АвторТема: FTDNA  (Прочитано 677476 раз)

varang, Roaring и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн ochkas

  • Сообщений: 330
  • Страна: ru
  • Рейтинг +119/-0
  • FTDNA: 634321
    • Ochkas DNA
  • Y-ДНК: R1a-L1029-Y128286 (UKR)
  • мтДНК: U3a3b (BLR)
Re: FTDNA
« Ответ #10770 : 15 Апрель 2019, 09:35:04 »
Кто-нибудь пробовал уже вытащить данные по Y и mito из нового GSA файла?
« Последнее редактирование: 15 Апрель 2019, 09:59:36 от ochkas »

Оффлайн Панк

  • Сообщений: 1032
  • Страна: ua
  • Рейтинг +424/-1
  • Y-ДНК: R-M198 [RUS]
  • мтДНК: H [UKR]
Re: FTDNA
« Ответ #10771 : 15 Апрель 2019, 10:07:53 »

Посмотрел в Экселе - там есть 571 снип для хромосомы, обозначенной как XY и 194 снипов MT

А как вытащить данные по У ??

В Экселе нашел снипы гг  А, J  (судя по всему отрицательные)
Искал снипы R1a-M198 и одноуровневые - не нашел (( проверял в результатах ФФ у кого сделан У-12 (R1a-M198)

Оффлайн piccolodrago

  • Сообщений: 93
  • Страна: ru
  • Рейтинг +12/-0
  • мтДНК: H6a1a
Re: FTDNA
« Ответ #10772 : 15 Апрель 2019, 12:59:43 »
А как понять, на каком чипе делались последние тесты?

Оффлайн rmk

  • Сообщений: 169
  • Страна: ru
  • Рейтинг +110/-30
Re: FTDNA
« Ответ #10773 : 15 Апрель 2019, 18:15:05 »
А как понять, на каком чипе делались последние тесты?
Посмотреть файл с исходными данными. Выложенный выше файл от нового чипа начинается со снипов, начинающихся на ".RS" (ранее не было снипов, начинающихся с точки). Также в нем много других снипов с необычными именами.

Примеры:
C8ORF37_c.545A>G_F,8,96259924
CD59_c.266G>A_F,11,33731793
CDH1-chr16-68842443,16,68842439
CDKN2A-chr9-21974679,9,21974679
CERKL_c.238+1G>A_F,2,182521495

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 34931
  • Страна: ca
  • Рейтинг +3036/-47
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Re: FTDNA
« Ответ #10774 : 15 Апрель 2019, 19:02:28 »
Можно загрузиться в ГедМатч и сравнить пересечения с заведомо старым чипом от ФТДНА.

Оффлайн rmk

  • Сообщений: 169
  • Страна: ru
  • Рейтинг +110/-30
Re: FTDNA
« Ответ #10775 : 16 Апрель 2019, 03:38:16 »
Сделал сводную таблицу по снипам для старого и нового чипа. Для старого чипа использован файл нового (январского) формата. Для нового чипа взят файл с предыдущей страницы.

« Последнее редактирование: 16 Апрель 2019, 04:09:52 от rmk »

Оффлайн NathanS

  • Сообщений: 184
  • Рейтинг +125/-1
  • Y-ДНК: ЖМ: N1c-Z1939
Re: FTDNA
« Ответ #10776 : 16 Апрель 2019, 19:00:48 »
Сделал сводную таблицу по снипам для старого и нового чипа. Для старого чипа использован файл нового (январского) формата. Для нового чипа взят файл с предыдущей страницы.

23andme и LivingDNA тоже используют чип GSA. В моих результатаг от 23andme имеется 3733 снипа в Y хромосоме. LivingDNA выдает положительные снипы отдельным файлом. Обе выдали мне группу R-Z92, что существенно лучше R-M198 с Y-111. Y видимо сознательно вырезаны из файла, чтобы не создавать конкуренции Y-STR тестам.

Также подозрительно мало снипов в мито - 23andme сообщает 4318 мито снипов. Определение моей митогруппы оказалось насколько же точным как и mtFULL в FTDNA.

Оффлайн Daemon2017

  • Сообщений: 1125
  • Страна: ru
  • Рейтинг +418/-16
  • Y-ДНК: R1a-Y35177/BY82934
  • мтДНК: V7-a2a2a2b*
Re: FTDNA
« Ответ #10777 : 16 Апрель 2019, 19:49:35 »
Написал FTNDA письмо. Извиняюсь за мой эльфийский:
Цитировать
Hello!

