АвторТема: Скелеты из шкафа: личный опыт извлечения Y-ДНК из зуба  (Прочитано 3269 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн raia

  • Сообщений: 150
  • Страна: ru
  • Рейтинг +320/-4
  • Y-ДНК: e
  • мтДНК: Т2b4
Время нахождения останков в земле было около  70 лет? Или это не влияет  на результаты анализа? Получается по факту они точно также извлекают дднк и могут принимать археологические образцы?

Оффлайн FarroukhАвтор темы

  • Maternal Y-DNA: R1b-BY124371
  • ...
  • Сообщений: 17099
  • Страна: az
  • Рейтинг +5911/-17
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f1
Влияет не столько время, а условия нахождения. Если останки были в естественной изоляции от деградационных воздействий, то дДНК вполне извлекаема даже через сотни тысяч лет.
(В нашем случае речь шла о сухой полупустынной почве).

Археологические образцы они активно принимают и исследуют. На форуме есть соответствующие статьи. Лаборатория МФТИ.

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Сообщений: 36936
  • Страна: ca
  • Рейтинг +3773/-48
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
И ещё. Изначальная идея о том чтобы извлечь ДНК из зуба, а потом отправить её в обычном ките во ФТДНА, увы, провалилась.
Как выяснилось, работа с материалом такого типа проходит совсем по другой методике, которую ФТДНА не использует. Они работают только с буккальным материалом и отправлять им даже извлечённую ДНК из нетипичного образца нет смысла. Только слюна (или кровь для полного генома).

А с YSEQ Вы не связывались?

Имею в виду более полный анализ извлечённой ДНК.

Оффлайн FarroukhАвтор темы

  • Maternal Y-DNA: R1b-BY124371
  • ...
  • Сообщений: 17099
  • Страна: az
  • Рейтинг +5911/-17
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f1
Михаил, нет, не связывались. Из ответа ФТДНА я так понял (возможно, ошибочно), что все коммерческие лаборатории по массовому тестированию ориентированы исключительно на живых людей и буккалку. Не исключаю, что Yseq могут работать и с нетипичным материалом.

Оффлайн TK

  • Сообщений: 505
  • Страна: ru
  • Рейтинг +385/-0
YSEQ может (по крайней мере, точно могло) работать с нетипичным материалом (они участвуют в том числе в анализах дДНК) и очень недорого (по сравнению со всеми остальными) - но они это не афишируют, так как это трудоёмко и не является их основным направлением работы. В любом случае - стоит связаться с ними напрямую, чтобы узнать, смогут помочь или нет в каждом конкретном случае.

Оффлайн FarroukhАвтор темы

  • Maternal Y-DNA: R1b-BY124371
  • ...
  • Сообщений: 17099
  • Страна: az
  • Рейтинг +5911/-17
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f1
Есть особенность, с которой мне довелось столкнуться. Лаборатории настаивают натом, чтобы самим и извлечь, и секвенировать. То есть вариант извлечь здесь, а потом отправить кит за бугор может не прокатить. Вообще, с дДНК работают крайне неохотно и цены на уровне 3000 американских рублей (и даже выше).

Поэтому лучше сразу описать всю задачу целиком.

Оффлайн dima75

  • Сообщений: 592
  • Страна: il
  • Рейтинг +122/-1
    • Tartakovsky surname project
  • Y-ДНК: E1b1b1-PF1975 (E-Z830-A)
  • мтДНК: K1a1b1a
Май Херитедж обещали ещё в 2019 году начать тестировать старые конверты. Жду, когда начнут. Есть конверты 1969 г., отправленные одним из дедушек, хотелось бы протестировать в формате Фемили файндер.

Оффлайн Бибиков

  • Сообщений: 188
  • Страна: ru
  • Рейтинг +78/-0
  • Y-ДНК: R1b (R-Y37731)
Очень познавательная информация, спасибо.

Оффлайн Roaring

  • Сообщений: 652
  • Рейтинг +155/-1
  • Y-ДНК: R1b-DF99
  • мтДНК: U5b1e
Цитировать
имеют полное совпадение по 25 STR с десятком человек по базе FTDNA. Потом на 37 маркерах это уже переходит либо в 2-3 отличия, либо больше.
Могу ли я на этом основания подозревать прямую родственную связь по мужской линии?
Уважаемый Соммер, дело в том, что 27 маркёров Yfiler plus как бы размазаны по всем 10 панелям от ФТДНА. Чтобы полностью сравниться надо иметь 111 маркёрный гаплотип, который как раз вмещает все 27 маркёров игрекфайлер.
У нас был сделан Биг, поэтому можно было полноценно сравниться.

Фаррух, а вы не звонили сами в эту контору? Попытался сегодня - не дозвониться.

Оффлайн FarroukhАвтор темы

  • Maternal Y-DNA: R1b-BY124371
  • ...
  • Сообщений: 17099
  • Страна: az
  • Рейтинг +5911/-17
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f1
Телефон вроде должен работать ???
Напишите им на почту, оставьте свои контакты
mail@dnk-nasledie.ru

Если нет возможности приехать в лабораторию, в письме опишите состояние образца максимально подробно.
« Последнее редактирование: 28 Июль 2020, 15:12:35 от Farroukh »

Оффлайн Roaring

  • Сообщений: 652
  • Рейтинг +155/-1
  • Y-ДНК: R1b-DF99
  • мтДНК: U5b1e
Телефон вроде должен работать ???
Напишите им на почту, оставьте свои контакты
mail@dnk-nasledie.ru

Написал, позвонил, ответа нет. Может закрылись или карантинят.

Если нет возможности приехать в лабораторию, в письме опишите состояние образца максимально подробно.

Оффлайн nilogov

  • Сообщений: 1379
  • Страна: ru
  • Рейтинг +95/-6
  • философ антиязыка
  • Y-ДНК: R-BY55151
  • мтДНК: T2b-T152C!
Интересная история! Побольше бы таких!


Оффлайн nilogov

  • Сообщений: 1379
  • Страна: ru
  • Рейтинг +95/-6
  • философ антиязыка
  • Y-ДНК: R-BY55151
  • мтДНК: T2b-T152C!
И ещё. Изначальная идея о том чтобы извлечь ДНК из зуба, а потом отправить её в обычном ките во ФТДНА, увы, провалилась.
Как выяснилось, работа с материалом такого типа проходит совсем по другой методике, которую ФТДНА не использует. Они работают только с буккальным материалом и отправлять им даже извлечённую ДНК из нетипичного образца нет смысла. Только слюна (или кровь для полного генома).

А вот полный геном в какой лучше лаборатории сделать?

Оффлайн FarroukhАвтор темы

  • Maternal Y-DNA: R1b-BY124371
  • ...
  • Сообщений: 17099
  • Страна: az
  • Рейтинг +5911/-17
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f1
Ответ зависит от исходных условий. ДНК из костного материала уже извлечена? Если да, то в любую из FGS лабораторий, обсуждавшихся тут - Nebula и иже с ними. Но лучше предварительно списаться с ними и уточнить.

Оффлайн nilogov

  • Сообщений: 1379
  • Страна: ru
  • Рейтинг +95/-6
  • философ антиязыка
  • Y-ДНК: R-BY55151
  • мтДНК: T2b-T152C!
Ответ зависит от исходных условий. ДНК из костного материала уже извлечена? Если да, то в любую из FGS лабораторий, обсуждавшихся тут - Nebula и иже с ними. Но лучше предварительно списаться с ними и уточнить.

Интересует не древняя ДНК, а моя для полного генома. Значит Nebula?

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.