Исходные файлы: FASTQ (.fq.gz)
Как я видел, они выдают и bam. Может конечно по требованию, но выдают. Крупный минус - не вырезают Y и mtDNA, для отдельного скачивания, то есть если качать, то весь геном.
Файл с аутосомами, по типу 23andme как вижу тоже выдают, так что без проблем можно залить на ГедМатч.
На Promethease получается тоже можно проверить свои данные.
Остаются STR. С ними сложнее. По причине коротких ридов они хуже читаются в бамах от DL. Хотя, ради справедливости, стоит заметить, что в новых Big Y STR тоже стали хуже читаться из-за некоторого уменьшения длины рида и глубины покрытия.
В любом случае, с современным уровнем развития технологии NGS, нельзя уверенно прочитать в баме все до одного STR маркеры из панели FTDNA Y111.