего не скажете по хромосоме 17?
17 50783676 56805223 7.97 912

где у нас четверых один общий упс. 2 человека с родословными из Британии/Ирландии, один - из сев. Италии, имеющий 3 ветки из Словении (на пути торговых путей?), у него никого из ирландцев-британцев нет, хотя у человека (см упс выше) - есть ашкеназские (в добавок к большинству ирландских) корни. Подозреваю, что именно по ашкеназским у меня с ним пересечение. Хотя некоторые кузены-ирландцы клянутся-божатся, что все родственники не выезжали из нескольких мест из-под Глазго и из-под Ольстера, например вот этот:
4   5987776   11619218   8.11   864
4   31249544   35689206   3.97   666
(но здесь - вообще 4 хромосома, другой случай, не те четверо с 17й).

Это в фтдна.
В 23андме мы тоже с одной дамой из Словении гадаем - откуда общий упс на 5 хромосоме:
5 23000000 31000000 7 1344
(у неё все известные родственники из маленького городка, некоторые линии известны до 1700х, но есть дырки).

Что-то можете сказать специального по 17 и 5 хромосомам? По 4й?

Оффлайн I2a1a

  • ...
  • Сообщений: 10999
  • Страна: ee
  • Рейтинг +755/-8
Re: Результаты Family Finder от FTDNA
« Ответ #89 : 12 Май 2010, 20:52:46 »
Ваше совпадение на 17 хромосоме приходится на регион 17q21.31, там же где находится 900Kb полиморфизм инверсии. Этот полиморфизм присутствует примерно у 20% европейцев.

http://www.nature.com/ng/journal/v37/n2/abs/ng1508.html

Цитировать
A refined physical map of chromosome 17q21.31 uncovered a 900-kb inversion polymorphism. Chromosomes with the inverted segment in different orientations represent two distinct lineages, H1 and H2, that have diverged for as much as 3 million years and show no evidence of having recombined. The H2 lineage is rare in Africans, almost absent in East Asians but found at a frequency of 20% in Europeans, in whom the haplotype structure is indicative of a history of positive selection. Here we show that the H2 lineage is undergoing positive selection in the Icelandic population, such that carrier females have more children and have higher recombination rates than noncarriers.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100