АвторТема: дДНК из Скандинавии  (Прочитано 3068 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн hyperАвтор темы

  • Сообщений: 24
  • Страна: 00
  • Рейтинг +14/-2
дДНК из Скандинавии
« : 04 Декабрь 2018, 00:50:57 »
Ancient DNA from chewing gums connects material culture and genetics of Mesolithic hunter-gatherers in Scandinavia

Natalija Kashuba, Emrah Kirdök, Hege Damlien, Mikael A. Manninen, Bengt Nordqvist, Per Persson, Anders Götherström
doi: https://doi.org/10.1101/485045

Abstract

The discussion of an early postglacial dual-route colonization of the Scandinavian Peninsula is largely based on associating genomic data to an early dispersal of lithic technology from the East European Plain. However, a direct link between the two has been lacking. We tackle this problem by analysing human DNA from birch bark pitch mastics, chewing gums, from Huseby Klev, a site in western Sweden with eastern lithic technology. We generate genome-wide data for three individuals, and show their affinity to the Scandinavian hunter-gatherers, or more precisely, to individuals from postglacial Sweden. Our samples date to 9880-9540 calBP, expanding the temporal range of this genetic group as well as its distribution. Human DNA from mastics provides a clear connection between material culture and genetic data. We also propose that DNA from different types of mastics can be used to study environment, ecology, and oral microbiome of prehistoric populations.

Все три mtDNA из Южной Скандинавии U5a2d.

Оффлайн Пашкевич Павел

  • Сообщений: 343
  • Страна: by
  • Рейтинг +227/-0
  • Y-ДНК: I1 -Y7477
  • мтДНК: H1b2
Re: дДНК из Скандинавии
« Ответ #1 : 04 Декабрь 2018, 07:48:48 »
 Y так и смогли прочитать?

Оффлайн hyperАвтор темы

  • Сообщений: 24
  • Страна: 00
  • Рейтинг +14/-2
Re: дДНК из Скандинавии
« Ответ #2 : 04 Декабрь 2018, 20:45:18 »
Там только один мужчина. Y не определили, зато определили аутосомныные компоненты.

Оффлайн hyperАвтор темы

  • Сообщений: 24
  • Страна: 00
  • Рейтинг +14/-2
Re: дДНК из Скандинавии
« Ответ #3 : 12 Декабрь 2018, 14:23:19 »

Оффлайн rozenblatt

  • Сообщений: 1569
  • Страна: kg
  • Рейтинг +2073/-0
  • Y-ДНК: C-ZQ31
  • мтДНК: M8a
Re: дДНК из Скандинавии
« Ответ #4 : 14 Декабрь 2018, 00:12:14 »
Что-то жвачка стала популярной у палеогенетиков:

https://www.biorxiv.org/content/early/2018/12/13/493882

Stone Age "chewing gum" yields 5,700 year-old human genome and oral microbiome

Theis ZT Jensen, Jonas Niemann, Katrine Hoejholt Iversen, Anna K Fotakis, Shyam Gopalakrishnan, Mikkel HS Sinding, Martin R Ellegaard, Morten E Allentoft, Liam T Lanigan, Alberto J Taurozzi, Sofie Holtsmark Nielsen, Michael W Dee, Martin N Mortensen, Mads C Christensen, Soeren A Soerensen, Matthew J Collins, Tom Gilbert, Martin Sikora, Simon Rasmussen, View ORCID ProfileHannes Schroeder

doi: https://doi.org/10.1101/493882

Abstract

We present a complete ancient human genome and oral microbiome sequenced from a piece of resinous "chewing gum" recovered from a Stone Age site on the island of Lolland, Denmark, and directly dated to 5,858-5,661 cal. BP (GrM-13305; 5,007+/-11). We sequenced the genome to an average depth-of-coverage of 2.3x and find that the individual who chewed the resin was female and genetically more closely related to western hunter-gatherers from mainland Europe, than hunter-gatherers from central Scandinavia. We use imputed genotypes to predict physical characteristics and find that she had dark skin and hair, and blue eyes. Lastly, we also recovered microbial DNA that is characteristic of an oral microbiome and faunal reads that likely associate with diet. The results highlight the potential for this type of sample material as a new source of ancient human and microbial DNA.

Мы представляем полный древний геном человека и микробиом полости рта, секвенированный из кусочка смолистой "жевательной резинки", извлеченной со стоянки каменного века на острове Лолланд, Дания, и непосредственно датированной временем 5 858- 5 661 лет назад. Мы секвенировали геном до средней глубины охвата 2,3 x и обнаружили, что особь, которая жевала смолу, была женщиной и генетически более тесно связана с западными охотниками-собирателями из материковой Европы, чем охотники-собиратели из Центральной Скандинавии. Мы используем импутированные генотипы, чтобы предсказать физические характеристики и обнаружили, что у нее была темная кожа и волосы, а также голубые глаза. Наконец, мы также обнаружили микробную ДНК, которая характерна для микробиома полости рта и куски генома животных, которые, вероятно, связаны с питанием. Результаты подчеркивают потенциал материала этого типа в качестве нового источника древней человеческой и микробной ДНК.

мтДНК определена как K1e.

Оффлайн DmitroR-2

  • Сообщений: 1886
  • Страна: ru
  • Рейтинг +683/-3
Re: дДНК из Скандинавии
« Ответ #5 : 14 Декабрь 2018, 12:33:21 »
дДНК как расшифровывается? древние ДНК?

Оффлайн Аббат Бузони

  • ...
  • Сообщений: 19888
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1818/-60
  • Y-ДНК: I1-SHTR7+
  • мтДНК: H16-a1-T152C!
Re: дДНК из Скандинавии
« Ответ #6 : 14 Декабрь 2018, 15:55:52 »
дДНК как расшифровывается? древние ДНК?

древняя ДНК

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.