0 Пользователей и 3 Гостей просматривают эту тему.
Цитата: Шад от 11 Август 2016, 09:42:02Очевидно, что полный геном (ну таких у нас единицы пока) и данные FF и 23&Me (но там ограниченный набор снипов Х-хромосомы).Да, в файлах от FTDNA (FF) я нашел только два снипа из перечисленных авторами.У моего отца Ancestral allele по двум этим снипам:"rs12845083","X","141656627","AA""rs5908365","X","141659498","CC"
Очевидно, что полный геном (ну таких у нас единицы пока) и данные FF и 23&Me (но там ограниченный набор снипов Х-хромосомы).
гаплогруппы по X-хромосоме
то в случае мужчины это будет 15x на Y-хромосому и 15x на X-хромосому, то есть по 15x на каждую "половину" генома. Такое писал человек из Full Genome
Цитироватьто в случае мужчины это будет 15x на Y-хромосому и 15x на X-хромосому, то есть по 15x на каждую "половину" генома. Такое писал человек из Full GenomeА можно конкретную цитату или ссылочку? Тем более, что Х у человека то же могут быть разные, и что это получается - по 15х на каждую половину? Попахивает недопониманием.
AbstractHuman genetic diversity in Europe has been extensively studied using uniparentally inherited sequences (mitochondrial DNA (mtDNA) and the Y chromosome), which reveal very different patterns indicating sex-specific demographic histories. The X chromosome, haploid in males and inherited twice as often from mothers as from fathers, could provide insights into past female behaviours, but has not been extensively investigated. Here, we use HapMap single-nucleotide polymorphism data to identify genome-wide segments of the X chromosome in which recombination is historically absent and mutations are likely to be the only source of genetic variation, referring to these as phylogeographically informative haplotypes on autosomes and X chromosome (PHAXs). Three such sequences on the X chromosome spanning a total of ~49 kb were resequenced in 240 males from Europe, the Middle East and Africa at an average coverage of 181 ×. These PHAXs were confirmed to be essentially non‐recombining across European samples. All three loci show highly homogeneous patterns across Europe and are highly differentiated from the African sample. Star-like structures of European-specific haplotypes in median-joining networks indicate past population expansions. Bayesian skyline plots and time-to-most-recent-common-ancestor estimates suggest expansions pre-dating the Neolithic transition, a finding that is more compatible with data on mtDNA than the Y chromosome, and with the female bias of X-chromosomal inheritance. This study demonstrates the potential of the use of X-chromosomal haplotype blocks, and the utility of the accurate ascertainment of rare variants for inferring human demographic history.