АвторТема: YP6504  (Прочитано 4025 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Centurion

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 10121
  • Страна: ru
  • Рейтинг +563/-2
Re: YP6504
« Ответ #15 : 22 Сентябрь 2017, 15:46:54 »
Добавил промежуточный снип BY27257 из ftdna.
BY27257   22465618   T to A
Регион DYZ19, гомология.
Т.е. он может встречаться и у других гаплогрупп?
нет, это значит, что этот регион имеет очень похожие участки, которые на 95-99% совпадают с другими участками на игреке или на икс-хромосоме или даже других аутосомных хромосомах. такие снипы нельзя тестировать с помощью классического теста или чипа, а ngs дает смешанные результаты, потому что на этот участок могут смаппироваться риды с других участков или даже других хромосом

Оффлайн FeroceАвтор темы

  • Сообщений: 538
  • Страна: ru
  • Рейтинг +80/-0
    • Бессоновы/Безсоновы
  • Y-ДНК: R1a-Z92 (YP6504->BY30750)
Re: YP6504
« Ответ #16 : 22 Сентябрь 2017, 17:49:45 »
Добавил промежуточный снип BY27257 из ftdna.
BY27257   22465618   T to A
Регион DYZ19, гомология.
Т.е. он может встречаться и у других гаплогрупп?
нет, это значит, что этот регион имеет очень похожие участки, которые на 95-99% совпадают с другими участками на игреке или на икс-хромосоме или даже других аутосомных хромосомах. такие снипы нельзя тестировать с помощью классического теста или чипа, а ngs дает смешанные результаты, потому что на этот участок могут смаппироваться риды с других участков или даже других хромосом
Видимо в FTDNA считают иначе :)
Получается для построения древа снипов его использовать нельзя?
Видимо придётся сначала ждать интерпретации моего образца в YFull, а потом ещё и #406192 Stanley Hrynkiewich.

Оффлайн Centurion

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 10121
  • Страна: ru
  • Рейтинг +563/-2
Re: YP6504
« Ответ #17 : 22 Сентябрь 2017, 17:51:00 »
Получается для построения древа снипов его использовать нельзя?
по факту нет, но запретить никто не может

Оффлайн Lesla

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 8406
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1902/-8
  • FTDNA: 154400 (Big Y - 283049)
  • Y-ДНК: R1a-YP682 (VK01/VK03+)
Re: YP6504
« Ответ #18 : 24 Сентябрь 2017, 19:48:19 »
На сайте Estonian biocentre в открытом доступе размещены результаты тестирования "307 high coverage human Y chromosome sequences" http://evolbio.ut.ee/chrY/.
В первую очередь наверно надо смотреть вот эту таблицу: http://evolbio.ut.ee/chrY/Y_data_metainfo.xlsx
Как я понял в ней через R1a1a и R1a1b обозначены Z92+, R1a1c - это CTS1211+, R1a1d - это M458+, R1a1e - это Z284+, R1a2 - это Z93+.
Снипы можно смотреть в каждой директории, например, в файлах /ASM/var_chrY-GS00 ...
Кстати, 4 образца из этой базы из этой ветки - Y11268:
Komi2_dupl   R1a1a   Komis   Komis   Komi_republic   Russia   GS000018364-DID
RusPs2   R1a1a   Russians-West   Russians   Pskov   Russia   GS000021425-DID
RusPi2   R1a1a   Russians-North   Russians   Pinega   Russia   GS000018432-DID
Komi2   R1a1a   Komis   Komis      Russia   GS000035445-DID
Между прочим, трое из них - YP6504+
Komi2_dupl   R1a1a   Komis   Komi_republic   Russia
RusPi2   R1a1a   Russians   Pinega   Russia
Komi2   R1a1a   Komis      Russia

Оффлайн tightfog

  • Сообщений: 54
  • Страна: ru
  • Рейтинг +18/-0
  • Y-ДНК: R1a-YP728*
  • мтДНК: H11a1
Re: YP6504
« Ответ #19 : 25 Сентябрь 2017, 07:50:32 »
Между прочим, трое из них - YP6504+
Komi2_dupl   R1a1a   Komis   Komi_republic   Russia
RusPi2   R1a1a   Russians   Pinega   Russia
Komi2   R1a1a   Komis      Russia
Вот бы их в FTDNA протестировать...

Оффлайн Semargl

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 4940
  • Страна: hr
  • Рейтинг +2129/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: YP6504
« Ответ #20 : 25 Сентябрь 2017, 09:56:57 »
Между прочим, трое из них - YP6504+
Komi2_dupl   R1a1a   Komis   Komi_republic   Russia
RusPi2   R1a1a   Russians   Pinega   Russia
Komi2   R1a1a   Komis      Russia
Вот бы их в FTDNA протестировать...
У них уже есть полный сиквенс. К сожалению БАМов не будет, но посмотреть значение любого снипа в их результатах возможно.

