АвторТема: Х хромосомы женщин в файлах 23andMe и других  (Прочитано 217 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн vaavdeevАвтор темы

  • Сообщений: 8
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1/-0
  • Y-ДНК: R1A1
Подскажите новичку пожалуйста.
У женщин 2 Х хромосомы ( одна от отца, другая от матери)

А в файлах 23andMe и других - одна....

Я сравнил Х из своего файла и Х своей тети сестры мамы - они разные.
Анализ для мамы сделать не могу.

Подскажите пожалуйста, как 2 Х хромосомы женщин реализованы в ДНК тестах известных фирм.

Оффлайн MCB

  • Сообщений: 44
  • Страна: 00
  • Рейтинг +27/-1
Re: Х хромосомы женщин в файлах 23andMe и других
« Ответ #1 : 06 Октябрь 2019, 19:28:20 »
В данных 23andMe Х-хромосомы у женщин имеют два аллеля у каждого маркера. Посмотрите в сырых данных, увидите что-то наподобие
intergenic   rs28463388   191998   G or T   G / T
intergenic   rs28669107   195014   C or G   C / G
intergenic   rs6655397   201935   A or G   G / G

Какая из них отцовская, какая материнская, они, естественно, разобрать не могут. Ваша Х-хромосома - это смесь из двух материнских, а у матери с ее сестрой одна из хромосом совпадает (от дедушки), другая совпадает лишь наполовину (от бабушки), так что нетрудно догадаться, что у вас с тетей совпадение Х-хромосом будет только частичное (подробнее этот довольно сложный вопрос о количестве совпадений на Х (X-matches) подробно разбирается в разных источниках, но для вашего конкретного вопроса достаточно просто знать, что нет, не должна Х совпасть у вас с тетей). Что должно совпасть по материнской линии, так это мтДНК, но это тоже отдельный вопрос.

Оффлайн vaavdeevАвтор темы

  • Сообщений: 8
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1/-0
  • Y-ДНК: R1A1
Re: Х хромосомы женщин в файлах 23andMe и других
« Ответ #2 : 07 Октябрь 2019, 10:29:49 »
Спасибо за ответ.
Но что то не совсем догоняю.

Еще у меня есть ЖЕНСКИЕ файлы от компании MyHeritage
Там X представлена следующим образом:
rs7877506,X,139065869,TT
rs5953923,X,139070906,AA
rs5955267,X,139077956,GG

Как рассматривать эту ситуацию?
Аллели от разных иксов?
В левой части это один Х а в правой другой Х ?

Тогда что же в мужском файле?
Там такая же структура Х
Но у нас всего одна Х хромосома.

Пока не понял где 2 Икса в женском файле

Оффлайн MCB

  • Сообщений: 44
  • Страна: 00
  • Рейтинг +27/-1
Re: Х хромосомы женщин в файлах 23andMe и других
« Ответ #3 : 08 Октябрь 2019, 18:04:42 »
Спасибо за ответ.
Но что то не совсем догоняю.

Еще у меня есть ЖЕНСКИЕ файлы от компании MyHeritage
Там X представлена следующим образом:
rs7877506,X,139065869,TT
rs5953923,X,139070906,AA
rs5955267,X,139077956,GG

Как рассматривать эту ситуацию?
Аллели от разных иксов?
В левой части это один Х а в правой другой Х ?

Тогда что же в мужском файле?
Там такая же структура Х
Но у нас всего одна Х хромосома.

Пока не понял где 2 Икса в женском файле
Просто трудно понятьм в чем именно заключается ваш вопрос. Ну вот вы приводите пример:
rs7877506,X,139065869,TT

Один аллель Т это одна из двух Х-хромосом, другой - другая. Какая мамина, какая отцовская, узнать невозможно. Иногда аллели одинаковые на обоих, но часто разные.

А у мужчин формат может тоже иметь две "буквы", но всегда одинаковые, просто чтобы сохранять техническое описание формата.

Только мне кажется, что ваш вопрос не про Х, а про мтДНК?

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100