Такой, гипотетический вопрос.
130х экзомы имеют какое-то отдельное значение, там какая-то спецтехника?
Или 5 раз по обычных 30х дадут даже 150х экзом + 150х всего?
Просто по цене все равно дешевле получается 5 по 30х сделать, не понимаю.
Логически можно предположить, что техника подготовки библиотеки другая, что бы увеличить количество средних прочтений экзом должен секвенироваться отдельно. Я заказывал этот вариант и пока не доволен результатом. Беглый анализ полученных снипов примерно следующий:
всего 3944336 с средним DP 34,8
c DP>80 снипов 30382 с средним DP 126,2
и из них только 2641 полностью прошли фильтры и их средние DP 84
Причем надо еще изучить качество выравнивание, тк не факт что много прочтений именно в экзоме, они могли их накидать в микросателиты.
Этого не делал, надо поискать файл с снипами исключительно экзома, может clinvar приблизительно подойдет.
Поэтому думаю полезней сделать несколько x30 за те же или меньшие деньги.