АвторТема: Склейка файлов ДНК. Синтез файла ДНК из других файлов  (Прочитано 268 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн vaavdeevАвтор темы

  • Сообщений: 8
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1/-0
  • Y-ДНК: R1A1
Добрый день!
Кто знает, можно ли сгенерить файл ДНК из имеющихся нескольких других?
Есть такие сервисы или ресурсы?

Задача - синтезировать файл ДНК ( на сколько будет возможным) моего давно умершего деда.
В наличии есть 3 файла МХ его дочерей.

Известно, что отец и мать передают по 50% своих днк детям в случайном порядке и каждый раз разные куски.
Следовательно, 3 дочери имеют по 50% днк родителей, но с разных кусков и адресов.
Значит теоретически можно синтезировать обобщенный файл, хоть и не полный.

Так ли это?





Оффлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-L584
  • ...
  • Сообщений: 11355
  • Страна: az
  • Рейтинг +2077/-15
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f
Корректнее было назвать "Выделение ДНК одного из родителей из совокупности ДНК сиблингов"
Это можно сделать (или, если по-умному, провести фазирование), если на руках есть ещё и ДНК бабушки. Чтобы его можно было вычесть и получить в остатке ДНК деда.

Просто по трём дочерям одной пары людей мало что выудите. Разве что бабушкину митогаплогруппу.

Оффлайн vaavdeevАвтор темы

  • Сообщений: 8
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1/-0
  • Y-ДНК: R1A1
ДНК бабушки нет.
Но есть ДНК племянницы дедушки, где нет кусков кода ДНК бабушки
То есть в наличии есть ДНК дочки родной сестры дедушки.


Можно ли при таких условиях сделать разделение бабушки от дедушки, имея еще 3-х дочерей дедушки и бабушки


Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 34801
  • Страна: ca
  • Рейтинг +2998/-47
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Это называется фазирование.
Делается в первом тайере ГедМатча.
Сервис называется Лазарус.
Результаты пока дрянь.

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 34801
  • Страна: ca
  • Рейтинг +2998/-47
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Я делал фазирование по отцу.
Идеальные условия. Сэмплы мамы, мой, сестры, и полусотни родственников.

Результаты, как уже сказал, дрянь.
Родичей можно откидывать простым исключением. Вновьпоявившиеся более чем спекулятивные.

Что до этнокалькуляторов, то это вообще ерунда для генеалогических нужд. А в этом случае, ерунда в квадрате.

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 34801
  • Страна: ca
  • Рейтинг +2998/-47
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Второе фазирование делал для тестя. Использовал сэмплы жены, её мамы, брата и сестры.

Результаты тоже дерьмо.

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 34801
  • Страна: ca
  • Рейтинг +2998/-47
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Фазирование можно делать по любым сэмплам.

Чем родственники ближе и чем их больше, - тем результат лучше.

Пока (на уровне программного исполнения, размерности используемого чипа и сравнительной базы) - имеем не очень впечатляющие результаты.

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 34801
  • Страна: ca
  • Рейтинг +2998/-47
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Есть ещё программа австралийского индуса многостаночника (Феликс что-то там, забыл имя), та вообще стрём, как и большинство его программ.

Оффлайн vaavdeevАвтор темы

  • Сообщений: 8
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1/-0
  • Y-ДНК: R1A1
Большое спасибо за исчерпывающие ответы

Оффлайн Alexey_V.B.

  • Сообщений: 244
  • Страна: il
  • Рейтинг +62/-0
  • Y-ДНК: R1a (R-A8998)
  • мтДНК: K1a1b1a
Спасибо за ответы, мне тоже пригодилось

Оффлайн Clavis

  • Сообщений: 1544
  • Страна: ru
  • Рейтинг +103/-0
  • y+mito-search: RK448
    • Семёнов Михаил Юрьевич домашняя страничка
  • Y-ДНК: G2a2b2a1a1a2a (L1264+)
  • мтДНК: HV9, ранее известная как HV3a
Спасибо, меня тоже интересовал этот вопрос. Подождем более совершенных программ, какие наши годы  ;D

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100