Ветвь Венедов (Ve) YP569+

[Lesla]

Добавил.

Кто-то точно учитывал DYS464 (сходу не вспомню, кто публиковал дерево как красивую картинку 10-мегабайтного размера?). Причём у меня учитывал как 12-12-14-14.

Спасибо!

У нас деревьями R1a1 сейчас занимаются Овод (Игорь), VVR (Владимир), mouglley (Виктор), Semargl (Владимир).
Интересно будет узнать мнение их и других филогенистов об использование DYS464.

[mladshij]

Кстати, на 37 маркерах у меня с моим троюродным братом 3 шага (дупликацию в 464 считаю как 1 шаг). Что-то многовато... Надо будет его проапгрейдить и посмотреть что в других маркерах...

[Semargl]

149865 - Ejsmond заказал апгрейд 67->111
Часть маркеров готова.

[VVR]

Добавил.

Кто-то точно учитывал DYS464 (сходу не вспомню, кто публиковал дерево как красивую картинку 10-мегабайтного размера?). Причём у меня учитывал как 12-12-14-14.

Неправильно учитывали. Для филогенических деревьев правильно в данном случае брать 12-14-14-16.
У Вас с троюродным братом действительно три мутации. Наиболее вероятный вариант - от общего предка(прадеда) в Вашей линии две мутации за три поколения (464,442), в линии брата - 1 мутация за три поколения (389-2). Другие варианты очень маловероятны.
Советую обязательно оставить оба гаплотипа, а для поиска в YSearch внести гаплотип прадеда:
389-2 = 30
464    =12-14-14-16
442    =14

[VVR]

Добавил.

Кто-то точно учитывал DYS464 (сходу не вспомню, кто публиковал дерево как красивую картинку 10-мегабайтного размера?). Причём у меня учитывал как 12-12-14-14.

Спасибо!

У нас деревьями R1a1 сейчас занимаются Овод (Игорь), VVR (Владимир), mouglley (Виктор), Semargl (Владимир).
Интересно будет узнать мнение их и других филогенистов об использование DYS464.

Очень желательно учитывать - это ведь дополнительная информация, но учитывать правильно, понимая смысл, индивидуально подходить к каждому необычному значению. Если человек не понимает о чём речь, то лучше не учитывать. С деревьями Семаргла не разбирался, а Овод и Маугли автоматически обрезают 6,7-копийные 464-е до a,b,c,d, что не всегда правильно и может вносить некоторые ошибки в месте гаплотипа на дереве(как правило внутри ветви). Естественно, это не от непонимания, а от того, что гаплотипов тысячи и разобраться с каждым индивидуально никакого времени не хватит. Я бы для таких больших деревьев рекомендовал давать для DYS464 минимальные веса, чтобы уменьшить возможность подобных неточностей.

[mouglley]

С деревьями Семаргла не разбирался, а Овод и Маугли автоматически обрезают 6,7-копийные 464-е до a,b,c,d, что не всегда правильно и может вносить некоторые ошибки в месте гаплотипа на дереве(как правило внутри ветви). Естественно, это не от непонимания, а от того, что гаплотипов тысячи и разобраться с каждым индивидуально никакого времени не хватит.

Со мной не совсем верно.
Я, в основном, работаю с N1, a у нас, как известно, в DYS464 делеция (только у 2% из нас, причём, у несвязанных веток,  имеется дупликация,  то есть вместо 2-х повторений, возникает 3 повторения), то есть, 2 маркера для большинства гаплотипов учитываются мною, как 4.
Естественно поэтому, ошибка в филогении по DYS464 для N1 составляет 1/2 (50%), а не 1/16 (94%), как для других гаплогрупп.
Для филогении N1 я считаю это приемлемым.

[Semargl]

Овод и Маугли автоматически обрезают 6,7-копийные 464-е до a,b,c,d, что не всегда правильно и может вносить некоторые ошибки в месте гаплотипа на дереве(как правило внутри ветви).

Аналогично.

Естественно, это не от непонимания, а от того, что гаплотипов тысячи и разобраться с каждым индивидуально никакого времени не хватит.

Все верно. Тем более выборки динамичные. Постоянно добавляются новые гаплотипы, обновляются существующие.

VVR правильно подметил, что ошибки, если и возникают, то в основном внутри ветвей, влияя только на расположение такого гаплотипа на ветке.
Подумываю попробовать исключить 464 из построений. Посмотрим что выйдет.

