https://www.biorxiv.org/content/early/2018/03/08/278374Ancient Genomics Reveals Four Prehistoric Migration Waves into Southeast AsiaHugh McColl, Fernando Racimo, Lasse Vinner, Fabrice Demeter, Uffe Gram Wilken, J. Victor Moreno Mayar, Andaine Seguin-Orlando, Constanza de la Fuente Castro, Sally Wasef, Ana Prohaska, Ashot Margarayan, Peter de Barros Damgaard, Rasmi Shoocongdej, Viengkeo Souksavatdy, Thongsa Sayavongkhamdy, Mohd Mokhtar Saidin, Supannee Kaewsutthi, Patcharee Lertrit, Huong Mai Nguyen, Hsiao-chun Hung, Thi Minh Tran, Huu Nghia Truong, Shaiful Shahidan, Ketut Wiradnyana, Anne-Marie Bacon, Philippe Duringer, Jean-Luc Ponche, Laura Shackelford, Elise Patole-Edoumba, Anh Tuan Nguyen, Berenice Bellina-Pryce, Jean-Christophe Galipaud, Rebecca Kinaston, Hallie Buckley, Christophe Pottier, Simon Rasmussen, Tom Higham, Robert A. Foley, Marta Mirazon Lahr, Ludovic Orlando, Martin Sikora, Charles Higham, David M. Lambert, Eske Willerslev
doi:
https://doi.org/10.1101/278374Abstract
Two distinct population models have been put forward to explain present-day human diversity in Southeast Asia. The first model proposes long-term continuity (Regional Continuity model) while the other suggests two waves of dispersal (Two Layer model). Here, we use whole-genome capture in combination with shotgun sequencing to generate 25 ancient human genome sequences from mainland and island Southeast Asia, and directly test the two competing hypotheses. We find that early genomes from Hoabinhian hunter-gatherer contexts in Laos and Malaysia have genetic affinities with the Onge hunter-gatherers from the Andaman Islands, while Southeast Asian Neolithic farmers have a distinct East Asian genomic ancestry related to present-day Austroasiatic-speaking populations. We also identify two further migratory events, consistent with the expansion of speakers of Austronesian languages into Island Southeast Asia ca. 4 kya, and the expansion by East Asians into northern Vietnam ca. 2 kya. These findings support the Two Layer model for the early peopling of Southeast Asia and highlight the complexities of dispersal patterns from East Asia.
Для объяснения современного человеческого разнообразия в Юго-Восточной Азии были предложены две различные популяционные модели. Первая модель предполагает долгосрочную непрерывность (модель региональной непрерывности), а вторая предполагает две волны расселения (модель двух слоев). Здесь мы используем захват цельного генома в сочетании с секвенированием методом дробовика для получения 25 древних последовательностей генома человека из материковой и островной Юго-Восточной Азии и непосредственно проверяем две конкурирующие гипотезы. Мы обнаруживаем, что ранние геномы из хоабиньских контекстов охотников-собирателей в Лаосе и Малайзии имеют генетическое сходство с охотниками-собирателями Onge с Андаманских островов, в то время как неолитические фермеры из Юго-Восточной Азии имеют отчетливый восточноазиатский геномный компонент, связанный с современными австроазиатскоязычными популяциями. Мы также выявляем еще два миграционных события, связанных с распространением носителей австронезийских языков на островную Юго-Восточную Азию примерно 4 тысячи лет назад, и расселение восточных азиатов на север Вьетнама около 2 тысяч лет назад. Эти результаты подтверждают модель двух слоев для раннего заселения Юго-Восточной Азии и подчеркивают сложность моделей рассеивания из Восточной Азии.