АвторТема: Где закодирована женская ГГ: на X или в mtDNA?  (Прочитано 11854 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн dnaexploraАвтор темы

  • Сообщений: 129
  • Рейтинг +5/-0
  • ySearch: KWRRB, maternal yDNA J2a4b*
  • Y-ДНК: G2a3b1a1* (U1+ L13- P303+)
  • мтДНК: H1e
Как я понимаю есть женская хромосома X.

Девочкам передается от матери и от матери отца пара.

Женскую гаплогруппу достают из материала "валяющегося" между хромосомами, а не из X. Верное утверждение?

Какая информация закодирована в X?

Оффлайн Овод

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 2176
  • Рейтинг +390/-3
  • Omnia mea mecum porto
  • Y-ДНК: R1a-M198
  • мтДНК: U4a
Re: Где закодирована женская ГГ: на X или в mtDNA?
« Ответ #1 : 10 Январь 2010, 22:40:07 »
"Женская" ГГ определяется по мито-ДНК, наследуемой по прямой материнской линии. Она так и называется - мито-ГГ.
 
По Х-хромосоме ГАПЛОгруппа определяться не может, так как набор Х-хромосом у женщин не гаплоидный, а ДИплоидный, то есть их - две (одна наследуется от отца, другая - от матери). То есть наследование Х=хромосомы, в отличие от Y ведётся не по прямой, а по сочетанным линиям.

Оффлайн Centurion

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 10121
  • Страна: ru
  • Рейтинг +565/-2
Re: Где закодирована женская ГГ: на X или в mtDNA?
« Ответ #2 : 10 Январь 2010, 23:13:57 »
На ВОГИСе был доклад по X-хромосомным гаплотипам и гаплогруппам локуса ZFX
http://forum.molgen.org/index.php/topic,354.msg6903.html#msg6903

Оффлайн dnaexploraАвтор темы

  • Сообщений: 129
  • Рейтинг +5/-0
  • ySearch: KWRRB, maternal yDNA J2a4b*
  • Y-ДНК: G2a3b1a1* (U1+ L13- P303+)
  • мтДНК: H1e
Re: Где закодирована женская ГГ: на X или в mtDNA?
« Ответ #3 : 10 Январь 2010, 23:29:20 »
"Женская" ГГ определяется по мито-ДНК, наследуемой по прямой материнской линии. Она так и называется - мито-ГГ.
 
По Х-хромосоме ГАПЛОгруппа определяться не может, так как набор Х-хромосом у женщин не гаплоидный, а ДИплоидный, то есть их - две (одна наследуется от отца, другая - от матери). То есть наследование Х=хромосомы, в отличие от Y ведётся не по прямой, а по сочетанным линиям.

То есть смысл вот этих тестов на FTDNA -- просто сравнение нескольких локусов на X хромосоме у двух или больше людей (они обозваны X-STR DNA TESTS FOR SIBLINGSHIP) с целью узнать есть ли родство по женской линии?

X-STR Markers Panel 1
Close info... ORDER NOW $99.00 This is a set of six x-chromosome short tandem repeat, STR, markers: DXS10011, DXS10066, DXS10067, DXS10068, DXS10069, and DXS10131.
X-STR Markers Panel 1 and 2
Close info... ORDER NOW $161.00 This is a set of seventeen x-chromosome short tandem repeat, STR, markers. Panel one tests DXS10011, DXS10066, DXS10067, DXS10068, DXS10069, and DXS10131. Panel two tests DXS10074, DXS10075, DXS10077, DXS10079, DXS10132, DXS6807, DXS7132, DXS7423, DXS8377, DXS981, and HPRTB.

Оффлайн dnaexploraАвтор темы

  • Сообщений: 129
  • Рейтинг +5/-0
  • ySearch: KWRRB, maternal yDNA J2a4b*
  • Y-ДНК: G2a3b1a1* (U1+ L13- P303+)
  • мтДНК: H1e
Re: Где закодирована женская ГГ: на X или в mtDNA?
« Ответ #4 : 10 Январь 2010, 23:32:25 »
гаплогруппам локуса ZFX

Как понять "гаплогруппа такого-то локуса"? Разве у локуса может быть гаплогруппа?

