Филогенетический анализ гаплогруппы C2b-F1067

[rozenblatt]

https://www.nature.com/articles/s10038-020-0775-1

Article
Published: 19 May 2020

Phylogenetic analysis of the Y-chromosome haplogroup C2b-F1067, a dominant paternal lineage in Eastern Eurasia

Qiao Wu, Hui-Zhen Cheng, Na Sun, Peng-Cheng Ma, Jin Sun, Hong-Bing Yao, Yong-Mei Xie, Yong-Lan Li, Song-Lin Meng, Maxat Zhabagin, Yan-Huan Cai, Da-Ru Lu, Shi Yan & Lan-Hai Wei

Journal of Human Genetics (2020)Cite this article

Abstract

Human Y-chromosome haplogroup C2b-F1067 is one of the dominant paternal lineages of populations in Eastern Eurasia. In order to explore the origin, diversification, and expansion of this haplogroup, we generated 206 new Y-chromosome sequences from C2b-F1067 males and coanalyzed 220 Y-chromosome sequences of this haplogroup. BEAST software was used to reconstruct a revised phylogenetic tree of haplogroup C2b-F1067 with age estimates. The revised phylogeny of C2b-F1067 included 155 sublineages, 1986 non-private variants, and >6000 private variants. The age estimation suggested that the initial splitting of C2b-F1067 happened at about 32.8 thousand years ago (kya) and the major sublineages of this haplgroup experienced continuous expansion in the most recent 10,000 years. We identified numerous sublineages that were nearly specific for Korean, Mongolian, Chinese, and other ethnic minorities in China. In particular, we evaluated the candidate-specific lineage for the Dayan Khan family and the Confucius family, the descendants of the ruling family of the Chinese Shang dynasty. These findings suggest that ancient populations with varied C2b-F1067 sublineages played an important role during the formation of most modern populations in Eastern Eurasia, and thus eventually became the founding paternal lineages of these populations.

Аннотация
Гаплогруппа человеческой Y-хромосомы C2b-F1067 является одной из доминирующих отцовских линий населения в Восточной Евразии. Для изучения происхождения, диверсификации и распространения этой гаплогруппы нами было сгенерировано 206 новых Y-хромосомных последовательностей у мужчин с C2b-F1067 и совместно проанализировано 220 Y-хромосомных последовательностей этой гаплогруппы. Программа BEAST была использована для реконструкции пересмотренного филогенетического дерева гаплогруппы C2b-F1067 с оценками возраста. Пересмотренная филогения C2b-F1067 включала 155 подлиний, 1986 не частных вариантов и> 6000 частных вариантов. Оценка возраста показала, что первоначальное расщепление C2b-F1067 произошло примерно 32,8 тысячи лет назад (kya), и основные сублинии этой гаплогруппы испытали непрерывное расширение в последние 10 000 лет. Мы выявили многочисленные подлинии, которые были почти специфичны для корейцев, монголов, китайцев и других этнических меньшинств Китая. В частности, мы оценивали родословную конкретного кандидата для семьи Даян-Хана и семьи Конфуция, потомков правящей семьи китайской династии Шан. Эти находки позволяют предположить, что древние популяции с различными подлиниями C2b-F1067 играли важную роль в формировании большинства современных популяций Восточной Евразии, и, таким образом, в конечном итоге, стали основополагающими отцовскими линиями этих популяций.

[Yaroslav]

In order to explore the origin, diversification, and expansion of this haplogroup, we generated 206 new Y-chromosome sequences from C2b-F1067 males and coanalyzed 220 Y-chromosome sequences of this haplogroup.

Жаль, что публикация закрыта. Интересно, какие методы для определения происхождения гаплогруппы использовали авторы, и какие результаты получили.

UPD: Хотя, возможно имеется в виду время происхождения, а не место, как подумал я.

[sahaliyan]

There are only 6 star-like clusters in western Zhou period each make up more than 0.5% of Chinese population,N-CTS1350(subclade F1998),O-F4249,0-F1273,O-F700,C-F13136,Q-F5346
In my opinion,CTS1350 is Zhou Taiwang,F1998 is Zhou Wenwang(King Wen of Zhou)，CTS1350 make up 0.3%,F1998 make up 0.7%,total 1% Chinese males.Both CTS1350 and F1998 are star like and widely spread in northern China,also fit for the early Zhou history
C-F13136 is the royal family of Song state,Song is the descendants of royal family of Shang dynasty(F10036),Confucius is a descendant of Song royal family,and his family is a subclade of F13136.F13136 mainly found in modern Henan and Shandong
O-F4249 is the royal family of Chen state,the ancestor of this family married the daughter of Zhou Wuwang(king Wu of Zhou,the son of King Wen of Zhou),later one  branch of this family usurped the throne of Qi state,one of the seven warring states
There are two subclades of F1273,one is F25545,one is MF14479,F25545 probably is the royal house of Zhao,highest in Shanxi and Hebei.MF14479 is royal house of Qin,highest in Shaanxi and Henan.Zhao and Qin are two states in warring state period,later Qin Shihuang end the warring state,founded the Qin dynasty
O-F700 maybe Jiang family,who are close ally of the Zhou royal family and provide Queens for Zhou Kings,one branch of Jiang family founded Qi state in Shandong,later the throne usurped by the Chen family,this haplogroup is higher in northwest China and Shandong
F5346,not sure,however the royal house of Song dynasty belong to the downstream of this haplogroup,Song was conquered by the Mongols,one Azeri in YFULL also belong to this haplogroup