АвторТема: Компания Dante Labs  (Прочитано 168798 раз)

0 Пользователей и 4 Гостей просматривают эту тему.

Оффлайн Томми

  • Сообщений: 264
  • Рейтинг +75/-1
  • Y-ДНК: I2a2b L38 S2606
  • мтДНК: H3f
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #1110 : 20 Февраль 2020, 06:50:11 »
Наконец то мой комплект идёт ко мне, 4 месяца простоя, думаю Данте ошиблись, открыв свое представительство в Италии, к примеру Ливинг ДНК имеет филиал в Дании, все работает как часы, а тут сплошное раздолбайство

Оффлайн bulatv2

  • Сообщений: 238
  • Страна: ru
  • Рейтинг +65/-1
  • ftdna: 468412
  • Y-ДНК: R1a-Y35123
  • мтДНК: H1b2c
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #1111 : 20 Февраль 2020, 17:35:11 »
 Появились два fastq файла  каждый 46 и 48 гигабайта, и ещё другие файлы, bam 90 г.
« Последнее редактирование: 09 Сентябрь 2020, 07:50:26 от bulatv2 »

Оффлайн bulatv2

  • Сообщений: 238
  • Страна: ru
  • Рейтинг +65/-1
  • ftdna: 468412
  • Y-ДНК: R1a-Y35123
  • мтДНК: H1b2c
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #1112 : 20 Февраль 2020, 18:52:11 »
Появились два фастку файла  каждый почти 43 и 45 гигабайта
Это старый или новый заказ? Для нового необычно. Проверьте количество гигабаз и длину чтения.
это чёрная пятница 2018

Оффлайн Arthwr

  • Сообщений: 1331
  • Страна: ua
  • Рейтинг +787/-6
    • http://r1b-pf7562.blogspot.com/
  • Y-ДНК: R1b-PF7563
  • мтДНК: K1c1e
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #1113 : 22 Февраль 2020, 12:05:19 »
У меня небольшая просьба к тем, кто закзал в ДЛ и в итоге залился на ИгрекФулл. Описать плюсы и минусы этой затеи по сравнению с Бигом.
Вроде по стоимости это в разы дешевле. Но по нервотрёпке - тьма-тьмущая подводных камней с доставкой, отправкой и пр. х. В сухом остатке - каков фактический результат? (Может, всем нам имеет смысл перейти в ДЛ, чем постоянно апгрейдить с 500 до 700, потом с 700 до 1000 и так до скончания веков)

Повторю вопрос Фарруха совсем по детски. В стиле, кто сильнее - кит, или слон?     ::)

Что лучше для наиболее полного и уверенного определения серии терминальных снипов?

1. БигИгрек 700.
2. Данте Лабз х30.
3. Данте Лабз лонг рид.
Все три пункта - это разные технологии.
1) таргетное секвенирование. Примеры: BigY, FGC Elite
2) WGS. Полный геном. Предоставляют услугу: YSEQ, FGC, Dante
3) Лонг риды. Предоставляют услугу: FGC, Dante

Третий пункт отпадает сразу, так как уже сказали - технология не отлаженная. Я видел лонгриды от Данте очень высокого качества, но видел и совсем трешовые.
Если выбирать между первым и вторым пунктами, то WGS в любом случае лучше. Таргетное секвенирование делали ради удешевления процесса. Теперь, когда цена на WGS упала, выбор очевиден.
Что касается конкретно Данте. Они сильно демпингуют, то есть цена очень привлекательная. Но имеют кучу проблем с логистикой. Так что какую контору выбирать из второго пункта - вопрос толщины кошелька и желания решать возникающие проблемы.
По качеству секвенирования - многое зависит от качества биоматериала. Лайфхак - собирая слюну, попробуйте слегка повредить десны и подмешать крови ;)
Практика показывает увеличение покрытия в глубину.
Для себя я уже решил - на скидках закажу несколько наборов, но уже через шипито.

Таким образом ответ - пункт 2.

Думаю, статистика по WGS от Данте, выравненному на hg38 в YSEQ, при сравнении со статистикой даже Y Elite от FGC, не говоря уже про статистику Big Y-700, который хуже, чем Y Elite,
По отношению с любым Big Y тест от Dante должен по идее дать улучшение. По сравнению с Y Elite возможно ничего не даст.
даёт убедительный ответ в пользу выбора теста WGS (Dante, Nebula, etc.).

