АвторТема: Мои результаты по H и что делать с этим счастьем дальше  (Прочитано 1470 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Semargl

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Сообщений: 5182
  • Страна: hr
  • Рейтинг +2436/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Отправил запрос в Генотек и информативно пообщался со специалистом (очень оперативно ответили!). Подтвердили, что у меня Н6a1a мутация T11254C.
*Почитал об этом субкладе. Его носители появились в В. Европе не раньше Бронзового века во времена миграций индоевропейцев с территории Средней Азии в понто-каспийские степи, так же эта гаплогруппа рапространилась с носителями культуры Шнуровой керамики.
Все верно. Гаплогруппа Н6a1a. Использовали референс Yoruba, поэтому некоторые позиции отличаются от общепринятых.
Правила конвертации
< 315 leave position
>= 315 and < 3107: decrease 2
>= 3107 and <16193: decrease 1
>= 16193 decrease 2

Оффлайн pashka_1604Автор темы

  • берегите лес, негде будет партизанить
  • Сообщений: 90
  • Страна: ru
  • Рейтинг +22/-0
  • FTDNA: B486274 GEDmatch Genesis: HD652233
  • Y-ДНК: R-Z92
  • мтДНК: H6a1a
Цитировать
Все верно. Гаплогруппа Н6a1a. Использовали референс Yoruba, поэтому некоторые позиции отличаются от общепринятых.
Хорошо, но почему-то нигде на просторах интернет не мелькает  информация о мутации T11254C в отличие от мутации T11253C. Сказали вроде как параллельная близкая мутация.
« Последнее редактирование: 25 Февраль 2019, 16:19:51 от pashka_1604 »

Оффлайн FELIX

  • Сообщений: 2407
  • Страна: ru
  • Рейтинг +699/-3
  • Y-ДНК: R-YP569
  • мтДНК: U5a1a1b
Цитировать
Все верно. Гаплогруппа Н6a1a. Использовали референс Yoruba, поэтому некоторые позиции отличаются от общепринятых.
Хорошо, но почему-то нигде на просторах интернет не мелькает  информация о мутации T11254C в отличие от мутации T11253C. Сказали вроде как параллельная близкая мутация.

Это одна и таже мутация. Просто есть альтернативные классификации, в которых номера позиций не совпадают. О чем Вам выше и ответили.

An alternative African (Yoruba) reference sequence has also been used sometimes instead of the Cambridge.
« Последнее редактирование: 25 Февраль 2019, 16:33:45 от FELIX »

Оффлайн Semargl

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Сообщений: 5182
  • Страна: hr
  • Рейтинг +2436/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Цитировать
Все верно. Гаплогруппа Н6a1a. Использовали референс Yoruba, поэтому некоторые позиции отличаются от общепринятых.
Хорошо, но почему-то нигде на просторах интернет не мелькает  информация о мутации T11254C в отличие от мутации T11253C. Сказали вроде как параллельная близкая мутация.
Я перечислил правила конвертации координат йоруба в общепринятый везде rCRS.
Смотрите. Позиция 11254 попадает под правило >= 3107 and <16193 следовательно к ней применяется действие decrease 1
11254-1=11253

Оффлайн pashka_1604Автор темы

  • берегите лес, негде будет партизанить
  • Сообщений: 90
  • Страна: ru
  • Рейтинг +22/-0
  • FTDNA: B486274 GEDmatch Genesis: HD652233
  • Y-ДНК: R-Z92
  • мтДНК: H6a1a
Коллеги, благодарю за помощь! Без вас бы точно не справился. Тогда следующим шагом буду конвертировать в форматы для 23andme, Ancestry DNA и FamilyTreeDNA Family Finder. Посмотрим, что из этого выйдет.

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Сообщений: 34045
  • Страна: ca
  • Рейтинг +2821/-44
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Что у Вас в полученном файле vcf в параграфе chrM по позиции 10937?

По Кембриджу это 10937 - 1 = 10936.

Если вместо референтного значения С для этой позиции у Вас Т (обозначают чаще всего сей факт вот так C10936T), то это значит, что у Вас гаплогруппа H6a1a5.

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Сообщений: 34045
  • Страна: ca
  • Рейтинг +2821/-44
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Вот тут (ссылка) выложил свой женский клан.

