АвторТема: Тест K45 от Лукаса.  (Прочитано 3788 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн RoaringАвтор темы

  • Сообщений: 476
  • Рейтинг +74/-1
  • Y-ДНК: R1b-DF99
  • мтДНК: U5b1e
Тест K45 от Лукаса.
« : 11 Декабрь 2017, 19:41:50 »
Поляк под именем Лукас, который создал оракул для Eurogenes K36, сделал свой собственный калькулятор, по моему мнению он даёт весьма вразумительные результаты, поэтому хотелось бы посмотреть на результаты остальных форумчан.

Как пользоваться:

1.Скачиваем программу R  https://www.r-project.org/

2.Скачиваем файлы калькулятора https://drive.google.com/file/d/1fk2ygti0RIU92rcm70OQ_LmovtIle9Qr/view

3. Помещаем всё в одну папку и туда же кладём ваш raw-data файл в распакованном.

4. Далее описание процесса в визуальном виде:




Команды в текстовом виде для кёнтрол ц+кёнтрол ве:

 setwd('c:\\название папки')
source('standardize.r')
standardize('ВасяПупкин.txt', company='23andMe') если файл от 23ия, если ФТДНА то standardize('ВасяПупкин.csv', company='ftdna')
system('DIYDodecadWin admix.par')
« Последнее редактирование: 11 Декабрь 2017, 19:53:53 от Roaring »

Оффлайн RoaringАвтор темы

  • Сообщений: 476
  • Рейтинг +74/-1
  • Y-ДНК: R1b-DF99
  • мтДНК: U5b1e
Re: Тест K45 от Лукаса.
« Ответ #1 : 11 Декабрь 2017, 19:42:34 »
Описание компонентов:

South-Caucasian (Abkhazian, Georgian Imereti, Georgian Megrelian and Lazes)
North-Caucasian (formerly Caucasian, Cirkassian, Adigei, Kabardin, Tabassaran, Lezgin, Avar, Chechen, Abkhazians moved above, )
Paleo-Balkan (Albanians Tirana and Kosovo)
Turkic-Altaic (Altaic, Shor, Tuvan)
Proto-Austronesian (Atayal, Ami, Igorot)
Nilotic (added Anuak to Nilotic and Dinka)
East-Med (Cyprus, Lebanon Christian, Samaritan)
Omotic (Ari blacksmith and Ari cultivator)
Munda (Asur, Bonda, Gadaba, Ho, Santhal, Savara, Kharia, Mawasi, Juang)
North-Amerind (Athabaskan)
SW-Euro (Basques Spanish and French))
Arabic (formerly SW-Asian, only name changed, Saudi and Bedouin B )
East-Euro (formerly East-slavic but added Mordvin and northern Belarus to Russian Kursk, Voronezh, Ryazan, Smolensk, Oryol, Ukraine Belgorod, Sumy, Chernigov)(
Central-African_HG (formerly Pygmy, only name changed)
Andean (Quechua, Colla, Cachi, Bolivian)
Indo-Chinese (Lahu, Dai, Thai, Cambodian)
South-Indian (less refrecnes, Chenchus, Hakkipikki, Kurumba, Paniya,Lambadi,Sakilli)
NE-Asian (Chukchi, Koryak)
Volgan (Chuvash)
Mongolian (added Daur to Mongolian Khalkha and Mongola)
Siberian (Nganassan and Dolgan, removed Selkup)
North-Sea_Germanic (Nord-Holland, Friesland, Groningen, Derthe, NW Germans, English_Kent)
Celtic (Irish, much more samples from Cornwall and Scotland, removed Orcadian)
West-African (Yoruba, Esan)
Kushitic (much more samples added to Somali)
West-Finnic (more western now, added Finland, Ingrians, less Vepsian and Karelian)
Uralic (Khanty, Mansi, forest Nenet)
Sahelian (Gemar, Zagawa)
NW-Indian (GujaratiB )
East-African_HG (Hadza, Sandawe)
East-Asian (Han, Korean)
Amuro-Manchurian (Nivkh, Hezhen, Oroqen, Ulchi)
Scando-Germanic Norway, added slected Iceland kits, removed most of Sweden)
Iranian (Iranian Farsi mostly and few Kerman)
South-African_HG (formerly Khoisan, only name changed)
Amazonian (Surui, Karitiana)
Baltic (Latvian, added Lithuanian)
Malay
Meso-Amerind (Mixe, Mixtec, Maya)
South-Chinese (Naxi, She, Miao, Tu, Tujia)
North-African (Mozabite, added Moroccan)
Papuan
West-Amazonian (Piapoco)
West-Med (Sardinian, removed few Baleares samples)
Pamirian (less samples, but with another dataset, with better coverage)

Визуализация :


Оффлайн RoaringАвтор темы

  • Сообщений: 476
  • Рейтинг +74/-1
  • Y-ДНК: R1b-DF99
  • мтДНК: U5b1e
Re: Тест K45 от Лукаса.
« Ответ #2 : 11 Декабрь 2017, 19:46:15 »
Результаты дедушек-бабушек и мои.

