Более простым языком о неравновесном сцеплении (Linkage Disequilibrium) и методиках датировок адмиксов
Это хорошо знакомые нам общие сегменты. Если два участка ДНК находятся на одной и той же хромосоме неподалеку друг от друга, то они с высокой вероятностью совместно передадутся (или совместно не передадутся) потомку. Мерой сцепленности являются сантиморганиды cM. Расстояние между участками 1 cM означает, что при передаче ребенку на этом участке с вероятностью 1% произойдет разрыв сегмента. Следовательно, чем сегмент короче, тем реже он распадается при поколенных переходах, и с ходом времени длинные сегменты постепенно превращаются в короткие (но какая-то часть длинных все равно сохраняется). Например, для казахской выборки кривые распределения по моим данным выглядят так:
Если между двумя популяциями произошел новый адмикс, это создаст новую порцию общих длинных сегментов между ними и форма графика нарушится. Например, на картинке выше у алтайцев количество сегментов 3-4 сМ с казахами ниже, чем у тувинцев и якутов, а сегментов 4-5 и 5-6 сМ - столько же. Можно предположить, что адмикс с алтайцами у казахов был позже, чем с тувинцами и якутами. Для папуасов, наоборот, кривая опускается к нулю быстрее всех. Следовательно, адмикс с ними предполагается наиболее древним. Вообще тут будет правильнее говорить не об адмиксе, а об аутосомном аналоге ВБОПа.
То есть в целом логика тут есть. Но на практике я не верю в достоверность получаемых датировок, поскольку дрейф очень сильно влияет на количество и длину сегментов - в частности, благодаря составным сегментам. Уже само по себе это может занизить результат в разы. К примеру, на графике у казахов больше сегментов с тувинцами, якутами и алтайцами, чем с собственно казахами, поскольку казахи - менее однородная и менее отдрейфовавшая популяция. Далее, если казахи повлияли на третью популяцию, при ее исследовании адмикс может проявиться, не как собственно казахский, а как "восточносибирский". Время какого события должна показать при этом датировка? Если адмиксов было несколько, или один, но длительный, датировка также собьется. Предположительно, в большинстве случаев самое сильное влияние на итоговый результат при этом должно быть у самого позднего события. В общем, подводных камней множество.