АвторТема: YFULL.com - Интерпретация вашего полного сиквенса mtDNA  (Прочитано 9512 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Bakalavrr

  • 98%East evropa <2%Sibir <1%South amerika.
  • Сообщений: 206
  • Страна: ru
  • Рейтинг +47/-0
  • Y-ДНК: R1a- YP569 (YP6505/Y139505+)
  • мтДНК: H5d YF 63400
 Мутацию T5082 C  вывели из игры она ж и олицетворяла H5d :-[

Оффлайн Oxon

  • Сообщений: 852
  • Страна: gb
  • Рейтинг +184/-0
Сбой наверно какой-то.

Верните нас пожалуйста нашей праматери.

Оффлайн Oxon

  • Сообщений: 852
  • Страна: gb
  • Рейтинг +184/-0
Посмотрите пожалуйста, что случилось, и почему нас при наличии 5082C вывели из H5d в какую-то многоэтажную H-c1m2c23d22k7

Оффлайн Ankor

  • Сообщений: 293
  • Страна: ru
  • Рейтинг +149/-0
H5d сломалась.  Мы не H-c1m2c23d22k
H1e2 теперь H-c1m2c23, так что сломалось где-то уровнем выше.  Но как уже писали здесь и в Фейсбуке, мито дерево все еще в разработке

Оффлайн Yaroslav

  • Я всего лишь уличный повеса, Улыбающийся встречным лицам
  • Сообщений: 12315
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2374/-10
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a-ZS3114 > ZS3084, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1-Z16971 > Y159653, МЖМ: G2a2b1a1a1a2-Y92117
  • мтДНК: K1b1a1-T199C, МЖ: H13a1a1d
У меня есть согаплогруппник по K1b1-a1a1a*-T199C (UPD: На данный момент это опять ветвь K1-b1a1-T199C) - образец id:MF523173.1 из публикации Peng et al. 2017, Mitochondrial Genomes Uncover the Maternal History of the Pamir Populations.

В Table S1. Summary of the mtDNA genome sequencing for the 382 samples указано, что это Wakhan Tajik. Я так понимаю, что это ваханец.

Цитировать
Sample ID   Access No in GSA   Access No in GenBank   Population

WT181   SAMC014950   MF523173   Wakhan Tajik

В Fig. 1 The haplogroup profiles of populations from Central Asia and neighboring regions и в Table 1 Summary of populations investigated in this study указано, что ваханцы, образцы которых брали для исследования, родом из Ташкургана Ташкурган-Таджикского автономного уезда Кашгарского округа Синьцзян-Уйгурского автономного района Китая.

В связи с чем хотел бы попросить водрузить Пятизвёздный Красный Флаг рядом с образцом id:MF523173.1, с указанием региона :)



« Последнее редактирование: 08 Август 2019, 08:56:58 от Yaroslav »

Оффлайн Yaroslav

  • Я всего лишь уличный повеса, Улыбающийся встречным лицам
  • Сообщений: 12315
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2374/-10
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a-ZS3114 > ZS3084, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1-Z16971 > Y159653, МЖМ: G2a2b1a1a1a2-Y92117
  • мтДНК: K1b1a1-T199C, МЖ: H13a1a1d
Кстати, и id:MF523013.1 из гаплогруппы K1b1a1a1-T16093C той же публикации, если посмотреть в таблицу и на карту предыдущего сообщения - из равнинных уйгуров Артуха Кызылсу-Киргизского автономного округа Синьцзян-Уйгурского автономного района КНР.

Цитировать
Sample ID   Access No in GSA   Access No in GenBank   Population
LU446   SAMC014790   MF523013   Lowland Uygur

Рядом с ним тоже можно поставить Пятизвёздный Красный Флаг с регионом :)

Интересное у него соседство с датчанами :)

« Последнее редактирование: 31 Июль 2019, 08:58:57 от Yaroslav »

Оффлайн Михаил Петров

  • Vindemiatrix
  • Сообщений: 101
  • Страна: ru
  • Рейтинг +50/-0
  • И это всё о нём:
  • Y-ДНК: G2a1a1a1a1a1a1b1 Z7947+
  • мтДНК: V1a1g1 С16169Т
У моей дочери на FT DNA после тестирования mtDNA указана гаплогруппа J1c3f
HVR1: 16063C, 16069T, 16126C, 16342C
HVR2: 73G, 185A, 263G, 295T, 309.1C, 315.1C, 462T, 489C
Coding Region: 750G, 1438G, 2706G, 3010A, 4216C, 4769G, 6040G, 7028T, 7681A, 8860G, 10398G, 11251G, 11719A, 12477C, 12612G, 13708A, 13934T, 14766T, 14798C, 15326G, 15452A
О чём это говорит?

