DYS385..........0.00226
DYS388..........0.00022
DYS389..........0.00186, 0.00242
DYS390..........0.00311
DYS391..........0.00265
DYS392..........0.00052
DYS393..........0.00076
DYS394..........0.00151
DYS426..........0.00009
DYS437..........0.00099
DYS438..........0.00055
DYS439..........0.00477
DYS442..........0.00324
DYS447..........0.00264
DYS448..........0.00135
DYS449..........0.00838
DYS454..........0.00016
DYS455..........0.00016
DYS456..........0.00735
DYS458..........0.00814
DYS459..........0.00132
DYS460..........0.00402
DYS464..........0.00566
DYS570..........0.00790
DYS576..........0.01022
DYS607..........0.00411
DYS724..........0.03531
YCAII..........0.00123
Y-GATA-H4..........0.00208

Роман, это "общепринятые" скорости?

Если размерность приведённых скоростей - число мутаций/поколение, то по приведенной таблице
DYS390 скорость 0,00311 или 1 мутация за 25/0,00311=8040 лет
DYS391              0,0265 или     мутация за                  9400 лет
DYS392              0,00052 или    мутация за                48000 лет
DYS393              0,00076 или    мутация за                33000 лет
DYS388              0,00022 или    мутация за               114000 лет
Скорости для тех же маркеров из статьи А. Клёсова "Иосиф и его братья" (http://www.molgen.org/index.php?name=News&file=article&sid=37)
DYS390 - мутация за 8150 лет,
DYS391 - мутация за 41000 лет,
DYS392 - мутация за 31000 лет,
DYS393 - мутация за 94000 лет.
Правда, для DYS388 у него в одном месте 7800 лет, а в другом 40-50 тыс.лет, но всё равно, чувствуется некоторая разница в данных. Какие данные более актуальны?

Уважаемый Centurion, если можно, то и источник, пожалуйста.

Так это же скорости Чандлера.

Правда, для DYS388 у него в одном месте 7800 лет, а в другом 40-50 тыс.лет, но всё равно, чувствуется некоторая разница в данных. Какие данные более актуальны?

Нет "более актуальных" данных. Каждый считает как может.

Чандлер брал свои выборки.
Клёсов или брал скорости Урасина, или сам считал по Макдональдам.
Есть еще скорости FTDNA, они вообще третьи...

Объяснение методики расчета частот мутаций , например, есть в данной статье Клесова
http://www.molgen.org/index.php?name=News&file=article&sid=37

Скажите, а кем-то доказано, что скорость мутаций всегда и везде (в различных регионах) была постоянной?

Объяснение методики расчета частот мутаций , например, есть в данной статье Клесова
http://www.molgen.org/index.php?name=News&file=article&sid=37

Скажите, а кем-то доказано, что скорость мутаций всегда и везде (в различных регионах) была постоянной?

Игрок, я тоже пытался задавать подобные вопросы, но наколько я понял, никто точно и обоснованно не сможет ответить на этот вопрос пока.

Хотя чисто умозрительно я могу сделать предположение (больше для себя и пока не появятся данные), повторяю предположение, что не может она быть одинаковой в различных регионах и в разное время. Другое дело насколько это различие существенное.

К тому же с терминами здесь не все в порядке, как мне представляется.
Но допускаю, что некоторые термины используют пока для простоты и из-за недостатка данных.

Случайные процессы, к которым можно и нужно отнести мутации, характеризуются совершенно определенными понятиями в математике, куда понятие "скорость", насколько я знаю не входит. Ее можно использовать лишь как упрощение. Т. е., когда говорят о "скорости мутаций", (мне) остается предполагать, что для корректности применения такого понятия имеется ввиду упрощение и допущение в виде переноса или продолжение в область более древнюю воображаемой ассимптоты к кривой зависимости количества мутаций в единицу времени на последнем более-менее выверенном и известном ее участке. Остается надеяться, что это ассимптотическое приближение дает не очень большие ошибки при таком упрощении, и что от принадлежности к разным народам она сильно не зависит...

А вот применение скорости мутаций на коротких промежутках времени, для последних, скажем, 400 лет, когда может произойти одна мутация или вообще не произойти, мне видится некорректным и дающим большие ошибки (>100%) ...

