АвторТема: Компания Dante Labs  (Прочитано 19773 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Онлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 33238
  • Страна: ca
  • Рейтинг +2679/-44
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #375 : 11 Апрель 2019, 19:56:04 »
Из США, полагаю, шлют только по Северной Америке. И только тестовый набор.
Преоплаченный конверт для возврата - адресован в Италию.

Оффлайн TK

  • Сообщений: 226
  • Страна: ru
  • Рейтинг +133/-0
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #376 : 12 Апрель 2019, 14:38:18 »
Хочу поинтересоваться, кто-нибудь из России уже получил свои результаты? Истории успеха встречаются в Интернете, но там всё Канада, США и другие западные страны. Соблазн велик в районе лета заказать такой тест, но боязно. 200-300 евро (или сколько там) - не игрушка для меня.

Судя по всему, более-менее массовый заказ тестов клиентами из России произошел лишь в на распродаже в ноябре 2018.
С учётом времени, потребовавшегося для почтовой доставки, первые результаты данные клиенты получат не ранее апреля-мая 2019, плюс ещё пара месяцев на заказ и доставку жесткого диска с данными.

P.S. Касательно жесткого диска... Не исключено, что он может и не потребоваться.
На сайте sequence.com в описании Dante Labs появилась фраза (https://sequencing.com/dante-labs):

"New! Your raw data and genetic reports can now be securely imported into your Sequencing.com account.
Click here to email your request to Dante Labs. Please make sure to include your Dante Labs Kit ID# with your request."


При нажатии на ссылку формируется письмо вида:

Цитировать
Request to import my data into my Sequencing.com account

Hi Dante Labs,
My Dante Labs Kit ID# is:
My email address is:
Please import a copy of all of my raw genetic data (paired fastq, bam and vcf files) into my Sequencing.com account.
Thank you!

P.P.S. Заодно немного про доставку.
Компания Dante Labs - небольшая, занимается биоинформатикой и не специализируется на почтовой логистике :)
Соответственно, можно порекомендовать заказывать кит в Россию через компанию-посредника, предоставляющую почтовый адрес в Европе (таких много уже).
Обратно же возвращать кит проще всего, используя Почту России, отправив его мелким пакетом.

Оффлайн TK

  • Сообщений: 226
  • Страна: ru
  • Рейтинг +133/-0
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #377 : 23 Апрель 2019, 19:59:00 »
По не подтвержденной пока информации из французских соцсетей, 25-29 апреля у Dante Labs будет распродажа. Цена пока окончательно неизвестна, но ожидается, что она не превысит 250 euro.
https://www.facebook.com/groups/genealogie.ADN/permalink/1222680297899098/

Кроме того, изменилась политика компании по срокам для новых заказов - если в течение 90 дней после получения ими обратно образца, результат не будет готов, то они вернут деньги и потом бесплатно доделают образец...
https://www.dantelabs.com/pages/guarantee
« Последнее редактирование: 24 Апрель 2019, 10:49:27 от TK »

Оффлайн TK

  • Сообщений: 226
  • Страна: ru
  • Рейтинг +133/-0
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #378 : 25 Апрель 2019, 07:51:23 »
Подтвердилось: 25-29 апреля цена полногеномного тестирования у Dante Labs составляет 199 евро с гарантией обработки за 90 дней и возможностью скачать BAM, не заказывая жёсткий диск:
https://www.dantelabs.com/blogs/news/whole-genome-offer-for-dna-day-2019

Оффлайн Arthwr

  • Сообщений: 871
  • Страна: de
  • Рейтинг +346/-5
    • r1b-pf7562.blogspot.com
  • Y-ДНК: R1b-PF7563
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #379 : 25 Апрель 2019, 09:47:59 »
Не подскажете, как можно осуществить доставку на Украину и обратно, через какую компанию-посредника и т. д. Спасибо.

Оффлайн rmk

  • Сообщений: 62
  • Страна: ru
  • Рейтинг +33/-30
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #380 : 26 Апрель 2019, 12:38:27 »
Кстати о накоплении партии ;D Кто-нибудь получил результаты из заказывавших в "Чёрную пятницу" и позже? Мне пока только отписались об успешном выделении ДНК.
Похоже, уведомление об успешном выделении ДНК не всегда отправляется.

Напомню, что получил подтверждение о получении ими образца 21 января. По сообщениям на различных ресурсах знал, что обычно в течение месяца приходит уведомление об успешном выделении ДНК. Не получив данного уведомления спустя более двух месяцев, написал им месяц назад с просьбой уточнить, все ли в порядке. Получил ответ:
Цитировать
I checked on your kit number and it is just about to undergo a quality assessment before DNA extraction can be undertaken. Please note due to the large number of kits we receive this can take a little bit of time, however do not be distressed, we will upload the details on your profile as soon as we get to your sample.

