АвторТема: Средневековая ДНК из Индии  (Прочитано 929 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн rozenblattАвтор темы

  • Сообщений: 1154
  • Страна: kg
  • Рейтинг +1287/-0
  • Y-ДНК: C-F5481
  • мтДНК: M8a
Средневековая ДНК из Индии
« : 20 Август 2019, 19:49:09 »
https://www.nature.com/articles/s41467-019-11357-9

Ancient DNA from the skeletons of Roopkund Lake reveals Mediterranean migrants in India

    Éadaoin Harney, Ayushi Nayak, Nick Patterson, Pramod Joglekar, Veena Mushrif-Tripathy, Swapan Mallick, Nadin Rohland, Jakob Sedig, Nicole Adamski, Rebecca Bernardos, Nasreen Broomandkhoshbacht, Brendan J. Culleton, Matthew Ferry, Thomas K. Harper, Megan Michel, Jonas Oppenheimer, Kristin Stewardson, Zhao Zhang, Harashawaradhana, Maanwendra Singh Bartwal, Sachin Kumar, Subhash Chandra Diyundi, Patrick Roberts, Nicole Boivin, Douglas J. Kennett, Kumarasamy Thangaraj, David Reich & Niraj Rai - Show fewer authors

Nature Communications volume 10, Article number: 3670 (2019)

Abstract

Situated at over 5,000 meters above sea level in the Himalayan Mountains, Roopkund Lake is home to the scattered skeletal remains of several hundred individuals of unknown origin. We report genome-wide ancient DNA for 38 skeletons from Roopkund Lake, and find that they cluster into three distinct groups. A group of 23 individuals have ancestry that falls within the range of variation of present-day South Asians. A further 14 have ancestry typical of the eastern Mediterranean. We also identify one individual with Southeast Asian-related ancestry. Radiocarbon dating indicates that these remains were not deposited simultaneously. Instead, all of the individuals with South Asian-related ancestry date to ~800 CE (but with evidence of being deposited in more than one event), while all other individuals date to ~1800 CE. These differences are also reflected in stable isotope measurements, which reveal a distinct dietary profile for the two main groups.

Расположенное на высоте более 5000 метров над уровнем моря в Гималайских горах, озеро Рупкунд является местом скопления разбросанных скелетных останков нескольких сотен человек неизвестного происхождения. Мы сообщаем о древней ДНК 38 скелетов из озера Рупкунд в масштабе всего генома и обнаруживаем, что они сгруппированы в три различные группы. Группа из 23 человек имеет происхождение, которое попадает в диапазон вариаций, характерных для современной Южной Азии. Еще 14 имеют происхождение, типичное для Восточного Средиземноморья. Мы также идентифицируем одного человека с предками, связанными с Юго-Восточной Азией.Радиоуглеродное датирование указывает на то, что эти останки не были отложены одновременно. Вместо этого, все лица с южноазиатским происхождением датируются ~800 годом нашей эры (но есть свидетельства того, что они погибли более чем в одном событии), тогда как все остальные лица датируются ~1800 годом нашей эры. Эти различия также отражаются в измерениях стабильных изотопов, которые показывают четко различимые рационы питания для двух основных групп.

