АвторТема: FTDNA  (Прочитано 1277571 раз)

0 Пользователей и 4 Гостей просматривают эту тему.

Оффлайн AlexanderK

  • Сообщений: 1936
  • Страна: ru
  • Рейтинг +357/-1
  • Y-ДНК: J1-PF7257
  • мтДНК: H11a1
Re: FTDNA
« Ответ #8280 : 09 Февраль 2017, 14:15:33 »
По здоровью, уже в каждой стране свои есть фирмы...
Но это уже совсем другой порядок цифр в цене.

В Генотеке Здоровье стоит 7500 рублей, это $125. Причем генерится заключение в PDF на какие конкретно риски надо обратить внимание и какие конретно анализы или исследования (типа УЗИ чего-нибудь) рекомендуется пройти. Ну и есть консультация врача-генетика по результатам, 2000р очно или 1000р по скайпу. 

Оффлайн gecube_ru

  • Сообщений: 1418
  • Страна: hu
  • Рейтинг +264/-6
  • Незнайка на Луне
  • Y-ДНК: I-A6397 -> I-FGC79161
  • мтДНК: V7a1?
Re: FTDNA
« Ответ #8281 : 09 Февраль 2017, 14:19:31 »
Цитировать
В Генотеке Здоровье стоит 7500 рублей, это $125. Причем генерится заключение в PDF на какие конкретно риски надо обратить внимание и какие конретно анализы илиисследования рекомендуется пройти
Я уверен, что такое тестирование очень поверхностное, т.к. повторюсь, что смотрят на какие-то базовые локусы. Условно - есть ли Альцгеймер или нет. Остальное пока скорее на уровне каких-то вероятностей и наука еще не знает точной взаимосвязи между генами и многофакторно вызываемыми болезнями типа диабета. Свое расстройство метаболизма (а оно 100% связано с наследственностью) я в списке прометеазы не нашел. Возможно, по нему вообще научных работ нет..

Оффлайн AlexanderK

  • Сообщений: 1936
  • Страна: ru
  • Рейтинг +357/-1
  • Y-ДНК: J1-PF7257
  • мтДНК: H11a1
Re: FTDNA
« Ответ #8282 : 09 Февраль 2017, 14:38:33 »
Цитировать
В Генотеке Здоровье стоит 7500 рублей, это $125. Причем генерится заключение в PDF на какие конкретно риски надо обратить внимание и какие конретно анализы илиисследования рекомендуется пройти
Я уверен, что такое тестирование очень поверхностное, т.к. повторюсь, что смотрят на какие-то базовые локусы. Условно - есть ли Альцгеймер или нет. Остальное пока скорее на уровне каких-то вероятностей и наука еще не знает точной взаимосвязи между генами и многофакторно вызываемыми болезнями типа диабета. Свое расстройство метаболизма (а оно 100% связано с наследственностью) я в списке прометеазы не нашел. Возможно, по нему вообще научных работ нет..

Да, естественно, поверхностное. Но они говорили что больше чем у 23&Me или FamilyFinder. Причем из 23&Me у них есть импорт и интерпретация которые гораздо лучше чем в Promethease как минимум потому что бесплатно, в приятном веб-интерфейсе, и на русском языке ;D Еще осенью обещали сделать импорт и из FamilyFinder (а заодно и экспорт собственных данных в формат совместимый с Gedmatch) - но что-то никак.

У них есть и более глубокое ДНК-тестирование - но год назад оно стоило порядка 70 тысяч рублей...

Оффлайн ankr21

  • Сообщений: 2258
  • Страна: ru
  • Рейтинг +551/-0
  • Y-ДНК: I1-L1302
  • мтДНК: U3b1b
Re: FTDNA
« Ответ #8283 : 09 Февраль 2017, 15:00:02 »
Видел полное секвенирование митохондриальной ДНК аз 3000 долларов в медицинских целях, возможно это устаревшие цифры, ибо оно уже там не продается, просто висит прайс.

Если цель максимально качественное секвенирование митохондриальной ДНК для здоровья, пойдут ли услуги FTDNA?

Может ли кто в Мск продать набор и отправить его? (с моей оплатой за услугу)
Мито не такая уж и большая. Всего примерно 16500 нуклеотидов. FTDNA сделает полный митосеквенс, то есть прочтет и выдаст в FASTA файле все нуклеотды. А вот интерпретацией и обработкой по здоровью занимаются сторонние фирмы.

Оффлайн rLin

  • Сообщений: 769
  • Страна: ru
  • Рейтинг +269/-0
  • Калуга
  • Y-ДНК: R1a1a-Z92 (Y569+)
  • мтДНК: T2b2-С16304T!
Re: FTDNA
« Ответ #8284 : 09 Февраль 2017, 15:00:17 »
hart, FTDNA в ошибках замечены не были в сравнении с 23andMe. Разве что на нескольких участках есть разночтения (300-315 и 16179-16193) из-за сложностей автоматической обработки (причём проблема, по-видимому, у 23andMe, а не у FTDNA).
Вот тут пишут, что для клинического тестирования достаточно качества Q30 для аппаратуры Illumina:
https://www.illumina.com/science/education/sequencing-quality-scores.html
Ссылки на pdf с описанием того, что значит Q30 по вышеуказанной ссылке присутствуют. Если коротко, то это лучше, чем 99.9%, но хуже, чем 99.999%.  :) От 0 до 17 ошибок на полный сиквенс.
Ссылок на медицинские стандарты по качеству секвенирования найти сходу не удалось. Но копайте в этом направлении.
Если найдёте допустимое количество ошибок в клинических исследованиях и узнаете качество аппаратуры в FTDNA (напишите им письмо с просьбой уточнить качество секвенирования Full Mito), то по таблице от Illumnia можно понять, подходит вам FTDNA или нет. Строго говоря, FTDNA не предполагает, что их результаты могут быть использованы в медицинских целях.
« Последнее редактирование: 09 Февраль 2017, 15:07:07 от rLin »

Оффлайн gecube_ru

  • Сообщений: 1418
  • Страна: hu
  • Рейтинг +264/-6
  • Незнайка на Луне
  • Y-ДНК: I-A6397 -> I-FGC79161
  • мтДНК: V7a1?
Re: FTDNA
« Ответ #8285 : 09 Февраль 2017, 15:06:25 »
А поясните - что вы в митосиквенсе хотите найти?
Насколько мне известно, болезней передающихся по митоДНК раз два и обчелся! И если они есть, то клиент уже скорее всего про них знает?!

