дДНК из Исландии, 10-11 век и позднее

[rozenblatt]

http://science.sciencemag.org/content/360/6392/1028

Ancient genomes from Iceland reveal the making of a human population

S. Sunna Ebenesersdóttir1,2,*, Marcela Sandoval-Velasco3, Ellen D. Gunnarsdóttir1,2, Anuradha Jagadeesan1,2, Valdís B. Guðmundsdóttir1,2, Elísabet L. Thordardóttir1,2, Margrét S. Einarsdóttir1,2, Kristjan H. S. Moore1, Ásgeir Sigurðsson1, Droplaug N. Magnúsdóttir1, Hákon Jónsson1, Steinunn Snorradóttir1, Eivind Hovig4,5,6, Pål Møller4,7,8, Ingrid Kockum9, Tomas Olsson9, Lars Alfredsson10, Thomas F. Hansen11,12, Thomas Werge11,13,14, Gianpiero L. Cavalleri15, Edmund Gilbert15, Carles Lalueza-Fox16, Joe W. Walser III17,18, Steinunn Kristjánsdóttir17,18, Shyam Gopalakrishnan3, Lilja Árnadóttir17, Ólafur Þ. Magnússon1, M. Thomas P. Gilbert3,19, Kári Stefánsson1,20,*, Agnar Helgason1,2,*

Science 01 Jun 2018:
Vol. 360, Issue 6392, pp. 1028-1032
DOI: 10.1126/science.aar2625

Abstract

Opportunities to directly study the founding of a human population and its subsequent evolutionary history are rare. Using genome sequence data from 27 ancient Icelanders, we demonstrate that they are a combination of Norse, Gaelic, and admixed individuals. We further show that these ancient Icelanders are markedly more similar to their source populations in Scandinavia and the British-Irish Isles than to contemporary Icelanders, who have been shaped by 1100 years of extensive genetic drift. Finally, we report evidence of unequal contributions from the ancient founders to the contemporary Icelandic gene pool. These results provide detailed insights into the making of a human population that has proven extraordinarily useful for the discovery of genotype-phenotype associations

Возможности прямого изучения основания человеческой популяции и ее последующей эволюционной истории редки. Используя данные о последовательности генома 27 древних Исландцев, мы демонстрируем, что они представляют собой комбинацию индивидуумов скандинавско, гэльского и смешанного происхождения. Далее мы показываем, что эти древние исландцы заметно больше похожи на исходные популяции в Скандинавии и на Британско-ирландских островах, чем на современных исландцев, которые сформировались за 1100 лет обширного генетического дрейфа. Наконец, мы приводим доказательства неравного вклада древних основателей в современный исландский генофонд. Эти результаты дают детальное представление о создании человеческой популяции, которая оказалась чрезвычайно полезной для открытия ассоциаций генотипа и фенотипа.

Код: [Выделить]

Образец Пол мтДНК Y-ДНК

Дохристианская Исландия, примерно 1000 год н.э.
Мигранты:
DA‑V-A8 XX H1 –
DAV-A9 XY H1 I1
SSG-A2* XY J1c3g R1b1a1a2a1a2c1
SSG-A3* XY T2b2b I1
SSG-A4* XX J1b1a1a –
Местные:
DKS-A1 XY U5a1h R1a1a1b1a3
GRS-A1 XY K1a1b1b R1a1a1b1a3b
GTE-A1 XY H4a1a4b R1a1a1b1a3a1
HSJ-A1 XY H3g1 I1a1b3b
KNS-A1 XY H5 R1b1a1a2a1a2c
MKR-A1 XY K1c1b R1a1a1b
NNM-A1 XY H2a2b5a R1a1a1b1a3a
ORE-A1 XY K1a3a R1b1a1a2a1a
SBT-A1 XY H3g1a I1a2a1a2
SSJ-A2 XY U5a1a1 I1a1b3
STT-A2 XY U4b1b1 R1b1a1a2a1a2c1
SVK-A1 XY I2 I1b
VDP-A5 XX H3 –
VDP-A6 XY H1c3a R1a1a1b1a3a
VDP-A7 XY H4a1a1 R1b1a1a2a1a1b
Неизвестно:
FSS-A1 XX U4a2 –
NÞR-A2 XX K1a2a –
TGS-A1 XY T2e1 R1b1a1a2a1a2d
YGS-B2 XXY J1c1a R1b1a1a2a1a

Раннехристианский местный:
ÞSK-A26 XY J1b1a1a R1a1

13 век:
FOV-A1 XY HV17a R1b1a1a2a1a2c1a1

17 век:
KOV-A2 XY H1 R1b1a1a2a1a

Насчёт YGS-B2 - это не ошибка, у него действительно XXY, синдром Клайнфельтера.

