АвторТема: Whole-genome sequencing of 175 Mongolians  (Прочитано 218 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн NimissinАвтор темы

  • Сообщений: 2071
  • Рейтинг +523/-0
  • Y-ДНК: N-M178 L839+ P298+ M2019+ M2118+ M1991+ M1988+
  • мтДНК: C4b4
Whole-genome sequencing of 175 Mongolians
« : 06 Ноябрь 2018, 06:58:17 »
Whole-genome sequencing of 175 Mongolians uncovers population-specific genetic architecture and gene flow throughout North and East Asia

Haihua Bai, Xiaosen Guo, Narisu Narisu, Tianming Lan, Qizhu Wu, Yanping Xing, Yong Zhang, Stephen R. Bond, Zhili Pei, Yanru Zhang, Dandan Zhang, Jirimutu Jirimutu, Dong Zhang, Xukui Yang, Morigenbatu Morigenbatu, Li Zhang, Bingyi Ding, Baozhu Guan, Junwei Cao, Haorong Lu, Yiyi Liu, Wangsheng Li, Ningxin Dang, Mingyang Jiang, Shenyuan Wang, Huixin Xu, Dingzhu Wang, Chunxia Liu, Xin Luo, Ying Gao, Xueqiong Li, Zongze Wu, Liqing Yang, Fanhua Meng, Xiaolian Ning, Hashenqimuge Hashenqimuge, Kaifeng Wu, Bo Wang, Suyalatu Suyalatu, Yingchun Liu, Chen Ye, Huiguang Wu, Kalle Leppälä, Lu Li, Lin Fang, Yujie Chen, Wenhao Xu, Tao Li, Xin Liu, Xun Xu, Christopher R. Gignoux, Huanming Yang, Lawrence C. Brody, Jun Wang, Karsten Kristiansen, Burenbatu Burenbatu,
Huanmin Zhou, Ye Yin

 Abstract

The genetic variation in Northern Asian populations is currently undersampled. To address this, we generated a new genetic variation reference panel by whole-genome sequencing of 175 ethnic Mongolians, representing six tribes. The cataloged variation in the panel shows strong population stratification among these tribes, which correlates with the diverse demographic histories in the region. Incorporating our results with the 1000 Genomes Project panel identifies derived alleles shared between Finns and Mongolians/Siberians, suggesting that substantial gene flow between northern Eurasian populations has occurred in the past. Furthermore, we highlight that North, East, and Southeast Asian populations are more aligned with each other than these groups are with South Asian and Oceanian populations.

http://www.nature.com/articles/s41588-018-0250-5

В работе есть и сведения о гаплогруппах игрек-хромосомы.



Оффлайн asan-kaygy

  • ...
  • Сообщений: 7949
  • Страна: kz
  • Рейтинг +694/-5
  • Y-ДНК: R1a1a1b2a1a-L657+,Y9+,Y944+
Re: Whole-genome sequencing of 175 Mongolians
« Ответ #1 : 06 Ноябрь 2018, 09:15:29 »
Спасибо за ссылку

Оффлайн asan-kaygy

  • ...
  • Сообщений: 7949
  • Страна: kz
  • Рейтинг +694/-5
  • Y-ДНК: R1a1a1b2a1a-L657+,Y9+,Y944+
Re: Whole-genome sequencing of 175 Mongolians
« Ответ #2 : 06 Ноябрь 2018, 09:15:40 »
A "Data accessibility" section is included at the end of Online Methods as "Raw sequencing data and variant sets have been deposited to the CNGB Nucleotide
Sequence Archive of China National Genebank (CNGB) with accession number CNP0000063. The data will be available to download fro anyone with an approval
from the study committee.
https://db.cngb.org/search/project/CNP0000063/
ftp://ftp.cngb.org/pub/CNSA/CNP0000063

Оффлайн Шад

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6006
  • Страна: ru
  • Рейтинг +945/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q1b1a
  • мтДНК: J1c2
Re: Whole-genome sequencing of 175 Mongolians
« Ответ #3 : 06 Ноябрь 2018, 10:52:29 »
https://www.ebi.ac.uk/ena/data/view/PRJEB27259

Есть ссылка на ENA, но BAM файлов почему-то не видно.
Хотя для YFull бы они были очень интересны.

Оффлайн asan-kaygy

  • ...
  • Сообщений: 7949
  • Страна: kz
  • Рейтинг +694/-5
  • Y-ДНК: R1a1a1b2a1a-L657+,Y9+,Y944+
Re: Whole-genome sequencing of 175 Mongolians
« Ответ #4 : 06 Ноябрь 2018, 11:20:35 »
https://www.ebi.ac.uk/ena/data/view/PRJEB27259

Есть ссылка на ENA, но BAM файлов почему-то не видно.
Хотя для YFull бы они были очень интересны.
Данные надо запрашивать

Оффлайн Teresh

  • Сообщений: 385
  • Страна: ru
  • Рейтинг +153/-0
  • Y-ДНК: R1a [YP237+ YP578+]
  • мтДНК: U5a1f
Re: Whole-genome sequencing of 175 Mongolians
« Ответ #5 : 07 Ноябрь 2018, 03:44:14 »
Гаплогруппа  D по Y-хромосоме  монголам, скорее всего, досталась от тибетцев (вместе с религией). Гаплогруппа R2, возможно, тоже через Тибет пришла.
Будем надеяться,  что китайцы и по Тибету когда-нибудь подобную статью сделают.

Оффлайн Teresh

  • Сообщений: 385
  • Страна: ru
  • Рейтинг +153/-0
  • Y-ДНК: R1a [YP237+ YP578+]
  • мтДНК: U5a1f
Re: Whole-genome sequencing of 175 Mongolians
« Ответ #6 : 07 Ноябрь 2018, 06:35:36 »
Буряты из Внутренней Монголии Китая

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100