Оффлайн Овод

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 2176
  • Рейтинг +390/-3
  • Omnia mea mecum porto
  • Y-ДНК: R1a-M198
  • мтДНК: U4a
Re: Где закодирована женская ГГ: на X или в mtDNA?
« Ответ #5 : 10 Январь 2010, 23:44:08 »
Разумеется, у каждой отдельной Х-хромосомы может быть свой гаплотип. Однако, у женщин их две. Так что вряд ли можно говорить о "женской" Х-гаплогруппе, в случае, если гаплогруппы обоих хромосом не совпадают...

Оффлайн dnaexploraАвтор темы

  • Сообщений: 129
  • Рейтинг +5/-0
  • ySearch: KWRRB, maternal yDNA J2a4b*
  • Y-ДНК: G2a3b1a1* (U1+ L13- P303+)
  • мтДНК: H1e
Re: Где закодирована женская ГГ: на X или в mtDNA?
« Ответ #6 : 10 Январь 2010, 23:45:55 »
Разумеется, у каждой отдельной Х-хромосомы может быть свой гаплотип. Однако, у женщин их две. Так что вряд ли можно говорить о "женской" Х-гаплогруппе, в случае, если гаплогруппы обоих хромосом не совпадают...

Т.е. у мужчины в X-хромосоме записан тот же гаплотип что и в mtDNA и его можно считать?

Оффлайн Овод

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 2176
  • Рейтинг +390/-3
  • Omnia mea mecum porto
  • Y-ДНК: R1a-M198
  • мтДНК: U4a
Re: Где закодирована женская ГГ: на X или в mtDNA?
« Ответ #7 : 10 Январь 2010, 23:55:10 »
Как понять "гаплогруппа такого-то локуса"? Разве у локуса может быть гаплогруппа?

У любого локуса может быть гаплотип (совокупность СТР или СНП маркеров в этом локусе) но не гаплогруппа.

Оффлайн Centurion

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 10121
  • Страна: ru
  • Рейтинг +565/-2
Re: Где закодирована женская ГГ: на X или в mtDNA?
« Ответ #8 : 11 Январь 2010, 00:14:58 »
Разумеется, у каждой отдельной Х-хромосомы может быть свой гаплотип. Однако, у женщин их две. Так что вряд ли можно говорить о "женской" Х-гаплогруппе, в случае, если гаплогруппы обоих хромосом не совпадают...

Т.е. у мужчины в X-хромосоме записан тот же гаплотип что и в mtDNA и его можно считать?
Нет, почему? митохондрия передается по прямой женской линии, находится она вне ядра клетки, и имеет свою ДНК. В митохондрии не определяют микросателитов там подобие снипов, вернее отличие по отдельным нуклеотидам от одной единственной последовательности митохондриальной ДНК (из гаплогруппы H) которую приняли за образец.

Оффлайн Овод

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 2176
  • Рейтинг +390/-3
  • Omnia mea mecum porto
  • Y-ДНК: R1a-M198
  • мтДНК: U4a
Re: Где закодирована женская ГГ: на X или в mtDNA?
« Ответ #9 : 11 Январь 2010, 01:13:21 »
Чтобы уточнить терминологию: Гаплотип - это совокупность маркеров ( СТР и/или СНП). Гаплогруппа - результат классификации гаплотипов. Мне известно 2 таких классификации Y-гаплогруппы и мито-гаплогруппы. Про Х-гаплогруппы (в отличие от Х-гаплотипов) мне ничего не известно.
 
Но, возможно, мои сведения устарели. Если так, то было бы неплохо иметь ссылку на общеизвестную классификацию Х-гаплогрупп для гаплотипов Х-хромосомы, плиз.

