Кстати, из свежих новостей:
https://gencove.com/
Есть некоторое подозрение что за зверь новый продукт от BGI. Методика секвенирования должна несколько отличаться от принятой сейчас повсеместно. Если подозрения подтвердятся, то WGS 4X за $175 должен быть бомбой. Не уверен насчет STR, но SNP + Full mtDNA + все аутосомы будут доступны за весьма скромную цену.
Со страницы gencove
https://gencove.com/data/gencove_bgi.pdf:
Gencove’s highly-accurate ImputeSeq calls
variants across the whole genome with an average imputation concordance with deep WGS of 99%
for 1x coverage and 99.5% for 4x. [...] Deliverables Data files: Imputed VCF file**, ** Imputation is based on the 1000 Genomes Phase 3
Все конечно хорошо, но потом может будет непонятно, что импутировали, а что нет. Интересное предложение, но надо смотреть в БАМ, есть инфа об импутации или нет. Потом народ начнет все это в Генезис заливать, и появиться больше родсвенников из Бразилии или Конго.
Ну и там ссылочка таким мелким шрифтом:
† Pricing for more than 1000 samples
Все бы, но как 1000 образцов набрать? Всем молгеном будем закупать? Ну может в будущем будут продавать штучно...
Со страницы gencove и их блога:
https://my.gencove.com/Data uploads and kit orders are no longer available on Gencove. Read more.
https://medium.com/the-seeq-blog/sunsetting-gencove-for-individuals-7d24f951193cWe are making some important changes at Gencove. In the last year, we’ve seen increasing demand for our low-pass sequencing technology from researchers looking for accessible and effective sequencing, [...]
But this also means that we have decided to fully focus on our sequencing platform and that we will need to gradually discontinue our direct-to-consumer products.
Коротко, мы меняем направление, есть растущий рынок доступного и эффективного секвенсирования для
исследователей. Это означает, что нам необходимо постепенно прекратить работу с
потребителями. Загрузка данных и тестовые наборы более недоступны. Вот, так.
У них наработаны приложения по медицине и генеалогии, может они это продадут кому-то с правом перепродажи их тестовых наборов.