Оффлайн пенелопа

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6485
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2714/-13
  • мтДНК: H1b
Re: FTDNA
« Ответ #8286 : 09 Февраль 2017, 16:41:39 »
 Не раз-два, больше. И есть очень серьезные. Список легко ищется в сети по запросу "митохондриальные заболевания". Некоторые очень долго могут не проявляться.

Оффлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-BY124371
  • ...
  • Сообщений: 17098
  • Страна: az
  • Рейтинг +5909/-17
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f1
Re: FTDNA
« Ответ #8287 : 09 Февраль 2017, 18:14:27 »
Цитировать
FTDNA сделает полный митосеквенс, то есть прочтет и выдаст в FASTA файле все нуклеотды.
Они убрали фасту, оставили только таблицу с мито-гаплотипом

Оффлайн AlexanderK

  • Сообщений: 1936
  • Страна: ru
  • Рейтинг +357/-1
  • Y-ДНК: J1-PF7257
  • мтДНК: H11a1
Re: FTDNA
« Ответ #8288 : 09 Февраль 2017, 18:55:24 »
Цитировать
FTDNA сделает полный митосеквенс, то есть прочтет и выдаст в FASTA файле все нуклеотды.
Они убрали фасту, оставили только таблицу с мито-гаплотипом

На месте FASTA. Только что проверил. Может ты с админки заходишь? 

Оффлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-BY124371
  • ...
  • Сообщений: 17098
  • Страна: az
  • Рейтинг +5909/-17
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f1
Re: FTDNA
« Ответ #8289 : 09 Февраль 2017, 19:15:11 »
Захожу под собой, фасту не вижу, и не я один такой

Оффлайн Sylvester

  • Сообщений: 1641
  • Страна: ru
  • Рейтинг +570/-0
  • FTDNA:290147 YFull:YF64174 GEDmatch:T532939
  • Y-ДНК: I1-Y16803 Varangians (SWE>RUS)
  • мтДНК: N1a1a1a1a2 (RUS,KAZ,BGR,HUN)
Re: FTDNA
« Ответ #8290 : 09 Февраль 2017, 19:22:42 »
Захожу под собой, фасту не вижу, и не я один такой
Так там и не mtFull.
У меня mtFull и фаста на месте.

Оффлайн gecube_ru

  • Сообщений: 1418
  • Страна: hu
  • Рейтинг +264/-6
  • Незнайка на Луне
  • Y-ДНК: I-A6397 -> I-FGC79161
  • мтДНК: V7a1?
Re: FTDNA
« Ответ #8291 : 09 Февраль 2017, 21:22:55 »
Из бига уже мито не выведешь.
Если говорить о y elite, то там покрытие 99%, т.е. какого-то количества оснований может не хватать.

Оффлайн ankr21

  • Сообщений: 2258
  • Страна: ru
  • Рейтинг +551/-0
  • Y-ДНК: I1-L1302
  • мтДНК: U3b1b
Re: FTDNA
« Ответ #8292 : 09 Февраль 2017, 21:25:49 »
Захожу под собой, фасту не вижу, и не я один такой
Заказывал тестю FMS на этих  рождественских скидках. Результат получил уже в 2017. Фаста на месте.

Цитировать
FASTA format was uploaded. Based on the markers found, assuming the following regions were completely sequenced: HVR1 (16001~16569) HVR2 (1~574) CR (575~16000).
Found 16569 markers at 16569 positions covering 100.0% of mtDNA.
Markers found (shown as differences to rCRS):
HVR2: 263G (309.1C) (309.2C) (315.1C)
CR: 750G 1438G 3290C 4769G 8289.1C 8289.2C 8289.3C 8289.4C 8289.5C 8289.6T 8289.7C 8289.8T 8289.9A 8860G 11665T 13651G 15326G
HVR1: 16354T (16519C)

Оффлайн Lesla

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 9628
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2923/-9
  • FTDNA: 154400 (Big Y - 283049)
  • Y-ДНК: R1a-YP682 (VK06+)
Re: FTDNA
« Ответ #8293 : 09 Февраль 2017, 23:01:51 »
кто знает разница есть между Фаста из Митофулл и Фаста выведенная из Бига?По качеству они разные или нет?Спасибо заранее за ответ
Нет там никакой разницы.

Оффлайн Lesla

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 9628
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2923/-9
  • FTDNA: 154400 (Big Y - 283049)
  • Y-ДНК: R1a-YP682 (VK06+)
Re: FTDNA
« Ответ #8294 : 09 Февраль 2017, 23:35:09 »
кто знает разница есть между Фаста из Митофулл и Фаста выведенная из Бига?По качеству они разные или нет?Спасибо заранее за ответ
Нет там никакой разницы.
я это к чему? друг отправил свою Фасту Яну Логану и вот что ответил он-
Если отправляли фасту от YFull, то лучше к первоисточнику обратиться - http://forum.molgen.org/index.php/topic,5782.0.html

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.