АвторТема: Статьи о дДНК (мито)  (Прочитано 556 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн пенелопаАвтор темы

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 5650
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1755/-12
  • мтДНК: H1b
Статьи о дДНК (мито)
« : 14 Март 2019, 21:03:26 »
В этой теме - перечень статей о древней мито ДНК.

First Ancient Mitochondrial Human Genome from a Prepastoralist Southern African https://academic.oup.com/gbe/article/6/10/2647/609100

Ancient genomes from southern Africa pushes modern human divergence beyond 260,000 years ago https://www.biorxiv.org/content/10.1101/145409v1

Reconstructing Prehistoric African Population Structure https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(17)31008-5

Молекулярная филогеография коренного населения Северной Азии по данным об изменчивости митохондриальной ДНК http://www.dslib.net/genetika/molekuljarnaja-filogeografija-korennogo-naselenija-severnoj-azii-po-dannym-ob.html

Ancient DNA Analysis of 8000 B.C. Near Eastern Farmers Supports an Early Neolithic Pioneer Maritime Colonization of Mainland Europe through Cyprus and the Aegean Islands https://journals.plos.org/plosgenetics/article?id=10.1371/journal.pgen.1004401

Ancient Egyptian mummy genomes suggest an increase of Sub-Saharan African ancestry in post-Roman periods https://www.nature.com/articles/ncomms15694

Ancient Ethiopian genome reveals extensive Eurasian admixture in Eastern Africa http://science.sciencemag.org/content/350/6262/820

Six complete mitochondrial genomes from Early Bronze Age humans in the North Caucasus https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0305440316301091

The genetic history of Ice Age Europe https://www.nature.com/articles/nature17993

Population genomics of Bronze Age Eurasia https://www.nature.com/articles/nature14507

Pleistocene North African genomes link Near Eastern and sub-Saharan African human populations http://science.sciencemag.org/content/360/6388/548

The kinship of two 12th Dynasty mummies revealed by ancient DNA sequencing https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2352409X17305631

Genome-wide data from two early Neolithic East Asian individuals dating to 7700 years ago http://advances.sciencemag.org/content/3/2/e1601877.full

Ancient Genomics Reveals Four Prehistoric Migration Waves into Southeast Asia https://www.biorxiv.org/content/10.1101/278374v1

The Genomic Formation of South and Central Asia https://www.biorxiv.org/content/10.1101/292581v1

Maternal Genetic Ancestry and Legacy of 10th Century AD Hungarians http://advances.sciencemag.org/content/4/10/eaat4457.full

Ancient genomes suggest the eastern Pontic-Caspian steppe as the source of western Iron Age nomads http://advances.sciencemag.org/content/4/10/eaat4457.full

An early modern human from Romania with a recent Neanderthal ancestor https://www.nature.com/articles/nature14558#tables

Compound-specific radiocarbon dating and mitochondrial DNA analysis of the Pleistocene hominin from Salkhit Mongolia https://www.nature.com/articles/s41467-018-08018-8

Paleolithic DNA from the Caucasus reveals core of West Eurasian ancestry https://www.biorxiv.org/content/10.1101/423079v1

Ancestral mitochondrial N lineage from the Neolithic ‘green’ Sahara https://www.nature.com/articles/s41598-019-39802-1

Ancient DNA from Chalcolithic Israel reveals the role of population mixture in cultural transformation https://www.nature.com/articles/s41467-018-05649-9

Population genomics of Bronze Age Eurasia https://www.nature.com/articles/nature14507

Kinship Analysis of Human Remains from the Sargat Mounds, Baraba Forest-Steppe, Western Siberia https://www.researchgate.net/publication/321071660_Kinship_Analysis_of_Human_Remains_from_the_Sargat_Mounds_Baraba_Forest-Steppe_Western_Siberia

An unexpected case in the prehistory of the Iberian Peninsula: Biogeographical origin analysis through mitochondrial DNA https://www.fsigeneticssup.com/article/S1875-1768(17)30056-2/fulltext

Paleo-Eskimo genetic legacy across North America https://www.biorxiv.org/content/10.1101/203018v1

Genetic Analysis of Early Holocene Skeletal Remains From Alaska and its Implications for the Settlement of the Americas http://pages.ucsd.edu/~rfrank/class_web/UnivHouse/Kemp%20et%20al.%202007.pdf

Reconstructing the Deep Population History of Central and South America https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(18)31380-1

Genome-wide data from two early Neolithic East Asian individuals dating to 7700 years ago http://advances.sciencemag.org/content/3/2/e1601877.full

