АвторТема: Reconstructing an African haploid genome from the 18th century  (Прочитано 598 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн rozenblattАвтор темы

  • Сообщений: 1156
  • Страна: kg
  • Рейтинг +1290/-0
  • Y-ДНК: C-F5481
  • мтДНК: M8a
https://www.nature.com/articles/s41588-017-0031-6

Reconstructing an African haploid genome from the 18th century

Anuradha Jagadeesan, Ellen D. Gunnarsdóttir, S. Sunna Ebenesersdóttir, Valdis B. Guðmundsdóttir, Elisabet Linda Thordardottir, Margrét S. Einarsdóttir, Hákon Jónsson, Jean-Michel Dugoujon, Cesar Fortes-Lima, Florence Migot-Nabias, Achille Massougbodji, Gil Bellis, Luisa Pereira, Gísli Másson, Augustine Kong, Kári Stefánsson & Agnar Helgason

Nature Genetics (2018)
doi:10.1038/s41588-017-0031-6

Received: 01 March 2017
Accepted: 18 December 2017
Published online: 15 January 2018

Abstract

A genome is a mosaic of chromosome fragments from ancestors who existed some arbitrary number of generations earlier. Here, we reconstruct the genome of Hans Jonatan (HJ), born in the Caribbean in 1784 to an enslaved African mother and European father. HJ migrated to Iceland in 1802, married and had two children. We genotyped 182 of his 788 descendants using single-nucleotide polymorphism (SNP) chips and whole-genome sequenced (WGS) 20 of them. Using these data, we reconstructed 38% of HJ’s maternal genome and inferred that his mother was from the region spanned by Benin, Nigeria and Cameroon.

Геном - это мозаика фрагментов хромосом от предков, живших поколениями ранее. Здесь мы реконструируем геном Ханса Йонатана (HJ), родившегося в Карибском регионе в 1784 году, от африканской рабыни и отца европейца. HJ мигрировал в Исландию в 1802 году, женился и имел двух детей. Мы генотипировали 182 из его 788 потомков с использованием однонуклеотидных полиморфизмов (SNP) и полностью секвенировали (WGS) 20 из них. Используя эти данные, мы восстановили 38% материнского генома HJ и предположили, что его мать была из региона, охваченного Бенином, Нигерией и Камеруном.

UPD: In addition, we used WGS data from a sixth-generation patrilineal descendant of HJ to determine that his Y chromosome belongs to haplogroup I2a2a3a2 (according to the ISOGG 2013 classification system), which has a frequency of 0.15% in Iceland.
« Последнее редактирование: 15 Январь 2018, 23:35:15 от rozenblatt »

Оффлайн kardes

  • Сообщений: 318
  • Страна: ru
  • Рейтинг +284/-2
  • Y-ДНК: G2a1
Re: Reconstructing an African haploid genome from the 18th century
« Ответ #1 : 15 Январь 2018, 23:57:39 »
Интересное исследование и интересная статистика, за 200 лет у одной пары появилось  800 прямых потомков. По подсчетам примерно аналогичная статистика и у нас просматривается, при среднененьких показателях рождаемости. Где бы ознакомиться о количестве наследников у других более успешных(многодетных)  пар?

Оффлайн zastrug

  • ...
  • Сообщений: 10243
  • Страна: tt
  • Рейтинг +1673/-45
  • I2b1c (P78+)=I2a2a1b1a
  • Y-ДНК: I2b1c
  • мтДНК: T2a1a
Re: Reconstructing an African haploid genome from the 18th century
« Ответ #2 : 16 Январь 2018, 19:07:18 »
Интересное исследование и интересная статистика, за 200 лет у одной пары появилось  800 прямых потомков. По подсчетам примерно аналогичная статистика и у нас просматривается, при среднененьких показателях рождаемости. Где бы ознакомиться о количестве наследников у других более успешных(многодетных)  пар?
Эта статистика мало применима к нашим регионам. точнее вообще неприменима. Ибо речь об Исландии, за этот период не знавшей войн, социальных потрясений, эпидемий, массового голода... В общем тепличные, практически идеальные опытные условия.ИМХО.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100