Позавчера написал им снова с тем же вопросом, т. к. прошло уже больше трех месяцев, а уведомления все еще не было. Ответили:
Цитировать
We are currently running the DNA extraction/Sequencing process of your sample. You will receive a notification email as soon as our lab starts processing it.


Considering the timeframe of when the process began and when your samples arrived, you can expect to receive a notification on your results around the end of May.

Вчера попросил их подтвердить, что образец прошел проверку качества, т. к. знаю, что другие люди давно получили уведомления об успешном выделении ДНК. Спустя менее получаса вдруг пришло данное уведомление и следом новый ответ:
Цитировать
I confirm your DNA sample passed the quality check. We are currently running the Bioinformatics analysis of your sample. Your results are expected to be ready by end month.

Как понял, из последнего ответа следует, что тестирование уже завершено, и идет процесс программной обработки результатов. Готовность уже ожидается к концу текущего месяца.
« Последнее редактирование: 26 Апрель 2019, 13:59:13 от rmk »

Оффлайн Arthwr

  • Сообщений: 871
  • Страна: de
  • Рейтинг +346/-5
    • r1b-pf7562.blogspot.com
  • Y-ДНК: R1b-PF7563
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #381 : 26 Апрель 2019, 21:05:07 »
P.S. Касательно жесткого диска... Не исключено, что он может и не потребоваться.
На сайте sequence.com в описании Dante Labs появилась фраза (https://sequencing.com/dante-labs):

"New! Your raw data and genetic reports can now be securely imported into your Sequencing.com account.
Click here to email your request to Dante Labs. Please make sure to include your Dante Labs Kit ID# with your request."


При нажатии на ссылку формируется письмо вида:

Цитировать
Request to import my data into my Sequencing.com account

Hi Dante Labs,
My Dante Labs Kit ID# is:
My email address is:
Please import a copy of all of my raw genetic data (paired fastq, bam and vcf files) into my Sequencing.com account.
Thank you!

Подтвердилось: 25-29 апреля цена полногеномного тестирования у Dante Labs составляет 199 евро с гарантией обработки за 90 дней и возможностью скачать BAM, не заказывая жёсткий диск:
https://www.dantelabs.com/blogs/news/whole-genome-offer-for-dna-day-2019

На Антрогенике сегодня пишут:

They are able to transfer VCF files only.

I used the form above and I received the following reply yesterday:

Hello Petr,

Thanks for your message,

Your Raw data is being uploaded to your sequencing.com account. Please take note these are only VCF files.

FASTQ and BAM files (~100 GB each) can only be delivered via a 512 GB HD. You can purchase one here: https://www.dantelabs.com/products/5...-your-raw-data

Please let me know if you have any questions.

Kindest regards,

Mark

https://anthrogenica.com/showthread.php?12075-Dante-Labs-(WGS)&p=564153&viewfull=1#post564153

Оффлайн TK

  • Сообщений: 226
  • Страна: ru
  • Рейтинг +133/-0
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #382 : 10 Май 2019, 08:05:55 »
По косвенной информации, Dante Labs выложили результаты очередной партии анализов от распродажи "чёрной пятницы". Писем ещё не было, но можно зайти в свой профиль и там посмотреть. В этой партии как раз должно быть приличное количество заказов из России.

Оффлайн Srkz

  • Сообщений: 5245
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1959/-2
  • Y-ДНК: N1c L1025*
  • мтДНК: U4a1e-pre T16093C T16311T
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #383 : 10 Май 2019, 08:20:49 »
По косвенной информации, Dante Labs выложили результаты очередной партии анализов от распродажи "чёрной пятницы". Писем ещё не было, но можно зайти в свой профиль и там посмотреть. В этой партии как раз должно быть приличное количество заказов из России.
Спасибо, у меня пока пусто.

Оффлайн bulatv2

  • Сообщений: 186
  • Страна: ru
  • Рейтинг +47/-0
  • ftdna: 468412
  • Y-ДНК: R1a-Z92(YP682+)
  • мтДНК: H1b2
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #384 : 10 Май 2019, 19:23:18 »
По косвенной информации, Dante Labs выложили результаты очередной партии анализов от распродажи "чёрной пятницы". Писем ещё не было, но можно зайти в свой профиль и там посмотреть. В этой партии как раз должно быть приличное количество заказов из России.
у меня тоже пусто но после отправки запроса на загрузку в sequencing.com пришло письмо что в течении 24 часов загрузят vcf
« Последнее редактирование: 11 Май 2019, 07:50:10 от bulatv2 »

Оффлайн ilpo

  • Сообщений: 34
  • Страна: fi
  • Рейтинг +7/-0
  • Y-ДНК: N-BY32529
  • мтДНК: U8a1a1b1
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #385 : 10 Май 2019, 22:51:32 »
Михаилу - просьба. Если все-таки получите результаты, то провалидируйте их по уже сделанным Вами тестам (бигигрек, автосомы - что есть) и дайте нам обратную связь - сошлось ли или нет. Я действительно рассуждал о возможности поддельных результатов тестов. Но может речь идет о вбросе со стороны конкурентов.