Оффлайн dnaexploraАвтор темы

  • Сообщений: 129
  • Рейтинг +5/-0
  • ySearch: KWRRB, maternal yDNA J2a4b*
  • Y-ДНК: G2a3b1a1* (U1+ L13- P303+)
  • мтДНК: H1e
Re: Где закодирована женская ГГ: на X или в mtDNA?
« Ответ #10 : 11 Январь 2010, 01:15:11 »
Но, возможно, мои сведения устарели. Если так, то было бы неплохо иметь ссылку на общеизвестную классификацию Х-гаплогрупп для гаплотипов Х-хромосомы, плиз.

+1

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 31473
  • Страна: ca
  • Рейтинг +2353/-40
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5
Re: Где закодирована женская ГГ: на X или в mtDNA?
« Ответ #11 : 11 Январь 2010, 01:20:23 »
Про Х-гаплогруппы (в отличие от Х-гаплотипов) мне ничего не известно.
 
Но, возможно, мои сведения устарели. Если так, то было бы неплохо иметь ссылку на общеизвестную классификацию Х-гаплогрупп для гаплотипов Х-хромосомы, плиз.
Присоединяюсь к просьбе.
Я следил за обсуждением введением классификации субкладов и гаплогрупп для Х-хромосомы.
Как данность, сообщалось о том, что и на Х-хромосоме есть нерекомбинантные участки. То, что линии в общем случае чередующиеся, многими почему-то рассматривалось как недостаток. А по мне, предок, он предок и есть. Что мужского, что женского пола.
Чем всё кончилось - не знаю.

Роман, если у Вас есть сведения о проектах классификации Х-гаплогрупп, поделитесь, пожалуйста.
:)

Оффлайн asan-kaygy

  • ...
  • Сообщений: 7988
  • Страна: kz
  • Рейтинг +700/-5
  • Y-ДНК: R1a1a1b2a1a-L657+,Y9+,Y944+
Re: Где закодирована женская ГГ: на X или в mtDNA?
« Ответ #12 : 11 Январь 2010, 05:16:19 »
Насчет Х-гаплогрупп тоже интересно, вопрос, кто нибудь делал анализ по Х-хромосоме, какие результаты.

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 31473
  • Страна: ca
  • Рейтинг +2353/-40
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5
Re: Где закодирована женская ГГ: на X или в mtDNA?
« Ответ #13 : 11 Январь 2010, 06:09:45 »
Насчет Х-гаплогрупп тоже интересно, вопрос, кто нибудь делал анализ по Х-хромосоме, какие результаты.
По Х хромосоме два варианта:
1) Как часть теста у 23эндМи (там, кстати, на форумах я и видел попытки классификации).
2) Сиблингшип тест у ФТДНА - пара панелек, не имеющая отношения к Х-гаплогруппам, ну если только свой предиктор по Х-STRам когда-нибудь не сваяют (только надо сначала со снипами гаплогрупп определиться :) ).

Оффлайн Овод

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 2176
  • Рейтинг +390/-3
  • Omnia mea mecum porto
  • Y-ДНК: R1a-M198
  • мтДНК: U4a
Re: Где закодирована женская ГГ: на X или в mtDNA?
« Ответ #14 : 11 Январь 2010, 13:45:23 »
Михаил, с гаплогруппами Х-хромосомы существует та же самая проблема, что только что обсуждалась Вами по филогении УПСов аутосом в другой ветке.
 
Дело в том, что известные ранее классификации гаплогрупп (Y и мито) базируются на идее существования единого предка для части гаплотипов и именно при его наличии эти гаплотипы образуют гаплогруппу.
 
С Х-хромосомой всё сложнее, поскольку в её формировании (в силу рекомбинации) участвует не один, а множество предков по сочетанным линиям. По какому из них прикажете формировать гаплогруппу?
 
То есть, здесь нужен какой-то иной принцип формирования гаплогруппы. И называться эта "гаплогруппа" должна как-то иначе. Напомню, что само слово ГАПЛО значит - единственный.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100