АвторТема: дДНК из Сибири, Средней Азии и Анатолии, неолит и бронзовый век  (Прочитано 10609 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Онлайн Srkz

  • Сообщений: 5521
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2305/-2
  • Y-ДНК: N-L1025*
  • мтДНК: U4a1e-pre T16093C T16311T
А калькулятора на основе афонтовца нет?
Там очень слабые образцы
А народ Yi в Китае реально выделяется большей близостью к ботайцам, чем северные хань?
Насколько эти числа характеризуют больше сегментов и/или снипов?
Обычно они, либо другие из Юго-Восточной Азии получаются ближе к древним сибирякам, чем китайцы. На ум приходят миграции N примерно оттуда. Хотя может быть, и через Индию взаимосвязь.

Оффлайн Fire

  • 100% child of stardust
  • Сообщений: 7748
  • Страна: gr
  • Рейтинг +667/-123
  • Y-dna G2a1a1a1a1a1b1 Z7947

Карта сумм общих сегментов:
https://a.radikal.ru/a06/1805/5f/8e5b88c1e2de.png

Moksha 71,78 ---//Confidence: medium
Ket 71,38 ---//Confidence: low

Finnish-East 65,55 ---//Confidence: very high

Belarusian 58,92 ---//Confidence: very high

Burusho 53,9 ---//Confidence: very high

Yi 30,8 ---//Confidence: medium

Daur 25,33 ---//Confidence: medium
Japanese 24,53 ---//Confidence: very high
Han 24,5 ---//Confidence: very high
Naxi 23,83 ---//Confidence: low
She 23,83 ---//Confidence: medium
Viet 23,18 ---//Confidence: high

Han-North 22,7 ---//Confidence: medium
Lahu 19,39 ---//Confidence: low


А народ Yi в Китае реально выделяется большей близостью к ботайцам, чем северные хань?
Насколько эти числа характеризуют больше сегментов и/или снипов?

Burmese 31,89 ---//Confidence: very high
Бирманцы у которых пик ANE в своем регионе ещё ближе

Онлайн Srkz

  • Сообщений: 5521
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2305/-2
  • Y-ДНК: N-L1025*
  • мтДНК: U4a1e-pre T16093C T16311T
Да, есть такое подозрение, что это все же ANE-подобные влияния с запада на ЮВА

Оффлайн Fire

  • 100% child of stardust
  • Сообщений: 7748
  • Страна: gr
  • Рейтинг +667/-123
  • Y-dna G2a1a1a1a1a1b1 Z7947
Да, есть такое подозрение, что это все же ANE-подобные влияния с запада на ЮВА
Скорее с севера, и прогнали Прото-Мунда в Индию

Оффлайн Шад

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6264
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1140/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
В попытке связать индентификаторы из статьи и файлы данных сделал небольшую таблицу (см. по ссылке).
Но выявилась проблема: набор данных PRJEB26349 не полон - некоторые файлы не видны в открытом доступе и, соответственно, часть образцов осталась "не привязанными" к файлам.

UPD Если у кого-то возникнет желание дополнить таблицу своими данными (например по аннотации образцов или аутосомам на GEDmatch) - пишите в ЛС, я пропишу доступ к редактированию файла.

Оффлайн Eugene

  • Санктпетербурхъ
  • Сообщений: 6468
  • Страна: ru
  • Рейтинг +841/-40
    • N1c1 Y-DNA Project
  • Y-ДНК: N-BY32524
  • мтДНК: U-C1341T
Небольшое сравнение с соседями по калькулятору Eurogenes ANE K7 (чистого ANE там нет и 51% афонтовца это максимум):


Кстати из этих результатов Ботая еще один интересный и вроде очевидный вывод (хотя вроде подобный вывод был ранее по неолиту северо-западной Европы) - имея производящее хозяйство энеолита, у ботайцев 0% неолитического компонента!

Оффлайн Arthwr

  • Сообщений: 1049
  • Страна: ua
  • Рейтинг +529/-5
    • Ancient DNA relatives
  • Y-ДНК: R1b-PF7563
А скачать суплементы тоже платно?
  :(
У кого нибудь есть ихный Эксел файл по образцам?