Я знаю несколько человек, которые заказали тест WGS. Все ок. Один человек взял результаты YFull, и они сработали. Я на самом деле заказал тест Dante Labs WGS.

Оффлайн evgivanov

  • Сообщений: 275
  • Страна: ru
  • Рейтинг +73/-0
  • Y-ДНК: R1a-Z92 (YP682+, YP1261+)
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #386 : 10 Май 2019, 23:08:42 »
]В принципе можно _легко_ сделать файл типа 23andMe для корректной загрузки на гедматч из bam файла от Данте.
Совместно с уважаемым Daemon2017 мы составили небольшую инструкцию как вырезать из bam'а Y и MT на компьютере с Win 10. Можно дополнить и тем как создать VCF для загрузки на Гедматч.
Беда только в том, что инструкция состоит из картинок и наборов технических фраз. Возможно кто-то "причешет" ее?)))
Думаю это поможет всем клиентам Данте.

Присылайте мне. Вот только в ближайшее время скорее всего заняться ей не получится, так как на мне сейчас два достаточно объёмных дела, и ко второму ещё даже не приступал ;D Может быть, кто-то более оперативно сработает.

В прошлом году я делал файл аутосомы + X формата FTDNA на основе VCF от YSeq, но специфическими наколенными методами, инструкцию для использования на их основе не составить. После добавления отсутствующих снипов из референса результаты этнокалькуляторов полностью нормализовались, но вот поиск родственников, как по мне, стал даже хуже - часть сегментов разорвалась.
Набросок руководства тут.

перепост из группы на фэйсбуке:

The beta version of the program "WGS Extract" is now available for download:

http://37.187.22.93/wgsextract/WGSExtractBeta.zip

Source is enclosed.

Here is a description of the software from an earlier post:

"

The idea is that you just need to download the package and install it with one click. All the tools and reference genomes for hg19 and hg38 are already included. The program asks what you want to do (e.g. upload just the part with the Y-Chromosome to Y-DNA Warehouse? Or maybe extract a 23andmeV3 file for an upload to Gedmatch?), then calls the needed tools in the background, and eventually the user has nothing else to do than waiting for the results. The attached screenshots should show the idea.

From a technical perspective, the program is just a GUI that calls Windows compiled versions of the latest samtools etc. in the background. Nothing big, but maybe useful for some non-tech-savvy genealogists. It will be published as open source.

"

The software has still got Beta status. Please report if you find any bugs.

There are several features planned for future version, especially regarding the part of autosomal extraction.

There are also great projects by others, that are very useful for examining your WGS results:

BAM Analysis Kit, 2019 update - very interesting if you have got the BAM file:

https://github.com/teepean/BAM-Analysis-Kit

DNA Kit Studio - the new version 2.2 now supports gVCF format:

http://dnagenics.com/dna-kit-studio/

Оффлайн Srkz

  • Сообщений: 5245
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1959/-2
  • Y-ДНК: N1c L1025*
  • мтДНК: U4a1e-pre T16093C T16311T
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #387 : 12 Май 2019, 07:53:59 »
По косвенной информации, Dante Labs выложили результаты очередной партии анализов от распродажи "чёрной пятницы". Писем ещё не было, но можно зайти в свой профиль и там посмотреть. В этой партии как раз должно быть приличное количество заказов из России.
Спасибо, у меня пока пусто.
Появились ссылки на VCF, отчёты по реакции на лекарства и наследственным заболеваниям. Итого чуть больше 90 дней с момента получения и около полугода на всю историю :)

Оффлайн TK

  • Сообщений: 226
  • Страна: ru
  • Рейтинг +133/-0
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #388 : 12 Май 2019, 15:29:26 »
Кажется, можно чуть обождать с заказами HDD. FastQ и BAM совсем скоро могут стать доступными для скачивания в кабинете. (Они могут появляться не сразу, а по мере выкладывания - рекомендую подождать недельку после появления ссылки на VCF).

Оффлайн Srkz

  • Сообщений: 5245
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1959/-2
  • Y-ДНК: N1c L1025*
  • мтДНК: U4a1e-pre T16093C T16311T
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #389 : 16 Май 2019, 08:16:08 »
Кажется, можно чуть обождать с заказами HDD. FastQ и BAM совсем скоро могут стать доступными для скачивания в кабинете. (Они могут появляться не сразу, а по мере выкладывания - рекомендую подождать недельку после появления ссылки на VCF).
Для порядка отпишусь, что файлы FastQ и BAM (31.6 Gb) появились позавчера.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100