Если нам важно прежде всего правильное и точное ветвление древа и уточнение возраста ветвей, то качество превыше всего )

Оффлайн Andymeon

  • Сообщений: 1179
  • Страна: ru
  • Рейтинг +119/-5
  • Y-ДНК: R1a [CTS 3402+ Y2910+ YP310+]
  • мтДНК: H3i
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #1114 : 22 Февраль 2020, 22:18:47 »

это чёрная пятница 2018

не прошло и 2х лет  ;D ;D ;D ;D ;D ;D ;D ;D ;D
через 5 бесплатно будут с люльки делать  ;)
« Последнее редактирование: 23 Февраль 2020, 07:04:16 от пенелопа »

Оффлайн Шад

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6334
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1330/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #1115 : 22 Февраль 2020, 22:39:24 »
У меня готово.

Оффлайн Arthwr

  • Сообщений: 1331
  • Страна: ua
  • Рейтинг +787/-6
    • http://r1b-pf7562.blogspot.com/
  • Y-ДНК: R1b-PF7563
  • мтДНК: K1c1e
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #1116 : 22 Февраль 2020, 23:00:59 »
Пока что чаша весов на стороне ФТДНА, т. к. там есть база для сравнения, что незаменимо.

Извините, всё никак не уймусь :-X

База ФТДНА сегодня по некоторым субкладам уступает базе YFull.

Вот, например, R1b-PF7563: в базе ФТДНА 9 албанцев с Бигом (один с косовским флажком), а на YFull их 13, и черногорец из YFull отсутствует в ФТДНА.

https://www.familytreedna.com/public/y-dna-haplotree/R;name=R-PF7563

https://www.yfull.com/tree/R-PF7563/

Думаю, оптимальный вариант - гаплотип в ФТДНА для вхождения в проекты и тест WGS (Dante или Nebula) для YFull. Односубкладники с Бигом будут видны и в проектах, и на гаплодреве ФТДНА.
В поле для указания предка на ФТДНА можно прописать свой YFull ID и субклад, и участники проекта будут знать своих односубкладников, протестированных в других компаниях.

И как только зашатается и рухнет монополия ФТДНА на полноту базы - люди перекочуют в YFull ко всеобщему благу )
« Последнее редактирование: 23 Февраль 2020, 00:53:06 от Arthwr »

Оффлайн ilpo

  • Сообщений: 41
  • Страна: fi
  • Рейтинг +9/-0
  • Y-ДНК: N-NY68373
  • мтДНК: U8a1a1b1c
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #1117 : 23 Февраль 2020, 21:29:29 »
Сегодня я получил результаты всего теста генома. 300 дней с момента заказа.  :)

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 36936
  • Страна: ca
  • Рейтинг +3773/-48
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #1118 : 25 Февраль 2020, 03:08:40 »
Моя точка зрения очередной раз изменилась.

Не буду рекомендовать Данте в качестве эконом варианта для обеспеченных (такой вот парадокс) тестовиков.

Приглядываюсь к Небуле. Но там больше смахивает на протокол о намерениях.

Оффлайн vad245

  • Сообщений: 228
  • Страна: ru
  • Рейтинг +88/-0
  • Y-ДНК: R-YP1410
  • мтДНК: U8a1a
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #1119 : 25 Февраль 2020, 13:34:14 »
Получил наконец-то набор. Напишу, вдруг кому-то пригодится по шагам.

Заказывал в Dante 10.11.2019. Выслали, вернулось.
Решил почесаться 18.01.2020. Создал адрес в Shipito (с перевозчиком BoxBerry), написал в Dante.
Набор выслали 20.01.2020. Прибыл в Shipito 26.01.2020.

