АвторТема: Ещё один предположительный E1b1b1a2 или E1b1b1*-C  (Прочитано 13745 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Centurion

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 9799
  • Страна: ru
  • Рейтинг +569/-2
Re: Ещё один предположительный E1b1b1a2 или E1b1b1*-C
« Ответ #45 : 17 Январь 2010, 00:30:57 »
Да чо вы спорите. Просто GATA H4 - 1. вот вам и фтдна, или наоборот, формат фтдна не правильный, т.е. к нему на +1 делать чтобы был НОРМАЛЬНЫЙ формат 17 локусов.

Оффлайн Nozdrin

  • Сообщений: 492
  • Рейтинг +33/-0
  • V13
Вопрос про "технологию" определения GATA_H4
« Ответ #46 : 17 Январь 2010, 05:01:39 »
Да мы не спорим. С переводом из формата в формат, я думаю, уже всё ясно.
А вот почему существует различие? Используются различные праймеры, или различие в "математике", или ещё что? Почему "Балановские", Гентис (вернее, когда используется формат Y-filer) нам выдают GATA_H4 = 12, а FTDNA - 11? Из-за чего приходится конвертировать форматы?
Какими "линейками" GATA_H4 меряют и какими "гирями" взвешивают?
Или у GATA_H4 есть какой-то "хвостик", который одни видят, а другие нет?
Или я ни фига не понял про аллели?
Цитировать
GATA H4

Repeat Motif:   [TAGA]n
Variable Region:   [TAGA]n
GATA_H4 = 12 - это 12 раз TAGA
GATA_H4 = 11 - это 11 (раз TAGA)
 ???

Оффлайн Овод

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 2120
  • Рейтинг +390/-3
  • Omnia mea mecum porto
  • Y-ДНК: R1a-M198
  • мтДНК: U4a
Re: Ещё один предположительный E1b1b1a2 или E1b1b1*-C
« Ответ #47 : 17 Январь 2010, 13:30:57 »
Да, такой "хвостик" есть. И он действительно зависит от пары праймеров, которые должны "сесть" до и после региона повтора, но не обязательно - вплотную к нему.
 
Положение пика на гель-электрофорезе таким образом не строго кратно количеству повторов, а включает некоторый сдвиг, зависящий также от суммарной массы обоих праймеров и величины двух "хвостиков". Величина этих "хвостиков неизвестна", к тому же и сам "мотив" может включать кроме полных, также и неполные повторы.
 
Поэтому многие исследователи описывают иногда аллели как "дробные", скажем 11.2, что означает одиннадцать полных повторов с двумя неполными. Однако при такой записи реально нельзя судить о числе мутаций (которое должно быть целым). Поэтому фирмы округляют. Одни в плюс, другие - в минус. Отсюда и разночтения.
 
Никто не знает "правильной" величины.

Оффлайн Centurion

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 9799
  • Страна: ru
  • Рейтинг +569/-2
Re: Ещё один предположительный E1b1b1a2 или E1b1b1*-C
« Ответ #48 : 17 Январь 2010, 14:08:53 »
Нет, Овод, это вы объяснили о дробных аллелях, а тут вопрос о конкретном H4, а там другая причина.

Оффлайн Sergey Lutak

  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 1020
  • Страна: 00
  • Рейтинг +63/-0
  • Carpatho-Rusyn-E1b1b1a1b1a and East.Galindian-H1b*
  • Y-ДНК: E1b1b1a1b1a10 (L142.1+, L539+, L542+, L544+, L618+, L930+, M78+, V13+, V36+, FGC11451+, CTS1489-, L17-, L99-, L143-, L241-, L250-, L540-, P65-, V12-, V22-, V27-, FGC11450-)
  • мтДНК: H1b* (16189C, 16356C, 16519C, 263G, 315.1C)
Re: Ещё один предположительный E1b1b1a2 или E1b1b1*-C
« Ответ #49 : 18 Январь 2010, 23:21:48 »
Фарра, можешь передать своему знакомому - уважаемому А...ву, что он - E1b1b1*-Cluster C (Jewish Cluster) (см. сайт Гаплотип).

Дима, поздравляю! В твоём кластере  прибыло!
« Последнее редактирование: 19 Август 2010, 14:49:20 от Sergey Lutak »

Оффлайн FarroukhАвтор темы

  • Maternal Y-DNA: R1b-L584
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 12660
  • Страна: az
  • Рейтинг +2755/-15
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f
Re: Ещё один предположительный E1b1b1a2 или E1b1b1*-C
« Ответ #50 : 18 Январь 2010, 23:35:03 »
Получается, что это еврейский кластер? И как же быть?