Расшифровка древней ДНК рассказала о происхождении южноамериканских индейцев. https://elementy.ru/novosti_nauki/432739/Rasshifrovka_drevney_DNK_rasskazala_o_proiskhozhdenii_yuzhnoamerikanskikh_indeytsev

A western Eurasian male is found in 2000‐year‐old elite Xiongnu cemetery in Northeast Mongolia https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1002/ajpa.21242

КАЗАХСТАНСКИЙ ДНК-ПРОЕКТ. http://www.np.kz/hotnewstop/20716-kazahstanskiy-dnk-proekt.html

The population history of northeastern Siberia since the Pleistocene https://www.biorxiv.org/content/10.1101/448829v1

Уникальное захоронение воина гунно-сарматского времени в Западно-Сибирской лесостепи: результаты палеогенетического анализа. http://archaeology.nsc.ru/journarticleru/76/1171

Molecular analysis of an ancient Thule population at Nuvuk, Point Barrow, Alaska. https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1002/ajpa.23746

Ancient Genomics Reveals Four Prehistoric Migration Waves into Southeast Asia https://www.biorxiv.org/content/10.1101/278374v1

Punctuated bursts in human male demography inferred from 1,244 worldwide Y-chromosome sequences https://www.nature.com/articles/ng.3559

Палеогенетические данные подтвердили, что создателями протоориньякской культуры были люди современного типа. https://elementy.ru/novosti_nauki/432467

Ancient DNA https://isogg.org/wiki/Famous_DNA:Ancient_DNA

A 28,000 Years Old Cro-Magnon mtDNA Sequence Differs from All Potentially Contaminating Modern Sequences https://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0002700






« Последнее редактирование: 21 Март 2019, 12:04:43 от пенелопа »

Оффлайн mikhail a.

  • Сообщений: 1170
  • Страна: ru
  • Рейтинг +273/-0
  • Y-ДНК: J2a-PF5252
  • мтДНК: T2b
Re: Статьи о дДНК (мито)
« Ответ #1 : 20 Март 2019, 23:59:32 »
Mitogenomes illuminate the origin and migration patterns of the indigenous people of the Canary Islands

https://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371%2Fjournal.pone.0209125&fbclid=IwAR3QVyj-2KMZtnZua1cCj0szvqrkkWtpckRLRnDc3VfxcSbcQAmUr4Pe_QI

The Canary Islands’ indigenous people have been the subject of substantial archaeological, anthropological, linguistic and genetic research pointing to a most probable North African Berber source. However, neither agreement about the exact point of origin nor a model for the indigenous colonization of the islands has been established. To shed light on these questions, we analyzed 48 ancient mitogenomes from 25 archaeological sites from the seven main islands. Most lineages observed in the ancient samples have a Mediterranean distribution, and belong to lineages associated with the Neolithic expansion in the Near East and Europe (T2c, J2a, X3a…). This phylogeographic analysis of Canarian ancient mitogenomes, the first of its kind, shows that some lineages are restricted to Central North Africa (H1cf, J2a2d and T2c1d3), while others have a wider distribution, including both West and Central North Africa, and, in some cases, Europe and the Near East (U6a1a1, U6a7a1, U6b, X3a, U6c1). In addition, we identify four new Canarian-specific lineages (H1e1a9, H4a1e, J2a2d1a and L3b1a12) whose coalescence dates correlate with the estimated time for the colonization of the islands (1st millennia CE). Additionally, we observe an asymmetrical distribution of mtDNA haplogroups in the ancient population, with certain haplogroups appearing more frequently in the islands closer to the continent. This reinforces results based on modern mtDNA and Y-chromosome data, and archaeological evidence suggesting the existence of two distinct migrations. Comparisons between insular populations show that some populations had high genetic diversity, while others were probably affected by genetic drift and/or bottlenecks. In spite of observing interinsular differences in the survival of indigenous lineages, modern populations, with the sole exception of La Gomera, are homogenous across the islands, supporting the theory of extensive human mobility after the European conquest

Оффлайн rozenblatt

  • Сообщений: 1074
  • Страна: kg
  • Рейтинг +1117/-0
  • Y-ДНК: C-F5481
  • мтДНК: M8a
Re: Статьи о дДНК (мито)
« Ответ #2 : 01 Апрель 2019, 19:48:08 »
https://www.nature.com/articles/s41598-019-41945-0

Article | Open | Published: 01 April 2019

Ancient human mitochondrial genomes from Bronze Age Bulgaria: new insights into the genetic history of Thracians

