АвторТема: Минимальное количество маркеров  (Прочитано 286 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн sommerАвтор темы

  • Сообщений: 25
  • Страна: ru
  • Рейтинг +3/-0
Минимальное количество маркеров
« : 02 Октябрь 2018, 22:51:07 »
Господа, подскажите пожалуйста почти полному профану. Задача такая: генеалогия меня не интересует ( я ее знаю), как определить субклад гаплогруппы
до уровня R1a L664 (это субклад моего как я почти уверен родственника по прямой мужской линии). Глубже не надо. Сколько маркеров надо для анализа?
Заранее благодарен за возможную помощь со стороны форумного сообщества.
Тест Морли пишет, что-то вроде M512 L664 и какой-то там  PF. Но доверие у меня к этому тесту околонуля, хотя бы потому, что он одновременно предполагает
какие-то экзотические гаплогруппы вроде K или P. Сам я по мужскому происхождению остзейский немец по нисходящей до 12 века.
Тест предполагаю делать YSEQ, если кто подскажет какой именно лучше, буду очень благодарен. Форум читал много, ответа на свой вопрос не нашел.
Может что-то не так понял или не так формулирую вопрос?
« Последнее редактирование: 02 Октябрь 2018, 23:24:39 от sommer »

Оффлайн Francois

  • Сообщений: 370
  • Страна: ua
  • Рейтинг +53/-0
  • Y-ДНК: R1a-Z280
  • мтДНК: H
Re: Минимальное количество маркеров
« Ответ #1 : 03 Октябрь 2018, 08:39:21 »
Вы скорее всего R1a по тесту Морли. Это нормально, что он предлагает и предковые гаплогруппы, так что да. Если уверенны, что L664, берите этот снип в YSEQ, цена с доставкой меньше 20 евро: http://www.yseq.net/product_info.php?products_id=8035

Если не уверенны, R1a или R1b, можно сделать 12 маркеров в через проект FTDNA. Это минимальное количество маркеров, и только грубо определяет гаплогруппу. Дальше надо будет тестировать снипы.

Оффлайн sommerАвтор темы

  • Сообщений: 25
  • Страна: ru
  • Рейтинг +3/-0
Re: Минимальное количество маркеров
« Ответ #2 : 03 Октябрь 2018, 09:40:21 »
Вы скорее всего R1a по тесту Морли. Это нормально, что он предлагает и предковые гаплогруппы, так что да. Если уверенны, что L664, берите этот снип в YSEQ, цена с доставкой меньше 20 евро: http://www.yseq.net/product_info.php?products_id=8035

Если не уверенны, R1a или R1b, можно сделать 12 маркеров в через проект FTDNA. Это минимальное количество маркеров, и только грубо определяет гаплогруппу. Дальше надо будет тестировать снипы.
Большое спасибо за ваш ответ. Я совершенно не уверен, опираясь на тест Морли. Неизвестна его релевантность, никто не проводил статистики по его совпадениям.Но возникает такой естественный вопрос, если я сделаю эти 12 маркеров, то они покажут значимый для меня результат, то есть 100 процентов L664 или наоборот 100 процентов не L664?
В противном случае - ни да, ни нет смысла для меня нет никакого.
Получается надо тестировать этот снип L664.
Возникает вопрос интерпретации этого теста, что он покажет - отсутствие R1a, либо L664? Либо наличие R1b?
« Последнее редактирование: 03 Октябрь 2018, 09:52:45 от sommer »

Оффлайн Francois

  • Сообщений: 370
  • Страна: ua
  • Рейтинг +53/-0
  • Y-ДНК: R1a-Z280
  • мтДНК: H
Re: Минимальное количество маркеров
« Ответ #3 : 03 Октябрь 2018, 10:08:59 »
Маркеры не дадут 100% ответ, но люди их делают чтобы вообще понять общую картину - определить гаплогруппу.

Если будете тестировать только снип L664, то тест покажет только наличие снипа, всё. Если результат будет отрицательным, Вы останетесь ни с чем, не будете ясна даже гаплогруппа, Вы можете быть и R1a, и R1b, и все остальные гаплогруппы мира и их субклады. Если результат положительный- Вы молодец, определили субклад.

