АвторТема: Characterizing the genetic history of admixture across inner Eurasia  (Прочитано 11762 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Онлайн rozenblattАвтор темы

  • Сообщений: 1571
  • Страна: kg
  • Рейтинг +2073/-0
  • Y-ДНК: C-ZQ31
  • мтДНК: M8a
https://www.biorxiv.org/content/early/2018/05/23/327122

Characterizing the genetic history of admixture across inner Eurasia

View ORCID ProfileChoongwon Jeong, Oleg Balanovsky, Elena Lukianova, Nurzhibek Kahbatkyzy, Pavel Flegontov, Valery Zaporozhchenko, Alexander Immel, Chuan-Chao Wang, Olzhas Ixan, Elmira Khussainova, Bakhytzhan Bekmanov, Victor Zaibert, Maria Lavryashina, Elvira Pocheshkhova, Yuldash Yusupov, Anastasiya Agdzhoyan, Koshel Sergey, Andrei Bukin, Pagbajabyn Nymadawa, Michail Churnosov, Roza Skhalyakho, Denis Daragan, Yuri Bogunov, Anna Bogunova, Alexandr Shtrunov, Nadezda Dubova, Maxat Zhabagin, Levon Yepiskoposyan, Vladimir Churakov, Nikolay Pislegin, Larissa Damba, Ludmila Saroyants, Khadizhat Dibirova, Lubov Artamentova, Olga Utevska, Eldar Idrisov, Evgeniya Kamenshchikova, Irina Evseeva, Mait Metspalu, Martine Robbeets, Leyla Djansugurova, Elena Balanovska, Stephan Schiffels, Wolfgang Haak, David Reich, Johannes Krause

doi: https://doi.org/10.1101/327122

Abstract

The indigenous populations of inner Eurasia, a huge geographic region covering the central Eurasian steppe and the northern Eurasian taiga and tundra, harbor tremendous diversity in their genes, cultures and languages. In this study, we report novel genome-wide data for 763 individuals from Armenia, Georgia, Kazakhstan, Moldova, Mongolia, Russia, Tajikistan, Ukraine, and Uzbekistan. We furthermore report genome-wide data of two Eneolithic individuals (~5,400 years before present) associated with the Botai culture in northern Kazakhstan. We find that inner Eurasian populations are structured into three distinct admixture clines stretching between various western and eastern Eurasian ancestries. This genetic separation is well mirrored by geography. The ancient Botai genomes suggest yet another layer of admixture in inner Eurasia that involves Mesolithic hunter-gatherers in Europe, the Upper Paleolithic southern Siberians and East Asians. Admixture modeling of ancient and modern populations suggests an overwriting of this ancient structure in the Altai-Sayan region by migrations of western steppe herders, but partial retaining of this ancient North Eurasian-related cline further to the North. Finally, the genetic structure of Caucasus populations highlights a role of the Caucasus Mountains as a barrier to gene flow and suggests a post-Neolithic gene flow into North Caucasus populations from the steppe.

Коренные народы внутренней Евразии, огромного географического региона, охватывающего центральную евразийскую степь и северную евразийскую тайгу и тундру, обладают огромным разнообразием в своих генах, культурах и языках. В этом исследовании мы сообщаем о новых данных генома для 763 человек из Армении, Грузии, Казахстана, Молдовы, Монголии, России, Таджикистана, Украины и Узбекистана. Кроме того, мы приводим данные о геноме двух энеолитических людей (~ 5400 лет до настоящего времени), связанных с ботайской культурой в Северном Казахстане. Мы находим, что внутренние евразийские популяции структурированы в три отдельных генетических градиента, простирающиеся между различными западными и восточными евразийскими предками. Это генетическое разделение хорошо отражено географией. Древние геномы Ботая предполагают еще один слой примеси во внутренней Евразии, в котором участвуют мезолитические охотники-собиратели в Европе, южные сибиряки верхнего палеолита и восточные азиаты. Моделирование смешения древних и современных популяций предполагает стирание этой древней структуры в Алтае-Саянском регионе миграциями западных степных скотоводов, но частичное сохранение этого древнего северноевразийского градиента дальше к северу. Наконец, генетическая структура популяций Кавказа подчеркивает роль кавказских гор как барьер для потока генов и предполагает, что пост-неолитический генный поток поступает в северокавказские популяции из степи.

