АвторТема: Результаты Family Finder от FTDNA  (Прочитано 349358 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн I2a1a

  • ...
  • Сообщений: 10632
  • Страна: ee
  • Рейтинг +757/-8
Re: Результаты Family Finder от FTDNA
« Ответ #1560 : 27 Январь 2016, 16:23:57 »
У меня самого немного (всего два) примера, когда благодаря IBD-анализу (т.е изучению общих по происхождению) сегментов хромосом я нашел ранее неизвестных мне людей, с которыми удалось выйти на линию общих предков.

Первый пример - канадка, бабушка которой происходит из рода Качановских, а прабабушка Агафия Васильевна из рода Вереничей. Благодаря метрическим книгам я узнал, что наше реальное родство 5 поколений до общего предка (с учетом простейшей линии родства). На Gedmatch медианное значение степени вероятного родства -  4.4.

Ниже приводятся технические детали 3 совпадающих сегментов (как видите, все три сегмента проходят пороговые требования к  минимальному размеру (7 cM) и числу снипов (700) в  сегменте), и - что наиболее важно - все три находятся на разных хромосомах. Поскольку наследование каждого сегмента, то вероятности случайного (негенеалогического) совпадения этих сегментов перемножаются.

ChrStart LocationEnd LocationCentimorgans (cM)SNPs
432,232,22442,421,62513.21,115
78,295,40513,845,9899.8885
1136,784,44545,084,8788.0881

Largest segment = 13.2 cM
Total of segments > 7 cM = 30.9 cM
Estimated number of generations to MRCA = 4.4

 

Оффлайн Ya-nina

  • Сообщений: 213
  • Страна: by
  • Рейтинг +84/-4
  • Y-ДНК: R-YP1410 (отец),
  • мтДНК: HV2 (отец); V7а (я)
Re: Результаты Family Finder от FTDNA
« Ответ #1561 : 27 Январь 2016, 17:42:56 »
На тему еврейских совпаденцев (ашкенази).
Есть, например, у меня такой совпаденец (папа - еврей, мама -- ирландка). На ФТДНА 3-5 кузен, 8 сегментов, сумма 42.69 сМ. Совсем мелкие сегменты опускаю.

Chr.     Start Location                End Location               (cM)       SNPs
11   27451835      30151147      2.41      500
11   40345455      43471106      3.89      800
12   54388428      57269740      2.29      700
13   43809556      74903294      25.38      7600

на Гедматче
Сравнение 1:1
Largest segment = 23.9 cM
 Total of segments > 7 cM = 23.9 cM (в таблице – 41сМ)
 Estimated number of generations to MRCA = 4.6 (в общей таблице – 4,2)

В обозримом прошлом никаких пересечений пока не просматривается. Хотелось бы все-таки узнать поточнее -- учитывая специфику этноса -- насколько эта генетическая дистанция может соответствовать стандартной ситуации?

Оффлайн I2a1a

  • ...
  • Сообщений: 10632
  • Страна: ee
  • Рейтинг +757/-8
Re: Результаты Family Finder от FTDNA
« Ответ #1562 : 27 Январь 2016, 18:33:18 »
На тему еврейских совпаденцев (ашкенази).
Есть, например, у меня такой совпаденец (папа - еврей, мама -- ирландка). На ФТДНА 3-5 кузен, 8 сегментов, сумма 42.69 сМ. Совсем мелкие сегменты опускаю.

Chr.     Start Location                End Location               (cM)       SNPs
11   27451835      30151147      2.41      500
11   40345455      43471106      3.89      800
12   54388428      57269740      2.29      700
13   43809556      74903294      25.38      7600

на Гедматче
Сравнение 1:1
Largest segment = 23.9 cM
 Total of segments > 7 cM = 23.9 cM (в таблице – 41сМ)
 Estimated number of generations to MRCA = 4.6 (в общей таблице – 4,2)

В обозримом прошлом никаких пересечений пока не просматривается. Хотелось бы все-таки узнать поточнее -- учитывая специфику этноса -- насколько эта генетическая дистанция может соответствовать стандартной ситуации?

