АвторТема: Филогенетическое древо гаплогруппы I1 (TNT)  (Прочитано 44158 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Аббат БузониАвтор темы

  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 19334
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1395/-56
  • Y-ДНК: I1a2a1a3a1a1a-YP1084+
  • мтДНК: H16
Он-лайн дерево I1 можно увидеть здесь - ссылка
« Последнее редактирование: 18 Май 2012, 22:00:17 от Аббат Бузони »

Оффлайн Alexander

  • Сообщений: 669
  • Рейтинг +73/-0
  • Y-ДНК: J2b
Re: Филогенетическое древо гаплогруппы I1 (TNT)
« Ответ #1 : 19 Февраль 2010, 22:43:26 »
Благодаря Оводу, имею возможность анализировать дерево I1, построенное в программе TNT, за что ему огромное спасибо.
Просматривается 4 ветви.
Скажите, на что Вы укореняете I1-дерево ТНТ?

Оффлайн Аббат БузониАвтор темы

  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 19334
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1395/-56
  • Y-ДНК: I1a2a1a3a1a1a-YP1084+
  • мтДНК: H16
Re: Филогенетическое древо гаплогруппы I1 (TNT)
« Ответ #2 : 19 Февраль 2010, 22:51:22 »
Пока без укоренений, но опыт говорит о том, что достаточно добавить гаплотипы братских кладов.

Если Овод будет любезен, то это дело мы провернем, но пока цель иная, посмотреть как нынешняя классификация кладов I1 соответствует древу TNT. Определенные корреляции есть, но есть и вопросы.

Оффлайн Овод

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 2158
  • Рейтинг +390/-3
  • Omnia mea mecum porto
  • Y-ДНК: R1a-M198
  • мтДНК: U4a
Re: Филогенетическое древо гаплогруппы I1 (TNT)
« Ответ #3 : 19 Февраль 2010, 23:03:57 »
Пока без укоренений, но опыт говорит о том, что достаточно добавить гаплотипы братских кладов.

Я же Вашу выборку укоренял, Аббат. По модалу R1a. Поскольку не знал, какой гаплогруппы ваша выборка (хотя подозревал I1) то укоренил по заведомо постороннему для неё субкладу (так как видел, что она не R1a).
 
ТNT без укорениения не работает. Постороннего я отрезал, но корень от него на пересечении с вашей выборкой оставил. Так что всё путём.
 
Для вашей выборки в 900 человек вообще можно брать любого постороннего - дерево и возраста на нём заведомо не изменятся. Главное - чтобы не "своего".

Оффлайн Аббат БузониАвтор темы

  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 19334
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1395/-56
  • Y-ДНК: I1a2a1a3a1a1a-YP1084+
  • мтДНК: H16
Re: Филогенетическое древо гаплогруппы I1 (TNT)
« Ответ #4 : 19 Февраль 2010, 23:26:46 »
Спасибо за помощь, Игорь.

Интересен возраст I1 - 6000 лет, возникает вопрос к методике расчета возраста по АК.

Интересно было бы прогнать эту же выборку (или улучшенную, без дублей и 37-ми маркерных с укоренением) и в Мурке. Ну и сравнить оба древа.
« Последнее редактирование: 19 Февраль 2010, 23:58:59 от Аббат Бузони »

Оффлайн Овод

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 2158
  • Рейтинг +390/-3
  • Omnia mea mecum porto
  • Y-ДНК: R1a-M198
  • мтДНК: U4a
Re: Филогенетическое древо гаплогруппы I1 (TNT)
« Ответ #5 : 20 Февраль 2010, 01:58:49 »
37- маркерные занижают возраст, я писал. Не думаю, что намного, но лучше их убрать, как и дубли, которые ещё более занижают.
 
При том учтите, что это не возраст ответвления I1 от I. И даже не возраст снипа. Это - возраст последнего предка этой выборки, BБОП.
 
А что и как у АК получалось?

Оффлайн I2a1a

  • ...
  • Сообщений: 10999
  • Страна: ee
  • Рейтинг +755/-8
Re: Филогенетическое древо гаплогруппы I1 (TNT)
« Ответ #6 : 20 Февраль 2010, 02:11:30 »
Спасибо за помощь, Игорь.

Интересен возраст I1 - 6000 лет, возникает вопрос к методике расчета возраста по АК.

Интересно было бы прогнать эту же выборку (или улучшенную, без дублей и 37-ми маркерных с укоренением) и в Мурке. Ну и сравнить оба древа.

Можно.
Уберите дубли (хотя в Мурке их можно обозначить префиксом n@, тогда Мурка не будет их учитывать при расчете ро). 37 маркерные нужно убрать по любому, так как Мурка работает с гаплотипами одной длины.

Оффлайн Овод

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 2158
  • Рейтинг +390/-3
  • Omnia mea mecum porto
  • Y-ДНК: R1a-M198
  • мтДНК: U4a
Re: Филогенетическое древо гаплогруппы I1 (TNT)
« Ответ #7 : 20 Февраль 2010, 02:27:08 »
Ну Вам, Вадим, как лучшему из нас знатоку Мурки и карты в руки. Надо помочь братскому для Вас субкладу. То бишь - сестринской гаплогруппе.  :)
 
А результаты действительно интересно сравнить.