Статья бесплатна для зарегистрировавшихся:

"Register for free to read this article
As a service to the community, this article is available for free. Existing users log in."

А скачать суплементы тоже платно?
  :(
У кого нибудь есть ихный Эксел файл по образцам?
Страница 68 http://science.sciencemag.org/content/sci/suppl/2018/05/08/science.aar7711.DC1/aar7711_de_Barros_Damgaard_SM.pdf

Это неполный саплемент. После регистрации доступны эксель-файлы.

Оффлайн smal

  • Сообщений: 1060
  • Страна: by
  • Рейтинг +407/-3
  • Y-ДНК: R-CTS9219
  • мтДНК: U4a
Посмотрел ямника и окуневца R1b. Сиквенс ямника очень качественный. R1b-Z2109*, Негативен по всем 4 субкладам R-Z2109, нет совпадений и с приватными маркерами 3-х известных мне R-Z2109* образцов. Сиквенс окуневца RISE675 совсем плохой, кроме одного рида Z2105+ почти ничего нет, практически ни один субклад нельзя исключить, совсем мало прочтений.

Оффлайн Yurgan

  • Кто везёт, тому везёт
  • ...
  • Сообщений: 8732
  • Страна: gt
  • Рейтинг +680/-6
  • Потомок кузнеца Ильмаринена
    • Сибирский родословец
Посмотрел DA363 Shamanka_EN Baikal Early Neolithic
N-L666*. Нет общих снипов ни с одной из нисходящих ветвей N-P43 и N-F1154

Оффлайн Yurgan

  • Кто везёт, тому везёт
  • ...
  • Сообщений: 8732
  • Страна: gt
  • Рейтинг +680/-6
  • Потомок кузнеца Ильмаринена
    • Сибирский родословец
Ботаец BOT15
N-Y6503*
Предковая для большой группы с Балкан N-P189.2 (Хорватия, Сербия, Босния и Герцеговина)
Это группа выделилась 4 800 лет назад, т.е. через тысячу лет после начала Ботайской культуры.
К прямым предкам финно-угров и самодийцев по мужской линии не имеют отношения.
Но могли выйти из одного котла.
Потомками могут быть казахи N1*, но, кажется, никто их на снипы не проверял.

Онлайн Srkz

  • Сообщений: 5521
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2305/-2
  • Y-ДНК: N-L1025*
  • мтДНК: U4a1e-pre T16093C T16311T
Ботаец BOT15
N-Y6503*
Предковая для большой группы с Балкан N-P189.2 (Хорватия, Сербия, Босния и Герцеговина)
Это группа выделилась 4 800 лет назад, т.е. через тысячу лет после начала Ботайской культуры.
К прямым предкам финно-угров и самодийцев по мужской линии не имеют отношения.
Но могли выйти из одного котла.
Потомками могут быть казахи N1*, но, кажется, никто их на снипы не проверял.
И вспомнился еще один древний N-Y6503 - степняк из раннего железного века Венгрии IR1
Еще вот что сказали: IR1 вероятно будет или N1 (old N1a) или N2 старые (N1c+N1b).
Значения снипов уровня N1a для IR1
Y6503+, Y6511+, Y6559+, Y6560+, Y6561+, Y6562+, Y6564+, Y6566+, Y6470+, Y6482+, Y6494+, Y6515+, Y6518+, Y6521+, Y6523+, Y6525+, Y6536+, Y6537+, Y6541+, Y6542+, Y6543+, Y6544+, Y6546+, Y6548+, Y6549+, Y6553+, Y6557+, Y6569+, Y6570+, Y6571+, Y6572+, Y6576+, Y6577+, Y6586+, Y6587+, Y6589+
P189-, Y6466-, Y6498-, Y6504-, Y6505-, Y6508-, Y6509-, Y6512-, Y6565-, Y6468-, Y6471-, Y6473-, Y6476-, Y6478-, Y6481-, Y6486-, Y6488-, Y6514-, Y6522-, Y6528-, Y6533-, Y6539-, Y6540-, Y6550-, Y6551-, Y6556-, Y6558-, Y6573-, Y6580-, Y6581-, Y6583-