Ещё два ботайца:

Sex mtDNA Y-DNA
TU45 M K1b2 R1b1a1
BKZ001 F Z1

Оффлайн zastrug

  • ...
  • Сообщений: 11274
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2848/-49
  • I2b1c (P78+)=I2a2a1b1a= I2a1b1a2a1a1( I-FT413656)
  • Y-ДНК: I2b1c
  • мтДНК: T2a1a
Re: Characterizing the genetic history of admixture across inner Eurasia
« Ответ #1 : 24 Май 2018, 02:51:01 »
Цитировать
"Наконец, генетическая структура популяций Кавказа подчеркивает роль кавказских гор как барьер для потока генов и предполагает, что пост-неолитический генный поток поступает в северокавказских популяции из степи."
Что-то опять пошло не так....

Онлайн rozenblattАвтор темы

  • Сообщений: 1571
  • Страна: kg
  • Рейтинг +2073/-0
  • Y-ДНК: C-ZQ31
  • мтДНК: M8a
Re: Characterizing the genetic history of admixture across inner Eurasia
« Ответ #2 : 24 Май 2018, 04:07:15 »
Внимательно перечитал и у меня появилось подозрение, что это те же самые ботайцы, что и в статье копенгагенцев. Сравните:

Копенгагенская статья:

Образец Пол мтДНК Y-ДНК

BOT2016 Ж Z1a
BOT14 М K1b2 R-M478(R1b1a1)
BOT15 М R1b1 N-M231

Новая статья:

Sex mtDNA Y-DNA
TU45 M K1b2 R1b1a1
BKZ001 F Z1

Может оказаться что: TU45 = BOT14, BKZ001 = BOT2016.

Оффлайн Yurgan

  • Кто везёт, тому везёт
  • ...
  • Сообщений: 8423
  • Страна: ar
  • Рейтинг +945/-8
  • Потомок кузнеца Ильмаринена
    • Сибирский родословец
Re: Characterizing the genetic history of admixture across inner Eurasia
« Ответ #3 : 24 Май 2018, 04:19:46 »
Внимательно перечитал и у меня появилось подозрение, что это те же самые ботайцы, что и в статье копенгагенцев. Сравните:

Копенгагенская статья:

Образец Пол мтДНК Y-ДНК

BOT2016 Ж Z1a
BOT14 М K1b2 R-M478(R1b1a1)
BOT15 М R1b1 N-M231

Новая статья:

Sex mtDNA Y-DNA
TU45 M K1b2 R1b1a1
BKZ001 F Z1

Может оказаться что: TU45 = BOT14, BKZ001 = BOT2016.
Ботайцев растащили по частям. Однимдостались зубы, другим пяточные кости :)

Онлайн rozenblattАвтор темы

  • Сообщений: 1571
  • Страна: kg
  • Рейтинг +2073/-0
  • Y-ДНК: C-ZQ31
  • мтДНК: M8a
Re: Characterizing the genetic history of admixture across inner Eurasia
« Ответ #4 : 24 Май 2018, 07:59:25 »
Ботайцев растащили по частям. Однимдостались зубы, другим пяточные кости :)

Не первый случай. Человека с Маркиной Горы(Костёнки-14) тоже две команды независимо секвенировали.

Оффлайн Fire

  • 100% child of stardust
  • Сообщений: 9685
  • Страна: gr
  • Рейтинг +904/-133
  • Y-dna G2a1a1a1a1a1b1 Z7947
Re: Characterizing the genetic history of admixture across inner Eurasia
« Ответ #5 : 24 Май 2018, 08:44:21 »
Цитировать
"Наконец, генетическая структура популяций Кавказа подчеркивает роль кавказских гор как барьер для потока генов и предполагает, что пост-неолитический генный поток поступает в северокавказских популяции из степи."
Что-то опять пошло не так....
Ничего страшного ведь Северо-Кавказская КИО по аутосомам южные Ямники и антропологически
"Результаты сопоставления свидетельствуют, что краниологический полиморфизм кавкасионцев и позднеямно-"северокавказского" населения Калмыкии сходен. Незначительные различия между выборками вряд ли стоит объяснять эпохальной изменчивостью в условиях горной изоляции. Несколько меньшая величина скулового диаметра у кавкасионцев, заметно большая высота (особенно абсолютная) орбиты и т. д. вполне могут быть вызваны участием в расогенезе кавкасионских групп населения майкопской и куро-араксинской культур, принадлежавшего к средиземноморскому кругу типов" - Шевченко (1986)
Кавкасионы http://www.anthroquote.ru/caucasionian


