АвторТема: Полногеномное секвенирование (Whole Genome Sequencing)  (Прочитано 820 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн napobo3Автор темы

  • Сообщений: 1338
  • Страна: il
  • Рейтинг +330/-2
  • קַח-נָא אֶת-בִּנְךָ אֶת-יְחִידְךָ אֲשֶׁר-אָהַבְתָּ, אֶת-יִצְחָק
  • Y-ДНК: J-FGC5231
  • мтДНК: N1b2
Обзор рынка от NEO.LIFE

Сравнение предложений по полногеномному секвенированию :



https://medium.com/neodotlife/dna-analysis-and-sequencing-from-23andme-veritas-ancestry-human-longevity-arivale-family-tree-and-others-20f5ce7a0786


Оффлайн Oleg V.

  • Сообщений: 686
  • Страна: ru
  • Рейтинг +124/-0
  • Y-ДНК: R1a-Z92>YP569
  • мтДНК: ?
Re: Полногеномное секвенирование (Whole Genome Sequencing)
« Ответ #1 : 19 Февраль 2018, 13:42:52 »
Тут не учитывается, за сколько времени делают тесты. Технические параметры тоже не учтены. К тому же нет YSEQ и Dante Labs. Ещё не учтено, что не все компании согласны отправлять наборы в любые страны. Таблица ни о чём.

Оффлайн napobo3Автор темы

  • Сообщений: 1338
  • Страна: il
  • Рейтинг +330/-2
  • קַח-נָא אֶת-בִּנְךָ אֶת-יְחִידְךָ אֲשֶׁר-אָהַבְתָּ, אֶת-יִצְחָק
  • Y-ДНК: J-FGC5231
  • мтДНК: N1b2

Оффлайн gecube_ru

  • Сообщений: 977
  • Страна: ru
  • Рейтинг +154/-0
  • Незнайка на Луне
  • Y-ДНК: I-A6397
  • мтДНК: V7a1?
Re: Полногеномное секвенирование (Whole Genome Sequencing)
« Ответ #3 : 19 Февраль 2018, 17:29:32 »
Тут не учитывается, за сколько времени делают тесты. Технические параметры тоже не учтены. К тому же нет YSEQ и Dante Labs. Ещё не учтено, что не все компании согласны отправлять наборы в любые страны. Таблица ни о чём.
полностью согласен! К сожалению, таблица не дает понимания к кому идти и с какой целью

Онлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 30774
  • Страна: ca
  • Рейтинг +2261/-38
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5
Re: Полногеномное секвенирование (Whole Genome Sequencing)
« Ответ #4 : 19 Февраль 2018, 19:00:11 »
Парни. Таблица есть. Компании (пусть и не все) указаны. Можно их прогуглить.
Пеняющие на неполноту, могут предложить свой исчерпывающий вариант.     ::)

Оффлайн Шад

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 5997
  • Страна: ru
  • Рейтинг +943/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q1b1a
  • мтДНК: J1c2
WeGene предлагает полный геном 30х за 480 долларов

По ссылке можно ознакомится с не слишком информативным обсуждением на Anthrogenica

Сама ссылка на WeGene также загадочна, так как описание услуги зашито в графический файл и поэтому не переводится. Через камеру телефона не пробовал. Да и судя по форме подачи предложение ориентировано исключительно на локальную аудиторию.
Поэтому не совсем ясно что это - новый ценовой ориентир или просто маркетинговая акция?

Онлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 30774
  • Страна: ca
  • Рейтинг +2261/-38
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5
Китайское для китайцев.

Оффлайн Daemon2017

  • Сообщений: 929
  • Страна: ru
  • Рейтинг +262/-5
  • Y-ДНК: R1a-Y35177/BY89957
  • мтДНК: V7a1
WeGene предлагает полный геном 30х за 480 долларов

По ссылке можно ознакомится с не слишком информативным обсуждением на Anthrogenica

Сама ссылка на WeGene также загадочна, так как описание услуги зашито в графический файл и поэтому не переводится. Через камеру телефона не пробовал. Да и судя по форме подачи предложение ориентировано исключительно на локальную аудиторию.
Поэтому не совсем ясно что это - новый ценовой ориентир или просто маркетинговая акция?

Встраивать картинки не стану, чтобы не травмировать  ;D
"От главной распространение болезни надежда серия тяжелых групп людей недочеловекам научиться редактировать 2"
"С в рот кусок призванных заставить Восточно-азиатских людей"
https://pp.userapi.com/c834303/v834303233/11a118/itKzQwIS4YQ.jpg
https://pp.userapi.com/c834303/v834303233/11a136/AH70L_ltn38.jpg
https://pp.userapi.com/c834303/v834303233/11a12c/q5mdv_20AHY.jpg
https://pp.userapi.com/c834303/v834303233/11a122/VP8aVmU2qLw.jpg

Оффлайн rLin

  • Сообщений: 812
  • Страна: ru
  • Рейтинг +261/-0
  • Калуга
  • Y-ДНК: R1a1a-Z92 (Y569+)
  • мтДНК: T2b2-С16304T!
Шад, я китайского не знаю от слова совсем. Но примерный перевод такой:
Цитировать
WEGENE Секвенирование Генома Элитная версия
ПРЕДПРОДАЖА
Цена предпродажи - 2999 юаней (около 30 000 рублей)

Полезные свойства:
Независимо разработанная технология от BGI Genomics Co. (я так понимаю, этот BGI вложился в Wegene)
3 миллиарда (30 стомиллионов...китайцы...) локусов  (наверное всё же пар оснований) - весь геном .
Генетический проект 600+ (Скорее всего имеется проект по определению 600 моногенных заболеваний, есть у них такой).
Постоянные обновления

Официальный релиз 1 июня 2018 года

Срок предварительной продажи 8 апреля 2018 года - 31 мая 2018 года

Подарок: во время предпродажи купите полногеноменый элитный сиквенс от Wegene и
получите высококачественный индивидуальный медицинский пакет (отчёт?), всего за 2999 юаней.