Оффлайн sommerАвтор темы

  • Сообщений: 25
  • Страна: ru
  • Рейтинг +3/-0
Re: Минимальное количество маркеров
« Ответ #4 : 03 Октябрь 2018, 10:25:12 »
Спасибо, еще раз. Что-то вырисовывается. В конце концов гаплогруппа - это сказочно малое количество генов из
генома. Если бы негр из Уганды попал бы в Швецию в 12 веке и у него в роду последовательно рождались бы одни мальчики
он был к настоящему времени  был бы 100 процентный носитель скандинавских генов, а по гаплогруппе африканец.
Как и наоборот носители скандинавских гаплогрупп в славянском окружении на протяжении столетий, ничего общего не имеют со скандинавами, кроме гаплогруппы
 а это  очень маленькое количество генов из общего генома.
Наверно, сделаю сразу два анализа - это будет разумнее.

Оффлайн ankr21

  • Сообщений: 2052
  • Страна: ru
  • Рейтинг +416/-0
  • Y-ДНК: I1-L1302
  • мтДНК: U3b1b
Re: Минимальное количество маркеров
« Ответ #5 : 03 Октябрь 2018, 11:02:33 »
Делайте 12 маркеров. У L664 dys388=10, на других ветках как правило =12. Но бывают исключения. Если по маркёрам вам определят R1a да еще и dys388 10 или 11, заказывайте снип. Можно в yseq тестироваться.  Дешевле получится чем в FTDNA. 58$ - 17 маркеров.
« Последнее редактирование: 03 Октябрь 2018, 11:09:49 от ankr21 »

Оффлайн sommerАвтор темы

  • Сообщений: 25
  • Страна: ru
  • Рейтинг +3/-0
Re: Минимальное количество маркеров
« Ответ #6 : 03 Октябрь 2018, 11:31:38 »
Делайте 12 маркеров. У L664 dys388=10, на других ветках как правило =12. Но бывают исключения. Если по маркёрам вам определят R1a да еще и dys388 10 или 11, заказывайте снип. Можно в yseq тестироваться.  Дешевле получится чем в FTDNA. 58$ - 17 маркеров.

Спасибо. А 12 точно хватит?
Человек в соседней ветке делал 37 маркеров
http://forum.molgen.org/index.php/topic,9948.msg386051.html#msg386051
И получил такой ответ. "Your Predicted Haplogroup is N-M231"
Не маловато?
Не могу понять, где в YSEQ тест на маркеры?
« Последнее редактирование: 03 Октябрь 2018, 11:55:18 от sommer »

Оффлайн ankr21

  • Сообщений: 2052
  • Страна: ru
  • Рейтинг +416/-0
  • Y-ДНК: I1-L1302
  • мтДНК: U3b1b
Re: Минимальное количество маркеров
« Ответ #7 : 03 Октябрь 2018, 12:41:10 »
Делайте 12 маркеров. У L664 dys388=10, на других ветках как правило =12. Но бывают исключения. Если по маркёрам вам определят R1a да еще и dys388 10 или 11, заказывайте снип. Можно в yseq тестироваться.  Дешевле получится чем в FTDNA. 58$ - 17 маркеров.

Спасибо. А 12 точно хватит?
Человек в соседней ветке делал 37 маркеров
http://forum.molgen.org/index.php/topic,9948.msg386051.html#msg386051
И получил такой ответ. "Your Predicted Haplogroup is N-M231"
Не маловато?
Не могу понять, где в YSEQ тест на маркеры?
https://www.yseq.net/product_info.php?cPath=23&products_id=32
В YSEQ будет 17 маркеров. Этого конечно мало. Но для определения гаплогруппы на уровне буквы - R1a, N1a, I1 и тд. достаточно. Дальше ветку можно вычислить по характерным маркерам-индикаторам. В случае с L664  это dys388. Но глубоко предсказывать ветвь по STR - дело неблагодарное. Поэтому лучше потом уточнять ветвь, тестируя снипы. 

Оффлайн sommerАвтор темы

  • Сообщений: 25
  • Страна: ru
  • Рейтинг +3/-0
Re: Минимальное количество маркеров
« Ответ #8 : 07 Октябрь 2018, 14:16:28 »
Всем спасибо за помощь. Для начала заказал 17 маркеров, так как совсем не доверяю тесту Морли.
Может кто подскажет что значит эта китайская для меня грамота:
PF:21995972(A|T)+

а в дереве нахожу поиском
21995972   19834086   T->A
как они коррелируются? A|T + это равно T|A - ?

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100