    Alessandra Modi, Desislava Nesheva, Stefania Sarno, Stefania Vai, Sena Karachanak-Yankova, Donata Luiselli, Elena Pilli, Martina Lari, Chiara Vergata, Yordan Yordanov, Diana Dimitrova, Petar Kalcev, Rada Staneva, Olga Antonova, Savina Hadjidekova, Angel Galabov, Draga Toncheva & David Caramelli

Scientific Reports volume 9, Article number: 5412 (2019) |

Abstract

One of the best documented Indo-European civilizations that inhabited Bulgaria is the Thracians, who lasted for more than five millennia and whose origin and relationships with other past and present-day populations are debated among researchers. Here we report 25 new complete mitochondrial genomes of ancient individuals coming from three necropolises located in different regions of Bulgaria – Shekerdja mogila, Gabrova mogila and Bereketska mogila – dated to II-III millennium BC. The identified mtDNA haplogroup composition reflects the mitochondrial variability of Western Eurasia. In particular, within the ancient Eurasian genetic landscape, Thracians locate in an intermediate position between Early Neolithic farmers and Late Neolithic-Bronze Age steppe pastoralists, supporting the scenario that the Balkan region has been a link between Eastern Europe and the Mediterranean since the prehistoric time. Spatial Principal Component Analysis (sPCA) performed on Thracian and modern mtDNA sequences, confirms the pattern highlighted on ancient populations, overall indicating that the maternal gene pool of Thracians reflects their central geographical position at the gateway of Europe.

Одной из наиболее хорошо документированных индоевропейских цивилизаций, населявших Болгарию, являются фракийцы, которые просуществовали более пяти тысячелетий и чье происхождение и отношения с другими прошлыми и современными популяциями обсуждаются среди исследователей. Здесь мы сообщаем о 25 новых полных митохондриальных геномах древних особей, происходящих из трех некрополей, расположенных в разных регионах Болгарии - Шекерджа могила, Габрова могила и Берекетска могила - датируемых II-III тысячелетием до нашей эры. Выявленный состав гаплогрупп мтДНК отражает митохондриальную изменчивость Западной Евразии. В частности, в древнем евразийском генетическом ландшафте фракийцы занимают промежуточное положение между фермерами раннего неолита и степными скотоводами позднего неолита и бронзы, поддерживая сценарий, согласно которому Балканский регион является связующим звеном между Восточной Европой и Средиземноморьем с доисторического времени. Пространственный анализ основных компонентов (sPCA), проведенный на фракийских и современных последовательностях мтДНК, подтверждает паттерн, выделенный на древних популяциях, что в целом указывает на то, что материнский генофонд фракийцев отражает их центральное географическое положение у ворот Европы.     

Оффлайн rozenblatt

  • Сообщений: 1074
  • Страна: kg
  • Рейтинг +1117/-0
  • Y-ДНК: C-F5481
  • мтДНК: M8a
Re: Статьи о дДНК (мито)
« Ответ #3 : 10 Апрель 2019, 16:08:28 »
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1002/ajpa.23820

Genetic resiliency and the Black Death: No apparent loss of mitogenomic diversity due to the Black Death in medieval London and Denmark

Jennifer Klunk, Ana T. Duggan, Rebecca Redfern, Julia Gamble, Jesper L. Boldsen, G. Brian Golding, Brittany S. Walter, Katherine Eaton, Julianna Stangroom, Jean‐Marie Rouillard, Alison Devault, Sharon N. DeWitte, Hendrik N. Poinar

First published: 09 April 2019

https://doi.org/10.1002/ajpa.23820

Abstract

Objectives

In the 14th century AD, medieval Europe was severely affected by the Great European Famine as well as repeated bouts of disease, including the Black Death, causing major demographic shifts. This high volatility led to increased mobility and migration due to new labor and economic opportunities, as evidenced by documentary and stable isotope data. This study uses ancient DNA (aDNA) isolated from skeletal remains to examine whether evidence for large‐scale population movement can be gleaned from the complete mitochondrial genomes of 264 medieval individuals from England (London) and Denmark.

Materials and Methods

Using a novel library‐conserving approach to targeted capture, we recovered 264 full mitochondrial genomes from the petrous portion of the temporal bones and teeth and compared genetic diversity across the medieval period within and between English (London) and Danish populations and with contemporary populations through population pairwise ΦST analysis.

Results

We find no evidence of significant differences in genetic diversity spatially or temporally in our dataset, yet there is a high degree of haplotype diversity in our medieval samples with little exact sequence sharing.