Точно неизвестно. Но реально значимый сегмент в совпадении у вас один - на 13 хромосоме. Проблема в том, что мы ничего не знаем о характере наследования этого участка - может быть это недавний кусок генома общего предка, cохранившийся после множества кроссинговеров. А может - консервативный фрагмент генома, находящийся под давлением естественного отбора (например, в этом сегменте находятся полезные гены иммунитета от некоторых заболеваний).

Вы спрсите меня: "А кто знает?" Да наверное, никто. До тех пор пока не будет изучена этногеномика условных популяций ваших условных предков.

Оффлайн dars

  • Сообщений: 506
  • Страна: se
  • Рейтинг +59/-0
  • Y-ДНК: N1c1-L708
  • мтДНК: U7, ММЖ: U8a1a
Re: Результаты Family Finder от FTDNA
« Ответ #1563 : 27 Январь 2016, 20:32:20 »
Точно неизвестно. Но реально значимый сегмент в совпадении у вас один - на 13 хромосоме. Проблема в том, что мы ничего не знаем о характере наследования этого участка - может быть это недавний кусок генома общего предка, cохранившийся после множества кроссинговеров. А может - консервативный фрагмент генома, находящийся под давлением естественного отбора (например, в этом сегменте находятся полезные гены иммунитета от некоторых заболеваний).

Вы спрсите меня: "А кто знает?" Да наверное, никто. До тех пор пока не будет изучена этногеномика условных популяций ваших условных предков.

а можно подробнее вот этот момент? как вы это видите?

Оффлайн I2a1a

  • ...
  • Сообщений: 10632
  • Страна: ee
  • Рейтинг +757/-8
Re: Результаты Family Finder от FTDNA
« Ответ #1564 : 27 Январь 2016, 22:35:38 »
Точно неизвестно. Но реально значимый сегмент в совпадении у вас один - на 13 хромосоме. Проблема в том, что мы ничего не знаем о характере наследования этого участка - может быть это недавний кусок генома общего предка, cохранившийся после множества кроссинговеров. А может - консервативный фрагмент генома, находящийся под давлением естественного отбора (например, в этом сегменте находятся полезные гены иммунитета от некоторых заболеваний).

Вы спрсите меня: "А кто знает?" Да наверное, никто. До тех пор пока не будет изучена этногеномика условных популяций ваших условных предков.

а можно подробнее вот этот момент? как вы это видите?

Так и вижу - подробное изучения аутосомного генофонда популяций

Оффлайн Ya-nina

  • Сообщений: 213
  • Страна: by
  • Рейтинг +84/-4
  • Y-ДНК: R-YP1410 (отец),
  • мтДНК: HV2 (отец); V7а (я)
Re: Результаты Family Finder от FTDNA
« Ответ #1565 : 27 Январь 2016, 23:29:10 »

Точно неизвестно. Но реально значимый сегмент в совпадении у вас один - на 13 хромосоме. Проблема в том, что мы ничего не знаем о характере наследования этого участка - может быть это недавний кусок генома общего предка, cохранившийся после множества кроссинговеров. А может - консервативный фрагмент генома, находящийся под давлением естественного отбора (например, в этом сегменте находятся полезные гены иммунитета от некоторых заболеваний).

Вы спрсите меня: "А кто знает?" Да наверное, никто. До тех пор пока не будет изучена этногеномика условных популяций ваших условных предков.

Этот сегмент на 13 хромосоме  я унаследовала от отца, правда, в каждом подобном случае у меня сегмент чуть-чуть, но увеличивается (?). И всех евреев, которые есть у меня в совпаденцах (а это из 34 стр. на ФТДНА -- пожалуй, половина) можно сгруппировать на расположению большого сегмента -- их 3 группы, на 3, 8 и 13 хромосоме. И на 13-й они все локализуются на одном участке в основном. Но в этнокалькуляторах  ашкеназов у меня нет.