Оффлайн Lesla

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 8406
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1902/-8
  • FTDNA: 154400 (Big Y - 283049)
  • Y-ДНК: R1a-YP682 (VK01/VK03+)
Re: YP6504
« Ответ #21 : 25 Сентябрь 2017, 16:27:05 »
У них уже есть полный сиквенс. К сожалению БАМов не будет, но посмотреть значение любого снипа в их результатах возможно.
Владимир намекает, что можно проверить свои приватные снипы на их наличие у этих образцов  :)

Оффлайн Semargl

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 4940
  • Страна: hr
  • Рейтинг +2129/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: YP6504
« Ответ #22 : 25 Сентябрь 2017, 17:43:06 »
У них уже есть полный сиквенс. К сожалению БАМов не будет, но посмотреть значение любого снипа в их результатах возможно.
Владимир намекает, что можно проверить свои приватные снипы на их наличие у этих образцов  :)
Верно. Я что-то уже проверял, но не помню чьи приватные и в каком научном. :) Позже постараюсь это сделать для тех из этой ветви у кого уже определены приватные.

Оффлайн FeroceАвтор темы

  • Сообщений: 538
  • Страна: ru
  • Рейтинг +80/-0
    • Бессоновы/Безсоновы
  • Y-ДНК: R1a-Z92 (YP6504->BY30750)
Re: YP6504
« Ответ #23 : 25 Сентябрь 2017, 20:57:37 »
У них уже есть полный сиквенс. К сожалению БАМов не будет, но посмотреть значение любого снипа в их результатах возможно.
Владимир намекает, что можно проверить свои приватные снипы на их наличие у этих образцов  :)
Верно. Я что-то уже проверял, но не помню чьи приватные и в каком научном. :) Позже постараюсь это сделать для тех из этой ветви у кого уже определены приватные.
Меня не забудьте, я самый не приватный человек :)

Оффлайн tightfog

  • Сообщений: 54
  • Страна: ru
  • Рейтинг +18/-0
  • Y-ДНК: R1a-YP728*
  • мтДНК: H11a1
Re: YP6504
« Ответ #24 : 26 Сентябрь 2017, 10:56:10 »
Обновилось дерево YFull YTree до версии v5.06.
Появился субклад YP6504 :)

Оффлайн FeroceАвтор темы

  • Сообщений: 538
  • Страна: ru
  • Рейтинг +80/-0
    • Бессоновы/Безсоновы
  • Y-ДНК: R1a-Z92 (YP6504->BY30750)
Re: YP6504
« Ответ #25 : 28 Сентябрь 2017, 19:30:41 »
У FTDNA тоже обновилось.
Добавил в шапку изменения. Древо снипов указал как в YFull, но так же слежу за изменениями у FTDNA их прям прорвало.

Оффлайн FeroceАвтор темы

  • Сообщений: 538
  • Страна: ru
  • Рейтинг +80/-0
    • Бессоновы/Безсоновы
  • Y-ДНК: R1a-Z92 (YP6504->BY30750)
Re: YP6504
« Ответ #26 : 16 Октябрь 2017, 22:09:04 »
Готов мой YFull, YP6504 подтвержден.

Оффлайн tightfog

  • Сообщений: 54
  • Страна: ru
  • Рейтинг +18/-0
  • Y-ДНК: R1a-YP728*
  • мтДНК: H11a1
Re: YP6504
« Ответ #27 : 17 Октябрь 2017, 01:57:12 »
Готов мой YFull, YP6504 подтвержден.
Теперь нас двое в этой ветке на YFull. Осталось дождаться TMRCA.

Оффлайн FeroceАвтор темы

  • Сообщений: 538
  • Страна: ru
  • Рейтинг +80/-0
    • Бессоновы/Безсоновы
  • Y-ДНК: R1a-Z92 (YP6504->BY30750)
Re: YP6504
« Ответ #28 : 17 Октябрь 2017, 20:19:49 »
Готов мой YFull, YP6504 подтвержден.
Теперь нас двое в этой ветке на YFull. Осталось дождаться TMRCA.
что-то мне подсказывает, что он будет достаточно большой :) И я очень состарю эту ветку.
Если я правильно понял, то я в разделе SNP-совпадения выбрал всю нашу ветку R-Y11268
Убрал все общие снипы меня с вами и с 4 представителями не из нашей подветви и остались эти:
Y115, YP6504/B120, YP6505, Z4651, т.е. наши.
Я так понимаю, что возможно появятся ещё общие из приватных? или они сразу добавляются?

Оффлайн FeroceАвтор темы

  • Сообщений: 538
  • Страна: ru
  • Рейтинг +80/-0
    • Бессоновы/Безсоновы
  • Y-ДНК: R1a-Z92 (YP6504->BY30750)
Re: YP6504
« Ответ #29 : 17 Октябрь 2017, 20:24:37 »
И в YFull появилась группа R-z92

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100