Discussion

The mitochondrial genomes of both medieval Londoners and medieval Danes suggest high mitochondrial diversity before, during and after the Black Death. While our mitochondrial genomic data lack geographically correlated signals, these data could be the result of high, continual female migration before and after the Black Death or may simply indicate a large female effective population size unaffected by the upheaval of the medieval period. Either scenario suggests a genetic resiliency in areas of northwestern medieval Europe.


Цели
   
В 14 веке н.э. на средневековую Европу сильно повлиял Великий европейский голод, а также повторяющиеся вспышки болезней, в том числе Черная смерть, что привело к значительным демографическим сдвигам. Эта высокая нестабильность привела к увеличению мобильности и миграции благодаря новым трудовым и экономическим возможностям, о чем свидетельствуют документальные и данные по стабильным изотопам. В этом исследовании используется древняя ДНК (дДНК), выделенная из останков скелета, чтобы выяснить, можно ли собрать данные о широкомасштабном перемещении населения на основании полных митохондриальных геномов 264 средневековых особей из Англии (Лондона) и Дании.   
   
Материалы и методы   
   
Используя новый подход к целевому захвату, сохраняющий библиотеку, мы извлекли 264 полных митохондриальных генома из каменистой части височных костей и зубов и сравнили генетическое разнообразие в течение средневекового периода в пределах и между английским (лондонским) и датским населением и с современными популяциями через популяционный попарный анализ ΦST.     
   
Результаты   
   
Мы не находим доказательств значительных различий в генетическом разнообразии пространственно или временно в нашем наборе данных, однако в наших средневековых образцах наблюдается высокая степень разнообразия гаплотипов с небольшим точным совпадением последовательностей.   
   
Обсуждение   
   
Митохондриальные геномы как средневековых лондонцев, так и средневековых датчан свидетельствуют о высоком митохондриальном разнообразии до, во время и после Черной Смерти. Хотя в наших митохондриальных геномных данных отсутствуют географически коррелированные сигналы, эти данные могут быть результатом высокой, постоянной миграции женщин до и после Черной смерти или могут просто указывать на большой размер эффективной популяции женщин, не затронутый потрясениями средневекового периода. Любой сценарий предполагает генетическую устойчивость в районах северо-западной средневековой Европы.

Оффлайн rozenblatt

  • Сообщений: 1074
  • Страна: kg
  • Рейтинг +1117/-0
  • Y-ДНК: C-F5481
  • мтДНК: M8a
мтДНК готов
« Ответ #4 : 01 Май 2019, 19:12:29 »
https://www.nature.com/articles/s41598-019-43183-w

Article | Open | Published: 01 May 2019

Goth migration induced changes in the matrilineal genetic structure of the central-east European population

    I. Stolarek, L. Handschuh, A. Juras, W. Nowaczewska, H. Kóčka-Krenz, A. Michalowski, J. Piontek, P. Kozlowski & M. Figlerowicz

Scientific Reportsvolume 9, Article number: 6737 (2019) | Download Citation

Abstract

For years, the issues related to the origin of the Goths and their early migrations in the Iron Age have been a matter of hot debate among archaeologists. Unfortunately, the lack of new independent data has precluded the evaluation of the existing hypothesis. To overcome this problem, we initiated systematic studies of the populations inhabiting the contemporary territory of Poland during the Iron Age. Here, we present an analysis of mitochondrial DNA isolated from 27 individuals (collectively called the Mas-VBIA group) excavated from an Iron Age cemetery (dated to the 2nd-4th century A.D.) attributed to Goths and located near Masłomęcz, eastern Poland. We found that Mas-VBIA has similar genetic diversity to present-day Asian populations and higher diversity than that of contemporary Europeans. Our studies revealed close genetic links between the Mas-VBIA and two other Iron Age populations from the Jutland peninsula and from Kowalewko, located in western Poland. We disclosed the genetic connection between the Mas-VBIA and ancient Pontic-Caspian steppe groups. Similar connections were absent in the chronologically earlier Kowalewko and Jutland peninsula populations. The collected results seem to be consistent with the historical narrative that assumed that the Goths originated in southern Scandinavia; then, at least part of the Goth population moved south through the territory of contemporary Poland towards the Black Sea region, where they mixed with local populations and formed the Chernyakhov culture. Finally, a fraction of the Chernyakhov population returned to the southeast region of present-day Poland and established the archaeological formation called the “Masłomęcz group”.

