АвторТема: An Ancient Harappan Genome Lacks Ancestry from Steppe Pastoralists or Iranian Farmers  (Прочитано 5616 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн mikhail a.

  • Сообщений: 1253
  • Страна: ru
  • Рейтинг +332/-0
  • Y-ДНК: J2a-PF5252
  • мтДНК: T2b
Re: An Ancient Harappan Genome Lacks Ancestry from Steppe Pastoralists or Iranian Farmers
« Ответ #15 : 07 Сентябрь 2019, 13:12:00 »
Посмотрел несколько bam'ов по J2:

1) I10411  Гонкур тепе БМАК бронзовый век 2300-2200 BCE  - J2a2a
Покрытие слабенькое. Углубить версию авторов статьи не удалось.
На уровне J2а-P279 у образца: Y24646+ и P279+, контроверсный Z35890 и Z28416-.
Ниже по дереву Z38514- в узле J-Y36579. В остальном - пустота. Теоретически возможны общие снипы с приватными мутациями кого-либо из J2а-P279*. А таких только на дереве YFull две штуки.
Была надежда, что I10411 окажется не J2а-P279, а из братской степной, а в настоящее время тюркоязычной J-PH1795. Но не случилось.

Оффлайн mikhail a.

  • Сообщений: 1253
  • Страна: ru
  • Рейтинг +332/-0
  • Y-ДНК: J2a-PF5252
  • мтДНК: T2b
Re: An Ancient Harappan Genome Lacks Ancestry from Steppe Pastoralists or Iranian Farmers
« Ответ #16 : 07 Сентябрь 2019, 13:32:41 »
2) I7494 Саппали тепе БМАК бронзовый век 2010-1883 calBCE - J2a1
Покрытие значительно лучше, чем у I10411. Удалось значительно уточнить гаплогруппу образца - до J2a1h2d (по той же номенклатуре 2016).
Положительные снипы в узлах ниже L26: PF5160(Z2221+)>L24 (Z396+, Z422+)>L25 (PF5309+,PF5318+, Z436+, CTS830+, Z416+, PF5284+Z431+)>F3133(Z7700+, Z7702+, Z7701+,F3133+)>Z7706(Z7706+).
И на терминальном уровне разбил блок L192: Y14315+ (два прочтения) и 3 снипа в минусе: Y29552, Y29552 и Y29552.
Итого получается J2a-Y14315 https://yfull.com/tree/J-L192/

Оффлайн mikhail a.

  • Сообщений: 1253
  • Страна: ru
  • Рейтинг +332/-0
  • Y-ДНК: J2a-PF5252
  • мтДНК: T2b
Re: An Ancient Harappan Genome Lacks Ancestry from Steppe Pastoralists or Iranian Farmers
« Ответ #17 : 07 Сентябрь 2019, 14:13:51 »
3) Еще один образец бронзового века из Сапалли тепе  I7421, датированный 1931-1767 calBCE, оказался пока что для меня самым любопытным.  По версии авторов статьи всего лишь J2a.
Качество сиквенса - хорошее. В реальности I7421 оказался из той же реликтовой ветки J2a-PF5008* (xL581), о которой я раньше писал в связи с образцом I1662/SG7 из Sheh Gabi (халколит, Загрос)
см. тут - http://forum.molgen.org/index.php/topic,9927.msg444437.html#msg444437
У I7421 в плюсе все прочтенные снипы "верхнего" уровня: MF10470+, MF10501+, MF51135+ и MF51135+ (последний снип может быть уже на уровне I7421-I1662/SG7).
Все прочтенные снипы подветки пенджабца HG01589 и иранца из Исфахана 462289: MF10529-, MF10540-, BY220118- и BY225241 +/-  у узбекского бронзовика I7421, как и у западноиранского халкалитчика из Sheh Gabi, также оказались  в минусе.
В итоге I7421 Sappali Tepe и I1662/SG7 Sheh Gabi сформировали свою (пара)группу J2- MF10470(xMF10529)
« Последнее редактирование: 07 Сентябрь 2019, 23:52:05 от mikhail a. »

Оффлайн пенелопа

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 5692
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1833/-12
  • мтДНК: H1b
Re: An Ancient Harappan Genome Lacks Ancestry from Steppe Pastoralists or Iranian Farmers
« Ответ #18 : 07 Сентябрь 2019, 19:15:41 »

Чудно так: пошли на запад, потом вдруг разругались, одни дальше потопали, а часть развернулась - и до самой Индии... :D


Оффлайн mikhail a.

