АвторТема: Сдал в ДНК-НАСЛЕДИЕ, получил R1a1a (M198)  (Прочитано 6319 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн VladSerdАвтор темы

  • Сообщений: 44
  • Страна: ru
  • Рейтинг +22/-0
  • Y-ДНК: R-Y153140
  • мтДНК: U5a1b1h
Re: Сдал в ДНК-НАСЛЕДИЕ, получил R1a1a (M198)
« Ответ #60 : 05 Декабрь 2019, 19:52:54 »
Как интересно...((...

Оффлайн Lesla

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 9168
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2354/-9
  • FTDNA: 154400 (Big Y - 283049)
  • Y-ДНК: R1a-YP682 (VK06+)
Re: Сдал в ДНК-НАСЛЕДИЕ, получил R1a1a (M198)
« Ответ #61 : 06 Декабрь 2019, 18:54:48 »
Перенесено про почту - http://forum.molgen.org/index.php/topic,5774.1200.html

Оффлайн VladSerdАвтор темы

  • Сообщений: 44
  • Страна: ru
  • Рейтинг +22/-0
  • Y-ДНК: R-Y153140
  • мтДНК: U5a1b1h
Re: Сдал в ДНК-НАСЛЕДИЕ, получил R1a1a (M198)
« Ответ #62 : 13 Декабрь 2019, 10:06:53 »
Здравствуйте Всем, дорогие форумчане !) Вчера получил ответ Y Full...
пожалуйста, кто-нибудь сможет перевести на сырьмяжный ензык ))
"Маркер Y-GGAAT-1B07 в YFull не совпадает с номенклатурой FTDNA!

Маркер Y-GGAAT-1B07 можно назвать странным. Лаборатория SMGF разработала праймеры для этого маркера используя сиквенс AC019099 клона RP11-428D10 от донора RP11. Однако, этот сиквенс нельзя обнаружить в референсной последовательности человеческого генома. Даже в сброке GRCh37/hg18. Мы точно знаем, что последовательность существует (почти) у каждого мужчины, и что она наследуется по прямой мужской линии. Поэтому она должна быть где-то на Y-хромосоме. Повторяющиеся сегменты GGAAT очень сильно распространены в области центромеры на Y-хромосоме, но в то же время они являются общим мотивом в регионе Yq12. Оба этих региона являются мало изученными, потому что нет достаточно данных для картирования, чтобы создать сборку и полную последовательность для них. Поэтому точное положение маркера Y-GGAAT-1B07 остается загадкой до тех пор, пока у нас не появятся улучшенные технологии секвенирования, которые способны упорядочить и просеквенировать десятки тысяч нуклеотидов подряд.

Thomas Krahn // http://archiver.rootsweb.ancestry.com/th/read/GENEALOGY-DNA/2013-01/1357339085"
...я , признаться к своему стыду.  ничаво не "срубил" ))

Спасибо огромное Всем за внимание!

А где и как себя увидеть в  Большом дереве ?...

Ещё раз спасибо.

Оффлайн VladSerdАвтор темы

  • Сообщений: 44
  • Страна: ru
  • Рейтинг +22/-0
  • Y-ДНК: R-Y153140
  • мтДНК: U5a1b1h
Re: Сдал в ДНК-НАСЛЕДИЕ, получил R1a1a (M198)
« Ответ #63 : 13 Декабрь 2019, 10:39:37 »
))) прошу прощения за "вольности"...
серьмяжный язык/правда...
... там из более 700 значений Y Full  - индексов маркеров...все нижние, около 200 были красного цвета...
...т.е. не попадающие в  "прокрустово ложе..."

Оффлайн NathanS

  • Сообщений: 290
  • Рейтинг +203/-2
Re: Сдал в ДНК-НАСЛЕДИЕ, получил R1a1a (M198)
« Ответ #64 : 14 Декабрь 2019, 01:00:33 »
А где и как себя увидеть в  Большом дереве ?..

На дереве Yfull Вы можете увидеть себя здесь: https://www.yfull.com/tree/R-YP1020/, смотрите свой номер в Yfull. Пока Вы не попали ни в одну подветку R-YP1020, хотя, как я понимаю, у Вас позитивен R-Y35177. У меня есть похожий результат в другой гаплогруппе. Насколько я понимаю, надо тестировать какого-то родственника, или пару, по мужской линии, чтобы можно было выделить подветвь. Возмжно разобьете какую-то существующую подветку, но я пока сам не очень понимаю такие случаи.

Оффлайн NathanS

  • Сообщений: 290
  • Рейтинг +203/-2
Re: Сдал в ДНК-НАСЛЕДИЕ, получил R1a1a (M198)
« Ответ #65 : 14 Декабрь 2019, 01:20:49 »
"Маркер Y-GGAAT-1B07 в YFull не совпадает с номенклатурой FTDNA!

Маркер Y-GGAAT-1B07 можно назвать странным. Лаборатория SMGF разработала праймеры для этого маркера используя сиквенс AC019099 клона RP11-428D10 от донора RP11. Однако, этот сиквенс нельзя обнаружить в референсной последовательности человеческого генома. Даже в сброке GRCh37/hg18. Мы точно знаем, что последовательность существует (почти) у каждого мужчины, и что она наследуется по прямой мужской линии. Поэтому она должна быть где-то на Y-хромосоме. Повторяющиеся сегменты GGAAT очень сильно распространены в области центромеры на Y-хромосоме, но в то же время они являются общим мотивом в регионе Yq12. Оба этих региона являются мало изученными, потому что нет достаточно данных для картирования, чтобы создать сборку и полную последовательность для них. Поэтому точное положение маркера Y-GGAAT-1B07 остается загадкой до тех пор, пока у нас не появятся улучшенные технологии секвенирования, которые способны упорядочить и просеквенировать десятки тысяч нуклеотидов подряд.

