В России нет таких лабораторий.
Даже генетики отправляют за рубеж образцы.
странно, что сие написано в июле 2020 г. Понимаю, Владимир, Вы бы написали это лет 5 назад. Не в лесу же живете, постоянно работаете с томской лабораторией, да и с нами вроде дружите.
Мы не нарушаем установленного МЗ порядка. У нас все делается в России. И экзомы, и 10+Мб Y (собственная разработка), и чипы ильюмины (куда большего объема, чем в коммерции), и панели снипов малого размера (мы пользуемся OpenArray, на смену старому мультиплексу, делаем порядка 700 Y-SNP рутинным образом всем образцам сами).
Все это доступно например в Мск. Полные геномы - дороже, чем заграницей, это правда. Но коммерчески доступны и человеку с улицы.
Вопрос топика был конкретный - есть ли в России коммерческие компании вроде FT. Нет, и это не секрет. Тем более нету контор all-in-one. Но услуги все эти есть - и для людей с улицы, и для научных целей. Вам нужен геном определенным образом отсеквенированный и собранный - договаривайтесь, найдете все, главное точно понимать у кого искать и представлять что хотите. Out of the box - нет такого. Все - сделай сам! Если вы не знаете азов ngs, не можете сформулировать исполнителю что вам от него надо, какие нужны таргеты, и у вас нет под рукой сервера с бва и самтулзами - увы, получите кота в мешке в лучшем случае. Для полного генома это кстати не только в России так - за надлежащее качество придется переплатить. Сколько - уже вопрос обсуждаемый, ит депендз. Почитал в соответствующих ветках, как ведут себя с клиентами Nebula и Dante - это свинство, пародия на работу за деньги. По своему опыту - не помню, чтобы исполнитель позволил себе хоть десятую долю подобного хамства - не отвечать на письма! Обсуждаются библиотеки, корректируется все как надо, вовремя заливаются результаты на сервер, какой я укажу, переделываются сбойные образцы. Не дозволяйте исполнителю общаться с вами, как советский врач с советским пациентом - то есть как с бесправным ребенком! Выбирайте конторы, которые могут сделать то, что вам нужно за оговоренную сумму, и отвечают за свою работу. Заранее требуйте файл таргетов (обязательных, опциональных итд - исполнитель может что-то не гарантировать), оговаривайте покрытие (цена от этого зависит, да), сроки, переделку сбойных образцов.