Онлайн rozenblattАвтор темы

  • Сообщений: 1571
  • Страна: kg
  • Рейтинг +2073/-0
  • Y-ДНК: C-ZQ31
  • мтДНК: M8a
Re: Characterizing the genetic history of admixture across inner Eurasia
« Ответ #6 : 24 Май 2018, 08:46:19 »
Ничего страшного ведь Северо-Кавказская КИО по аутосомам южные Ямники

Это данные из ещё неопубликованной статьи? Или они уже опубликованы?

Оффлайн Fire

  • 100% child of stardust
  • Сообщений: 9685
  • Страна: gr
  • Рейтинг +904/-133
  • Y-dna G2a1a1a1a1a1b1 Z7947
Re: Characterizing the genetic history of admixture across inner Eurasia
« Ответ #7 : 24 Май 2018, 22:42:30 »
Ничего страшного ведь Северо-Кавказская КИО по аутосомам южные Ямники

Это данные из ещё неопубликованной статьи? Или они уже опубликованы?
Есть это с компонентами аутосом
https://www.gnxp.com/WordPress/wp-content/uploads/2018/05/Screenshot-2018-05-16-23.18.43.png

Конкретно Ямники из Калмыкии близко к Кавкасионам антропологически
а на картине есть Северо-Кавказская Катакомбники и Ямная Кавказа в степном Кластере

Оффлайн zastrug

  • ...
  • Сообщений: 11274
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2848/-49
  • I2b1c (P78+)=I2a2a1b1a= I2a1b1a2a1a1( I-FT413656)
  • Y-ДНК: I2b1c
  • мтДНК: T2a1a
Re: Characterizing the genetic history of admixture across inner Eurasia
« Ответ #8 : 25 Май 2018, 00:42:37 »

Есть это с компонентами аутосом
https://www.gnxp.com/WordPress/wp-content/uploads/2018/05/Screenshot-2018-05-16-23.18.43.png

Конкретно Ямники из Калмыкии близко к Кавкасионам антропологически
а на картине есть Северо-Кавказская Катакомбники и Ямная Кавказа в степном Кластере
Ну то есть это очередная ваша интерпретация?

Оффлайн Fire

  • 100% child of stardust
  • Сообщений: 9685
  • Страна: gr
  • Рейтинг +904/-133
  • Y-dna G2a1a1a1a1a1b1 Z7947
Re: Characterizing the genetic history of admixture across inner Eurasia
« Ответ #9 : 25 Май 2018, 00:45:45 »

Есть это с компонентами аутосом
https://www.gnxp.com/WordPress/wp-content/uploads/2018/05/Screenshot-2018-05-16-23.18.43.png

Конкретно Ямники из Калмыкии близко к Кавкасионам антропологически
а на картине есть Северо-Кавказская Катакомбники и Ямная Кавказа в степном Кластере
Ну то есть это очередная ваша интерпретация?
Что? Это?
"Результаты сопоставления свидетельствуют, что краниологический полиморфизм кавкасионцев и позднеямно-"северокавказского" населения Калмыкии сходен. Незначительные различия между выборками вряд ли стоит объяснять эпохальной изменчивостью в условиях горной изоляции. Несколько меньшая величина скулового диаметра у кавкасионцев, заметно большая высота (особенно абсолютная) орбиты и т. д. вполне могут быть вызваны участием в расогенезе кавкасионских групп населения майкопской и куро-араксинской культур, принадлежавшего к средиземноморскому кругу типов" - Шевченко (1986)