Sample ID Skeletal codes Population label Sex mtDNA (method 1) mtDNA (method 2) Y-DNA 1240k coverage Calibrated radiocarbon datesc
I2868 R01 Roopkund_A M M1a1c M33d H1a2a1 0.868 890–982 CE
I2871 R04 Roopkund_A F M3C1 M3c1a .. 0.579 773–940 CE
I2872 R06 Roopkund_A F M3c2 M3c2 .. 0.199 773–940 CE
I3342 R08 Roopkund_A M M3a2 M3a2 H1a1d2 0.577 773–940 CE
I3343 R10 Roopkund_A F M3 M3 .. 0.223 773–890 CE
I3344 R11 Roopkund_A F U U2c1 .. 0.105 775–890 CE
I3346 R15 Roopkund_A M .. M30c E1b1b1 0.304 717–889 CE
I3349 R17 Roopkund_A F .. M5a .. 0.133 770–945 CE
I3351 R19 Roopkund_A M M3a1 M4 Jb 0.044 770–887 CE
I3352 R20 Roopkund_A M HV HV14 R2a3a2b2c 1.476 689–876 CE
I3402 R25 Roopkund_A M M5a U1a1a H3b 0.118 770–887 CE
I3406 R43 Roopkund_A M M30 M30 J2a1 0.295 885–980 CE
I3407 R44 Roopkund_A M M3a1 M3a1 H1a1d2 0.105 775–961 CE
I6934 R45 Roopkund_A F .. .. .. 0.861 773–890 CE
I6938 R51 Roopkund_A F X X2p .. 0.481 694–875 CE
I6941 R55 Roopkund_A M J1b1a1 J1b1a1 .. 0.59 894–985 CE
I6942 R57 Roopkund_A M P4b1 R30b2a .. 0.602 770–887 CE
I6943 R61 Roopkund_A M M3a1 M3a1 .. 0.133 675–769 CE
I6944 R62 Roopkund_A F U2e3 U4d3 .. 0.34 726–885 CE
I6945 R64 Roopkund_A F M4″67 M30 + 16234 .. 0.035 687–870 CE
I6946 R65 Roopkund_A M U2a1 U8b1a1 .. 0.349 773–890 CE
I7035 R68 Roopkund_A F U7 U7a2 .. 0.565 889–971 CE
I7036 R69 Roopkund_A M H H13a2a .. 0.37 778–988 CE
I2869 R02 Roopkund_B M H H6b1 J1a3a 0.782 1668–1945 CE
I2870 R03 Roopkund_B F T1 T1a .. 0.028 1706–1915 CE
I3345 R13 Roopkund_B M H1 H1 R1a1a1b1a2b 1.547 1681–1939 CE
I3348 R16 Roopkund_B F H1 H1c .. 0.409 1682–1932 CE
I3350 R18 Roopkund_B M H H60a G2a2b2a1a1c1a2 1.349 1675–1943 CE
I3401 R22 Roopkund_B M N2 W1 R1b1ab 0.049 ..
I3403 R39 Roopkund_B M N X2d T1a2 0.492 1691–1925 CE
I3404 R40 Roopkund_B M H H12 E1b1b1b2 1.077 1706–1915 CE
I3405 R42 Roopkund_B F J1b J1b .. 0.514 1656-… CE
I6935 R46 Roopkund_B F HV .. .. 0.627 1668–1945 CE
I6936 R48 Roopkund_B M M2a1a H1b .. 1.371 1681–1939 CE
I6937 R49 Roopkund_B F H12 H12a .. 0.837 1661-… CE
I6939 R53 Roopkund_B M H1 H1 .. 0.605 1680–1939 CE
I6947 R66 Roopkund_B M K K1a .. 0.026 1675–1943 CE
I6940 R54 Roopkund_C M M24 M24a O1b1a1a1b 0.489 1653-… CE

В новостях:

«Озеро скелетов» в Индии оказалось могилой для паломников

Оффлайн Yaroslav

  • Я всего лишь уличный повеса, Улыбающийся встречным лицам
  • Сообщений: 12293
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2361/-10
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a-ZS3114 > ZS3084, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1-Z16971 > Y159653, МЖМ: G2a2b1a1a1a2-Y92117
  • мтДНК: K1b1a1-T199C, МЖ: H13a1a1d
Re: Средневековая ДНК из Индии
« Ответ #1 : 20 Август 2019, 20:12:08 »
Jb у образца I3351 - это наверно J2b с опечаткой? Номенклатура ISOGG, я думаю, у них 2019 года?

Оффлайн rozenblattАвтор темы

  • Сообщений: 1154
  • Страна: kg
  • Рейтинг +1287/-0
  • Y-ДНК: C-F5481
  • мтДНК: M8a
Re: Средневековая ДНК из Индии
« Ответ #2 : 20 Август 2019, 20:21:21 »
Jb у образца I3351 - это наверно J2b с опечаткой? Номенклатура ISOGG, я думаю, у них 2019 года?

Нет, там b - это примечание, b - Y-chromosome calls that should be interpreted with caution due to low coverage, т.е. там J, но покрытие низкое, так что возможны ошибки.

Оффлайн kardes

  • Сообщений: 303
  • Страна: ru
  • Рейтинг +275/-2
  • Y-ДНК: G2a1
Re: Средневековая ДНК из Индии
« Ответ #3 : 20 Август 2019, 20:38:44 »
"Ученые не обнаружили в останках ДНК патогенных микроорганизмов"
теперь такие "джентльмены удачи и горе альпинисты" будут объектом охоты палеогенетиков как кладезь неиспорченного дднк,
а полученные результаты пища для архивариусов, журналистов и детективов:
"Возможно, отмечают авторы, в архивах удастся найти информацию о больших иностранных экспедициях, пропавших за последние несколько веков."