Эта скорость откалибрирована для расчетова возраста предка относительно больших выборок с стандартными маркерами (вроде панелей ФТДНА), поэтому для расчета на меньших, генеалогических дистанциях мог быть определенные отклонения от этой скорости. Есть два подхода - первый проспективный, согласно которому скорости мутаций при прочих равных условиях практически постоянны, несущественные отклонения могут быть обусловлены климатом и антропогеными условиями.
Второй - ретроспективный - согласно которому, в разных генетических линиях скорость мутаций может быть разной. Этот метод использовался при калибровки скоростей в клане МакДональд, а в настоящее время его практикуют польские коллеги из проекта FTDNA Central European Nobility. Например, в роде Плевако произошла одна мутация на 67 маркерах между кузенами, чей общий предок жил 150 лет тому назад. В роде Лапко-Лапинских за период 500 лет произошло 6 мутаций
на 67 маркерах. У меня был с приверженцами этого подхода спор, но каждый остался при своем.

Хотя чисто умозрительно я могу сделать предположение (больше для себя и пока не появятся данные), повторяю предположение, что не может она быть одинаковой в различных регионах и в разное время. Другое дело насколько это различие существенное...
когда говорят о "скорости мутаций", (мне) остается предполагать, что для корректности применения такого понятия имеется ввиду упрощение и допущение в виде переноса или продолжение в область более древнюю воображаемой ассимптоты к кривой зависимости количества мутаций в единицу времени на последнем более-менее выверенном и известном ее участке. Остается надеяться, что это ассимптотическое приближение дает не очень большие ошибки при таком упрощении, и что от принадлежности к разным народам она сильно не зависит...

В статистике на практике применяют одно очень хорошее правило: не можешь зафиксировать механизм влияния какого-либо фактора, значит, его и нет.

Случайные процессы, к которым можно и нужно отнести мутации, характеризуются совершенно определенными понятиями в математике, куда понятие "скорость", насколько я знаю не входит. Ее можно использовать лишь как упрощение.

Именно так и есть. На самом деле понятие "скорость мутаций" правильнее (с точки зрения статистики, конечно) назвать "интенсивность потока мутаций", и измеряется она либо в [количество мутаций/(маркер х поколение)], либо в  [количество мутаций/(гаплотип х поколение)]

Друзья-коллеги, кто-нибудь знает скорость мутирования Y-STR локуса DYS A7.2?

Этот маркер я нашёл в статье Cengiz Cinnioğlu et al (2003).

Как я понимаю, DYS A7.2 это тоже, что и GATA-A7.2 (теперь называется DYS461).

В статье Cinnioğlu представлены 10-ти маркерные гаплотипы с "хитрым" набором маркеров:
DYS19 DYS388 DYS390 DYS391 DYS392 DYS393 DYS389I DYS389II DYS439 DYSA7.2

Хитрость в том, что скорости всех маркеов, кроме DYS A7.2, я легко нашёл, а вот скорости для DYS A7.2 (GATA-A7.2=DYS461) - нигде нет.

Может кто-то знает?

Друзья-коллеги, кто-нибудь знает скорость мутирования Y-STR локуса DYS A7.2?

0.002327
Источник - Direct determination of mutation characteristics of Y chromosome STR loci // American Society of Human Genetics Annual Meeting, Toronto, Canada, October 2004. by Luke A. D. Hutchison et al.

Благодарю Вас Dimitri!

Чандлер брал свои выборки.
Клёсов или брал скорости Урасина, или сам считал по Макдональдам.
Есть еще скорости FTDNA, они вообще третьи...

Не верю я Мак-Дональдам ранее XVII века. Лучше меньше статистики, зато подостоверней будет, например, "поздние" Мак-Дональды c XVII-го века.

DYS385..........0.00226
DYS388..........0.00022
DYS389..........0.00186, 0.00242
DYS390..........0.00311
DYS391..........0.00265
DYS392..........0.00052
DYS393..........0.00076
DYS394..........0.00151
DYS426..........0.00009
DYS437..........0.00099
DYS438..........0.00055
DYS439..........0.00477
DYS442..........0.00324
DYS447..........0.00264
DYS448..........0.00135
DYS449..........0.00838
DYS454..........0.00016
DYS455..........0.00016
DYS456..........0.00735
DYS458..........0.00814
DYS459..........0.00132
DYS460..........0.00402
DYS464..........0.00566
DYS570..........0.00790
DYS576..........0.01022
DYS607..........0.00411
DYS724..........0.03531
YCAII..........0.00123
Y-GATA-H4..........0.00208

Уважаемый Centurion, а это скорости или вероятности, полученные по парам "отец-сын"? На вероятности не похожи, поскольку есть, например, число 0,00009, которое можно получить только при огромной статистике.