АвторТема: Анализ родства по X-хромосоме на примере семьи  (Прочитано 470 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Evgeny KolchuginАвтор темы

  • Сообщений: 343
  • Страна: ru
  • Рейтинг +87/-0
  • Y-ДНК: R1a-YP5814; R1a-YP1698; R1a-YP578; R1a-Y16755
  • мтДНК: K1a1b; Т2
Здравствуйте! При нехватке архивных документов хотел восстановить родственные связи между жителями одной местности (Бутчинская волость Калужской губ.) путём генетического тестирования, но пока только насобирал дополнительные вопросы. Не поможете разобраться? Для простоты, буду выкладывать их по-одному. Ситуация осложнена большим количеством близкородственных браков в интересующих деревнях. Кого ни потри ваткой - готовый родственник :)

В первую очередь - собственная семья. Протестировал трех родных сестер своей матери - у всех совпадение Х-хромосомы словно под копирку. А как же рекомбинация Х-хромосом у их матери?

Comparing Kit T287191 (Zoya I. Proshina)(F) and T436241 (Valentina I. Proshina)(F)
Chr  Start Location End Location Centimorgans (cM) SNPs 
X 2,710,157 154,545,424 190.1 16,630
Largest segment = 190.1 cM
 Total of segments > 7 cM = 190.1 cM Actual.

Comparing Kit T287191 (Zoya I. Proshina)(F) and T396740 (Galina I. Proshina)(F)
Chr  Start Location End Location Centimorgans (cM) SNPs 
X 2,710,157 154,545,424 190.1 16,633
Largest segment = 190.1 cM
 Total of segments > 7 cM = 190.1 cM Actual.

Comparing Kit T287191 (Zoya I. Proshina)(F) and T303929 (Nadezhda I. Proshina)(F)
Chr  Start Location End Location Centimorgans (cM) SNPs 
X 2,710,157 154,545,424 190.1 16,603
Largest segment = 190.1 cM
 Total of segments > 7 cM = 190.1 cM Actual.

Оффлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-L584
  • ...
  • Сообщений: 10908
  • Страна: az
  • Рейтинг +1727/-15
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37093
  • мтДНК: F2f
Цитировать
совпадение Х-хромосомы словно под копирку.
Какова разница в возрасте у всех четырёх сестёр? Сёстры, естественно, родные, так что как минимум отцовский Икс у них идентичен.

Оффлайн Evgeny KolchuginАвтор темы

  • Сообщений: 343
  • Страна: ru
  • Рейтинг +87/-0
  • Y-ДНК: R1a-YP5814; R1a-YP1698; R1a-YP578; R1a-Y16755
  • мтДНК: K1a1b; Т2
Между старшей и младшей примерно 15 лет. Отец общий. Если совпадение объясняется отцовской Х, тогда ситуация понятна.

Теперь добавляю её двух родных братьев, мать у них всех тоже общая. Очевидно, что эти совпадения должны отражать Х с материнской стороны. Тем не менее, почему у Виктора выскакивают те же сегменты, что и при сравнении сестер? Начало совпадающего участка 2,710,157 идентичен такому у сестер. Родственный брак или что-то другое? Гедматч говорит, что родители Зои - дальние родственники с ориентировочным количеством поколений до общего предка 7.4

Comparing Kit T287191 (Zoya I. Proshina)(F) and T847382 (Veniamin I. Proshin)(M)
Chr  Start Location End Location Centimorgans (cM) SNPs 
X 53,076,044 140,335,603 73.5 7,581
Largest segment = 73.5 cM
 Total of segments > 7 cM = 73.5 cM Actual.

Comparing Kit T287191 (Zoya I. Proshina)(F) and T567682 (Viktor I. Proshin)(M)
Chr  Start Location End Location Centimorgans (cM) SNPs 
X 2,710,157 26,019,190 41.6 3,259
X 139,869,165 154,551,755 36.4 2,234
Largest segment = 41.6 cM
 Total of segments > 7 cM = 78.0 cM Actual.

« Последнее редактирование: 28 Июнь 2018, 17:48:04 от Evgeny Kolchugin »

Оффлайн dima75

  • Сообщений: 517
  • Страна: il
  • Рейтинг +75/-1
    • Tartakovsky surname project
  • Y-ДНК: E1b1b1-PF1975 (E-Z830-A)
  • мтДНК: K1a1b1a
Фаррух прав. Тест икс-хромосомы сестёр подтверждает их происхождение от общего отца, такой тест часто используют для подтверждения родства. При нынешнем уровне тестов, они показывают наибольшую длину совпадения по одной из икс-хромосом, но не показывают, есть ли вдобавок совпадение по второй икс-хромосоме на тех же участках. Логично предположить, что определённое совпадение есть и по икс-хромосоме, полученной от матери, но оно будет короче, чем полное совпадение по отцовской.