Сясьстрой:

0.02% South-Caucasian
2.74% North-Caucasian
1.35% Paleo-Balkan
0.00% Turkic-Altai
0.00% Proto-Austronesian
0.00% Nilotic
0.01% East-Med
0.00% Omotic
0.39% Munda
0.19% North-Amerind
0.01% West-Med
0.91% SW-Euro
0.00% Arabic
30.37% East-Euro
0.00% Central-African_HG
0.00% Andean
0.00% Indo-Chinese
0.01% South-Indian
0.00% NE-Asian
4.84% Volgan
0.00% Mongolian
0.00% Siberian
7.90% North-Sea_Germanic
6.89% Celtic
0.00% West-African
0.01% Kushitic
16.58% West-Finnic
3.17% Uralic
0.00% Sahelian
0.04% NW-Indian
0.00% East-African_HG
0.00% East-Asian
0.00% Amuro-Manchurian
8.03% Scando-Germanic
0.02% Iranian
0.01% South-African_HG
0.46% Amazonian
15.45% Baltic
0.00% Malay
0.00% Meso-Amerind
0.00% South-Chinese
0.60% North-African
0.00% Papuan
0.00% West-Amazonian
0.00% Pamirian

1\2 Балтийский немец, 1\4 Белорусский Поляк, 1\4 Псковская область

4.02% South-Caucasian
4.59% North-Caucasian
4.25% Paleo-Balkan
0.00% Turkic-Altai
0.00% Proto-Austronesian
0.00% Nilotic
0.03% East-Med
0.00% Omotic
0.00% Munda
0.00% North-Amerind
0.31% West-Med
3.72% SW-Euro
0.06% Arabic
25.46% East-Euro
0.00% Central-African_HG
0.00% Andean
0.00% Indo-Chinese
0.62% South-Indian
0.00% NE-Asian
2.02% Volgan
0.00% Mongolian
0.00% Siberian
11.02% North-Sea_Germanic
19.50% Celtic
0.00% West-African
0.00% Kushitic
9.26% West-Finnic
0.00% Uralic
0.00% Sahelian
0.00% NW-Indian
0.09% East-African_HG
0.00% East-Asian
0.00% Amuro-Manchurian
5.21% Scando-Germanic
0.03% Iranian
0.00% South-African_HG
0.00% Amazonian
9.35% Baltic
0.00% Malay
0.00% Meso-Amerind
0.00% South-Chinese
0.00% North-African
0.00% Papuan
0.00% West-Amazonian
0.44% Pamirian

3\4 Центральная и Южная Россия, 1\4 Поляк из Вильнюса.

3.28% South-Caucasian
0.11% North-Caucasian
2.20% Paleo-Balkan
0.00% Turkic-Altai
0.00% Proto-Austronesian
0.00% Nilotic
0.00% East-Med
0.00% Omotic
0.00% Munda
0.00% North-Amerind
0.00% West-Med
4.40% SW-Euro
0.92% Arabic
35.68% East-Euro
0.00% Central-African_HG
0.00% Andean
0.00% Indo-Chinese
0.00% South-Indian
0.00% NE-Asian
3.13% Volgan
0.00% Mongolian
0.00% Siberian
4.59% North-Sea_Germanic
7.16% Celtic
0.00% West-African
0.00% Kushitic
5.32% West-Finnic
0.09% Uralic
0.00% Sahelian
1.46% NW-Indian
0.00% East-African_HG
0.00% East-Asian
0.00% Amuro-Manchurian
8.40% Scando-Germanic
2.83% Iranian
0.00% South-African_HG
0.00% Amazonian
18.34% Baltic
0.00% Malay
0.01% Meso-Amerind
0.00% South-Chinese
0.00% North-African
0.15% Papuan
0.00% West-Amazonian
1.95% Pamirian

Поволжье\Курск :