  • Сообщений: 1253
  • Страна: ru
  • Рейтинг +332/-0
  • Y-ДНК: J2a-PF5252
  • мтДНК: T2b
Re: An Ancient Harappan Genome Lacks Ancestry from Steppe Pastoralists or Iranian Farmers
« Ответ #20 : 08 Сентябрь 2019, 13:02:55 »
4) Бронзовик из Северной Бактрии (Узбекистан) I11027 Bustan_BA BMAC 1662-1521 calBCE. В статье обозначен как  J2a1.
Очевидно должен стать самым популярным для молгена образцом, так как он оказался J2a-L26>PF5116>PF5119>L558>M67>Z1847>CTS900>Z7661* (xZ7661).
Первый дДНК, родственный самому распространенному на Северном Кавказе субкладу CTS900.
Уровень CTS900: CTS900+ (3 прочтения); Z2242+ (11 прочтений !!!)
Уровень Z7661: Z7678+ (5 прочтений); Z7667+ (1 прочтение); Y3023+ (7 прочтений); Z7664+ (8 прочтений); Z7662+ (1 прочтение)
Уровень Y3020: Z7675- (2 прочтения); Z7660- (1 прочтение); Y3020- (1 прочтение)
Из снипов, которые пока не распределены между уронями  Z7661<>Y3020: Z28055+(1 прочтение) и Z7663- (1 прочтение).
По-кавказски ярко) Обычно для дДНК 2 рида уже удача.

Про Бустан можно, например, здесь почитать https://secrethistory.su/844-kultury-ariyskih-plemen-i-ih-migracii-v-sredney-azii.html
« Последнее редактирование: 08 Сентябрь 2019, 13:12:00 от mikhail a. »

Оффлайн Semargl

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Сообщений: 5281
  • Страна: hr
  • Рейтинг +2580/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: An Ancient Harappan Genome Lacks Ancestry from Steppe Pastoralists or Iranian Farmers
« Ответ #21 : 08 Сентябрь 2019, 17:59:24 »
Посмотрел образец I3396 Krasnoyarsk_MLBA (Krasnoyarsk Krai, near Orak Ulus, Orak burial place) 2580-2340 calBCE (3960±40 BP, Poz-10825)
Заинтересовал тем, что указан в статье как R1a1a1b1a, то есть как понимаю - R1a-Z280 > P278 с возрастом всего в пару тысяч лет.
Как и предполагал, оказался нормальный восточный субклад R-S23592, в котором уже много древних образцов.
R-S23592: S23592+
R-YP5844: M4367-
R-Y95687: Y103445- Y105635-
R-BY102185: BY61819- BY65872- BY92576- BY120549- BY119500- A20162-
R-S23201: YP348-
R-YP1359: YP1359- Y12885-
R-YP1352: YP1353- YP1358-
R-YP5505: FGC56429- S10885-
R-FGC56440: FGC56440-
R-Y65081: Y65081-
R-YP1456: YP1456-
R-YP1455: YP1460/FGC31687-
R-YP1548: YP1557-
R-YP1542: Y29560- YP1546- YP1561- YP1559- YP1547- YP1560-
R-F21381: F21381-

Оффлайн G-Man

  • Сообщений: 333
  • Страна: ru
  • Рейтинг +165/-1
  • Y-ДНК: G-Z6653
Re: An Ancient Harappan Genome Lacks Ancestry from Steppe Pastoralists or Iranian Farmers
« Ответ #22 : 08 Сентябрь 2019, 20:53:05 »
Первый дДНК, родственный самому распространенному на Северном Кавказе субкладу CTS900.

Находили же в Майкопской культуре и энеолите Западного Кавказа  :)

http://forum.molgen.org/index.php/topic,10905.msg440904.html#msg440904

Оффлайн 248446

  • Сообщений: 1044
  • Страна: tr
  • Рейтинг +98/-30
  • Y-ДНК: L1b2b-PH8
  • мтДНК: X2f
Re: An Ancient Harappan Genome Lacks Ancestry from Steppe Pastoralists or Iranian Farmers
« Ответ #23 : 08 Сентябрь 2019, 22:10:03 »
Интересно, кто нибудь выложит все это в Google Excel?

Оффлайн mikhail a.

