АвторТема: Как определить гаплогруппу по гаплотипу?  (Прочитано 5184 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн ankr21

  • Сообщений: 2256
  • Страна: ru
  • Рейтинг +551/-0
  • Y-ДНК: I1-L1302
  • мтДНК: U3b1b
Интересно читать вашу дискуссию, уважаемые мэтры:)
А можно попросить в студию, раз уж речь зашла, список основных ресурсов: предикторов, баз и прочего необходимого. Поскольку это вполне соответствует теме. Т.е. алгоритм определения гаплогруппы состоит в следующем: (1) лезем на сайты-предикторы, смотрим предсказания; (2) ищем по базам людей со сходным гаплотипом; (3) спрашиваем совета у мэтров; и т.д.... Вот примерно в таком стиле можно попросить подытожить?
Да. Забыл. МЭтров можно послать лесом. И сделать BigY или YElite.

Оффлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-BY124371
  • ...
  • Сообщений: 17097
  • Страна: az
  • Рейтинг +5908/-17
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f1
Цитировать
Т.е. алгоритм определения гаплогруппы состоит в следующем: (1) лезем на сайты-предикторы, смотрим предсказания; (2) ищем по базам людей со сходным гаплотипом; (3) спрашиваем совета у мэтров; и т.д.... Вот примерно в таком стиле можно попросить подытожить?
Уже давно подытожено. Сссылка на примере гаплогруппы E-M35 (ибо в нашем случае предиктор бесполезен):
Я получил результат. Что делать дальше? Первая помощь

Онлайн Lesla

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 9628
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2923/-9
  • FTDNA: 154400 (Big Y - 283049)
  • Y-ДНК: R1a-YP682 (VK06+)
Хочу уточнить, что разговор начинался с определения гаплогрупп, не больше. Всякие субклады внутри гаплогрупп - это уже другой коленкор.

Оффлайн curmol

  • Сообщений: 107
  • Рейтинг +37/-2
Нет, все равно непонятно. Это каков же должен быть объем статистического материала (выборки)? Если есть (допустим) 37 маркеров и по каждому (пусть для простоты) 2 наиболее распространенных значения, так это же получается 2^37 гаплотипов.
137 438 953 472. Конечно - нет
Цитировать
Разве реально такое удержать в голове или "надергать" откуда-то?
Нет даже базы на порядки меньшей. У FTDNA по Y37 хорошо, если 300 000 наберется (вместе с теми , кто не делал Y25-37, а сделал BIG Y).

Оффлайн Bakalavrr

  • East. Europe 98% : West Slavic 42% , Baltic 23% , East Slavic 21% , Magyar 12%.
  • Сообщений: 484
  • Страна: ru
  • Рейтинг +208/-0
  • Y-ДНК: R1a>Z92>YP569>Y11268>Y177488
  • мтДНК: H5D
Re: Как определить гаплогруппу по гаплотипу?
« Ответ #19 : 30 Октябрь 2018, 20:10:44 »
У меня такой вопрос к знающим специалистам: Если в генеалогическом заключении нет ни одного SNP ,а одни только STR-маркеры можно ли утверждать что не может быть определена никакая гаплогруппа?  :-\

Оффлайн gecube_ru

  • Сообщений: 1418
  • Страна: hu
  • Рейтинг +264/-6
  • Незнайка на Луне
  • Y-ДНК: I-A6397 -> I-FGC79161
  • мтДНК: V7a1?
Re: Как определить гаплогруппу по гаплотипу?
« Ответ #20 : 30 Октябрь 2018, 21:18:50 »
У меня такой вопрос к знающим специалистам: Если в генеалогическом заключении нет ни одного SNP ,а одни только STR-маркеры можно ли утверждать что не может быть определена никакая гаплогруппа?  :-\
нет, есть характерные комбинации STR для конкретных гаплогруп. Но это не 100% соответствие, а все-таки вероятностное.

Оффлайн Bakalavrr

  • East. Europe 98% : West Slavic 42% , Baltic 23% , East Slavic 21% , Magyar 12%.
  • Сообщений: 484
  • Страна: ru
  • Рейтинг +208/-0
  • Y-ДНК: R1a>Z92>YP569>Y11268>Y177488
  • мтДНК: H5D
Re: Как определить гаплогруппу по гаплотипу?
« Ответ #21 : 01 Ноябрь 2018, 19:35:38 »
А по какой причине прикрыли базы -проекты:FTNDA Yfull и Semargl?

Оффлайн пенелопа

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6485
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2714/-13
  • мтДНК: H1b
Re: Как определить гаплогруппу по гаплотипу?
« Ответ #22 : 01 Ноябрь 2018, 21:22:00 »
А по какой причине прикрыли базы -проекты:FTNDA Yfull и Semargl?
В соответствии с законодательством по части обеспечения приватности.



Оффлайн DmitroR-2

  • Сообщений: 1886
  • Страна: ru
  • Рейтинг +683/-3
Re: Как определить гаплогруппу по гаплотипу?
« Ответ #23 : 06 Ноябрь 2018, 22:31:31 »
Кто подскажет, какие у меня есть характерные маркеры, на которых мне стило бы обратить внимание в гаплотипах потенциальных родственников?

п.с. Загрузил только 85 маркеров. При необходимости могу загрузить все маркеры из БИГа.

Оффлайн DmitroR-2

  • Сообщений: 1886
  • Страна: ru
  • Рейтинг +683/-3
Re: Как определить гаплогруппу по гаплотипу?
« Ответ #24 : 06 Ноябрь 2018, 22:36:33 »
Мне приметились:
-DYS385:12-12
-DYS459: 8-10
Есть в в этом какие-то резоны? Или я не прав?

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.