3.84% South-Caucasian
1.20% North-Caucasian
3.27% Paleo-Balkan
0.33% Turkic-Altai
0.00% Proto-Austronesian
0.00% Nilotic
0.00% East-Med
0.00% Omotic
0.00% Munda
1.07% North-Amerind
1.03% West-Med
3.40% SW-Euro
1.69% Arabic
30.65% East-Euro
0.00% Central-African_HG
0.00% Andean
0.00% Indo-Chinese
0.00% South-Indian
0.00% NE-Asian
5.22% Volgan
0.00% Mongolian
0.00% Siberian
14.21% North-Sea_Germanic
9.23% Celtic
0.00% West-African
0.00% Kushitic
7.93% West-Finnic
0.00% Uralic
0.00% Sahelian
0.00% NW-Indian
0.00% East-African_HG
0.00% East-Asian
0.00% Amuro-Manchurian
1.23% Scando-Germanic
1.06% Iranian
0.00% South-African_HG
0.00% Amazonian
13.13% Baltic
0.00% Malay
0.32% Meso-Amerind
0.00% South-Chinese
0.17% North-African
0.36% Papuan
0.05% West-Amazonian
0.60% Pamirian

Мои:

4.26% South-Caucasian
4.86% North-Caucasian
1.08% Paleo-Balkan
0.00% Turkic-Altai
0.00% Proto-Austronesian
0.02% Nilotic
0.02% East-Med
0.03% Omotic
0.00% Munda
0.06% North-Amerind
0.00% West-Med
0.85% SW-Euro
0.00% Arabic
32.52% East-Euro
0.27% Central-African_HG
0.00% Andean
0.00% Indo-Chinese
0.73% South-Indian
0.00% NE-Asian
6.41% Volgan
0.00% Mongolian
0.00% Siberian
9.46% North-Sea_Germanic
5.25% Celtic
0.00% West-African
0.00% Kushitic
11.87% West-Finnic
0.00% Uralic
0.00% Sahelian
0.27% NW-Indian
0.16% East-African_HG
0.00% East-Asian
0.00% Amuro-Manchurian
6.63% Scando-Germanic
0.97% Iranian
0.00% South-African_HG
0.00% Amazonian
13.55% Baltic
0.00% Malay
0.00% Meso-Amerind
0.00% South-Chinese
0.44% North-African
0.00% Papuan
0.01% West-Amazonian
0.27% Pamirian

Оффлайн Srkz

  • Сообщений: 4817
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1665/-2
  • Y-ДНК: N1c L1025*
  • мтДНК: U4a1a
Re: Тест K45 от Лукаса.
« Ответ #3 : 11 Декабрь 2017, 20:12:54 »
К45 ;D Кто больше ;D Хотя по Европе по количеству компонентов примерно то на то с К36

Мои результаты (русский из Сибири)
  0.00%  South-Caucasian     
  1.06%  North-Caucasian   
  3.99%  Paleo-Balkan       
 
  0.21%  Turkic-Altai       
  0.00%  Proto-Austronesian 
  0.76%  Nilotic             
  0.00%  East-Med           
  0.00%  Omotic             
  0.15%  Munda               
  1.31%  North-Amerind       
  1.01%  West-Med           
  1.85%  SW-Euro     
       
  0.06%  Arabic             
28.66%  East-Euro          
  0.00%  Central-African_HG 
  0.02%  Andean             
  0.00%  Indo-Chinese       
  0.33%  South-Indian       
  1.35%  NE-Asian           
  6.13%  Volgan         
     
  0.00%  Mongolian           
  0.01%  Siberian           
10.69%  North-Sea_Germanic 
  5.75%  Celtic           
   
  0.04%  West-African       
  0.00%  Kushitic           
  8.91%  West-Finnic         
  2.45%  Uralic       
     
  0.00%  Sahelian           
  1.56%  NW-Indian           
  0.07%  East-African_HG     
  0.00%  East-Asian         
  0.00%  Amuro-Manchurian   
  9.62%  Scando-Germanic    
  0.00%  Iranian             
  0.00%  South-African_HG   
  0.37%  Amazonian           
12.55%  Baltic              
  0.00%  Malay               
  0.16%  Meso-Amerind       
  0.00%  South-Chinese       
  0.10%  North-African       
  0.00%  Papuan             
  0.00%  West-Amazonian     
  0.79%  Pamirian