Не знаю, если перескажу правильно.
У Вас видимо прочиталась, мутация в игрек-хромосоме, которая есть у большинства мужчин. Известно, что она сидит на ингрек-хромосоме, но где именно пока не известно. Надо ждать развития новых технолофий, чтобы определить где именно она находится.

Т.е. возможно это может повлиять на положении в дере в будущем, но, я думаю, это маловероятно. Положение в дереве Вам дали, и это уже хорошо. Если бы было что-то совсвм необычное, то определили бы Вас к пра-Адаму. А так, это пока для информации и, что в будущем могут быть изменения в Вашем положении в дереве.

Оффлайн VladSerdАвтор темы

  • Сообщений: 44
  • Страна: ru
  • Рейтинг +22/-0
  • Y-ДНК: R-Y153140
  • мтДНК: U5a1b1h
Re: Сдал в ДНК-НАСЛЕДИЕ, получил R1a1a (M198)
« Ответ #66 : 14 Декабрь 2019, 19:58:29 »
СПАСИБО ВАМ ОГРОМНОЕ ! )

Оффлайн Semargl

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 5513
  • Страна: hr
  • Рейтинг +2902/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: Сдал в ДНК-НАСЛЕДИЕ, получил R1a1a (M198)
« Ответ #67 : 15 Декабрь 2019, 12:47:32 »
Здравствуйте Всем, дорогие форумчане !) Вчера получил ответ Y Full...
пожалуйста, кто-нибудь сможет перевести на сырьмяжный ензык ))
"Маркер Y-GGAAT-1B07 в YFull не совпадает с номенклатурой FTDNA!

Маркер Y-GGAAT-1B07 можно назвать странным. Лаборатория SMGF разработала праймеры для этого маркера используя сиквенс AC019099 клона RP11-428D10 от донора RP11. Однако, этот сиквенс нельзя обнаружить в референсной последовательности человеческого генома. Даже в сброке GRCh37/hg18. Мы точно знаем, что последовательность существует (почти) у каждого мужчины, и что она наследуется по прямой мужской линии. Поэтому она должна быть где-то на Y-хромосоме. Повторяющиеся сегменты GGAAT очень сильно распространены в области центромеры на Y-хромосоме, но в то же время они являются общим мотивом в регионе Yq12. Оба этих региона являются мало изученными, потому что нет достаточно данных для картирования, чтобы создать сборку и полную последовательность для них. Поэтому точное положение маркера Y-GGAAT-1B07 остается загадкой до тех пор, пока у нас не появятся улучшенные технологии секвенирования, которые способны упорядочить и просеквенировать десятки тысяч нуклеотидов подряд.

Thomas Krahn // http://archiver.rootsweb.ancestry.com/th/read/GENEALOGY-DNA/2013-01/1357339085"
...я , признаться к своему стыду.  ничаво не "срубил" ))

Спасибо огромное Всем за внимание!

А где и как себя увидеть в  Большом дереве ?...

Ещё раз спасибо.
Попробую объяснить. Сначала надо понять как тестируют STR маркеры классическим способом. Для метода ПЦР необходимы праймеры
https://ru.wikipedia.org/wiki/%D0%9F%D0%BE%D0%BB%D0%B8%D0%BC%D0%B5%D1%80%D0%B0%D0%B7%D0%BD%D0%B0%D1%8F_%D1%86%D0%B5%D0%BF%D0%BD%D0%B0%D1%8F_%D1%80%D0%B5%D0%B0%D0%BA%D1%86%D0%B8%D1%8F#%D0%9F%D1%80%D0%B0%D0%B9%D0%BC%D0%B5%D1%80%D1%8B
https://ru.wikipedia.org/wiki/%D0%9F%D1%80%D0%B0%D0%B9%D0%BC%D0%B5%D1%80
Так вот, когда ученые нашли этот STR и создали для него праймеры, то эти праймеры стали ловить результаты не того STR, который ожидали, а совершенно другого, который как все понимали, где-то существует на Y хромосоме, но где точно - не знал никто. Чтоб не морочиться - оставили как есть. Дали ему название, а на исходный STR маркер забили.
NGS технология секвенирования отличается от ПЦР, и зная на каком участке должен был находится Y-GGAAT-1B07, мы его нашли и спокойно считаем его повторы. Проблема только в том, что FTDNA пользуется методом ПЦР и теми самыми праймерами, которые ловят непонятный STR маркер) В результате мы имеем два разных STR маркера, реально существующих, расположенных в разных участках Y-хромосомы, но имеющих одно и тоже имя. Поэтому на сайте YFull и размещено примечание о несовпадении номенклатур, так как часто возникали вопросы, почему этот маркер FTDNA мне насчитали так, а YFull этак. Причем если использовать строго научный подход, то в YFull правильный Y-GGAAT-1B07, но в FTDNA общепринятый.

В продолжение всей этой эпопеи, с выходом референса сборки hg38, мы нашли тот самый STR маркер, который FTDNA принимала за Y-GGAAT-1B07. Этот участок отсутствовал в более ранних референсных файлах. Так что можно теперь определять и научный Y-GGAAT-1B07 и Y-GGAAT-1B07 в версии FTDNA.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100