Повторю вопрос Фарруха совсем по детски. В стиле, кто сильнее - кит, или слон?
Что лучше для наиболее полного и уверенного определения серии терминальных снипов?
1. БигИгрек 700.
2. Данте Лабз х30.
3. Данте Лабз лонг рид.
Все три пункта - это разные технологии.
1) таргетное секвенирование. Примеры: BigY, FGC Elite
2) WGS. Полный геном. Предоставляют услугу: YSEQ, FGC, Dante
3) Лонг риды. Предоставляют услугу: FGC, Dante
Третий пункт отпадает сразу, так как уже сказали - технология не отлаженная. Я видел лонгриды от Данте очень высокого качества, но видел и совсем трешовые.
Если выбирать между первым и вторым пунктами, то WGS в любом случае лучше. Таргетное секвенирование делали ради удешевления процесса. Теперь, когда цена на WGS упала, выбор очевиден.
Что касается конкретно Данте. Они сильно демпингуют, то есть цена очень привлекательная. Но имеют кучу проблем с логистикой. Так что какую контору выбирать из второго пункта - вопрос толщины кошелька и желания решать возникающие проблемы.
По качеству секвенирования - многое зависит от качества биоматериала. Лайфхак - собирая слюну, попробуйте слегка повредить десны и подмешать крови
Практика показывает увеличение покрытия в глубину.
Для себя я уже решил - на скидках закажу несколько наборов, но уже через шипито.
Таким образом ответ - пункт 2.