АвторТема: Insight into the history of the Near East from whole-genome sequences of Yemenis  (Прочитано 202 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн rozenblattАвтор темы

  • Сообщений: 1165
  • Страна: kg
  • Рейтинг +1315/-0
  • Y-ДНК: C-F5481
  • мтДНК: M8a
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/749341v1

Insight into the genomic history of the Near East from whole-genome sequences and genotypes of Yemenis

Marc Haber, Riyadh Saif-Ali, Molham Alhabori, Yuan Chen, Daniel E Platt, Chris Tyler-Smith, Yali Xue

doi: https://doi.org/10.1101/749341

Abstract

We report high coverage whole genome sequencing data from 46 Yemeni individuals as well as genome wide genotyping data from 169 Yemenis from diverse locations. We use this dataset to define the genetic diversity in Yemen and how it relates to people elsewhere in the Near East. Yemen is a vast region with substantial cultural and geographic diversity, but we found little genetic structure correlating with geography among the Yemenis, probably reflecting continuous movement of people between the regions. African ancestry from admixture in the past 800 years is widespread in Yemen and is the main contributor to the countrys limited genetic structure, with some individuals in Hudayda and Hadramout having up to 20% of their genetic ancestry from Africa. In contrast, individuals from Maarib appear to have been genetically isolated from the African gene flow and thus have genomes likely to reflect Yemens ancestry before the admixture. This ancestry was comparable to the ancestry present during the Bronze Age in the distant Northern regions of the Near East. After the Bronze Age, the South and North of the Near East therefore followed different genetic trajectories: in the North the Levantines admixed with a Eurasian population carrying steppe ancestry whose impact never reached as far south as the Yemen, where people instead admixed with Africans leading to the genetic structure observed in the Near East today.

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Сообщений: 34851
  • Страна: ca
  • Рейтинг +3012/-47
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Мой кузен (J-M205) всего один.    >:(

Не тех смотрели. Из всех родичей у меня преобладают именно йемениты.   :)

Оффлайн rozenblattАвтор темы

  • Сообщений: 1165
  • Страна: kg
  • Рейтинг +1315/-0
  • Y-ДНК: C-F5481
  • мтДНК: M8a
Мой кузен (J-M205) всего один.    >:(

Не тех смотрели. Из всех родичей у меня преобладают именно йемениты.   :)

Ну с нынешней ситуацией в Йемене, хорошо что хоть кого-то исследуют.

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Сообщений: 34851
  • Страна: ca
  • Рейтинг +3012/-47
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Ха.
Так ведь мои кузены - самовыдвиженцы. На свои кровные протестировались и со мною побратались.    ::)

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Сообщений: 34851
  • Страна: ca
  • Рейтинг +3012/-47
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a

Оффлайн rozenblattАвтор темы

  • Сообщений: 1165
  • Страна: kg
  • Рейтинг +1315/-0
  • Y-ДНК: C-F5481
  • мтДНК: M8a
Ха.
Так ведь мои кузены - самовыдвиженцы. На свои кровные протестировались и со мною побратались.    ::)

Молодцы. Наши бы(из Киргизии) так тестировались.

Оффлайн KHAN

  • Сообщений: 281
  • Рейтинг +66/-0
  • Y-ДНК: R-S3373*, J-ZS2366*, R-S1327*, R-YP1137*, R-YP4078*, I-Y3118*, Y-10622*
  • мтДНК: U5b1a1b, N1b1a8a, H7c1, H1c
В выборке даже R1a-Z92 засветился или опечатка с Z93...

Оффлайн Yaroslav

  • Я всего лишь уличный повеса, Улыбающийся встречным лицам
  • Сообщений: 12479
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2448/-10
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a-ZS3114 > ZS3084, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1-Z16971 > Y159653, МЖМ: G2a2b1a1a1a2b2-FT44209
  • мтДНК: K1b1a1-T199C, МЖ: H13a1a1d
Я так понимаю, номенклатура уровня ISOGG 2016:

J1a2a - P56

J1a2b - P58

J1a3 - Z1828

BAM-файлы будут? Интересен данный участок дерева, оно по снипам строилось? Если да, то из каких публикаций брались чеченец, ливанец и египтянин (которые в J1a3).

По йеменцам J1a2a-P56:

Цитировать
EGAN00001456765 Yemen-11 Hudayda J-CTS5368
EGAN00001456774 Yemen-12 Hudayda J-CTS5368

CTS5368 - это уровень Z2215. Опять с J1 не стали глубоко заморачиваться...

« Последнее редактирование: 30 Август 2019, 09:23:33 от Yaroslav »

Оффлайн mikhail a.

  • Сообщений: 1253
  • Страна: ru
  • Рейтинг +332/-0
  • Y-ДНК: J2a-PF5252
  • мтДНК: T2b
Re: Insight into the history of the Near East from whole-genome sequences of Yemenis
« Ответ #8 : 01 Сентябрь 2019, 01:22:20 »
BAM-файлы будут?

Есть, но доступ ограничен. По крайней мере, мне сайт показал такую вот фигу

Надеюсь, знатоки этой темы подскажу как до них добраться. Ну или сами посморят)

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100