  • Сообщений: 1253
  • Страна: ru
  • Рейтинг +332/-0
  • Y-ДНК: J2a-PF5252
  • мтДНК: T2b
Re: An Ancient Harappan Genome Lacks Ancestry from Steppe Pastoralists or Iranian Farmers
« Ответ #24 : 08 Сентябрь 2019, 23:49:08 »
Первый дДНК, родственный самому распространенному на Северном Кавказе субкладу CTS900.

Находили же в Майкопской культуре и энеолите Западного Кавказа  :)

http://forum.molgen.org/index.php/topic,10905.msg440904.html#msg440904

Забыл про них. Нужно будет еще раз внимательно пересмотреть результаты той статьи про Майкоп.

Оффлайн mikhail a.

  • Сообщений: 1253
  • Страна: ru
  • Рейтинг +332/-0
  • Y-ДНК: J2a-PF5252
  • мтДНК: T2b
Re: An Ancient Harappan Genome Lacks Ancestry from Steppe Pastoralists or Iranian Farmers
« Ответ #25 : 08 Сентябрь 2019, 23:53:44 »
Интересно, кто нибудь выложит все это в Google Excel?

Лично у меня по тем нескольким образцам, которые я проверял, эти данные довольно в непрезентабельном виде и для того, чтобы сделать их удобочитаемыми, нужно много трудозатрат.

Оффлайн 248446

  • Сообщений: 1044
  • Страна: tr
  • Рейтинг +98/-30
  • Y-ДНК: L1b2b-PH8
  • мтДНК: X2f
Re: An Ancient Harappan Genome Lacks Ancestry from Steppe Pastoralists or Iranian Farmers
« Ответ #26 : 09 Сентябрь 2019, 08:07:44 »
Имею ввиду, если возможно вообще, в виде общего списка образцов и определённого терминального снипа для него.

Оффлайн mikhail a.

  • Сообщений: 1253
  • Страна: ru
  • Рейтинг +332/-0
  • Y-ДНК: J2a-PF5252
  • мтДНК: T2b
Re: An Ancient Harappan Genome Lacks Ancestry from Steppe Pastoralists or Iranian Farmers
« Ответ #27 : 09 Сентябрь 2019, 09:24:36 »
Имею ввиду, если возможно вообще, в виде общего списка образцов и определённого терминального снипа для него.
Согласен. Такая табличка была бы очень полезной. Надеюсь, со временем кто-нибудь возьмет на себя труд обобщить результаты анализа из разных источников. Было бы очень полезно.

Оффлайн mikhail a.

  • Сообщений: 1253
  • Страна: ru
  • Рейтинг +332/-0
  • Y-ДНК: J2a-PF5252
  • мтДНК: T2b
Re: An Ancient Harappan Genome Lacks Ancestry from Steppe Pastoralists or Iranian Farmers
« Ответ #28 : 09 Сентябрь 2019, 09:28:32 »
5) I12458 Swat Valley, Loebanr 1000-800 BCE. Заявленная в статье гаплогруппа J2.
Оказался из характерного для Южной Азии субклада J2b-Y950 (хY947)
« Последнее редактирование: 09 Сентябрь 2019, 11:49:11 от mikhail a. »

Оффлайн Semargl

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Сообщений: 5281
  • Страна: hr
  • Рейтинг +2580/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: An Ancient Harappan Genome Lacks Ancestry from Steppe Pastoralists or Iranian Farmers
« Ответ #29 : 09 Сентябрь 2019, 09:50:36 »
Интересные данные по чешским шнуровикам:
I7208 2464-2295 calBCE (3885±25 BP, PSUAMS-3888) Corded_Ware_Czech_EN (Radovesice III) - R-CTS4385
I7209 2458-2207 calBCE (3850±25 BP, PSUAMS-4026) Corded_Ware_Czech_EN (Radovesice X) - R-CTS4385*
I7207 2559-2340 calBCE (3935±25 BP, PSUAMS-3887) Corded_Ware_Czech_EN (Radovesice XVIII) - R-M417. Недотипирован по причине низкого качества. Не исключено что мог бы быть R-CTS4385...
Напомню, что субклад R-CTS4385 является родительским к субкладу R-L664, который имеют подавляющее большинство R1a в Великобритании. На континенте они сейчас практически не представлены.
Похоже найден источник появления британских R1a-L664? :)

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100