upd Чёрный цвет (presumed negative) это ведь тоже некорректно, большинство снипов должно отображаться красным. Но нет
Строго говоря, у каждого, кому присвоена группа, имеющая downstream-ы (у нас это обозначается * в конце), все её downstream-ы должны сильно покрасненеть.
И, наверное, включаться в vcf как порожние. Но с этим я уже не уверен - критерия включения позиции в vcf я ведь точно не знаю. Думал, что там все протестированные позы.
Видимо с цветом некая халтура, хотя и напрасно. Какой-либо новый Downstream, открывшийся в связи с появлением Big700, должен быть именно голубым в старых китах Big500, поскольку не покрывался. И красным в 700-м.
У меня ещё остаётся призрачная надежда, что мой кит прихватил приватный другого кита той же группы, вместе он образовали новую подветвь, которой просто пока нет в текущей версии дерева. Тогда существующие downstreams справедливо "по-боку". Всякому охота выделиться, и мне, видимо, тоже.