АвторТема: Интерпретация данных из genotek  (Прочитано 1573 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн ChАвтор темы

  • Сообщений: 15
  • Рейтинг +0/-0
  • Y-ДНК: N1a1-(N-VL29)
  • мтДНК: U
Интерпретация данных из genotek
« : 08 Декабрь 2020, 14:56:54 »
Привет,
парни, подскажите, насколько корректно прошла интерпретация и определение гаплогруппы?
Данные получены путем перевода vcf(genotek)->23andme-> Morley SNPs
Достаточно ли данных? Где еще по таким данным можно провести оценку?
Первый день в генеалогии, поэтому прошу не судить строго.

Снипы здесь
https://whosts.ru/fF1Y3gy3Rk

Еще картинка по ссылке (здесь почему-то не загрузилась)
https://ibb.co/kX0zgxb




Оффлайн Semargl

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Сообщений: 6008
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4217/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: Интерпретация данных из genotek
« Ответ #1 : 08 Декабрь 2020, 15:18:48 »
Привет,
парни, подскажите, насколько корректно прошла интерпретация и определение гаплогруппы?
Данные получены путем перевода vcf(genotek)->23andme-> Morley SNPs
Достаточно ли данных? Где еще по таким данным можно провести оценку?
Первый день в генеалогии, поэтому прошу не судить строго.

Снипы здесь
https://whosts.ru/fF1Y3gy3Rk

Еще картинка по ссылке (здесь почему-то не загрузилась)
https://ibb.co/kX0zgxb

Тут явная ошибка в структуре используемого дерева... Обратите внимание, что определенный терминальным M46 встречается в двух местах на указанном дереве. На самом деле в одном, том что выше. Так что если других данных по снипам нет, то субклад будет N-VL29 (xL550)

Оффлайн ChАвтор темы

  • Сообщений: 15
  • Рейтинг +0/-0
  • Y-ДНК: N1a1-(N-VL29)
  • мтДНК: U
Re: Интерпретация данных из genotek
« Ответ #2 : 08 Декабрь 2020, 15:41:24 »
Тут явная ошибка в структуре используемого дерева... Обратите внимание, что определенный терминальным M46 встречается в двух местах на указанном дереве. На самом деле в одном, том что выше. Так что если других данных по снипам нет, то субклад будет N-VL29 (xL550)
Спасибо за ответ
Сделал интерпретацию другим сервисом ( https://cladefinder.yseq.net/index.php ) - результат такой же
Может дело в исходных данных?



Цитировать
L550
Как я понял по графику - у меня этого нет

Оффлайн NathanS

  • Сообщений: 1277
  • Страна: 00
  • Рейтинг +1202/-2
Re: Интерпретация данных из genotek
« Ответ #3 : 08 Декабрь 2020, 16:11:06 »
Тут явная ошибка в структуре используемого дерева... Обратите внимание, что определенный терминальным M46 встречается в двух местах на указанном дереве. На самом деле в одном, том что выше. Так что если других данных по снипам нет, то субклад будет N-VL29 (xL550)
Спасибо за ответ
Сделал интерпретацию другим сервисом ( https://cladefinder.yseq.net/index.php ) - результат такой же
Может дело в исходных данных?
Как я понял по графику - у меня этого нет
Yseq кажется должен принять VCF от Генотека, без всяких конвертаций. Вы его прогнали через этот сервис?

Оффлайн Semargl

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Сообщений: 6008
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4217/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: Интерпретация данных из genotek
« Ответ #4 : 08 Декабрь 2020, 16:11:12 »
Тут явная ошибка в структуре используемого дерева... Обратите внимание, что определенный терминальным M46 встречается в двух местах на указанном дереве. На самом деле в одном, том что выше. Так что если других данных по снипам нет, то субклад будет N-VL29 (xL550)
Спасибо за ответ
Сделал интерпретацию другим сервисом ( https://cladefinder.yseq.net/index.php ) - результат такой же
Может дело в исходных данных?

Цитировать
L550
Как я понял по графику - у меня этого нет
Указанный сервис использует дерево YFull, так что все верно.
(xL550) - это значит что у вас L550 признан отрицательным.

Оффлайн ChАвтор темы

  • Сообщений: 15
  • Рейтинг +0/-0
  • Y-ДНК: N1a1-(N-VL29)
  • мтДНК: U
Re: Интерпретация данных из genotek
« Ответ #5 : 08 Декабрь 2020, 16:17:43 »
Yseq кажется должен принять VCF от Генотека, без всяких конвертаций. Вы его проглани через этот сервис?
Да, тот же результат

Указанный сервис использует дерево YFull, так что все верно.
(xL550) - это значит что у вас L550 признан отрицательным.
Принял, спасибо.
Если ли смысл делать какие-то дополнительные исследования, или мои данные достаточно исчерпывающие?
Просто, как мне кажется, N-VL29 дает не там много информации.
Если я не смог войти в другие группы - можно ли выделить свой отдельный субсклад (если я правильно понимаю о чем говорю)?
« Последнее редактирование: 08 Декабрь 2020, 16:28:58 от Ch »

Онлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-BY124371
  • ...
  • Сообщений: 17179
  • Страна: az
  • Рейтинг +5961/-17
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f1
Re: Интерпретация данных из genotek
« Ответ #6 : 08 Декабрь 2020, 16:37:40 »
Ответ один: для более детального результата вам надо пройти тест в другой лаборатории - FTDNA или Nebula.
Всё зависит от ваших конкретных целей.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.