Оффлайн Evgeny KolchuginАвтор темы

  • Сообщений: 343
  • Страна: ru
  • Рейтинг +87/-0
  • Y-ДНК: R1a-YP5814; R1a-YP1698; R1a-YP578; R1a-Y16755
  • мтДНК: K1a1b; Т2
Спасибо. Тогда единственное объяснение, которое я могу предложить для совпадающего участка с началом 2,710,157 у всех сестер и одного брата, это совпадение этого участка у их отца и матери.

Теперь добавляю к сравнению двух двоюродных сестер моей матери (от двух родных братьев по отцу). Поскольку для каждой из дам родство идёт по мужской линии (отец-дед), пересечений по Х-хромосоме не ожидалось. Как бы не так! Есть и очень значительное, причём с перекрёстно совпадающими фрагментами.

Похоже, что мамы всех трёх сестрёнок были в родстве между собой. Интересно, можно сделать какие-то выводы о степени родства матерей на основе длины общих фрагментов Х-хромосомы?

Comparing Kit T287191 (Zoya I. Proshina)(F) and T707218 (Valentina Tihonovna Proshina)(F)
Chr  Start Location End Location Centimorgans (cM) SNPs 
X 21,866,749 37,528,612 27.0 2,323
X 53,076,044 96,315,983 20.9 2,850
X 106,672,721 154,545,424 78.5 6,055
Largest segment = 78.5 cM
 Total of segments > 7 cM = 126.3 cM Actual.

Comparing Kit T287191 (Zoya I. Proshina)(F) and T493765 (Varvara Vlasyevna Proshina)(F)
Chr  Start Location End Location Centimorgans (cM) SNPs 
X 2,710,157 12,457,411 19.9 1,408
X 21,866,749 36,686,507 25.8 2,267
X 96,301,626 154,545,424 86.6 7,058
Largest segment = 86.6 cM
 Total of segments > 7 cM = 132.3 cM Actual.
« Последнее редактирование: 29 Июнь 2018, 14:12:17 от Evgeny Kolchugin »

Оффлайн dima75

  • Сообщений: 517
  • Страна: il
  • Рейтинг +75/-1
    • Tartakovsky surname project
  • Y-ДНК: E1b1b1-PF1975 (E-Z830-A)
  • мтДНК: K1a1b1a
У брата одна икс-хромосома - от матери. Совпадение с сёстрами - по ней.

Оффлайн Evgeny KolchuginАвтор темы

  • Сообщений: 343
  • Страна: ru
  • Рейтинг +87/-0
  • Y-ДНК: R1a-YP5814; R1a-YP1698; R1a-YP578; R1a-Y16755
  • мтДНК: K1a1b; Т2
Интересно, можно сделать какие-то выводы о степени родства матерей на основе длины общих фрагментов Х-хромосомы?
Сам догадался, что совпадающие фрагменты для трёх двоюродных сестёр могли достаться им через отцов от их общей бабки.

Оффлайн Evgeny KolchuginАвтор темы

  • Сообщений: 343
  • Страна: ru
  • Рейтинг +87/-0
  • Y-ДНК: R1a-YP5814; R1a-YP1698; R1a-YP578; R1a-Y16755
  • мтДНК: K1a1b; Т2
А теперь добавляю их односельчанку, с рассчётной степенью родства по аутосомам со всеми вышеперечисленными от 3.0 до 3.9 поколений. У неё нашлись общие фрагменты Х-хромосомы как с родными сёстрами и братьями Прошиными, так и с двоюродными. Получается, что она связана с Прошиными и через их мать и через их бабку по отцовской линии.

Уф, вроде полегчало. ;D

Comparing Kit T364982 (Maria Frolikova)(F) and T287191 (Zoya I. Proshina)(F)
Chr  Start Location End Location Centimorgans (cM) SNPs 
X 86,796,766 121,271,067 36.8 3,344

Comparing Kit T364982 (Maria Frolikova)(F) and T396740 (Galina I. Proshina)(F)
Chr  Start Location End Location Centimorgans (cM) SNPs 
X 86,796,766 121,271,067 36.8 3,341

Comparing Kit T364982 (Maria Frolikova)(F) and T847382 (Veniamin I. Proshin)(M)
Chr  Start Location End Location Centimorgans (cM) SNPs 
X 87,556,760 121,271,067 35.4 3,230

Comparing Kit T364982 (Maria Frolikova)(F) and T493765 (Varvara Vlasyevna Proshina)(F)
Chr  Start Location End Location Centimorgans (cM) SNPs 
X 40,370,982 46,146,601 10.3 751

Comparing Kit T364982 (Maria Frolikova)(F) and T707218 (Valentina Tihonovna Proshina)(F)
Chr  Start Location End Location Centimorgans (cM) SNPs 
X 40,480,379 46,146,601 9.9 736

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100