то есть IR1 делит субклад N1a на два.
Получается, не предковый для упомянутых балканцев, но могли прийти вместе )

Оффлайн Yurgan

  • Кто везёт, тому везёт
  • ...
  • Сообщений: 8732
  • Страна: gt
  • Рейтинг +680/-6
  • Потомок кузнеца Ильмаринена
    • Сибирский родословец
Ботаец BOT15
N-Y6503*
Предковая для большой группы с Балкан N-P189.2 (Хорватия, Сербия, Босния и Герцеговина)
Это группа выделилась 4 800 лет назад, т.е. через тысячу лет после начала Ботайской культуры.
К прямым предкам финно-угров и самодийцев по мужской линии не имеют отношения.
Но могли выйти из одного котла.
Потомками могут быть казахи N1*, но, кажется, никто их на снипы не проверял.
И вспомнился еще один древний N-Y6503 - степняк из раннего железного века Венгрии IR1
Еще вот что сказали: IR1 вероятно будет или N1 (old N1a) или N2 старые (N1c+N1b).
Значения снипов уровня N1a для IR1
Y6503+, Y6511+, Y6559+, Y6560+, Y6561+, Y6562+, Y6564+, Y6566+, Y6470+, Y6482+, Y6494+, Y6515+, Y6518+, Y6521+, Y6523+, Y6525+, Y6536+, Y6537+, Y6541+, Y6542+, Y6543+, Y6544+, Y6546+, Y6548+, Y6549+, Y6553+, Y6557+, Y6569+, Y6570+, Y6571+, Y6572+, Y6576+, Y6577+, Y6586+, Y6587+, Y6589+
P189-, Y6466-, Y6498-, Y6504-, Y6505-, Y6508-, Y6509-, Y6512-, Y6565-, Y6468-, Y6471-, Y6473-, Y6476-, Y6478-, Y6481-, Y6486-, Y6488-, Y6514-, Y6522-, Y6528-, Y6533-, Y6539-, Y6540-, Y6550-, Y6551-, Y6556-, Y6558-, Y6573-, Y6580-, Y6581-, Y6583-

то есть IR1 делит субклад N1a на два.
Получается, не предковый для упомянутых балканцев, но могли прийти вместе )
Получается родственник.
Хотя может этот степняк - прямой потомок ботайца.
Надо  с ним сравнить. Но для этого надовыделить все снипы ботайца и степняка из Венгрии.

Онлайн Srkz

  • Сообщений: 5521
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2305/-2
  • Y-ДНК: N-L1025*
  • мтДНК: U4a1e-pre T16093C T16311T
Тут можно Y-BAM IR1 утянуть
страничка http://trace.ncbi.nlm.nih.gov/Traces/sra/?run=SRR1186714, там нужно ткнуть закладку Alignment, а там в Reference выбираем хромосому и внизу вместо fasta выбираем BAM, жмем кнопку file.

Оффлайн Yurgan

  • Кто везёт, тому везёт
  • ...
  • Сообщений: 8732
  • Страна: gt
  • Рейтинг +680/-6
  • Потомок кузнеца Ильмаринена
    • Сибирский родословец
Тут можно Y-BAM IR1 утянуть
страничка http://trace.ncbi.nlm.nih.gov/Traces/sra/?run=SRR1186714, там нужно ткнуть закладку Alignment, а там в Reference выбираем хромосому и внизу вместо fasta выбираем BAM, жмем кнопку file.
Скачал. Спасибо.
А там что-то из последних статей лежит?
Или можно положить?

Оффлайн Yurgan

  • Кто везёт, тому везёт
  • ...
  • Сообщений: 8732
  • Страна: gt
  • Рейтинг +680/-6
  • Потомок кузнеца Ильмаринена
    • Сибирский родословец
Тут можно Y-BAM IR1 утянуть
страничка http://trace.ncbi.nlm.nih.gov/Traces/sra/?run=SRR1186714, там нужно ткнуть закладку Alignment, а там в Reference выбираем хромосому и внизу вместо fasta выбираем BAM, жмем кнопку file.
Скачал. Спасибо.
А там что-то из последних статей лежит?
Или можно положить?
Вижу что лежит.
Спасибо за ссылку

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100