Оффлайн zastrug

  • ...
  • Сообщений: 11274
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2848/-49
  • I2b1c (P78+)=I2a2a1b1a= I2a1b1a2a1a1( I-FT413656)
  • Y-ДНК: I2b1c
  • мтДНК: T2a1a
Re: Characterizing the genetic history of admixture across inner Eurasia
« Ответ #10 : 25 Май 2018, 06:08:16 »
19
Что? Это?
"Результаты сопоставления свидетельствуют, что краниологический полиморфизм кавкасионцев и позднеямно-"северокавказского" населения Калмыкии сходен. Незначительные различия между выборками вряд ли стоит объяснять эпохальной изменчивостью в условиях горной изоляции. Несколько меньшая величина скулового диаметра у кавкасионцев, заметно большая высота (особенно абсолютная) орбиты и т. д. вполне могут быть вызваны участием в расогенезе кавкасионских групп населения майкопской и куро-араксинской культур, принадлежавшего к средиземноморскому кругу типов" - Шевченко (1986)
А что вы хотелии сказать этой цитатой? Что в расогенезе кавкасионного типа поучаствовали ямники?
Или что? Не было тогда еще на Кавказе брахикранов-кавкасинов.
А ямные брахикраны вот такие :
"В последние годы вышли в свет работы А.А. Хохлова с преварительными результатами изучения черепов эпохи ранней и средней бронзы из могильников Калмыкии [Хохлов 1999б,2001];  а также отдельное исследование особенностей носителей ямной культуры Калмыкии [Хохлов 2006]. По мнению А.А. Хохлова, новые ямные черепа из могильников Прикаспийской низменности и Южных Ергеней морфологически сходны между собой: суб- и гипербрахикранные, гиперморфные, относительно низколицые, как и серия ямных черепов Восточного Маныча, опубликованная А.В. Шевченко [1986]. По результатам канонического анализа этот специфический набор признаков ярко отличает ямную серию Калмыкии от других известных краниологических групп ямной культуры Восточной Европы. А.А. Хохлов пришел к выводу, что в эпоху ранней бронзы в Северо-Западном Прикаспии и Нижнем Поволжье существовал особый очаг расогенеза, что привело
к формированию брахикранного, широколицего и относительно низколицего краниологического комплекса, отличающего представителей ямной культуры Калмыкии. Причину такого своеобразия автор видит в генетической преемственности «ямников» Калмыкии и носителей хвалынской культуры из энеолитического могильника Хлопков Бугор в Нижнем Поволжье, а также в вероятном влиянии какого-то особого антропологического компонента, еще не обнаруженного среди древнего населения юга Восточной Европы [Хохлов 2006]."

Оффлайн Fire

  • 100% child of stardust
  • Сообщений: 9685
  • Страна: gr
  • Рейтинг +904/-133
  • Y-dna G2a1a1a1a1a1b1 Z7947
Re: Characterizing the genetic history of admixture across inner Eurasia
« Ответ #11 : 26 Май 2018, 10:56:26 »
19
Что? Это?
"Результаты сопоставления свидетельствуют, что краниологический полиморфизм кавкасионцев и позднеямно-"северокавказского" населения Калмыкии сходен. Незначительные различия между выборками вряд ли стоит объяснять эпохальной изменчивостью в условиях горной изоляции. Несколько меньшая величина скулового диаметра у кавкасионцев, заметно большая высота (особенно абсолютная) орбиты и т. д. вполне могут быть вызваны участием в расогенезе кавкасионских групп населения майкопской и куро-араксинской культур, принадлежавшего к средиземноморскому кругу типов" - Шевченко (1986)
А что вы хотелии сказать этой цитатой? Что в расогенезе кавкасионного типа поучаствовали ямники?
Или что? Не было тогда еще на Кавказе брахикранов-кавкасинов.
А ямные брахикраны вот такие :
"В последние годы вышли в свет работы А.А. Хохлова с преварительными результатами изучения черепов эпохи ранней и средней бронзы из могильников Калмыкии [Хохлов 1999б,2001];  а также отдельное исследование особенностей носителей ямной культуры Калмыкии [Хохлов 2006]. По мнению А.А. Хохлова, новые ямные черепа из могильников Прикаспийской низменности и Южных Ергеней морфологически сходны между собой: суб- и гипербрахикранные, гиперморфные, относительно низколицые, как и серия ямных черепов Восточного Маныча, опубликованная А.В. Шевченко [1986]. По результатам канонического анализа этот специфический набор признаков ярко отличает ямную серию Калмыкии от других известных краниологических групп ямной культуры Восточной Европы. А.А. Хохлов пришел к выводу, что в эпоху ранней бронзы в Северо-Западном Прикаспии и Нижнем Поволжье существовал особый очаг расогенеза, что привело
к формированию брахикранного, широколицего и относительно низколицего краниологического комплекса, отличающего представителей ямной культуры Калмыкии. Причину такого своеобразия автор видит в генетической преемственности «ямников» Калмыкии и носителей хвалынской культуры из энеолитического могильника Хлопков Бугор в Нижнем Поволжье, а также в вероятном влиянии какого-то особого антропологического компонента, еще не обнаруженного среди древнего населения юга Восточной Европы [Хохлов 2006]."