Оффлайн Oleg Vladimirov

  • Сообщений: 400
  • Страна: ru
  • Рейтинг +605/-0
  • Y-ДНК: R1a1 - Y28938
  • мтДНК: МЖ - H23, ММЖ - H11a1, МЖМЖ - H2a2a1, МЖЖМЖ - U5a1d2b, дочь - H6a1a
Re: Результаты Family Finder от FTDNA
« Ответ #1566 : 28 Январь 2016, 01:47:16 »
Oleg Vladimirov,
Chr.     Start Location          End Location         (cM)       SNPs  ?

Если кратко, то Compare List 5+ сМ выдает 5 одиночных сегментов на 1-й (17.81 сМ), 2-й (8.97 сМ), 3-й (17.64 сМ), 4-й (7.13 сМ), 10-й (23.2 сМ) и 15-й (9,99 сМ) хромосомах.

Кстати если кому интересно, вот результаты сравнения результатов по 5-6 юродным родстенникам:

1) 5-юродный дядя и племянник:

Comparing Kit F418637 (Vladimir Klimin) and F250006 (Valentin Tsyganov)

Minimum threshold size to be included in total = 700 SNPs
Mismatch-bunching Limit = 350 SNPs
Minimum segment cM to be included in total = 7.0 cM

Largest segment = 15.3 cM
Total of segments > 7 cM = 15.3 cM
Estimated number of generations to MRCA = 4.9

В FTDNA - всего 42.70 cM, Longest Block: 16.00 cM.

2) 6-юродные братья:

Comparing Kit F344702 (Roman Kozikhin) and F250006 (Valentin Tsyganov)

Minimum threshold size to be included in total = 700 SNPs
Mismatch-bunching Limit = 350 SNPs
Minimum segment cM to be included in total = 7.0 cM

Largest segment = 14.8 cM
Total of segments > 7 cM = 36.4 cM
Estimated number of generations to MRCA = 4.3

В FTDNA - всего 47.50 cM, Longest Block: 14.41 cM.

Оффлайн автоха

  • Сообщений: 368
  • Страна: ru
  • Рейтинг +51/-0
  • Y-ДНК: R1a1a z92
Re: Результаты Family Finder от FTDNA
« Ответ #1567 : 28 Январь 2016, 17:11:43 »


Кстати если кому интересно, вот результаты сравнения результатов по 5-6 юродным родстенникам:



Comparing Kit F344702 (Roman Kozikhin) and F250006 (Valentin Tsyganov)



Вообще мои исследования и результаты ДНК-тестов показывают, что большинство местных родов с большой долей вероятности были именно русского происхождения, потомки русских переселенцев из других регионов России...

F344702 F2 L  M   I1a   A 14.6 8.9 6.1   X 0 0   Roman Kozikhin

Возможно  мои татарские кузены объясняются именно такими миграциями

Оффлайн vnik

  • Сообщений: 242
  • Страна: de
  • Рейтинг +23/-0
  • мтДНК: H16
Re: Результаты Family Finder от FTDNA
« Ответ #1568 : 28 Январь 2016, 21:51:03 »
Кстати если кому интересно, вот результаты сравнения результатов по 5-6 юродным родстенникам:
В FTDNA - всего 42.70 cM, Longest Block: 16.00 cM.
В FTDNA - всего 47.50 cM, Longest Block: 14.41 cM.

Можете подсказать, когда были рождены общие предки по указанным выше примерам?

Оффлайн Oleg Vladimirov

  • Сообщений: 400
  • Страна: ru
  • Рейтинг +605/-0
  • Y-ДНК: R1a1 - Y28938
  • мтДНК: МЖ - H23, ММЖ - H11a1, МЖМЖ - H2a2a1, МЖЖМЖ - U5a1d2b, дочь - H6a1a
Re: Результаты Family Finder от FTDNA
« Ответ #1569 : 28 Январь 2016, 22:00:32 »
Можете подсказать, когда были рождены общие предки по указанным выше примерам?
1) Климентий Федоров (1773-1848) и Агафья Фокеева (1774-1843);
2) Козихин Евдоким Герасимов (1764-1833) и Татьяна Васильева (1760-1818).