Спрашивал тут, указывает ли Dante цену в сопроводительной бумажке. Никто не ответил. Так вот, не указывает. Это к вопросу, заказывать ли у Шипито услугу "убрать цену с наклеек". Не требуется.
Шипито требует ссылку на покупку и цену. Честно написал "Dante Labs" и номер заказа.
Нашёл на алибабе похожий комплект, поставил цену 5$ и эту ссылку послал. Картинку тоже с алибабы прикрепил.
https://russian.alibaba.com/product-detail/medical-disposable-painless-saliva-gene-detection-collector-sterilized-paternity-dna-test-kit-dna-genetic-testing-62190914748.html?spm=a2700.8699010.normalList.11.477d431aXB9Cof
В описании посылки написал "Plastic tubes", потом BoxBerry это трансформировал в "Стерилизованный набор для анализа ДНК отцовства (2 пластиковые пробирки)".
BoxBerry требует все персональные данные, включая ИНН и фото двух страниц паспорта.

В Россию пакет прибыл 10.02.2020.
Таможня выпустила 15.02.2020. Вскрывали - пакет заклеен скотчем.
В пункт выдачи BoxBerry пакет поступил 22.02.2020.

Набор - SpectrumDNA.
Посмотрим, за сколько в Италию доберётся. Послать, что ли, EMS-ом?-)

Оффлайн Semargl

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 5993
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4191/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #1120 : 25 Февраль 2020, 16:01:54 »
Мои 5 копеек, но претензии в основном к Почте России. После того как DHL вернули мой набор в Италию, я попросил отправить Почтой Италии. Отправленный набор затерялся на просторах России. Я попросил отправить тестовый набор снова, но уже через Шипито. Выбрал "для ускорения" пересылку через Австрию, за что и поплатился. Почта Австрии доставляет посылку до таможни и передает Почте России, которая в очередной раз лажанула и отправила посылку в Ярославль, где она и была получена адресатом судя по трек-номеру))). После долгого разбирательства с ПР, выяснилось что они перепутали трек-номер и наконец-то мне удалось получить посылку. Время в пути - 4 месяца.
В следующий раз буду заказывать через штаты - так значительно дешевле и позволяет миновать доставку на последнем отрезке Почтой России.
Насчет отправки обратно. Недавно отправлял через EMS - оно того не стоит. Доставка заняла в полтора раза больше времени чем обычное отправление.

Оффлайн Daemon2017

  • Сообщений: 2159
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1045/-18
  • Y-ДНК: R1a-Y35174
  • мтДНК: V7-a2a2a2b*
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #1121 : 25 Февраль 2020, 20:09:50 »
Вчера получил заветный набор :)

Хронология такая:
10.11.2019 сделал заказ
<Почти 3 месяца: то да сё - маялся с глупым DHL Russia>
31.1.2020 DL выслало посылку через USPS на мой адрес Shipito в Калифорнии
7.2.2020 USPS довезло посылку до Shipito
<Заполнил декларацию коряво - BoxBerry в Shipito обнаружило это и помогло мне заполнить все правильно>
14.2.2020 Shipito выслало посылку через BoxBerry
24.2.2020 получил посылку в Shipito

Посылка была вскрыта и заклеена скотчем с надписью "LINK"  ??? Дырка достаточно большая, чтобы извлечь коробку DL, но сама коробка на месте и видно, что ее не вскрывали.


Почистил зубы, прополоскал Листерином - через пару часов буду плевать в трубочку. Можно считать, что 1/3 эпопеи уже позади  ;D

Кстати, т.к. набор пришел в США, то на возвратной коробке USPS написано:
SpectrumDNA
12248 S. Lone Peak Parkway
Suite #106
Draper, UT 84020

Но мне ведь ничто не мешает отправить на:
Dante Labs
Tecnopolo d'Abruzzo
Strada Statale 17 Loc. Boschetto di Pile
67100
L'Aquila (AQ)
Italy

Ведь так? Сейчас уточню у них.
« Последнее редактирование: 25 Февраль 2020, 20:42:48 от Daemon2017 »

Оффлайн Andymeon

  • Сообщений: 1179
  • Страна: ru
  • Рейтинг +119/-5
  • Y-ДНК: R1a [CTS 3402+ Y2910+ YP310+]
  • мтДНК: H3i
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #1122 : 25 Февраль 2020, 22:03:21 »
Вчера получил заветный набор :)
[spoiler]
 Хронология такая:
10.11.2019 сделал заказ
<Почти 3 месяца: то да сё - маялся с глупым DHL Russia>
31.1.2020 DL выслало посылку через USPS на мой адрес Shipito в Калифорнии
7.2.2020 USPS довезло посылку до Shipito
<Заполнил декларацию коряво - BoxBerry в Shipito обнаружило это и помогло мне заполнить все правильно>
14.2.2020 Shipito выслало посылку через BoxBerry
24.2.2020 получил посылку в Shipito

Посылка была вскрыта и заклеена скотчем с надписью "LINK"  ??? Дырка достаточно большая, чтобы извлечь коробку DL, но сама коробка на месте и видно, что ее не вскрывали.