I heared, that FTDNA started using a new FF chip, "Infinium GSA-24" (665k SNPs), istead of old "Infinium OE-24" (713k SNPs). As I see in documentation, they are overlaping for 135k of SNPs, so my 5 years old FF test will overlap with newcomers tests for only 20-25%.

Is it possible for me to pay for a FF upgrade? I want to receive "BigFF" (713+(665-135)=1234k SNPs) to have a possibility of high-quality matching both with new and old FF's tested.

With respect,
Dmitrij

В прошлый раз на схожий околотехнический вопрос ответили на следующий день - надеюсь, что и в этот раз не подведут :)

Оффлайн rmk

  • Сообщений: 169
  • Страна: ru
  • Рейтинг +110/-30
Re: FTDNA
« Ответ #10778 : 16 Апрель 2019, 20:09:07 »
Y видимо сознательно вырезаны из файла, чтобы не создавать конкуренции Y-STR тестам.

Также подозрительно мало снипов в мито - 23andme сообщает 4318 мито снипов.
Да, не секрет, что FTDNA занимается вырезанием данных из результатов разных тестов (в том числе из Big Y вырезается мтДНК). На предыдущем чипе то же самое делали. Еще на предыдущем чипе удалялись результаты для множества медицинских снипов (ставились для них "no-call"). Теперь, похоже, с медицинскими снипами нормальная ситуация будет - проверил ряд интересных - большинство на месте и не "no-call".

Оффлайн ochkas

  • Сообщений: 330
  • Страна: ru
  • Рейтинг +119/-0
  • FTDNA: 634321
    • Ochkas DNA
  • Y-ДНК: R1a-L1029-Y128286 (UKR)
  • мтДНК: U3a3b (BLR)
Re: FTDNA
« Ответ #10779 : 16 Апрель 2019, 20:18:53 »
Прогнал новый FF через предиктор митогаплогрупп http://vps1.jameslick.com/dna/mthap/.
Показывает что испытуемый (из Украины) вероятно H2a2a1.
Значит Мито вытащить всё таки можно.

Оффлайн Oxon

  • Сообщений: 895
  • Страна: gb
  • Рейтинг +196/-0
Re: FTDNA
« Ответ #10780 : 16 Апрель 2019, 20:22:36 »
Это дефолтная H2a2a1 :(

Оффлайн rmk

  • Сообщений: 169
  • Страна: ru
  • Рейтинг +110/-30
Re: FTDNA
« Ответ #10781 : 16 Апрель 2019, 20:24:01 »
Значит Мито вытащить всё таки можно.
Всего 194 снипа, см. таблицу выше.

Оффлайн R1a-Stolin

  • Сообщений: 528
  • Страна: by
  • Рейтинг +270/-1
  • Y-ДНК: R-Y35192 - Сіціцк, Беларусь
  • мтДНК: H - Умань, Україна
Re: FTDNA
« Ответ #10782 : 16 Апрель 2019, 20:35:22 »
Показывает что испытуемый (из Украины) вероятно H2a2a1.
Значит Мито вытащить всё таки можно.

К сожалению нет, H2a2a1 это Кембриджская эталонная последовательность

Оффлайн Feroce

  • Сообщений: 959
  • Страна: ru
  • Рейтинг +224/-0
    • Бессоновы/Безсоновы
  • Y-ДНК: R1a-Z92 (YP6504->BY30750)
Re: FTDNA
« Ответ #10783 : 16 Апрель 2019, 20:56:00 »
А переход на новый чип коснётся только новых клиентов или старых тоже пересчитают?

Оффлайн Daemon2017

  • Сообщений: 1125
  • Страна: ru
  • Рейтинг +418/-16
  • Y-ДНК: R1a-Y35177/BY82934
  • мтДНК: V7-a2a2a2b*
Re: FTDNA
« Ответ #10784 : 16 Апрель 2019, 21:42:33 »
А переход на новый чип коснётся только новых клиентов или старых тоже пересчитают?

Это надо несколько сотен тысяч пробирок заново прогонять - едва ли они на это пойдут. Я согласен на доплату в 75% от цены нового: это справедливо, т.к. на 75% это новый продукт.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100