Добрый день!
Открыл в Экселе 15-мегабайтный файл своего аутосомного анализа в формате 37 (от FTDNA), и с удивлением обнаружил там 179 штук таких SNP, где в поле Хромосома указано "МТ" (а в названии, т.е. RSID, часто есть слово Mito)
Вот примеры:
RSID, CHROMOSOME, POSITION, RESULT
MitoT217C,MT,217,TT
200610-105,MT,236,TT
MitoT491C,MT,489,TT
2010-08-MT-723,MT,513,GG
2010-08-MT-729,MT,523,AA
2010-08-MT-830,MT,711,TT
1SNP794FT_A,MT,794,AA
1SNP825FT_A,MT,825,TT
200610-75,MT,951,GG
MitoC1050T,MT,1048,CC
rs267606618,MT,1095,TT
Я примерно догадываюсь, откуда эти данные - на чип ведь попадают все ошметки от раздербаненной клетки, там и ядерный ДНК, и митохондрии, и куча мусора типа обломков других органелл.
У меня два вопроса:
1. Насколько точны эти данные, это реально SNP моей митохондриальной ДНК?
2. Как мне по этим данным понять примерную митохондриальную гаплогруппу? Я видел где-то аналогичный софт или сервис для Y-хромосомы. У некоторых фирм (не FTDNA) в аутосомном файле есть SNP Y-хромосом, и по SNP можно примерно определить гаплогруппу (хотя и не так точно как по STR, потому что STR мутируют часто, а SNP редко).