Почистил зубы, прополоскал Листерином - через пару часов буду плевать в трубочку. Можно считать, что 1/3 эпопеи уже позади  ;D

Кстати, т.к. набор пришел в США, то на возвратной коробке USPS написано:
SpectrumDNA
12248 S. Lone Peak Parkway
Suite #106
Draper, UT 84020

Но мне ведь ничто не мешает отправить на:
Dante Labs
Tecnopolo d'Abruzzo
Strada Statale 17 Loc. Boschetto di Pile
67100
L'Aquila (AQ)
Italy
[/spoiler]
Ведь так? Сейчас уточню у них.
шипито позволяет делать фото пришедшей посылки, заказывали? Интересно на каком этапе шаловливые ручки туда лезут. И на каком основании, когда есть просвечивающая аппаратура.

Оффлайн Daemon2017

  • Сообщений: 2159
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1045/-18
  • Y-ДНК: R1a-Y35174
  • мтДНК: V7-a2a2a2b*
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #1123 : 25 Февраль 2020, 23:08:11 »
шипито позволяет делать фото пришедшей посылки, заказывали? Интересно на каком этапе шаловливые ручки туда лезут. И на каком основании, когда есть просвечивающая аппаратура.

Не заказывал, так что есть только 3 фотки, которые бесплатно делают: там видно, что повреждений нет. BoxBerry нет смысла что-то вскрывать, т.к. они последнее звено в цепи и, в случае чего, все шишки будут падать на них.
Выходит, что это или наша таможня на впуске, или таможня США на выпуске - и у тех, и у других очень шаловливые ручки. Ну или Shipito после фотографирования  ;D

Оффлайн vad245

  • Сообщений: 228
  • Страна: ru
  • Рейтинг +88/-0
  • Y-ДНК: R-YP1410
  • мтДНК: U8a1a
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #1124 : 25 Февраль 2020, 23:09:18 »
Вчера получил заветный набор :)
[spoiler]
 Хронология такая:
10.11.2019 сделал заказ
<Почти 3 месяца: то да сё - маялся с глупым DHL Russia>
31.1.2020 DL выслало посылку через USPS на мой адрес Shipito в Калифорнии
7.2.2020 USPS довезло посылку до Shipito
<Заполнил декларацию коряво - BoxBerry в Shipito обнаружило это и помогло мне заполнить все правильно>
14.2.2020 Shipito выслало посылку через BoxBerry
24.2.2020 получил посылку в Shipito

Посылка была вскрыта и заклеена скотчем с надписью "LINK"  ??? Дырка достаточно большая, чтобы извлечь коробку DL, но сама коробка на месте и видно, что ее не вскрывали.


Почистил зубы, прополоскал Листерином - через пару часов буду плевать в трубочку. Можно считать, что 1/3 эпопеи уже позади  ;D

Кстати, т.к. набор пришел в США, то на возвратной коробке USPS написано:
SpectrumDNA
12248 S. Lone Peak Parkway
Suite #106
Draper, UT 84020

Но мне ведь ничто не мешает отправить на:
Dante Labs
Tecnopolo d'Abruzzo
Strada Statale 17 Loc. Boschetto di Pile
67100
L'Aquila (AQ)
Italy
[/spoiler]
Ведь так? Сейчас уточню у них.
шипито позволяет делать фото пришедшей посылки, заказывали? Интересно на каком этапе шаловливые ручки туда лезут. И на каком основании, когда есть просвечивающая аппаратура.
Мне Шипито сделала снимки сразу, без заказа. На снимке пакет целый, без всяких скотчей.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.