АвторТема: Y DNA Reveal a Short Beringian Standstill, Rapid Expansion, and early Population  (Прочитано 376 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн rozenblattАвтор темы

  • Сообщений: 1165
  • Страна: kg
  • Рейтинг +1315/-0
  • Y-ДНК: C-F5481
  • мтДНК: M8a
https://www.cell.com/current-biology/fulltext/S0960-9822(18)31495-7

Y Chromosome Sequences Reveal a Short Beringian Standstill, Rapid Expansion, and early Population structure of Native American Founders

Thomaz Pinotti, Anders Bergström, Maria Geppert, Matt Bawn, Dominique Ohasi, Wentao Shi, Daniela R. Lacerda, Arne Solli, Jakob Norstedt, Kate Reed, Kim Dawtry, Fabricio González-Andrade, Cesar Paz-y-Miño, Susana Revollo, Cinthia Cuellar, Marilza S. Jota, José E. Santos Jr., Qasim Ayub, Toomas Kivisild 16, José R. Sandoval, Ricardo Fujita, Yali Xue, Lutz Roewer, Fabrício R. Santos, Chris Tyler-Smith 17

Open Access
Published: December 20, 2018
DOI:https://doi.org/10.1016/j.cub.2018.11.029

Highlights
• We sequenced 20 Native American Y chromosomes chosen for their genetic diversity
• A Beringian Standstill of <4,600 years led to both Siberian and American Y-lineages
• Y-lineage split times rule out occupation of the Americas before 19,500 years ago
• Present-day male population structure in South America arose before 12,000 years ago

Summary

The Americas were the last inhabitable continents to be occupied by humans, with a growing multidisciplinary consensus for entry 15–25 thousand years ago (kya) from northeast Asia via the former Beringia land bridge [1, 2, 3, 4]. Autosomal DNA analyses have dated the separation of Native American ancestors from the Asian gene pool to 23 kya or later [5, 6] and mtDNA analyses to ∼25 kya [7], followed by isolation (“Beringian Standstill” [8, 9]) for 2.4–9 ky and then a rapid expansion throughout the Americas. Here, we present a calibrated sequence-based analysis of 222 Native American and relevant Eurasian Y chromosomes (24 new) from haplogroups Q and C [10], with four major conclusions. First, we identify three to four independent lineages as autochthonous and likely founders: the major Q-M3 and rarer Q-CTS1780 present throughout the Americas, the very rare C3-MPB373 in South America, and possibly the C3-P39/Z30536 in North America. Second, from the divergence times and Eurasian/American distribution of lineages, we estimate a Beringian Standstill duration of 2.7 ky or 4.6 ky, according to alternative models, and entry south of the ice sheet after 19.5 kya. Third, we describe the star-like expansion of Q-M848 (within Q-M3) starting at 15 kya [11] in the Americas, followed by establishment of substantial spatial structure in South America by 12 kya. Fourth, the deep branches of the Q-CTS1780 lineage present at low frequencies throughout the Americas today [12] may reflect a separate out-of-Beringia dispersal after the melting of the glaciers at the end of the Pleistocene.

Основные моменты
       
•    Мы секвенировали 20 индейских Y-хромосом, выбранных с учетом их генетического разнообразия
       
•    Берингийский застой длительностью менее 4600 лет привел к появлению как сибирских, так и американских Y-линий
       
•    Времена разделения Y-линий исключают заселение Америки древнее 19 500 лет назад
       
•    Современная структура мужского населения в Южной Америке возникла до 12 000 лет назад
   
