Компания Dante Labs

[karwiso]

Я получил результаты WES (Whole Exome Sequencing).
Заняло 10 недель. Возможно сгрузить VCF файл.
Я добавил VCF  файл на GEDmatch Genesis. Для анализа могут быть использованы очень мало снипов. Пересечение с другими наборами только 16 тысяч - 60 тысяч снипов. Для генеалогии не следует делать WES, дешевле любой другой тест и даст больше информации.
Результаты полного секвенсирования (WGS) пока не пришли, но безусловно WGS полезнее WES.

[NathanS]

На Anthrogenica появилась статистика по одному образцу из Dante Labs: https://anthrogenica.com/showthread.php?12075-Dante-Labs-(WGS)&p=338306&viewfull=1#post338306.

Прочитанных снипов 14,278,386. По мнению Джеймса Кэйна, автора поста, это наиболее выгодный тест для открытия новых снипов в Y-хромосоме. Хоть длина чтения и 100 пар, все же результаты выглядят прилично.  Пока нет более комментариев так как проанализирован только один образец... Учитывая возможные скидки до 300-400€, то тест весьма привлекателен.

[Centurion]

Пока нет более комментариев так как проанализирован только один образец...

в базе YFull девять образцов из Dante Lab

[gecube_ru]

И как они?

[NathanS]

Dante Labs обьявила о скидке на полногеномное секвенсирование WGS - 399 € до 31 марта.

[napobo3]

Dante Labs обьявила о скидке на полногеномное секвенсирование WGS - 399 € до 31 марта.

Это не так.

[TK]

Dante Labs обьявила о скидке на полногеномное секвенсирование WGS - 399 € до 31 марта.

Это не так.

А ведь всё-таки так, по крайней мере на их сайте:
https://www.dantelabs.com/collections/our-tests/products/whole-genome-sequencing

[Mich Glitch]

Хорошая, вроде, цена.       

[Mich Glitch]

Скажу честно, не знаю пока, что с этим счастьем делать.

1. Болячки (генетические предрасположенности) меня не особо интересуют. Да, и понимания вероятностного характера предиктов имеется.

2. По игреку хватает продуктов а-ля БигИгрек (которые уже сделаны). Плюс коррекции от YSEQ.

Вся надежда только на поиск родичей по аутосомам. Но тут надо ждать, когда появится что-то вроде ГедМатч. Куда данные можно будет загружать, хотя бы для попарных сравнений.

[napobo3]

Dante Labs обьявила о скидке на полногеномное секвенсирование WGS - 399 € до 31 марта.

Это не так.

А ведь всё-таки так, по крайней мере на их сайте:
https://www.dantelabs.com/collections/our-tests/products/whole-genome-sequencing

Да, теперь обновилось.

[Mich Glitch]

А вот если бы у меня ничего не было (типа, БигИгрека, или Y Elite и пр. подобного), то без сомнения брал бы именно этот тест по его нынешней скидочной цене.       

[NathanS]

А вот если бы у меня ничего не было (типа, БигИгрека, или Y Elite и пр. подобного), то без сомнения брал бы именно этот тест по его нынешней скидочной цене.       

Да я вот БигИгрек и не делаю, делал через ДантеЛабс пару образцов. Думаю вот может заказать 2-3 теста для родственников в марте вместо BigY. Да и по моим результатам, все 111 маркеров из ФТДНА хорошо определяются в YFull по БАМу из Данте. Всётаки разница 10 миллинов SNP в BigY или 14 миллионов через Данте и ИФулл.

Может эксперты выскажутся? Как данные из Данте Лаб? Смущает и разница в геномах 37 и 38. Насколько это влияет на результаты?

[evgivanov]

Да я вот БигИгрек и не делаю, делал через ДантеЛабс пару образцов. Думаю вот может заказать 2-3 теста для родственников в марте вместо BigY. Да и по моим результатам, все 111 маркеров из ФТДНА хорошо определяются в YFull по БАМу из Данте. Всётаки разница 10 миллинов SNP в BigY или 14 миллионов через Данте и ИФулл.

Может эксперты выскажутся? Как данные из Данте Лаб? Смущает и разница в геномах 37 и 38. Насколько это влияет на результаты?

500 в USD если заказывать в Штатах? Я так понимаю, что и mtDNA  получится вытащить из BAM/fastq или нет? Если да, то в сумме это даже дешевле, чем BigY + mtDNA с самыми большими скидками от ftdna

[Remmo]

Да я вот БигИгрек и не делаю, делал через ДантеЛабс пару образцов. Думаю вот может заказать 2-3 теста для родственников в марте вместо BigY. Да и по моим результатам, все 111 маркеров из ФТДНА хорошо определяются в YFull по БАМу из Данте. Всётаки разница 10 миллинов SNP в BigY или 14 миллионов через Данте и ИФулл.

Может эксперты выскажутся? Как данные из Данте Лаб? Смущает и разница в геномах 37 и 38. Насколько это влияет на результаты?

500 в USD если заказывать в Штатах? Я так понимаю, что и mtDNA  получится вытащить из BAM/fastq или нет? Если да, то в сумме это даже дешевле, чем BigY + mtDNA с самыми большими скидками от ftdna

mtDNA имеете ввиду из BAM/fastq который дает Dante Labs или FTDNA? Если FTDNA  то оттуда данные mtDNA вырезатся перед выдачей.

[evgivanov]

mtDNA имеете ввиду из BAM/fastq который дает Dante Labs или FTDNA? Если FTDNA  то оттуда данные mtDNA вырезатся перед выдачей.

которые дает Dante Labs. Про ftdna, что они вырезают mtDNA из bam, я знаю. Также ftdna не выдает fastq