Залил её фаста файл на YFull. Получил её ID: YF64477 и кучу вопросов. Почему вместо J1c3f я вижу J1-a1a5a2a? С чем едят G185A? Кто и где скрывается под временным id: <W2SMPF>



Оффлайн Yaroslav

  • Я всего лишь уличный повеса, Улыбающийся встречным лицам
  • Сообщений: 12315
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2374/-10
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a-ZS3114 > ZS3084, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1-Z16971 > Y159653, МЖМ: G2a2b1a1a1a2-Y92117
  • мтДНК: K1b1a1-T199C, МЖ: H13a1a1d
У моей дочери на FT DNA после тестирования mtDNA указана гаплогруппа J1c3f
HVR1: 16063C, 16069T, 16126C, 16342C
HVR2: 73G, 185A, 263G, 295T, 309.1C, 315.1C, 462T, 489C
Coding Region: 750G, 1438G, 2706G, 3010A, 4216C, 4769G, 6040G, 7028T, 7681A, 8860G, 10398G, 11251G, 11719A, 12477C, 12612G, 13708A, 13934T, 14766T, 14798C, 15326G, 15452A
О чём это говорит?

Присоединяйте её к соответствующему митохондриальному проекту/проектам, таким образом сможете увидеть географию гаплогруппы. С возрастом пока туговато, так как где смотреть просчёты из научных публикаций - я не знаю, а в YFull возрасты, как и структуру дерева пока что колбасит.

Залил её фаста файл на YFull. Получил её ID: YF64477 и кучу вопросов. Почему вместо J1c3f я вижу J1-a1a5a2a?

Пока игнорируйте. Выше я уже сказал, о том, что митохондриальную филогению на дереве YFull пока колбасит. Уже не раз замечал здесь на форуме, что женские линии - как и сами женщины, капризны и непредсказуемы.

С чем едят G185A?

Ни с чем. Это просто на участке №185 гипервариабильного региона 2 в результате мутации гуанин поменялся на аденин. Теперь этот полиморфизм передаётся по наследству от мам к дочкам. Судя по тому, что он показан у Вашей дочери терминальным - это на сегодняшний день самый молодой полиморфизм, присутствующий у неё и у людей в базе YFull, и возможно, что и в базе FTDNA.

Кто и где скрывается под временным id: <W2SMPF>

Заходите в YFull, в разделе мтДНК кликайте Мт-совпадения. В списке совпаденцев находите этот ID. Справа от него будет колонка ЛС. Если в ней нарисован конверт, то это протестированный(-ая) в FTDNA. Кликнув на конверт, можно написать ему/ей сообщение. Если нарисована стрелка - это образец из научной публикации. Кликнув на стрелку, можно узнать из какой публикации данный образец.
« Последнее редактирование: 10 Август 2019, 16:45:45 от Yaroslav »

Оффлайн Yaroslav

  • Я всего лишь уличный повеса, Улыбающийся встречным лицам
  • Сообщений: 12315
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2374/-10
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a-ZS3114 > ZS3084, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1-Z16971 > Y159653, МЖМ: G2a2b1a1a1a2-Y92117
  • мтДНК: K1b1a1-T199C, МЖ: H13a1a1d
Кто и где скрывается под временным id: <W2SMPF>

А, хотя подождите. Вот такие номера между стрелками <...> - без адресов, т.к. емнип это временные номера наборов, владельцы которых не стали менять их в настройках на постоянные с возможностью связи. Если я сейчас не путаю.

UPD: Да, вроде бы не путаю (здесь и далее).