В течение многих лет вопросы, связанные с происхождением готов и их ранними миграциями в железный век, были предметом горячих споров среди археологов. К сожалению, отсутствие новых независимых данных не позволяло оценить существующую гипотезу. Для решения этой проблемы мы начали систематические исследования населения, населявшего современную территорию Польши в железном веке. Здесь мы представляем анализ митохондриальной ДНК, выделенной из 27 особей ( коллективно называемых группой Mas-VBIA), выкопанных на кладбище железного века (датируемом 2-4 вв. н.э.), приписываемого готам и расположенного недалеко от Масломенча, восточная Польша. Мы обнаружили, что Mas-VBIA имеет генетическое разнообразие, подобное современному азиатскому населению, и более высокое разнообразие, чем у современных европейцев. Наши исследования выявили тесные генетические связи между Mas-VBIA и двумя другими популяциями железного века с полуострова Ютландия и из Ковалевко, расположенного в западной Польше. Мы раскрыли генетическую связь между Mas-VBIA и древними понтийско-каспийскими степными группами. Подобные связи отсутствовали в хронологически более ранних популяциях Ковалевко и полуострова Ютландия. Собранные результаты, похоже, согласуются с историческим повествованием, в котором предполагалось, что готы возникли в южной Скандинавии; затем, по крайней мере, часть готского населения переместилась на юг через территорию современной Польши к Черноморскому региону, где они смешались с местным населением и сформировали черняховскую культуру. Наконец, часть черняховского населения вернулась в юго-восточный регион современной Польши и создала археологическую формацию, называемую «Масломенчская группа».


Оффлайн R1a-Stolin

  • Сообщений: 370
  • Страна: by
  • Рейтинг +166/-1
  • Y-ДНК: R1a-Y2902* - Дубай, Брэсцкая вобласць, Беларусь
  • мтДНК: H29* - Комарашеве, Одеська область, Україна
Re: Статьи о дДНК (мито)
« Ответ #5 : 01 Май 2019, 19:51:50 »
Масломенч почти на границе с Украиной, рядом Нововолынск...

Самый интересный момент:

Интересно отметить, что частоты гаплогрупп мтДНК U5a (характерные для групп восточных охотников-собирателей) и U5b (характерные для групп западных охотников-собирателей) значительно отличались в Mas-VBIA и других популяциях IA, изученных до настоящего времени (JIA и Kow-OVIA). ). Mas-VBIA характеризовался отсутствием гаплогруппы мтДНК U5b и высокой частотой гаплогруппы мтДНК U5a (14,8%), тогда как в JIA и Kow-OVIA гаплогруппа мтДНК U5b была более распространенной, чем U5a. Как отмечалось ранее, доминирование U5b над U5a в Центральной Европе наблюдалось только во время IA. Следовательно, либо процесс, который привел к временному увеличению частоты гаплогруппы мтДНК U5b, не затронул регионы к востоку от Вислы, либо его последствия были впоследствии устранены другим демографическим событием.

Оффлайн Andvari

  • Сообщений: 71
  • Страна: ru
  • Рейтинг +24/-0
  • Y-ДНК: R1a - Y10802
Re: Статьи о дДНК (мито)
« Ответ #6 : 01 Май 2019, 21:35:35 »
Как теперь красное с круглым сопоставить?

""Масломенчский" - представлен исключительно в женских сериях преимущественно Западной Украины и Молдавии. Несколько уклоняется от западных типов за счёт слегка подуплощённого лица. Истоки его можно видеть только на нижней Висле в вельбаркских могильниках. В славянскую эпоху данный тип получает широкое распространение, начинает появляться в мужских сериях и становится обычным среди женских славянских групп на Западной Украине и в смежных районах Польши. Среди мужчин славянской эпохи он тоже встречается, но реже, чем у женщин.
Судя по всему это какое-то местное доготское население захваченное миграцией и в дальнейшем послужившее субстратом для славянского (в женских славянских сериях он представлен сильнее, чем в мужских). Особо интересна его некоторая "лапоноидность" выражающаяся в снижении горизонтальной профилировки и увеличении ширины лица.


Существенно отличаются между собой по составу мужская и женская серии Масломенческой группы. Мужская серия состоит, главным образом, из носителей средиземноморского антропологического типа, а в женской серии доминирующим является лапоноидный тип (W. Kozak-Zychman).Интересно, что в средневековых сериях с территории Любельщины (Грудек Надбужный) лапоноидный тип доминирует как в мужской, так и в женской сериях. Это дает основание утверждать, что по крайней мере женская часть населения, похороненного на могильниках вельбарськой культуры Грудека и Масломенча, может быть генетически связана с населением этого региона эпохи средневековья"."

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100