P. S. Идём в синагогу?

Оффлайн Alesh

  • Сообщений: 927
  • Рейтинг +80/-1
Re: Ещё один предположительный E1b1b1a2 или E1b1b1*-C
« Ответ #51 : 18 Январь 2010, 23:45:40 »
С прибытием новых людей, кластер вполне может измениться из еврейского в не еврейский.
 :)


Так мы и до Алёши Поповича дойдём, эх жалко АК с Шварёвым, придётся им менять арийскую гапплогруппу
 ;D ;D ;D
« Последнее редактирование: 18 Январь 2010, 23:53:25 от Alesh »

Оффлайн FarroukhАвтор темы

  • Maternal Y-DNA: R1b-L584
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 12660
  • Страна: az
  • Рейтинг +2755/-15
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f
Re: Ещё один предположительный E1b1b1a2 или E1b1b1*-C
« Ответ #52 : 19 Январь 2010, 00:17:31 »
Как принято говорить в нашей гапле:

Добро пожаловать в Адъ тёплую компанию гаплогруппы E1b1b1!  ;D

Оффлайн dima75

  • Сообщений: 536
  • Страна: il
  • Рейтинг +83/-1
    • Tartakovsky surname project
  • Y-ДНК: E1b1b1-PF1975 (E-Z830-A)
  • мтДНК: K1a1b1a
Re: Ещё один предположительный E1b1b1a2 или E1b1b1*-C
« Ответ #53 : 19 Январь 2010, 08:59:58 »
Добро пожаловать!
А он не тестировал маркеры DYS426, DYS388?

Оффлайн FarroukhАвтор темы

  • Maternal Y-DNA: R1b-L584
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 12660
  • Страна: az
  • Рейтинг +2755/-15
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f
Re: Ещё один предположительный E1b1b1a2 или E1b1b1*-C
« Ответ #54 : 19 Январь 2010, 12:48:54 »
Вроде в 17-маркерных гаплотипах это не предусмотрено.

Оффлайн FarroukhАвтор темы

  • Maternal Y-DNA: R1b-L584
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 12660
  • Страна: az
  • Рейтинг +2755/-15
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f
Re: Ещё один предположительный E1b1b1a2 или E1b1b1*-C
« Ответ #55 : 20 Январь 2010, 23:17:13 »
Серж, тебе вопрос как к зубру. По какому принципу проводится кластеризация?
Если я правильно понимаю, участники кластера – это потомки одного обособившегося предка и давшего свою ветвь, отчего его потомки имеют свои характерные значения аллелей.

Поясню на этом примере. У Алексея из 17 маркеров 15 совпадают с человеком из субклада E1b1b1a2. Но гаплозона почему-то причислила его к E1b1b1*-C. И то через какое-то определённое время.

В чём причина? Почему он не E1b1b1a2 или E1b1b1c1, а именно E1b1b1*-C?

Оффлайн Centurion

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 9799
  • Страна: ru
  • Рейтинг +569/-2
Re: Ещё один предположительный E1b1b1a2 или E1b1b1*-C
« Ответ #56 : 20 Январь 2010, 23:32:34 »
Фарух, закажите Ал. SNP-тест в Гентисе. Можно будет его поставить на V13 и M123, и M35.

Если он будет полож. на M35, но отриц. на V13, значит это E1b1b1*(xE1b1b1a2)

Оффлайн Sergey Lutak

  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 1020
  • Страна: 00
  • Рейтинг +63/-0
  • Carpatho-Rusyn-E1b1b1a1b1a and East.Galindian-H1b*
  • Y-ДНК: E1b1b1a1b1a10 (L142.1+, L539+, L542+, L544+, L618+, L930+, M78+, V13+, V36+, FGC11451+, CTS1489-, L17-, L99-, L143-, L241-, L250-, L540-, P65-, V12-, V22-, V27-, FGC11450-)
  • мтДНК: H1b* (16189C, 16356C, 16519C, 263G, 315.1C)
Re: Ещё один предположительный E1b1b1a2 или E1b1b1*-C
« Ответ #57 : 21 Январь 2010, 00:00:28 »
Брат Фарра, я не совсем понимаю, в чём твои сомнения.

У А...ва есть два полных совпаденца - оба они E1b1b1*-Cluster C.
На дистанции в одну мутацию - 6 человек: 5 - E1b1b1*-Cluster C и 1 - E1b1b1a2.

Сам видишь, что вероятность E1b1b1*-Cluster C несравнимо выше, чем E1b1b1a2.

Если конечно говорить о вероятности 99,99..., то могу лишь посоветовать последовать совету уважаемого Центуриона.
« Последнее редактирование: 19 Август 2010, 14:50:03 от Sergey Lutak »

Оффлайн FarroukhАвтор темы

  • Maternal Y-DNA: R1b-L584
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 12660
  • Страна: az
  • Рейтинг +2755/-15
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f
Re: Ещё один предположительный E1b1b1a2 или E1b1b1*-C
« Ответ #58 : 21 Январь 2010, 00:10:40 »
Цитировать
У А...ва есть два полных совпаденца - оба они E1b1b1*-Cluster C.
Ааа, теперь ясно. Я-то думал что совпаденец только тот человек с E1b1b1a2.
« Последнее редактирование: 19 Август 2010, 14:50:22 от Sergey Lutak »

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100