Видно что у Южных Ямников(больше ANE,WSHG) и генетически "южного" Хвалынца Q1a(больше Америндийскоподобного) больше древне-восточных компонентов
И наоборот у северных Ямников например Давидский несколько лет назад нашел 6-9% Халколита Западной Анатолии у Ямников Самары, и генетики теперь находят что-то общее с Европейским Неолитом у Ямников, скорее всего и более западный EHG(поближе к WHG) у северных Ямников.
А Украинский Ямник(Кеми Обинская?) вообще противоположный он на дереве вместе с Бронзой Ирана и с Аланом и другими переднеазиатами.



Оффлайн Arame

  • Сообщений: 959
  • Страна: am
  • Рейтинг +387/-1
  • J1-Z1842
Re: Characterizing the genetic history of admixture across inner Eurasia
« Ответ #12 : 26 Май 2018, 12:12:50 »

А Украинский Ямник(Кеми Обинская?) вообще противоположный он на дереве вместе с Бронзой Ирана и с Аланом и другими переднеазиатами.

Файр может хватит людей вводить в заблуждение.
Тот ямник из Украина это женщина с левантийским мито R0a1. Она из работы Матиесона по Балканам. Найди и еще раз посмотри. Она обозначена как аутлайер.
Вот как она смоделирована

Yamnaya_Ukraine_outlier:I1917

Yamnaya_Samara:I0429 43.95
Armenia_EBA 28.3
Armenia_ChL 9.95
Iran_ChL 8.1

Ukraine_N 5.6
Trypillia 4.1
CHG:KK1 0

Она аутлайер. То есть имеет еще плюс к ямной добавок еще чего то многого из Южного Кавказа. 
Вот на ПСА Поляко можешь смотреть

http://eurogenes.blogspot.am/2018/02/the-yamnaya-outlier.html

Кстати она близка к Хаджи Фирузской Бронзе потому что этот бронзовик имеет очень много степной примеси.

Hajji_Firuz_BA_I4243
Hajji_Firuz_ChL 0.484±0.033
Yamnaya_Samara 0.516±0.033
tail: 0.26511852 (full output)

Вот ссылка. Поляко связал этих мигрантов со степей с гутиями.

http://eurogenes.blogspot.am/2018/04/likely-yamnaya-incursions-into.html

Оффлайн Asmat headhunter

  • Биохимическая субстанция
  • Сообщений: 14452
  • Страна: id
  • Рейтинг +939/-34
  • И того казака те тунгусы пальмами тут искололи
Re: Characterizing the genetic history of admixture across inner Eurasia
« Ответ #13 : 26 Май 2018, 12:17:57 »
Поляко связал этих мигрантов со степей с гутиями.
Нужны аутентичные гутии, чтобы сравнить.
Полагаться только на гипотезы, что гутии какие-то ИЕ, а потому какие-то неизвестные бронзовики в Иране со степным компонентом и есть гутии - ну, сомнительно всё как-то. :)

Оффлайн Arame

  • Сообщений: 959
  • Страна: am
  • Рейтинг +387/-1
  • J1-Z1842
Re: Characterizing the genetic history of admixture across inner Eurasia
« Ответ #14 : 26 Май 2018, 12:20:48 »
Asmat

Возраст этого обраца 4300 лет из СЗ Ирана. Это как раз тот период где там зафиксировани гутии.
А аутентичных гутии такого понятия нету в архаелогии.  Насколько я знаю.
Если есть обьяснение получше для этого образца готов послушать.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.