[Deus]

Ничего интересного

[hgv]

Исландцы за тысячу лет стали больше похожи на скандинавов
Photo Tractatus / flickr.com

Европейские исследователи проследили, как сформировались современные исландцы, рассказывается в Science. Несмотря на то, что первые переселенцы прибыли на остров из Норвегии, Британии и Ирландии, современные жители страны генетически похожи на норвежцев и шведов, которые мигрировали в Исландию сравнительно недавно.
Согласно историческим хроникам, Исландию заселили в IX-X веках выходцы из Норвегии и с Британских островов. По-видимому, в первые века после переселения на острове жили 8-15 тысяч человек. Позднее население увеличилось, но до 1850-х годов редко превышало 50 тысяч человек. И только в последние полтора века произошел взрывной рост численности исландцев и сегодня их насчитывается около 330 тысяч. Генетические исследования современных жителей страны (1, 2) показали, что по материнской линии они происходят из прибрежных районов Шотландии и Ирландии, а также с севера Англии, а по отцовской — из Скандинавии. Митохондриальная ДНК исландцев на 62 процента соответствует жителям Британских островов, а последовательности Y-хромосом исландцев, норвежцев и шведов схожи на 75 процентов. Анализ митохондриальной ДНК из останков первых поселенцев показал, что они больше похожи на современных жителей Скандинавии, Ирландии и Шотландии, чем на современных исландцев.
В новом исследовании генетики из шести стран под руководством Сунны Эбенесерсдоттир (Sunna Ebenesersdóttir) из Исландского университета провели полногеномный анализ ДНК из останков 27 первых поселенцев, найденных в дохристианских захоронениях в разных частях острова. В качестве референтных ученые сначала использовали геномы 2139 человек из 28 европейских современных популяций, а потом сузили поиск и провели анализ геномов 3118 современных жителей Скандинавии, 1436 жителей Британских островов и 916 исландцев.
Оказалось, что первые поселенцы были меньше похожи на жителей современных Норвегии, Дании и Швеции, чем современные исландцы. Процент генетической схожести между исландцами и другими скандинавами за 1100 лет вырос с 57 процентов до 70. Авторы исследования объясняют это тем, что жители Британских островов часто оказывались в Исландии в качестве рабов и у них было меньше возможностей оставить потомство, чем у свободных викингов. Кроме того, вероятно сыграла роль иммиграция из Дании, которая продолжалась на протяжении веков — Исландия была датской колонией с 1380 по 1944 годы.
Ранее археологи восстановили некоторые детали быта первых исландских поселенцев. Судя по хроническим заболеваниям суставов и костей, люди работали «на износ» и страдали от цинги и других заболеваний, вызванных скудным и несбалансированным питанием.

[kirroid]

http://science.sciencemag.org/content/360/6392/1028

Ancient genomes from Iceland reveal the making of a human population

S. Sunna Ebenesersdóttir at al.
Science  01 Jun 2018:
Vol. 360, Issue 6392, pp. 1028-1032
DOI: https://doi.org/10.1126/science.aar2625

Abstract

Opportunities to directly study the founding of a human population and its subsequent evolutionary history are rare. Using genome sequence data from 27 ancient Icelanders, we demonstrate that they are a combination of Norse, Gaelic, and admixed individuals. We further show that these ancient Icelanders are markedly more similar to their source populations in Scandinavia and the British-Irish Isles than to contemporary Icelanders, who have been shaped by 1100 years of extensive genetic drift. Finally, we report evidence of unequal contributions from the ancient founders to the contemporary Icelandic gene pool. These results provide detailed insights into the making of a human population that has proven extraordinarily useful for the discovery of genotype-phenotype associations.

Не так часто появляется возможность непосредственно изучить появление некой популяции и ее последующее развитие. Используя геномную последовательность из останков 27-и древних Исландцев, мы показываем, что они имели Скандинавское, Гэльское и смешанное происхождение. Далее мы показываем, что эти древние Исландцы оказались значительно ближе к тем исходным этническим группам из Скандинавии и Британо-Ирландских островов, нежели к современным Исландцам, чей этнофон сложился по итогам 1100 лет активного дрейфа генов. В заключении, мы предоставляем свидетельства, что древние предки современных Исландцев внесли неравный вклад в их нынешний генофонд. Данные результаты позволяют подробно проследить создание некой популяции, оказавшейся невероятно ценной для изучения взаимосвязи генотипа и фенотипа.

P.S. Говорят, что BAMы в свободном доступе 

[Semargl]

Первый раз вижу такой древний образец - качество лучше некоторых современных сиквенсов.
HSJ-A1 --- I-Y13039

[Semargl]

Первый раз вижу такой древний образец - качество лучше некоторых современных сиквенсов.
HSJ-A1 --- I-Y13039

10 из 22 будут добавлены на дерево YFull.