Поиск по "медицинскому пакету" выдаёт фотки здоровых китайцев на приёме у врача, поэтому точно неясно, что это такое, но могу,кстати, спросить точный перевод, если это кому-то важно.:)

Замечания:
1. Индивидуальный медицинский пакет(отчёт?) будет выслан после релиза продукта (значит после 1 июня)
2. Содержимое заказа зависит от времени заказа, пожалуйста загляните в информацию о заказе для подробностей.
3. Refund не применим.

Далее они рассказывают, как дошли до жизни такой и что с каждым годом цена полного сиквенса уменьшалась:
1990 год - старт проекта Human Genome
2003 год - завершение проекта Human Genome, секвенировано 3 млрд. пар оснований за 3 млрд. долларов
2001 год - цена сиквенса 9526.3 миллиона долларов
2006 год - 1047.5 млн долларов
2014 год - 1000 долларов. Оптимистично.
И вот настал 2018 год, WeGene запускает продукт нового поколения всего за 2999 юаней (около 480 долларов).

Теперь каждый может получить собственный геном.

Дальше идёт таблица сравнения продуктов: standard, Elite и Ultimate

Область секвенирования:
стандарт - 600 000 пар оснований и 9.4 млн импутация
элита - более 3 миллиарда пар оснований
Ультимейт - более 3 миллиарда пар оснований

Метод секвенирования:
стандарт - чипы
элита и ультимейт - секвенирование генома

Для кого:
стандарт - тем, кто хочет узнать базовые генетические характеристики и риски по здоровью.
элита - тем, кто фокусируется на генетических заболеваниях, хочет большего,энтузиасты молекулярной антропологии???
ультимейт - элита+ тем, кто хочет получить весь геном и сервис высшего уровня.
Так и не понятно, чем отличается качество элиты и ультимейта. наверное числом прочтений.

На чём делают:
стандарт - чип иностранного производства специально для азиатского региона
элита - используется крутая техника китайского производства, отличное соотношение цена/качество.
ультимейт - импортированная техника производства Illumina

Интерпретация результатов:
стандарт - базовая интерпретация, интерпретация сторонними сервисами
элита и ультимейт - базовая интерпретация, суперэлитная интерпретация, интерпретация сторонними сервисами.
Видимо дадут скачать RAW.

Предоставляемые данные:
стандарт - 10 млн (1000 десятитысяч) пар оснований (импутация)
элита и ультимейт - более 3 млрд (30 стомилионов) пар оснований.

Поддержка:
стандарт и элита - нету
ультимейт - профессиональный генетический консультант, результаты высылаются на устройстве хранения.


Далее рассказывают, чего они могут найти в генетическом коде:
риски по здоровью, спорту, определение группы крови и т.д.

Далее рассказывают, какая у них крутая техника:
- Своя платформа по секвенированию
- Техническая поддержка от стратегического партнёра BGI Genomics Co.
- Масштабная автоматизированная лаборатория
- Лучшие технологии хранения и анализа данных

В конце приписка, что финальная интерпретация остаётся за WeGene. Без понятия, что это значит.
Кстати, WeGene это что-то вроде МикроГен в переводе на русский.
В форме для заказа только регионы Китая.
Если что, то онлайн-переводчиками китайский язык намного лучше переводится на английский.
« Последнее редактирование: 23 Апрель 2018, 02:19:55 от rLin »

Оффлайн rLin

  • Сообщений: 812
  • Страна: ru
  • Рейтинг +261/-0
  • Калуга
  • Y-ДНК: R1a1a-Z92 (Y569+)
  • мтДНК: T2b2-С16304T!
Шад, глянул онлайн-переводчиком отчёты. Отчёты по здоровью и генетическим характеристикам у них на уровне 23andMe. Картинка с ancestry origin красивая.

Может быть стоит через посредников у них позаказывать чего-нибудь когда-нибудь.

Онлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 30774
  • Страна: ca
  • Рейтинг +2261/-38
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5
Может быть стоит через посредников у них позаказывать чего-нибудь когда-нибудь.

Так ведь это только анонс. Заказы будут с 1 июня. Даже для кондовых китайцев. (Так на Антрогенике в начальных сообщениях темы.)

Оффлайн nilogov

  • Сообщений: 859
  • Страна: ru
  • Рейтинг +52/-2
  • философ антиязыка
  • Y-ДНК: R-Y18348
  • мтДНК: T2b-T152C!
При полном геномном секвенировании в сухом остатке будет 3 млрд. букв-нуклеотидов?
В России делают такие тесты или только за границей?

Оффлайн rLin

  • Сообщений: 812
  • Страна: ru
  • Рейтинг +261/-0
  • Калуга
  • Y-ДНК: R1a1a-Z92 (Y569+)
  • мтДНК: T2b2-С16304T!
nilogov, да, в Генотек. Всего 250 000 рублей. Подешевело, было по-моему в районе 1 млн. рублей. Где конкретно проводится именно этот тест не очень понятно, но возможно и в России.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100