Резюме

Северная и Южная Америка были последними обитаемыми континентами, которые были заняты людьми, с растущим междисциплинарным консенсусом для входа 15-25 тысяч лет назад (тлн) из Северо-Восточной Азии через бывший берингийский сухопутный мост [1, 2, 3, 4]. Аутосомный анализ ДНК датировал отделение предков американских индейцев от азиатского генофонда до 23 тыс. лет назад или позже [5, 6], а анализ мтДНК - до 25 тыс. лет назад [7] с последующей изоляцией («Берингский застой» [8, 9]). ) на 2,4–9 тыс. лет, а затем быстрое распространение по всей Америке. Здесь мы представляем калиброванный, основанный на секвенировании, анализ 222 индейских и соответствующих евразийских Y-хромосом (24 новых) из гаплогрупп Q и C [10], с четырьмя основными выводами. Во-первых, мы определяем три-четыре линии независимого происхождения как автохтонные и вероятна предковые: основная Q-M3 и более редкая Q-CTS1780, присутствующие в Северной и Южной Америке, очень редкая C3-MPB373 в Южной Америке и, возможно, C3-P39 / Z30536 в Северной Америке. Во-вторых, исходя из времени расхождения и евразийско-американского распределения линий, мы оцениваем продолжительность Берингийского застоя в 2,7 тыс. лет или 4,6 тыс. лет, согласно альтернативным моделям, и продвижение к югу от ледяного покрова после 19,5 тыс. лет. Назад. В-третьих, мы описываем звездообразное расширение Q-M848 (в пределах Q-M3), начиная с 15 тыс. лет назад [11] в Северной и Южной Америке, с последующим установлением существенной пространственной структуры в Южной Америке к 12 тыс. лет. назад. В-четвертых, глубокие ветви линии Q-CTS1780, присутствующие сегодня на низких частотах по всей Северной и Южной Америке [12], могут отражать отдельное расселение из Берингии после таяния ледников в конце плейстоцена.

Оффлайн asan-kaygy

  • ...
  • Сообщений: 8267
  • Страна: kz
  • Рейтинг +751/-5
  • Y-ДНК: R1a1a1b2a1a-L657+,Y9+,Y944+
Re: Y DNA Reveal a Short Beringian Standstill, Rapid Expansion, and early Population
« Ответ #1 : 24 Декабрь 2018, 06:14:31 »
Спасибо за ссылку

Оффлайн Шад

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6255
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1131/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Y DNA Reveal a Short Beringian Standstill, Rapid Expansion, and early Population
« Ответ #2 : 02 Февраль 2019, 13:45:34 »


Ссылка на картинку.

Цитировать
Therefore, we can infer that Beringian isolation may not have started before 19.5 kya under the assumptions of the Beringian-American hypothesis. On this basis, we identify two clear founding lineages in Beringia [8]: Q-CTS1780 and Q-M3. We note that a similar conclusion could be drawn using haplogroup C lineages: a split after 17.4 kya (Figure 2). However, as we have only one chromosome from each autochthonous American lineage (North and South) and no ancient DNA evidence, their status as initial founding lineages is less clear, although their geographical locations and other genetic evidence [24] support founder status, particularly for C3-MPB373.
Following the logic of the mtDNA studies further, we can also infer the length of the Beringian Standstill using the time at which the America-specific lineages began to expand as a measure of its end. The early diversification (before 12 kya) within Q-CTS1780 could have occurred in Beringia, but the very striking expansion of the Q-M848 lineage beginning at 14.9 (13.1–16.8) kya within Q-M3 provides a compelling end date for the Beringian Standstill, when part of this population dispersed southward, perhaps via the ice-free Pacific coast [31, 32]. Taking into account the uncertainty in the phylogenetic dates, the duration of the Beringian Standstill can be estimated at a maximum 2.7 (19.5 minus 16.8) ky—considerably shorter than originally proposed [8, 9] (Figure 3).


Оффлайн Шад

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6255
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1131/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Y DNA Reveal a Short Beringian Standstill, Rapid Expansion, and early Population
« Ответ #3 : 02 Февраль 2019, 17:34:11 »


Ссылка для скачивания

Картинка из Pinotti et al., 2018.

Как видно, в Америке присутствуют два различных субклада С.
Скоро образец C3-MPB384 (Waranka from Ecuador) появится на дереве YFull. Он будет под https://www.yfull.com/tree/C-L1373/ (это пока все, что известно из статьи Пинотти).

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100