Оффлайн Laszcz

  • von Wrbna, von Würben, de Vrbna, h. Wierzbna (de Verbno)
  • Сообщений: 988
  • Страна: ru
  • Рейтинг +243/-31
    • laszczynski.pl
  • Y-ДНК: E-V13 (E-CTS9320*)
  • мтДНК: J1c2r
Re: Средневековая ДНК из Индии
« Ответ #4 : 20 Август 2019, 23:01:34 »
Интересно, будут ли БАМы по этим ребятам из экспедиции 19 века

Оффлайн пенелопа

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 5675
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1814/-12
  • мтДНК: H1b
Re: Средневековая ДНК из Индии
« Ответ #5 : 21 Август 2019, 10:05:25 »
Выложены результаты: https://www.ebi.ac.uk/ena/data/view/PRJEB29537

Оффлайн Semargl

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Сообщений: 5237
  • Страна: hr
  • Рейтинг +2504/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: Средневековая ДНК из Индии
« Ответ #6 : 21 Август 2019, 10:30:08 »
Выложены результаты: https://www.ebi.ac.uk/ena/data/view/PRJEB29537
I3345   R13   Roopkund_B   M   H1   H1   R1a1a1b1a2b   1.547   1681–1939 CE

Из ветви https://www.yfull.com/tree/R-Y2608/

Оффлайн kardes

  • Сообщений: 303
  • Страна: ru
  • Рейтинг +275/-2
  • Y-ДНК: G2a1
Re: Средневековая ДНК из Индии
« Ответ #7 : 21 Август 2019, 11:10:13 »
Выложены результаты: https://www.ebi.ac.uk/ena/data/view/PRJEB29537
I3345   R13   Roopkund_B   M   H1   H1   R1a1a1b1a2b   1.547   1681–1939 CE

Из ветви https://www.yfull.com/tree/R-Y2608/
Еще 14 имеют происхождение, типичное для Восточного Средиземноморья. 
да, славянин, не грек и не критянин, а G2а2 грек?
I3350   R18   Roopkund_B   M   H   H60a   G2a2b2a1a1c1a2   1.349   1675–1943 C

Оффлайн Laszcz

  • von Wrbna, von Würben, de Vrbna, h. Wierzbna (de Verbno)
  • Сообщений: 988
  • Страна: ru
  • Рейтинг +243/-31
    • laszczynski.pl
  • Y-ДНК: E-V13 (E-CTS9320*)
  • мтДНК: J1c2r
Re: Средневековая ДНК из Индии
« Ответ #8 : 21 Август 2019, 11:29:26 »
А по E скажите, пожалуйста!

Оффлайн Semargl

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Сообщений: 5237
  • Страна: hr
  • Рейтинг +2504/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: Средневековая ДНК из Индии
« Ответ #9 : 21 Август 2019, 13:31:35 »
I3350   R18   Roopkund_B   M   H   H60a   G2a2b2a1a1c1a2   1.349   1675–1943 C
Он точно с этой ветви, но что дальше - непонятно.
https://www.yfull.com/tree/G-Z3428/
Есть только пара минусов ниже:
FGC307- Y21161- FGC249- Z3568-

Все образцы, которые смотрел, не очень хорошего качества.

Оффлайн Semargl

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Сообщений: 5237
  • Страна: hr
  • Рейтинг +2504/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: Средневековая ДНК из Индии
« Ответ #10 : 21 Август 2019, 13:39:31 »
А по E скажите, пожалуйста!
I3404   R40   Roopkund_B   M   H   H12   E1b1b1b2   1.077   1706–1915 CE

https://www.yfull.com/tree/E-FGC18401/
Из минусов ниже только:
E-FGC18369: FGC18430- FGC18414-
E-Z36154: Z36157-
E-BY203096: BY202328-

Оффлайн kardes

  • Сообщений: 303
  • Страна: ru
  • Рейтинг +275/-2
  • Y-ДНК: G2a1
Re: Средневековая ДНК из Индии
« Ответ #11 : 21 Август 2019, 13:43:22 »
I3350   R18   Roopkund_B   M   H   H60a   G2a2b2a1a1c1a2   1.349   1675–1943 C
Он точно с этой ветви, но что дальше - непонятно.
https://www.yfull.com/tree/G-Z3428/
Есть только пара минусов ниже:
FGC307- Y21161- FGC249- Z3568-