Никаких пересечений случаем нет?    ::)

Оффлайн pashka_1604Автор темы

  • берегите лес, негде будет партизанить
  • Сообщений: 90
  • Страна: ru
  • Рейтинг +22/-0
  • FTDNA: B486274 GEDmatch Genesis: HD652233
  • Y-ДНК: R-Z92
  • мтДНК: H6a1a
Цитировать
Что у Вас в полученном файле vcf в параграфе chrM по позиции 10937?

По Кембриджу это 10937 - 1 = 10936.

Если вместо референтного значения С для этой позиции у Вас Т (обозначают чаще всего сей факт вот так C10936T), то это значит, что у Вас гаплогруппа H6a1a5.

Позиций 10937 и 10936 у меня там вообще нет в наличии.

Ближайшая к ним: chrM 10928 rs878989001 T C . PASS MCD=1.8283 GT 0/0

Semargl разобрался с моими исходными данными по мт-днк. Могу также с Вами поделиться этой частью исходника, если есть желание попробовать его интерпретировать.


Цитировать
Вот тут (ссылка) выложил свой женский клан.

Никаких пересечений случаем нет?    ::)

Не увидел ни одной знакомой Ф.И.О.
В плане генеалогии я пока, что в самом начале пути  :)  До 6 поколения где-то только некоторых прямых предков знаю, и то благодаря внимательным к памяти родословной дедушкам и бабушкам.


Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Сообщений: 34045
  • Страна: ca
  • Рейтинг +2821/-44
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Желания разбираться нет.    :)

Вялый интерес. Вопрос не к Вам, а к Semargl:

Речь идёт о полном митосиквенсе (нахожу это маловероятным)?

Или же имеем прочтение определённых позиций?

Оффлайн Semargl

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Сообщений: 5182
  • Страна: hr
  • Рейтинг +2436/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Желания разбираться нет.    :)

Вялый интерес. Вопрос не к Вам, а к Semargl:

Речь идёт о полном митосиквенсе (нахожу это маловероятным)?

Или же имеем прочтение определённых позиций?
Второе.

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Сообщений: 34045
  • Страна: ca
  • Рейтинг +2821/-44
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Спасибо!

:)

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Сообщений: 34045
  • Страна: ca
  • Рейтинг +2821/-44
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Вот тут (ссылка) начал рассуждать на отвлечённые темы и договорился до многих интересных вещей.

:)

Оффлайн pashka_1604Автор темы

  • берегите лес, негде будет партизанить
  • Сообщений: 90
  • Страна: ru
  • Рейтинг +22/-0
  • FTDNA: B486274 GEDmatch Genesis: HD652233
  • Y-ДНК: R-Z92
  • мтДНК: H6a1a
Цитировать
Вот тут (ссылка) начал рассуждать на отвлечённые темы и договорился до многих интересных вещей.

:)

Не зря у Вас изображение лопаты в профиле  :D "Копаете" хорошо  :)
Если доберетесь до метрики Колесни, дайте знать. 

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Сообщений: 34045
  • Страна: ca
  • Рейтинг +2821/-44
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Было бы хорошо, если Вы выложили своё дерево по этой линии и перечислили предковые фамилии.

Повторю то, что говорю всем новичкам и где многие отчего-то конкретно тупят:)

Поиск должен быть открытым. В ветках форума. Не в личке. Не в электронной почте. А в свободном обсуждении.
Это повышает эффективность не в разы, а на порядки.

Второе. Внятно определитесь. Скажите, что Вы ищите, что хотите узнать.
Как бывший разработчик алгоритмов скажу, провал многих проектов вызван скверно проработанным техническими заданиями.

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Сообщений: 34045
  • Страна: ca
  • Рейтинг +2821/-44
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Ну, и последнее.

Вы просто ещё не осмыслили, как Вам повезло, что вылетели на меня.    ;D
Даю Вам время осмотреться. Дабы не выглядеть, как в историческом анекдоте, подобно камер-юнкеру, похваляющимся перед трёхлетним ребёнком.

В данном конкретном случае, я сторона отдающая, а Вы принимающая.
Поэтому и тыкаю носом в тему, рекомендую предоставить имеющуюся информацию.
Но, естественно, если Вас интересуют досужие разговоры о миграция тысячелетней и более давности, скучная проза в виде прапрапрабабушек - ни к чему.

:)


*** В том, что аллюзия с классическим анекдотом Вам не известна - не сомневаюсь. И сам уже не помню от какого это классика.  :-X
Поэтому без затей его перескажу.

Камер-юнкер в парадном мундире после приёма ползает по полу и играет со своим малолетним сыном.
При этом сюсюкая выговаривает:
Папа холосый!
Его государь император любит.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100