Оффлайн SSlava

  • Сообщений: 959
  • Страна: 00
  • Рейтинг +52/-31
  • Y-ДНК: J-CTS6804
Re: Тест K45 от Лукаса.
« Ответ #4 : 11 Декабрь 2017, 20:27:46 »
0.05%  South-Caucasian     
 3.37%  North-Caucasian
  3.17%  Paleo-Balkan        
  0.00%  Turkic-Altai       
  0.00%  Proto-Austronesian 
  0.00%  Nilotic             
  0.01%  East-Med           
  0.00%  Omotic             
  0.00%  Munda               
  0.00%  North-Amerind       
  5.26%  West-Med           
  1.51%  SW-Euro            
  0.68%  Arabic              
 37.76%  East-Euro           
  0.00%  Central-African_HG 
  0.00%  Andean             
  0.00%  Indo-Chinese       
  0.00%  South-Indian       
  0.00%  NE-Asian           
  7.42%  Volgan             
  0.00%  Mongolian           
  0.00%  Siberian           
  8.21%  North-Sea_Germanic 
  5.08%  Celtic             
  0.00%  West-African       
  0.00%  Kushitic           
  5.10%  West-Finnic        
  0.00%  Uralic             
  0.00%  Sahelian           
  0.00%  NW-Indian           
  0.00%  East-African_HG     
  0.00%  East-Asian         
  0.00%  Amuro-Manchurian   
  5.15%  Scando-Germanic    
  0.00%  Iranian             
  0.00%  South-African_HG   
  0.00%  Amazonian           
16.99%  Baltic             
  0.00%  Malay               
  0.00%  Meso-Amerind       
  0.00%  South-Chinese       
  0.00%  North-African       
  0.03%  Papuan             
  0.00%  West-Amazonian     
  0.20%  Pamirian
« Последнее редактирование: 13 Декабрь 2017, 17:41:56 от SSlava »

Оффлайн SSlava

  • Сообщений: 959
  • Страна: 00
  • Рейтинг +52/-31
  • Y-ДНК: J-CTS6804
Re: Тест K45 от Лукаса.
« Ответ #5 : 11 Декабрь 2017, 20:31:52 »
Цитировать
К45 ;D Кто больше ;D Хотя по Европе по количеству компонентов примерно то на то с К36

Ну можно еще добавить))

Кстати хотел ради прикола свой калькулятор сделать)). А вы делали такое? Ну вот хочу с Пинк разобраться, вроде как бы не сложно, но с другой стороны, пока не все понял, тем более по английски там написано. Ну тут тему уже поднимали, помню вы ссылку кидали. Может в личку у вас спрошу что скоро))

Оффлайн Srkz

  • Сообщений: 4817
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1665/-2
  • Y-ДНК: N1c L1025*
  • мтДНК: U4a1a
Re: Тест K45 от Лукаса.
« Ответ #6 : 11 Декабрь 2017, 20:42:34 »
Кстати хотел ради прикола свой калькулятор сделать)). А вы делали такое? Ну вот хочу с Пинк разобраться, вроде как бы не сложно, но с другой стороны, пока не все понял, тем более по английски там написано. Ну тут тему уже поднимали, помню вы ссылку кидали. Может в личку у вас спрошу что скоро))
Нет, я калькулятор не планирую. Может быть, в январе проведу некоторые эксперименты.

Оффлайн SSlava

  • Сообщений: 959
  • Страна: 00
  • Рейтинг +52/-31
  • Y-ДНК: J-CTS6804
Re: Тест K45 от Лукаса.
« Ответ #7 : 11 Декабрь 2017, 20:59:32 »
Кстати хотел ради прикола свой калькулятор сделать)). А вы делали такое? Ну вот хочу с Пинк разобраться, вроде как бы не сложно, но с другой стороны, пока не все понял, тем более по английски там написано. Ну тут тему уже поднимали, помню вы ссылку кидали. Может в личку у вас спрошу что скоро))
Нет, я калькулятор не планирую. Может быть, в январе проведу некоторые эксперименты.

Ну а с методикой разобрались?

Да я так тоже ради интереса хотел сделать что.

Оффлайн Yaroslav

  • Я всего лишь уличный повеса, Улыбающийся встречным лицам
  • Сообщений: 10182
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1665/-7
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a-ZS3114 > ZS3084, ЖМ: I2a1b2a1a1a1a-Z16971*
  • мтДНК: K1b1a1-T199C, МЖ: H13a1a1d
Re: Тест K45 от Лукаса.
« Ответ #8 : 11 Декабрь 2017, 22:34:55 »
3. Помещаем всё в одну папку и туда же кладём ваш raw-data файл в распакованном.