Оффлайн smolinsky

  • Сообщений: 108
  • Страна: ru
  • Рейтинг +18/-0
  • u r not me
  • Y-ДНК: N-M232
  • мтДНК: H24A
Re: Результаты Family Finder от FTDNA
« Ответ #1570 : 01 Февраль 2016, 20:02:14 »
Можете подсказать, когда были рождены общие предки по указанным выше примерам?
1) Климентий Федоров (1773-1848) и Агафья Фокеева (1774-1843);
2) Козихин Евдоким Герасимов (1764-1833) и Татьяна Васильева (1760-1818).
А реальное число поколений какое? Не пять же по пятьдесят лет?

Оффлайн Oleg Vladimirov

  • Сообщений: 400
  • Страна: ru
  • Рейтинг +605/-0
  • Y-ДНК: R1a1 - Y28938
  • мтДНК: МЖ - H23, ММЖ - H11a1, МЖМЖ - H2a2a1, МЖЖМЖ - U5a1d2b, дочь - H6a1a
Re: Результаты Family Finder от FTDNA
« Ответ #1571 : 01 Февраль 2016, 20:41:28 »
А реальное число поколений какое? Не пять же по пятьдесят лет?
Не понял вопроса. По 1 примеру ДНК взят у шестиюродных братьев 1949 и 1961 г.р.
По 2 примеру у пятиюродного дяди 1930 г.р. и его пятиюродного племянника 1949 г.р.

Оффлайн smolinsky

  • Сообщений: 108
  • Страна: ru
  • Рейтинг +18/-0
  • u r not me
  • Y-ДНК: N-M232
  • мтДНК: H24A
Re: Результаты Family Finder от FTDNA
« Ответ #1572 : 01 Февраль 2016, 21:46:54 »
А реальное число поколений какое? Не пять же по пятьдесят лет?
Не понял вопроса. По 1 примеру ДНК взят у шестиюродных братьев 1949 и 1961 г.р.
По 2 примеру у пятиюродного дяди 1930 г.р. и его пятиюродного племянника 1949 г.р.
Gedmatch предсказал 4,9 и 4,3 поколения до общего предка в первом и втором случае соответственно. А в реальности какое количество поколений до общего предка в обоих случаях?
Я сморю по метрическим книгам и часто поколение  даже меньше двадцати лет, а племянники старше дядей.

Оффлайн smolinsky

  • Сообщений: 108
  • Страна: ru
  • Рейтинг +18/-0
  • u r not me
  • Y-ДНК: N-M232
  • мтДНК: H24A
Re: Результаты Family Finder от FTDNA
« Ответ #1573 : 01 Февраль 2016, 21:52:00 »
И еще, у меня есть два совпаденца, с дистанцией в 5 поколений (судя по gedmatch) и у каждого из них протестирован родитель. Почему в обоих случаях дистанция до общего предка на несколько десятых у меня меньше с детьми, но не с родителями?

Оффлайн FELIX

  • Сообщений: 2987
  • Страна: ru
  • Рейтинг +991/-4
  • Y-ДНК: R-YP569
  • мтДНК: U5a1a1b
Re: Результаты Family Finder от FTDNA
« Ответ #1574 : 01 Февраль 2016, 23:10:29 »
Если родственники шестиюродные и пятиюродные, то сколько будет поколений до общего предка?  ;D
180 лет на 5-6 поколений - это нормально. У меня 13 поколений за 400 лет - примерно такой же интервал на поколение.

И еще, у меня есть два совпаденца, с дистанцией в 5 поколений (судя по gedmatch) и у каждого из них протестирован родитель. Почему в обоих случаях дистанция до общего предка на несколько десятых у меня меньше с детьми, но не с родителями?

Как вариант: сегменты не только делятся, но ещё и суммируются: родителей то двое. У меня лично есть такое пересечение - из 4 значимых сегментов один оказался по линии второго родителя, но родство было определено верно (по средней величине интервала).

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100