Оффлайн Аббат БузониАвтор темы

  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 19334
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1395/-56
  • Y-ДНК: I1a2a1a3a1a1a-YP1084+
  • мтДНК: H16
Re: Филогенетическое древо гаплогруппы I1 (TNT)
« Ответ #8 : 20 Февраль 2010, 02:30:01 »
Хорошо я так и сделаю. Только вместо 37-ми маркерных вставлю 67-ми маркерные, например Абдуллаева (про которого забыл совсем), Кена, Илмари и т.д., но общее число не будет превышать 900.

Задача минимум по определению места русских I1 на дереве решена, двигаемся дальше.

 

Оффлайн nieswicz

  • Сообщений: 41
  • Рейтинг +7/-0
  • Fuimus
  • Y-ДНК: I1*
  • мтДНК: T2b2
Pastor,

moy vopros skoree vsego tekhnicheskiy, khotia sviazannyi s popytkami postroenia dreva dla vyborki 67-markerovykh gaplotipov "crispincousins" (znaete, eto sumashedshie, kotorye veriat, chto proizkhodiat ot Ragnara Lodbroka, v tom chisle i ya  :D).

Khotel by postroit drevo s pomoshchiu programmy TNT, no ne ochen' mne poniatno, kak s faila Excel s Y-STR poluchit' vkhodnoi fail v TNT.

Est u Vas retsept na takoe deistvie? (Imeyu v vidu ssylka na stranitsu web s "operational mode")

Budu blagodaren zaranee i esli udastsa pererabotat' moi gaplotipy (kstati, sredi nikh est' i Vash), vkhodnye danny i rezultaty budut dostupny vsem, kto zakhochet.
Eto pomogloby mne sravnit' takoe drevo s rezul'tatom Network'a, kotoryi u menia uzhe est.
S uvazheniem

Оффлайн garei

  • Сообщений: 216
  • Рейтинг +15/-7
  • Y-ДНК: I1
А как посмотреть это дерево и если там гаплотипы из проекта Tatarstan?

Оффлайн I2a1a

  • ...
  • Сообщений: 10999
  • Страна: ee
  • Рейтинг +755/-8
Pastor,

moy vopros skoree vsego tekhnicheskiy, khotia sviazannyi s popytkami postroenia dreva dla vyborki 67-markerovykh gaplotipov "crispincousins" (znaete, eto sumashedshie, kotorye veriat, chto proizkhodiat ot Ragnara Lodbroka, v tom chisle i ya  :D).

Khotel by postroit drevo s pomoshchiu programmy TNT, no ne ochen' mne poniatno, kak s faila Excel s Y-STR poluchit' vkhodnoi fail v TNT.

Est u Vas retsept na takoe deistvie? (Imeyu v vidu ssylka na stranitsu web s "operational mode")

Budu blagodaren zaranee i esli udastsa pererabotat' moi gaplotipy (kstati, sredi nikh est' i Vash), vkhodnye danny i rezultaty budut dostupny vsem, kto zakhochet.
Eto pomogloby mne sravnit' takoe drevo s rezul'tatom Network'a, kotoryi u menia uzhe est.
S uvazheniem

Да, присылайте файл в Excel. Я его "конвертирую" в TNT формат.

Оффлайн Аббат БузониАвтор темы

  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 19334
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1395/-56
  • Y-ДНК: I1a2a1a3a1a1a-YP1084+
  • мтДНК: H16
Что-то я упустил сообщение Леха из виду.:)

Если Вадим конвертирует, то мы попросим Овода посчитать дерево.

Оффлайн Аббат БузониАвтор темы

  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 19334
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1395/-56
  • Y-ДНК: I1a2a1a3a1a1a-YP1084+
  • мтДНК: H16
Гаут, Вы на дереве к потомку G.Teichert из Бранденбурга общий предок жил 2070 лет назад.

Оффлайн nieswicz

  • Сообщений: 41
  • Рейтинг +7/-0
  • Fuimus
  • Y-ДНК: I1*
  • мтДНК: T2b2
Eto vyborka 232 gaplotipov po familiam sviazannym s gruppoi tzv. "crispincousins". Bolshinstvo sviazano s tipichno anglo-normandskimi rodami prishedshimi v Angliu s Vilgel'mom Bastardom ("Ubliudkom"?). Tam gde rodoslov imeet znachenie, ya dal korotkuyu zapisku. Prilozhil tozhe kody kakimi dannye gaplotipy oboznacheny v semeynykh proektakh np. Harris'ov, Hamilton'ov, Gordon'ov. Proveril takzhe FTDNA I1 Project na schyot gaplogruppy po snipam i gde taka informatsia byla, tozhe prilozhil.

Pri postroyke dreva v Networke polzovalsia vesami poluchenymi s "standard deviation" populatsionnoy, kotoruyu perevernul v vesy ot 1= samaya vysokaya standart deviation do 99=samaya nizkaya st.dev. Ne znayu, v TNT vesy upotreblyayutsia, no po Networku s ikh upotrebleniem drevo vygladit krasivee. Ischezayut "kletochki" pochti sovsem.
Kogda u Vas chto-to poluchitsya s konversiey v format TNT, soobschchite. Dumayu esli odin iz spetsialistov na Vashem sayte smozhet peregonit etu vyborku, tak budet zdorrovee. Ya mogu prilozhit' eshche faili Networka dla sdelania benchmarka. S uvazheniem Lekh

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100