АвторТема: BY-снипы  (Прочитано 1647 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн LeslaАвтор темы

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 9168
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2354/-9
  • FTDNA: 154400 (Big Y - 283049)
  • Y-ДНК: R1a-YP682 (VK06+)
BY-снипы
« : 11 Октябрь 2017, 18:07:30 »
Многие спрашивают, что скрывается под тем или иным снипом с маркировкой BY (позиция, аллель). Не уверен, что тут все снипы, но вот такую табличку обнаружил
https://docs.google.com/spreadsheets/d/1ROz4wo6hP2Y6lo9xUfffVvNqrswGAsMRWUhhsZ4MuBU/edit#gid=1206450200

источник: перепост с Фэйсбука сообщения пользователя Ted Kandell в группе YFull.

Оффлайн Шад

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6300
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1221/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: BY-снипы
« Ответ #1 : 11 Октябрь 2017, 19:29:23 »
Насколько я понимаю, даже обновленный интерфейс FTDNA не дает возможности просмотра позиции и замены по именованным снипам, включая BY.
Так что актуально.
+100

Оффлайн Sylvester

  • Сообщений: 1624
  • Страна: ru
  • Рейтинг +559/-0
  • FTDNA:290147 YFull:YF64174 GEDmatch:T532939
  • Y-ДНК: I1-Y16803 Varangians (SWE>RUS)
  • мтДНК: N1a1a1a1a2 (RUS,KAZ,BGR,HUN)
Re: BY-снипы
« Ответ #2 : 11 Октябрь 2017, 20:21:14 »
Насколько я понимаю, даже обновленный интерфейс FTDNA не дает возможности просмотра позиции и замены по именованным снипам, включая BY.
Так что актуально.
+100
Почему нельзя? Можно, если этот снип есть в списке в колонке 'SNP Name' на страничке результатов BigY.
Вот например ткнул в один снип из списка :


Оффлайн Centurion

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 9755
  • Страна: ru
  • Рейтинг +569/-2
Re: BY-снипы
« Ответ #3 : 11 Октябрь 2017, 20:25:12 »
Вот например ткнул в один снип из списка :
зашибатый снип )))) уровень доверия - 99% треш

Оффлайн Шад

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6300
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1221/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: BY-снипы
« Ответ #4 : 11 Октябрь 2017, 20:48:46 »
Насколько я понимаю, даже обновленный интерфейс FTDNA не дает возможности просмотра позиции и замены по именованным снипам, включая BY.
Так что актуально.
+100
Почему нельзя? Можно, если этот снип есть в списке в колонке 'SNP Name' на страничке результатов BigY.

Спасибо. Еще не было времени потыкать и посмотреть как работает :)

Оффлайн Sylvester

  • Сообщений: 1624
  • Страна: ru
  • Рейтинг +559/-0
  • FTDNA:290147 YFull:YF64174 GEDmatch:T532939
  • Y-ДНК: I1-Y16803 Varangians (SWE>RUS)
  • мтДНК: N1a1a1a1a2 (RUS,KAZ,BGR,HUN)
Re: BY-снипы
« Ответ #5 : 11 Октябрь 2017, 20:56:15 »
Вот например ткнул в один снип из списка :
зашибатый снип )))) уровень доверия - 99% треш
так дело не в этом снипе, а в том как смотреть )))

Оффлайн Centurion

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 9755
  • Страна: ru
  • Рейтинг +569/-2
Re: BY-снипы
« Ответ #6 : 11 Октябрь 2017, 20:59:29 »
Вот например ткнул в один снип из списка :
зашибатый снип )))) уровень доверия - 99% треш
так дело не в этом снипе, а в том как смотреть )))
а для меня именно в снипе, с именем BY26812

это мусорный регион рядом с PAR2

Оффлайн Centurion

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 9755
  • Страна: ru
  • Рейтинг +569/-2
Re: BY-снипы
« Ответ #7 : 11 Октябрь 2017, 21:07:35 »
разве вот тут можно найти снип с уровнем доверия 99%?  :)


Оффлайн Таракан

  • "На стяге твоем такой же кот, лишь только цвет другой" (с)
  • Сообщений: 2136
  • Страна: ru
  • Рейтинг +260/-0
    • Татарский ДНК-проект "Идель"
  • Y-ДНК: R1a-YP5233
  • мтДНК: U4 (Ulrike)
Re: BY-снипы
« Ответ #8 : 11 Октябрь 2017, 22:22:40 »
разве вот тут можно найти снип с уровнем доверия 99%?  :)



Сейчас попробую найти.

Оффлайн Centurion

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 9755
  • Страна: ru
  • Рейтинг +569/-2
Re: BY-снипы
« Ответ #9 : 11 Октябрь 2017, 22:33:36 »
Сейчас попробую найти.
удачи!

Оффлайн Semargl

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Сообщений: 5512
  • Страна: hr
  • Рейтинг +2901/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: BY-снипы
« Ответ #10 : 11 Октябрь 2017, 23:00:25 »
Сейчас попробую найти.
+5 за юмор. Там снипов нет. Там "несколько сот снипов не покрытых в 37 референсе".  :-X

Оффлайн Centurion

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 9755
  • Страна: ru
  • Рейтинг +569/-2
Re: BY-снипы
« Ответ #11 : 11 Октябрь 2017, 23:10:25 »
Сейчас попробую найти.
+5 за юмор. Там снипов нет. Там "несколько сот снипов не покрытых в 37 референсе".  :-X
да нет. это тот же участок в 37 но в 38 все то же самое

Оффлайн evgivanov

  • Сообщений: 397
  • Страна: ru
  • Рейтинг +132/-0
  • Y-ДНК: R1a-Z92 (YP682+, YP1261+)
Re: BY-снипы
« Ответ #12 : 06 Март 2018, 19:08:14 »
Следует понимать, что BY28746 из той же оперы?



Ftdna продолжает присваивать номера сомнительным снипам из post palindromic region - BY28761, BY30079

Оффлайн Шад

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6300
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1221/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: BY-снипы
« Ответ #13 : 06 Март 2018, 22:36:42 »
Да. Это их вообще не останавливает:)

А еще у FTDNA есть серия снипов GT. Там вообще снипы из X-DNA mirrored и PAR-регионов.
Очевидно в изучении закономерностей псевдоутосомных регионов видится какой-то смысл.

Оффлайн Шад

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6300
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1221/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: BY-снипы
« Ответ #14 : 15 Май 2018, 10:55:22 »
Очередной свод данных по BY-снипам
https://isogg.org/wiki/BY_SNP_index
Можно выгрузить как таблицу

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100