[mladshij]

У Вас с троюродным братом действительно три мутации. Наиболее вероятный вариант - от общего предка(прадеда) в Вашей линии две мутации за три поколения (464,442), в линии брата - 1 мутация за три поколения (389-2). Другие варианты очень маловероятны.
Советую обязательно оставить оба гаплотипа, а для поиска в YSearch внести гаплотип прадеда:
389-2 = 30
464    =12-14-14-16
442    =14

Я хочу попозже брату сделать апгрейд 37 -> 67 (а потом и до 111). Как сделаю, так тогда и можно будет гаплотип прадеда сформировать. А то вдруг там ещё расхождения есть...

[Yurgan]

У Вас с троюродным братом действительно три мутации. Наиболее вероятный вариант - от общего предка(прадеда) в Вашей линии две мутации за три поколения (464,442), в линии брата - 1 мутация за три поколения (389-2). Другие варианты очень маловероятны.
Советую обязательно оставить оба гаплотипа, а для поиска в YSearch внести гаплотип прадеда:
389-2 = 30
464    =12-14-14-16
442    =14

Я хочу попозже брату сделать апгрейд 37 -> 67 (а потом и до 111). Как сделаю, так тогда и можно будет гаплотип прадеда сформировать. А то вдруг там ещё расхождения есть...

А брат двоюродный?

[mladshij]

А брат двоюродный?

Троюродный. Я об этом выше писал 

[mladshij]

Советую обязательно оставить оба гаплотипа, а для поиска в YSearch внести гаплотип прадеда:
389-2 = 30
464    =12-14-14-16
442    =14

Сделал, кстати, я такой синтетический гаплотип. Если кому-то нужен для коллекции номер, то вот: 88PUT.

Y-search в итоге выдаёт (сортирую по степени приближённости и выкидываю синтетические гаплотипы):
1. 188350 Данилевич 14/67
2-3. 152901 Анисимков 19/76
2-3. 152908 Рудич 17/68
4-8. 219661 Павилюнас 17/67
4-8. 93478 Останин 17/67
4-8. 152864 Василевич 17/67
4-8. 91542 Уваркин 17/67
4-8 154798 Рудзецкий 17/67
дальше начинаются все подряд и лучше уже не пытаться смотреть. Как и раньше: лидер - Данилевич, русских - только половина.

[mladshij]

Продолжаю сравнивать близкородственных венедов 188231 и 188784.

Помимо уже известного отличия в 3 мутации на 37 маркерах нашёл ещё одно.

тест DYF399X показывает:
188231 - 21t-21t-23c-26.1t
188784 - 22t-23c-26.1t

То есть кроме дупликации, которая удвоила часть маркеров в регионе P1/P2, ещё и произошло изменение 22t -> 21t в DYF399 (считаю предковым значением именно 22t, так как все венеды, которые делали DYF399X имеют там 22t или 23t). Причём получается, что сначала изменилось 22t -> 21t, а только потом (в следующем поколении?) прошла дупликация.

Что-то многовато мутаций для столь близких родственников. Заказал для 188784 апгрейд 37 -> 67. Может там ещё расхождений добавиться?

[VVR]

В маркере DYF399 каждая копия мутирует быстро, а учитывая. что их обычно три ( при Р1/Р2 дупликации - 4, при Р1/Р2 делеции - 2), то частота мутаций всего маркера возрастает примерно в 3 раза. Маркер не просто быстрый, а супербыстрый. Например, по почти 2 тыс. пар отец-сын, исследованым на этот маркер, я видел в двух парах по две мутации между отцом и сыном (на разных копиях конечно, т.е. мутации независимые).
Поэтому, ничего удивительного, что у Вас 2 мутации с троюродным братом.  Причём предковое значение для Вас двоих могло быть и 21, и 22. Маркер то очень быстрый, мутирует часто.Так что, всё нормально.

[Centurion]

Маркер то очень быстрый, мутирует часто.Так что, всё нормально.

Он самый быстромутирующий из всех известных на сегодня СТР маркеров. По парам отец-сын 139 мутаций на 1794 мейоза.

[Sanders76]

Добрый вечер!
Подскажите, пожалуйста, где можно посмотреть свое расположение на ветви Венедов?
(Потапов, FTDNA 214039)