А можно отдельно для танкистов, что это за raw-data файл? :) Какой-то из Build-ов?

Оффлайн Srkz

  • Сообщений: 4817
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1665/-2
  • Y-ДНК: N1c L1025*
  • мтДНК: U4a1a
Re: Тест K45 от Лукаса.
« Ответ #9 : 12 Декабрь 2017, 06:40:34 »
Ну а с методикой разобрались?
За последние пару лет уже даже забыл и то, что знал :)

Оффлайн RoaringАвтор темы

  • Сообщений: 476
  • Рейтинг +74/-1
  • Y-ДНК: R1b-DF99
  • мтДНК: U5b1e
Re: Тест K45 от Лукаса.
« Ответ #10 : 12 Декабрь 2017, 17:54:50 »
3. Помещаем всё в одну папку и туда же кладём ваш raw-data файл в распакованном.

А можно отдельно для танкистов, что это за raw-data файл? :) Какой-то из Build-ов?

Да, это то что вы с ФТДНА скачиваете, билд любой подойдёт.

Оффлайн SSlava

  • Сообщений: 959
  • Страна: 00
  • Рейтинг +52/-31
  • Y-ДНК: J-CTS6804
Re: Тест K45 от Лукаса.
« Ответ #11 : 13 Декабрь 2017, 00:50:34 »
Ну а с методикой разобрались?
За последние пару лет уже даже забыл и то, что знал :)

Понятно, спасибо, ну попробую сам разобраться. Кстати проверил башкира в этом калькуляторе, получил любопытные результаты. Выглядит как русский, у которого убрали часть германского компонента в этом калькуляторе и заменили его на 20 процентов Восточной Азии, которая близка нынешним сибирским народам. Ну соотношения европеоидных компонентов практически мало чем, даже ничем не отличаются от русских)) ну если убавить там по несколько процентов в пользу Восточной Азии)). Странно.

Как будто бы на Урале проживало в древности население, близкое генетически к восточным славянам, или возможно тем же эрзя, ну и в какой-то момент смешалось с азиатами из Сибири.

Ну может быть ошибаюсь я.
 ;D

Оффлайн SSlava

  • Сообщений: 959
  • Страна: 00
  • Рейтинг +52/-31
  • Y-ДНК: J-CTS6804
Re: Тест K45 от Лукаса.
« Ответ #12 : 13 Декабрь 2017, 01:10:46 »
 ;D Кстати ашкенази тоже показывают довольно высокую долю русского компонента (ну русского потому что в основу Восточной Европы тут взяли русские популяции в целом, хотя потом эрзя добавили, еще несколько популяций укранцев и белорусов), по сравнению с другими европейскими, к примеру у одного показывает 12 процентов, а остальные по 3-7 чтоли, Восточная Европа лидирует))

Возможно у них в самом деле относительно не малая восточно-европейская примесь есть, поэтому вездесущие ашкенази у многих))?
 ;D



Оффлайн SSlava

  • Сообщений: 959
  • Страна: 00
  • Рейтинг +52/-31
  • Y-ДНК: J-CTS6804
Re: Тест K45 от Лукаса.
« Ответ #13 : 13 Декабрь 2017, 01:22:54 »
 :) А насчет эрзя у него спрашивал, он писал, в принципе генетически мало чем от восточных славян они отличаются  по этим компонентам тоже.

Ну вообще эрзя, украинцы, белорусы, русские, поляки можно сказать единый континуум составляют. Видно недавнее происхождение от одной популяции. Конечно уже субстраты у всех народов есть, у поляков чуть кельтский компонент к примеру повышен, и так далее. Но явно видно родство.

Близки прибалты тоже, но уже чуть чуть в стороне они.


Оффлайн Srkz

  • Сообщений: 4817
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1665/-2
  • Y-ДНК: N1c L1025*
  • мтДНК: U4a1a
Re: Тест K45 от Лукаса.
« Ответ #14 : 13 Декабрь 2017, 09:20:28 »
Кстати проверил башкира в этом калькуляторе, получил любопытные результаты. Выглядит как русский, у которого убрали часть германского компонента в этом калькуляторе и заменили его на 20 процентов Восточной Азии, которая близка нынешним сибирским народам. Ну соотношения европеоидных компонентов практически мало чем, даже ничем не отличаются от русских)) ну если убавить там по несколько процентов в пользу Восточной Азии)). Странно.
Должна быть сильнее разница, у вас, наверное, башкир по отцу или деду.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100