Все образцы, которые смотрел, не очень хорошего качества.
Спасибо, итальянец, предки родом с Кальяри, в этой же ветви есть кавказцы дигорско-балкарская ветвь

Оффлайн Laszcz

  • von Wrbna, von Würben, de Vrbna, h. Wierzbna (de Verbno)
  • Сообщений: 988
  • Страна: ru
  • Рейтинг +243/-31
    • laszczynski.pl
  • Y-ДНК: E-V13 (E-CTS9320*)
  • мтДНК: J1c2r
Re: Средневековая ДНК из Индии
« Ответ #12 : 21 Август 2019, 13:49:39 »
А по E скажите, пожалуйста!
I3404   R40   Roopkund_B   M   H   H12   E1b1b1b2   1.077   1706–1915 CE

https://www.yfull.com/tree/E-FGC18401/
Из минусов ниже только:
E-FGC18369: FGC18430- FGC18414-
E-Z36154: Z36157-
E-BY203096: BY202328-
Спасибо! Интересная ветвь. А второй непонятный?

Оффлайн Yaroslav

  • Я всего лишь уличный повеса, Улыбающийся встречным лицам
  • Сообщений: 12293
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2361/-10
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a-ZS3114 > ZS3084, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1-Z16971 > Y159653, МЖМ: G2a2b1a1a1a2-Y92117
  • мтДНК: K1b1a1-T199C, МЖ: H13a1a1d
Re: Средневековая ДНК из Индии
« Ответ #13 : 21 Август 2019, 13:53:36 »
Уважаемый Semargl, и меня тогда уважьте, пожалуйста :)


Цитировать
I2869   R02   Roopkund_B   M   H   H6b1   J1a3a   0.782   1668–1945 CE

На Anthrogenica ещё пишут про какого-то:

Цитировать
I6941 R55 Roopkund_A J1b1a1 894–985 CE

Оффлайн Semargl

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Сообщений: 5237
  • Страна: hr
  • Рейтинг +2504/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: Средневековая ДНК из Индии
« Ответ #14 : 21 Август 2019, 14:58:12 »
Уважаемый Semargl, и меня тогда уважьте, пожалуйста :)


Цитировать
I2869   R02   Roopkund_B   M   H   H6b1   J1a3a   0.782   1668–1945 CE

На Anthrogenica ещё пишут про какого-то:

Цитировать
I6941 R55 Roopkund_A J1b1a1 894–985 CE

I2869   R02   Roopkund_B   M   H   H6b1   J1a3a   0.782   1668–1945 CE
https://www.yfull.com/tree/J-Z1842/
Знаю что будет интересен Вам, поэтому подробный расклад. Все что есть ниже:
J-Z1842: Z1842+
J-Y102610: Y91337- Y92226-
J-ZS11222: ZS11221- ZS11229- ZS11238-
J-Y36145: Y36148- Y36663- Y36153- Y36160- Y125988-
J-Y86486: Y87457-
J-ZS5655: BY38055-
J-ZS5644: ZS5677-
J-Y140347: Y140347-
J-Y83506: Y86804- Y91921-
J-Y22665: YSC0001133- ZS7012- Y157794- FGC37505-
J-Y158747: ZS7072/ZS8750- ZS8714- ZS8716- ZS8720- ZS8737- ZS8739-
J-Y5353: Z18460/Y5357-
J-ZS3009: ZS3006-
J-Y36737: Y36739-
J-Y36269: Y36273-
J-Y30433: Y29717- ZS10950- ZS10940-
J-Y86730: Y86736-
J-Y130256: BY84746-
J-FT11364: FT11364-
J-CTS7188: Y6918/FGC14045/Z18444-
J-Y166886: Y166893/FT5446- FT5450/Y166909- FT5742/Y166892- Y166900/FT6171-
J-Y113102: Y150785- BY60698-
J-Y81380: Y90304- Y83026-
J-ZS11710: Y72567- Y77873-
J-Y29727: Y29726- SK1695- FGC41005-
J-Y86300: Y86300- Y92901-
J-CTS3496: Y80636- Y75938- CTS3496-
J-ZS11316: ZS11316-
J-Y140352: Y140357-
J-Y140345: Y140345-
J-ZS2870: ZS2882-
J-Y151410: Y151414/BY152342- Y151465-
J-ZS7661: ZS10517- Y20908- Y51390-
J-Y143423: Y144386/BY45302- Y143422/BY45307-
J-ZS7640: ZS7628- ZS7643- Y21706- Y141145x ZS7654- ZS7641-
J-Y100085: Y145454-

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100