Все старые NGS образы изначально публикуются на дереве с временными ID, типа KKKKKK. В настройках можно отменить эту опцию - тогда будет виден номер YFxxxxxx. Это разовая процедура - вернуть обратно временный номер не получится. Реверанс в сторону GDPR.

Оффлайн R1a-Stolin

  • Сообщений: 515
  • Страна: by
  • Рейтинг +264/-1
  • Y-ДНК: R1a-Y2902* - Сіціцк, Беларусь
  • мтДНК: H* - Умань, Україна
У моей дочери на FT DNA после тестирования mtDNA указана гаплогруппа J1c3f

Это довольно древняя гаплогруппа, возраст минимум 13 тысяч лет - была найдена у мехтоидов в Алжире, Северной Африке:
https://ru.wikipedia.org/wiki/%D0%9C%D0%B5%D1%85%D1%82%D0%BE%D0%B8%D0%B4%D1%8B

По дереву FTDNA выглядит как общеевропейская гаплогруппа, Англия и Ирландия лидируют, но это потому что американцы с корнями на Британских островах  больше всего тестируются: https://www.familytreedna.com/public/mt-dna-haplotree/J;name=J1c3g

Оффлайн Михаил Петров

  • Vindemiatrix
  • Сообщений: 101
  • Страна: ru
  • Рейтинг +50/-0
  • И это всё о нём:
  • Y-ДНК: G2a1a1a1a1a1a1b1 Z7947+
  • мтДНК: V1a1g1 С16169Т
Спасибо Yaroslav и R1a-Stolin за информацию, Вы настоящие друзья :).

Оффлайн Yaroslav

  • Я всего лишь уличный повеса, Улыбающийся встречным лицам
  • Сообщений: 12315
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2374/-10
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a-ZS3114 > ZS3084, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1-Z16971 > Y159653, МЖМ: G2a2b1a1a1a2-Y92117
  • мтДНК: K1b1a1-T199C, МЖ: H13a1a1d
Ни с чем. Это просто на участке №185 гипервариабильного региона 2 в результате мутации гуанин поменялся на аденин. Теперь этот полиморфизм передаётся по наследству от мам к дочкам. Судя по тому, что он показан у Вашей дочери терминальным - это на сегодняшний день самый молодой полиморфизм, присутствующий у неё и у людей в базе YFull, и возможно, что и в базе FTDNA.

Неправильно выразился.

G185A - это самый молодой из полиморфизмов Вашей дочери, найденных не только в её образце. В базе YFull на сегодняшний день он найден пока что только у неё и у этого (этой) id:<W2SMPF>.

Оффлайн Bakalavrr

  • 98%East evropa <2%Sibir <1%South amerika.
  • Сообщений: 206
  • Страна: ru
  • Рейтинг +47/-0
  • Y-ДНК: R1a- YP569 (YP6505/Y139505+)
  • мтДНК: H5d YF 63400
У меня аж 3 штуки приватных и все моложе 225 лет (на всех совпаденцах) но мне индивидуально задают возраст 1889 лет...

Оффлайн nilogov

  • Сообщений: 877
  • Страна: ru
  • Рейтинг +52/-2
  • философ антиязыка
  • Y-ДНК: R-Y18348
  • мтДНК: T2b-T152C!
Хочу проконсультироваться насчёт митогаплогрупп.
 
Вот у моего отца митогаплогруппа - T1a1, а у мамы - T2b-T152C! (по YFull - T2-c4a2a1a1a2e*). Можно ли определить, когда жила их общая Ева? Получается, что общий предок - это время образования Т, от которой ответвились Т1 и Т2?
 
На сайте YFull есть информация о времени образования снипов для митогаплогрупп: а что значит неокруглённый и округлённый возраст? Какой надо брать для работы?

Оффлайн nilogov

  • Сообщений: 877
  • Страна: ru
  • Рейтинг +52/-2
  • философ антиязыка
  • Y-ДНК: R-Y18348
  • мтДНК: T2b-T152C!
Кто-нибудь знает, были ли добавлены гаплогруппы денисовок и неандерталок к сапиенсному митодреву, как это было сделано для Y-хромосомы?

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100